Information report for BnaA01G0099500ZS
Gene Details
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Functional Annotation
- Floral homeotic gene encoding a MADS domain transcription factor. Specifies floral meristem and carpel and stamen identity. Binds CArG box sequences. It is the only C function gene. It interacts genetically with the other homeotic genes to specify the floral organs.
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT4G18960.1
- Brassica oleracea: XP_013597293.1, XP_013597287.1, Bo1g020110, XP_013597309.1, XP_013597300.1, XP_013597282.1, XP_013626093.1, XP_013626092.1, XP_013626091.1
- Brassica rapa: XP_009132395.1, XP_009132380.1, Bra013364, XP_009132388.1, XP_009132372.1, XP_009132365.1, XP_009132356.1
- Raphanus raphanistrum: RrC152_p3
Gene Resources
- Pfam: PF01486 PF00319
- UniProt: A0A816XLW8
- RefSeq: XP_013668951.1
- EMBL: HG994355
- AlphaFoldDB: A0A816XLW8
- KEGG: bna:106373304
- OMA: KRETDLH
- InterPro: IPR002100 , IPR002487 , IPR033896 , IPR036879 , IPR050142
- PANTHER: PTHR48019
- SUPFAM: SSF55455
- PROSITE: PS00350 , PS50066 , PS51297
- Gene3D: 3.40.1810.10
- OrthoDB: A0A816XLW8
- SMR: A0A816XLW8
- CDD: cd00265
Sequences
gDNA Sequence
- >BnaA01G0099500ZS
TGGCTTACCAAATGGAGCTAGGAGGAGAATCCTCTCCACAAAGGAAAGCTGGGAGAGGAAAGATCGAAATAAAACGGATCGAGAACACAACGAACCGTCAAGTTACTTTCTGCAAACGCAGAAATGGTTTGCTCAAGAAAGCTTACGAACTCTCTGTTCTTTGTGATGCTGAAGTCGCACTCATTGTCTTCTCTAGCCGTGGCCGTCTCTATGAGTACTCAAACAACAGGTCTCTTCTTAATTAATTTCTGATCTTTTCTTAATTATAGTTTTTAATAGATTTATTACTTTAAATTGAGTCATCGTGTTAGGGTTATGTTAGAGGTCGAATCTGTACTAGGGTTCTCGATCTTATATGCTAGATTTGATTCTATTCTTCTTTGATGGGCGATCCCTCTTCCGTGTTGAGTTAATTATTTTTTCACTTTTTTCTTGATATTCCATATATAAACACACTTAACACTTGTGAGAATCTTTGTTGGCACATATGTTTATGTTAATTACTTTGCGACTTTATTCATAGATTTTGTGCTTAATTATTTTCTAGATCTGGCTTCTTCTTCATGTGTCTCTTTTCCCTTTATTAGACTAAAGACTTTTCAATAGGTAAAACTTGTTATATATTAAGTGATGAAAATGGTACAAAAGTTATGGAGATCTGAGTGAGTGTTAGATAATAAATGAAAAGAAAATAAGAAACAATCAGAGTTTTCTAATGTGGAGTTTTAGATTCAGTTTTGTAGAACTAAGATTCACTTTGTTGGGGTTTCTTTCATCACTCCTTTCTGTTATATATAATATATTATAACTTTCTATTTTCCCTACTAACAAGTACTCCAAGATTTAGATGTATTTTTAGATCTGGTGTTGTAATAGGTAAAATCTTGATTTTTATGACTATAAAAGTAAGTTTGGGGAAACAATTTGAGAGCGTAAGGACTATGAGGTCATATCTTCTGTTTTTGTGATCATATACCCATCCTCCATTGTTGCTAATGTCTGTGTCTCTCTTTCCCTTCTCTTCTTTCTCTTACTTTCCTTTCTCATCTTTGCCTCTTTTCTCTCTCATGAATTATCATATTTGATGCAACAACATGTGATGGTATGTGCGAGTAAATAAGGTGAAAGATATTGAGTGTCCAAAATTTTAAATTAATTAGTGCCAGAAATAATGGAAAGTACAAGTAGGACAATATGGTTTTTGTCTTGGTGAATGTTAAGTTTTATTTATTTTGCAGTTATGGAAAAATATCAAATATCTTTGAGCTTAGATTAGTTAGAAGTGGTTATAGCTAAAAGAAAACAAGTTTTTCAACTCCAAACAATACGAAATTTCGATTTTCAGTTGGAGTTTTAAGATTTAAAATAGACTGGCAGTCTCTAATCCCACACGTAATTCCCAATATTTGTTAGAATCCACGTGATTTTCTCTTCTCTCAAACATAAAACATGTCAAAAGTGAATGCTGTAAACAAAGTCTTGTTTTCCTAATAGCTTACAGTTGTCAACTCATGTCCAAAGAAAGAAAAGCTAACAAAGACTTCTAAGCTGAACGTACGTTTCATATATTCTTGTTTTCAAGATTTTTTACCTTTATTTAGAGGTTAGTATTGAGCGCAATATTAGGTTTGGTCTCTGTAAGATTTGTTGTCTTTGTTAGAGAATCTTTGATAACGTCATCCCTCAGATATTATTTACTTTTATTTATCACTTATATTTATTAGTAGTATATAAAGTTTTGATAGTTTCAGTTCTTGACTTCTGACAAGAAGGTTATGTCATCATGAATTACTTGATAAATTCGAAAATCTCATATTACTACTTTTGACCATTTAATACTAGATTTCACATTTGGTCAATACCTAATATAATTATCCCTCCTGAAGAAAGCCAAATCAGAATTCAATTCACATTATGTGTACATGTACACAAAGAGATAAATAATAAAAGGATATACTTAATATTGTTTCATAGTTCTACGAATCTTAAAAAAGATTAATGATCGCTGAATCAGTAACTTTGGTATAGAAGAAGCGCGTTGGCGTTGCTTCAACATCTTTGCTGTAGATACATTTGTGCAATTTCATTTTCTTTGTTTTTGAATTATTTTTTGGTCTAAGGAGAGAAAGTTAGGGCTTTTCTCATGTTCTTTCTCCTATGGGCAGAGAAAGTCTTTTGAATAAATAAATAAATAAAATGAAACTTTTTTGTGATGTCTTCTGTGATCCTATAATGAACGGCTATGGATTCTCCATCGAAGGGTCAGGCATCATAATTTATAATATGCCATTGTACTTAATAATATGTATATGTGTATGTATTAATGCATCTGTATACTTACAGAAGACTCAGAAAAAGATAAATGGGTCGAATAGTAATTGAATGATATTCCAAATAAGGAAAGTATGGAACGTTGTGATGTTACTCGGACAAGTCATTTAGTTACATCACAATTAAATTAATCCGATGGTTAACAACTATAAACTATCAAATGTCTACTGGATTTACCATTGTGCAATGGATTTTCGACACGTAGAAAACCCTAGACATGTTCAGACCAATCATGTCACTCAATTTCGCCAGCATGGAAGTTGTAGCCAATCACTAGCTCGATAAATTTAAGGTTTCAGTAAATGATTCTTTATTTGTTACAACTTTGAGGAATATTTAATCAACGGTAATTTATTTCTTGTATCTACTTTTTTCTTTACATCATGTCACGTTATGTTTCATTTTGTTCTGACTCAAAAGAACCGATGTTTGCTTTTAAGGTTTCGTATTAAAATCACTCAACTGAGCAAGTGGATGATTTGACCCTTAGTTATTCTTTCATATTTTTCGAATTGGTGACTTTAGTTTTGATTGTATAGTTAATACTAATTTTGCACCAAAAAAAAAAGTTAATACTAATCAACTTATTAATTCCATTGCAAAAATGTTGCAGTGTAAAAGGGACAATTGAGAGGTACAAGAAAGCAATATCGGATAATTCTAACACCGGATCCGTGGCAGAAATTAATGCACAGGTAACTTAATATTACAAGTACGATTTTAAGTTTCCAAAAACTTATGTGCTAATATAAATGCTAACACTTCCATACCTCACTCTTTTTCAAGTATTATCAACAAGAATCTGCCAAATTGCGTCAACAAATTATCAGCATACAGAACTCGAACAGGTTAATATCTTTTAAATGACTTGAGATGCTTTTTGATTAATTCATTAGTACGCTGGTATCAACTATCTCAGATATCAATACTTTTTGTAAAATTAATTAGGCAATTGATGGGTGAGACGATTGGGTCAATGTCTCCCAAAGAGCTCAGGAACTTGGAAGGCAGATTAGACAGAAGTGTTAATCGAATCCGATCCAAGAAGGTAACTGTATTTAATTAATTAATGCTTCAATGTCAATTCATTTACTAGGAAGTTTATATATTCACTTTTACTAATTTTTTTTTTTATAGAACGAACTCTTATTCGCCGAAATTGACTACATGCAGAAGAGAGTAAGAAACCATATTATATCTACTTTTCTTTCCATTGTTAATTTGTATTTATGGTAATTTGGCTCATTTGTAAAGTCTGTGCAGGAAGTTGATTTGCATAACGATAACCAGCTTCTTCGTGCTAAGGTATTTTGCACATTTGTCTGTTTTTGCGTATTATTTTATTATAACATCAACAAGATTATTGGAATGATTAAATACTAACCAAATACATGTGCGTAAATGTGTATATATATATATAGATAGCTGAAAATGAGAGGAACAATCCAAGTATGAGTCTGATGCCAGGAGGATCTAACTACGAGCAGATCATGCCACCGCCTCAAACGCAACCTCAACCGTTTGACTCACGGAACTATTTCCAAGTCGCGGCATTGCAACCTAACAATCACCATTACTCATCCGCAGGTCGCGAAGACCAAACCGCTCTTCAGTTAGTGTAA
CDS Sequence
- >BnaA01G0099500ZS
ATGGCTTACCAAATGGAGCTAGGAGGAGAATCCTCTCCACAAAGGAAAGCTGGGAGAGGAAAGATCGAAATAAAACGGATCGAGAACACAACGAACCGTCAAGTTACTTTCTGCAAACGCAGAAATGGTTTGCTCAAGAAAGCTTACGAACTCTCTGTTCTTTGTGATGCTGAAGTCGCACTCATTGTCTTCTCTAGCCGTGGCCGTCTCTATGAGTACTCAAACAACAGTGTAAAAGGGACAATTGAGAGGTACAAGAAAGCAATATCGGATAATTCTAACACCGGATCCGTGGCAGAAATTAATGCACAGTATTATCAACAAGAATCTGCCAAATTGCGTCAACAAATTATCAGCATACAGAACTCGAACAGGCAATTGATGGGTGAGACGATTGGGTCAATGTCTCCCAAAGAGCTCAGGAACTTGGAAGGCAGATTAGACAGAAGTGTTAATCGAATCCGATCCAAGAAGAACGAACTCTTATTCGCCGAAATTGACTACATGCAGAAGAGAGAAGTTGATTTGCATAACGATAACCAGCTTCTTCGTGCTAAGATAGCTGAAAATGAGAGGAACAATCCAAGTATGAGTCTGATGCCAGGAGGATCTAACTACGAGCAGATCATGCCACCGCCTCAAACGCAACCTCAACCGTTTGACTCACGGAACTATTTCCAAGTCGCGGCATTGCAACCTAACAATCACCATTACTCATCCGCAGGTCGCGAAGACCAAACCGCTCTTCAGTTAGTGTAA
Protein Sequence
- >BnaA01G0099500ZS
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