Information report for BnaA03G0319100ZS
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Encodes a NAC transcription factor that physically associates with the histone H3K4 demethylase JMJ14 and through that association is involved in transcriptional repression and flowering time control.
Homologous
- Brassica oleracea: XP_013622519.1, Bo3g062710, XP_013622520.1, XP_013586773.1, Bo5g137360
- Brassica rapa: XP_009135113.1, XP_009135112.1, Bra001366, XP_009146835.1, XP_009146834.1, Bra029844
Gene Resources
- Pfam: PF02365
- UniProt: A0A816VZB1
- RefSeq: XP_013648148.1 , XP_013648149.1 , XP_013648150.1 , XP_013736114.1 , XP_013736115.1 , XP_013736116.1
- EMBL: HG994357
- AlphaFoldDB: A0A816VZB1
- KEGG: bna:106353020
- InterPro: IPR003441 , IPR036093
- PANTHER: PTHR31744 , PTHR31744:SF210
- SUPFAM: SSF101941
- PROSITE: PS51005
- Gene3D: 2.170.150.80
- OrthoDB: A0A816VZB1
- SMR: A0A816VZB1
Sequences
gDNA Sequence
- >BnaA03G0319100ZS
TGGATCGCGGTTCTGTGGCTGTTGAGTCCTTGCCGTCATCAGCGACTGCGCCGAGTACTGCCGTGGCGGCTACGGCGCTTGCTCCCGGGTTCCGATTTCATCCCACTGACGAGGAGCTCGTGAGCTATTACTTGAAGCGAAAGGTTCTGGGTAGACCAGTGCGGTTCGATGCGATTGGGGATGCCGATATCTACAAGTACGAGCCTTGGGACTTAGCAGGTTCGTTGGGCTTCCTCTGTCTCTCTGTCTCTTCGTTTCTTTGAGACGTGTGAATTTGCTGATTCTGATTTGAATGGCCATGGCTTCTTGGGTAACTCAATTCTGGGGAAAGAGTTAAGCTTTATGGGCTTTGATTCATTTTCTTGGGAATTTCGATGCAGATTTATCATTTGCTATGTTTAGGCTGTTACACTGTGAAAACAAAATTTCATCTTGTCGACTTTTAATTGGAAAAAATCTGTACTTTTTTTTGTTGCTATTTTGTGCTTGAGTTTTGTTTGCTTGTGTTGCAGGGAATGAAGTTTGTTGTTGTTGTTATGTGTTTGGTTACTTGAAGTTTTGAGTTTCATGTTATTAAATTCGGTTTCATTCTTTGTCTTTGTGTGTGTATCTGATTCCTTAAAAGGATTTTTTTGCTACCTTGTGCTTCCACATTAGTTTACTTGTGTTTCAGGATATGAAGTTTGTTGTTCTGTAGCCAACTCATGTTCTGTGTTTGGTTATCTCAGGACACATTGTTCTGTGTTTGGTTATCTCAAGTTTTCGCCTTCCTTAAGGAGTTCTTGGTAACTTGTGCTTCCACATTAGTTTACTTGTGTTCCAGGGAATGAAGTTTGGTGTTTTGTTTCTGGTTATATGTTTTTTTTTTGGCTTTTTTGTATTTCCATTCCTTAAGGACTTCTTGCTGACTTTTGGTTCTACATTAGTTTGCTTGTCTTGGTATCTCAAGCTTATGCTGTTCTGATTCTCTTCTTCTGTGTTGTGTATGTTTCAGTGTTTGGTAAATTTGAAGTTTTGAGTTTGAGTGTTATGAAGTCCGGTTTCATTTAGTGCCTTGTGTATTTCCGATTCCTTATAGATTTCTTGCTAACTTGTGCTTCCACGTTAGTTTGCTTGTGTGTCGGACTATCTTGCTATCCTTATGTTTCAGTTTTGTTTGCTTGTGTTGCAGGGAATGAAGTTTGTTGTTTCTGTGTTTGGTTACTTGAAGTTTTTGAGTTTATTGTTTATTTAGTCCAGTTTCATTTCCTTTTTTGCCTTGAGTAGTTCCGATTAGTTTACCTTGAGTTTCACGACATAAATTTGCAGGGAATGAAGTTTGTTGTTTCTGTGTTTGGTTATGTGAAGTTTTGAGTTCTAGTCTTATGGTCCGGTTTCATGTTTTGCCTTGTGTAATTCCTCATTAGTTTGCTTTGTGTTTCAGGAAATGAAGTTTGTTGTTGCGTGTCTTAAGTATCTCGAGCTTACTCCGGTTTAATTTTCCCTTCTTCCGTGTCGTGTGTTTCCAGTGTTTTCGAGGTTGAAGACAAGGGACCAAGAATGGTACTTCTACTGCGCGTTAGACAAGAAGTACGGCAACGGCGCTAGAATGAACCGATCCACCAACATAGGCTACTGGAAAGCCACCGGAAAAGACAGAGAAATCCGCCGCGGCGATCAGATCCTCGGTATGAAGAAGACGCTCGTTTTCCACAGCGGGCGTGCCCCGGATGGGCTCCGGACCAACTGGGTCATGCACGAGTATCGCCTTGTGGACTATGAAACCGAAAGCAACGGAAACTTGGTGGTATATAGTTTTATATCTGATACTGTTCCAAAAGAATCATCCTAAGTTAAACTTCCTTTTCTCATCTCAAGTCTTTGTTTGAATGCAGCAAGATGCATATGTGTTGGTCAAAGTGTTCCACAAGAAGAACATTGGACCACCAAGTGCGAACAGATATGCGCCGTTCATTGAAGAGGAGTGGGCTGATGATGGAGTAGTTAGAGTCAGGGCAGAGCCGTTACCAGTAGCCAATGGAAACAACCAGATGGGCCAGGTTTGTACTTCCTTCATTACCAAGAAGCTGCTTAGTTTCATATTTACTACTCCCTCCATTCTTAAATATAAGATGTTTTAGGTTAAAACACATATTAGTAAAGTTACATTTTATCTAAAAAGTTTCATTAAAATTATAAATTAAAAACTTGTCAATCAGTTAGAAAATAGACTAAAAAAATCCGATTGGACATATAGTTTTTGATCAAATTAAAAAATTACCTAGAAATATGAGCATCTTACATATTGAAATATCAAAAAAATTCTTTTAAACATCCTGTATTTTGGATAACGGAGGGAGTATTTTTTTATATGCAAAAACTATGTATTGAAACCATCTTTTTAAATGGTTCCAGTGGGCTGAGTGAGTTTATTTGAACTTGACTAGTCTATTTATGAACAACTCTTACTACTTGAATGATACTAAGTTCAAGTGTTAAAAATTTATCTGATGAATCATCTCTCTTGATTTGCAAAATATTAAAAAAAATTATATGTAAAAACTTTTAGCTGAAGGGAAGCTTGTCTAAGTACTGTTTTCAGTTGATGACTGAGTTCGTAGAATCTGGACTACATGAGCCTGTAACCAACACTTGTAGATCCTCTCTCGTTTGAACATATCATCCTTGTTTGAGAAGCACTTGCCACTTTGCATCATATGACGTCATTTAATTTGATCGGTGAATGCTCTTATCAGAAGGGCTTGTTGTGTGTGCACCTTCTTAAGTTCATATAACTTTGGTGATTTTTCTGTACCAGTCAGAAAGCAAGGAGCTTATTAACATCAACGAGACACCAAGAGAGTTTACTCCAATGGATATGGAAGTTAACCATCAGGAGAATGCTCTCAAGCCGCAGGAGAATAACAACAACAACAACAACCATTGTGATGAAGATGAGAAAGCACTCAAACGTGAGCACGCAGATGAGGTTGAGTGTCCTCCTCCTCCTCCGTTACCTCTCCTCCAATACAAACGCAGACGCCAAAACGAATCCAACAACAAAAACTCAAGCAGGACCACACCGGATTCGTCCACAACAACAACCTTAATCTCATCCTCTGCCGCTGCTGCTGCCACCAGCACAGCCATCTCTGCATTGCTTGAGTTCTCCCTCATGGATATCTCCGAGAAGAAACCTCTTCACAAGGAAGGTTCTCCTCCTACTCCACTTCCATCTCTTGAAGAGAATATGCTTAACGATCTCTATAAGGAGATTCACGAGATGTCTGTTGAGAGAGAGACTTTCAAGCTTGAGATGATGAGTGCAGAGGCTATGATCAGTATTCTCCAGTCCAGGATCGATGCACTTCGCCAGGAAAACGATGAGCTGAAGAAGAACAGCGACAAGGGACAAGGAACGCTCTAA
