Gene Details:
- Gene ID: BnaA04G0029800ZS
- Suggest Gene Name: ATEIF3E-1, INT-6
- Description: putative flowering gene
- Species: Brassica napus
- Source: Putative flowering gene from PlantCFG
Protein Features:
Functional Descriptions:
- Encodes a protein that is found in not only the eif3 complex but also in association with subunits of the COP9 signalosome. eIF3e appears to be subjected to proteasome-dependent degradation that requires the PCI domain of eIF3e. The level of eIF3e present in cells appears to affect the rate of translation.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT3G57290
Sequences:
gDNA Sequence
- >BnaA04G0029800ZS
AAAATGGAGGAAACCAAAGAGAACTACGACCTAACCCCTCGAGTAGCTCCCAACCTAGACCGTCACCTGGTGTTCCCCATCCTCGAGTTCCTCCAAGAGCGTCAGCTTTACCCCGATGAGCAGATCCTCAAGTTCAAGATCGAGCTTTTGAACAAGACCAACATGGTTGATTACGCCATGGACATCCACAAGAGTCTTTACCACACCGAAGACGCTCCCCAAGGTAGTATAATAACGTCTGTGGAAAGTTTGCGTTTTTACGGCTTGTTTGGTTGGTTGGTTGATGAGTGTTGTGGTTTGTTTGATAGATATGGTGGAGAGGAGAGCTGAGGTTGTGGCGAGGCTTAAGTCTCTGGAGGAGGCGGCTGCACCGCTCGTGACTTTCCTTTTGAACCCTAATGCTGTTCAGGAGTTGAGGGCTGACAAGCAGTACAATCTCCAGATGCTGAAAGAACGTTACCAGGTTGTGTTTGGTTTGCATTTAGTATCGAAAGACTTGATTTTTTATGTGTTGTTTTGATCAGATTGGTCCGGGCCAGATAGAGTTGTGGTTTTGTCTTATTTTGTGTTGTTTGGTTTGCATTTTGTATCGAAAGACTTGATTTTTATGTGTAATGTTTGATCAGATTGGTTCAGGCCAGATAGAGTTGTGATTTTGGCTGTTAAAGTTGACATCTTTTGTCTGATGTTGTCTTGTTTGGTTTGCATTTCGTATGAAAGACTTGATTTTTATGTGTAATGTTTAATCAGATTGGTCCAGACCAGATAGAGTTATGATTTTGGCTGATAAAGTTAACATCTTTTGTGTTGTTTGATTTGCATAAAGACTCAGTTTTTATGTGTAATGTTCTTACCAGATTGGTCGAGACCAGATAGAGTTGTGATTTTCTCTTATTTTGTGTTGTTTGGTTTGCATTTTGTATTGAAAGACTCAATTTTTATGTGTAATGTTTGATCAGATTGGTCCGGACCAGATAAGAGTAGTGATTTCCTGTTGACATCTTTTGTGTTGTTTGATTTGCATGAACTCACTTTCACTATGTAATGTTCTTTATCAGATTGGTCCAGACCAGATAGAGGCTTTGTATCAGTACGCTAAGTTTCAGTTTGAATGTGGAAACTACTCTGGTGCAGCTGATTACCTTTACCAGTACAGGACACTTTGCTCTAACCTTGAGAGAAGTCTTAGCGCCTTGTGGGGAAAGCTCGCTTCTGAGATTCTGATGCAGAACTGGGACATTGCACTTGAAGAGCTTAACCGTGTTAAAGAAATTATCGACTCTAAGGTCTCCTTTTCAAGTTTCTTCTAGCTTTTGTTATAGCCTTTGATAAACTAATTAGCGTTTTGGTGTTTCAGAGCTTTGCCTCGCCGTTAAACCAGGTGCAGAACAGGATTTGGTTGATGCATTGGGGTCTCTACATCTTCTTTAACCATGATAACGGAAGGACACAGATCATTGATCTTTTTATCCAGGACAAGTATGTTTAAACCTCTCTGTTATCAGCTTTCCTAGCGCTATTGCTTAATACAGTTTTGTAGAAATTCCTTTCTCTTGTATATCAACTGAAACCAATCTATGCTTCCCCTTTTAATTGTTGTCCATCTAAGTTAGTTTTAGCTGAATTTGACATGGAAGATTGCTTTAATGTGCATGAGTGCATCACATATTTTAGGAATATAATTAAAAAATGTTACCAATCATGAATTATTTTTAATTTCTTGAGTTAATGTCTGAGTTACAGGTTTGAATTATTCCTTTAGAAAATTTGATAACTCCATTGTTAAGTTAACATCCAACAAATGTTTTTGGTTTTTGTTATTATGTATTAGAAGTTGCATTAGTAATTTAGTACTTTTGGTTTTTGTTAGTTATCTAACGTTATTTTTTGATTTTAACAAGTTTAAAATTTAATACATCTATGATTGTCTTAGTCCCAATAGAAGCTTGATCTGAGTGGATGCATTGGTGGTGGTTTGTGTATGAAACAATTTTTTGGAGTTAAAGTTAGTCTTGATGTATAATAAGTGAGAGTGTTTTCATTCTTTATGTCCGGACCATTCTGTTAGGATTGTGCTTTTAGTTTATGCAGTATTGCATTCTAATATTATATATATTATTAGGTATATGAATGCCATACAAACTAGTGCCCCACACTTGCTGCGTTACTTGGCAACTGCTTTCATTGTCAACAAAAGAAGAAGGCCTCAACTGAAAGAATTCATCAAGGTCATTCAACAAGAACACTACTCCTACAAAGATCCCATTGTGGAGTTCCTGGCATGTGTCTTTGTCAATTATGACTTTGACGGAGCTCAAAAGAAGATGAAAGAGTGTGAAGAGGTAAAGCCATTTACATGTGGTGTAGGATAATATAATCAATAGTCTGACATGTTACTACGATGTATTAGGTGATTGTGAATGATCCATTCCTTGGAAAGCGAGTTGATGATGGAAACTTTTCAACTGTGCCACTGAAAGATGAGTTTCTTGAAAATGCCCGCCTCTTTATCTTCGAAACCTATTGCAGAATTCATCAGAGAATTGACATGGGGTAAGTTATCATCATGTTTTGTTTAATTGTATTCGTTTTCACCTCTCAATATAATGAGAATCTCATGGCCTTGTCAGGGTGCTTGCTGAGAAGCTGAATCTGAACTATGAGGAGGCAGAGAGATGGATTGTGAACCTTATCCGTACCTCAAAGCTTGATGCCAAGATTGATTCCGAGTCTGGAACCGTAATCATGGAGCCTACTCAGCCCAACGTGTAAGAAGAATACAATCTTTTCGTATGACTTGCATGTTTTGGAGACTCTACAATCTAAACTATGTTTCCAACGTAATGCAGGCATGAGCAGTTGGTTAACCACACCAAAGCCTTATCAGGAAGGACTTACAAGTTAGTGACTCAGCTCTTAGAACACTCACAGGGACAAGCAGCTCGGTAATCACACCTAATTTTGCCCGTTTGTCTTTGATAAATCTTTGCTTTGTTGTCACTCTGGAATCAGTTGTGTTCTGCTTTGAATTTGCCTTACTTTGGAAACATGTCTACACTTGCAAAAGTTAAATTTAATGTTGGATTCATGAAAATTCGATAACCAAACTTGTTT
CDS Sequence
- >BnaA04G0029800ZS
ATGGAGGAAACCAAAGAGAACTACGACCTAACCCCTCGAGTAGCTCCCAACCTAGACCGTCACCTGGTGTTCCCCATCCTCGAGTTCCTCCAAGAGCGTCAGCTTTACCCCGATGAGCAGATCCTCAAGTTCAAGATCGAGCTTTTGAACAAGACCAACATGGTTGATTACGCCATGGACATCCACAAGAGTCTTTACCACACCGAAGACGCTCCCCAAGATATGGTGGAGAGGAGAGCTGAGGTTGTGGCGAGGCTTAAGTCTCTGGAGGAGGCGGCTGCACCGCTCGTGACTTTCCTTTTGAACCCTAATGCTGTTCAGGAGTTGAGGGCTGACAAGCAGTACAATCTCCAGATGCTGAAAGAACGTTACCAGATTGGTCCAGACCAGATAGAGGCTTTGTATCAGTACGCTAAGTTTCAGTTTGAATGTGGAAACTACTCTGGTGCAGCTGATTACCTTTACCAGTACAGGACACTTTGCTCTAACCTTGAGAGAAGTCTTAGCGCCTTGTGGGGAAAGCTCGCTTCTGAGATTCTGATGCAGAACTGGGACATTGCACTTGAAGAGCTTAACCGTGTTAAAGAAATTATCGACTCTAAGAGCTTTGCCTCGCCGTTAAACCAGGTGCAGAACAGGATTTGGTTGATGCATTGGGGTCTCTACATCTTCTTTAACCATGATAACGGAAGGACACAGATCATTGATCTTTTTATCCAGGACAAGTATATGAATGCCATACAAACTAGTGCCCCACACTTGCTGCGTTACTTGGCAACTGCTTTCATTGTCAACAAAAGAAGAAGGCCTCAACTGAAAGAATTCATCAAGGTCATTCAACAAGAACACTACTCCTACAAAGATCCCATTGTGGAGTTCCTGGCATGTGTCTTTGTCAATTATGACTTTGACGGAGCTCAAAAGAAGATGAAAGAGTGTGAAGAGGTGATTGTGAATGATCCATTCCTTGGAAAGCGAGTTGATGATGGAAACTTTTCAACTGTGCCACTGAAAGATGAGTTTCTTGAAAATGCCCGCCTCTTTATCTTCGAAACCTATTGCAGAATTCATCAGAGAATTGACATGGGGGTGCTTGCTGAGAAGCTGAATCTGAACTATGAGGAGGCAGAGAGATGGATTGTGAACCTTATCCGTACCTCAAAGCTTGATGCCAAGATTGATTCCGAGTCTGGAACCGTAATCATGGAGCCTACTCAGCCCAACGTGCATGAGCAGTTGGTTAACCACACCAAAGCCTTATCAGGAAGGACTTACAAGTTAGTGACTCAGCTCTTAGAACACTCACAGGGACAAGCAGCTCGGTAA
Protein Sequence
- >BnaA04G0029800ZS
MEETKENYDLTPRVAPNLDRHLVFPILEFLQERQLYPDEQILKFKIELLNKTNMVDYAMDIHKSLYHTEDAPQDMVERRAEVVARLKSLEEAAAPLVTFLLNPNAVQELRADKQYNLQMLKERYQIGPDQIEALYQYAKFQFECGNYSGAADYLYQYRTLCSNLERSLSALWGKLASEILMQNWDIALEELNRVKEIIDSKSFASPLNQVQNRIWLMHWGLYIFFNHDNGRTQIIDLFIQDKYMNAIQTSAPHLLRYLATAFIVNKRRRPQLKEFIKVIQQEHYSYKDPIVEFLACVFVNYDFDGAQKKMKECEEVIVNDPFLGKRVDDGNFSTVPLKDEFLENARLFIFETYCRIHQRIDMGVLAEKLNLNYEEAERWIVNLIRTSKLDAKIDSESGTVIMEPTQPNVHEQLVNHTKALSGRTYKLVTQLLEHSQGQAAR