CDS Sequence
- >BnaA03G0319100ZS
ATGGATCGCGGTTCTGTGGCTGTTGAGTCCTTGCCGTCATCAGCGACTGCGCCGAGTACTGCCGTGGCGGCTACGGCGCTTGCTCCCGGGTTCCGATTTCATCCCACTGACGAGGAGCTCGTGAGCTATTACTTGAAGCGAAAGGTTCTGGGTAGACCAGTGCGGTTCGATGCGATTGGGGATGCCGATATCTACAAGTACGAGCCTTGGGACTTAGCAGTGTTTTCGAGGTTGAAGACAAGGGACCAAGAATGGTACTTCTACTGCGCGTTAGACAAGAAGTACGGCAACGGCGCTAGAATGAACCGATCCACCAACATAGGCTACTGGAAAGCCACCGGAAAAGACAGAGAAATCCGCCGCGGCGATCAGATCCTCGGTATGAAGAAGACGCTCGTTTTCCACAGCGGGCGTGCCCCGGATGGGCTCCGGACCAACTGGGTCATGCACGAGTATCGCCTTGTGGACTATGAAACCGAAAGCAACGGAAACTTGGTGCAAGATGCATATGTGTTGGTCAAAGTGTTCCACAAGAAGAACATTGGACCACCAAGTGCGAACAGATATGCGCCGTTCATTGAAGAGGAGTGGGCTGATGATGGAGTAGTTAGAGTCAGGGCAGAGCCGTTACCAGTAGCCAATGGAAACAACCAGATGGGCCAGTCAGAAAGCAAGGAGCTTATTAACATCAACGAGACACCAAGAGAGTTTACTCCAATGGATATGGAAGTTAACCATCAGGAGAATGCTCTCAAGCCGCAGGAGAATAACAACAACAACAACAACCATTGTGATGAAGATGAGAAAGCACTCAAACGTGAGCACGCAGATGAGGTTGAGTGTCCTCCTCCTCCTCCGTTACCTCTCCTCCAATACAAACGCAGACGCCAAAACGAATCCAACAACAAAAACTCAAGCAGGACCACACCGGATTCGTCCACAACAACAACCTTAATCTCATCCTCTGCCGCTGCTGCTGCCACCAGCACAGCCATCTCTGCATTGCTTGAGTTCTCCCTCATGGATATCTCCGAGAAGAAACCTCTTCACAAGGAAGGTTCTCCTCCTACTCCACTTCCATCTCTTGAAGAGAATATGCTTAACGATCTCTATAAGGAGATTCACGAGATGTCTGTTGAGAGAGAGACTTTCAAGCTTGAGATGATGAGTGCAGAGGCTATGATCAGTATTCTCCAGTCCAGGATCGATGCACTTCGCCAGGAAAACGATGAGCTGAAGAAGAACAGCGACAAGGGACAAGGAACGCTCTAA
Protein Sequence
- >BnaA03G0319100ZS
MDRGSVAVESLPSSATAPSTAVAATALAPGFRFHPTDEELVSYYLKRKVLGRPVRFDAIGDADIYKYEPWDLAVFSRLKTRDQEWYFYCALDKKYGNGARMNRSTNIGYWKATGKDREIRRGDQILGMKKTLVFHSGRAPDGLRTNWVMHEYRLVDYETESNGNLVQDAYVLVKVFHKKNIGPPSANRYAPFIEEEWADDGVVRVRAEPLPVANGNNQMGQSESKELININETPREFTPMDMEVNHQENALKPQENNNNNNNHCDEDEKALKREHADEVECPPPPPLPLLQYKRRRQNESNNKNSSRTTPDSSTTTTLISSSAAAAATSTAISALLEFSLMDISEKKPLHKEGSPPTPLPSLEENMLNDLYKEIHEMSVERETFKLEMMSAEAMISILQSRIDALRQENDELKKNSDKGQGTL