Information report for A04p016530.1_BraROA
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes snf1‐related kinase interactor 2 that interacts with HDR1 and phosphorylates Hd1
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT5G39440
- Brassica napus: GSBRNA2T00114336001, BnaA04G0107400ZS, GSBRNA2T00105035001
- Brassica oleracea: Bo4g138000, Bol040106
- Brassica rapa: Bra028245, Brara.D00959
Sequences
gDNA Sequence
- >A04p016530.1_BraROA
TGTGTTCATATGGTGTTTCAGATTTTCGTTTCTCTTTATCAATCAAGAATTTTTCCGATTTTGATCTTGAATTTTTATCTATTGCAGATTTCCCCAACAGTGAAATGAATGGATCATCGAGTCAAATTTCCAGTAAGAGGAAATCAGTTCTACCAACTTATAAGATTGGTAAAACTCTTGGACAAGGATCTTTTGCGAAAGTGAAATTAGCTGTGCATAAAACTACTGGACACAACGTTGCTATCAAAATCCTTAATCGTGAGAAGATTAAGCAGATGGGAATTGAAGCAAAAGGTATATAACTTCAGTATATCTAGAATAAAACTACAAGATTGTGGCAATCCTTCCATGGTAATCAATAGCTAATGTATGCTCTTGATAGTACAACTAGTTGGTATGGAATGTATACGAATCTTTCTCATACTCGATTTCGAAAACTGACCTGGAATGTGACTATGACATATAACCTAATTGATAGTTTGTGCTATTGTTGTCGATGTGTTACATATTCTACAAAAAAAAAAAGAATTAAGTTGAATGTCTTGGTATATGCATAAGATCACTTTTTCGTTTAATCTTCACTTTTTTTTTTTTTTTGACGTCGGTTTAATCTTCACTTATATATATACAAATTAGTGTTTCCAATATGTCGTTACCTATATTCGACAGACAAAATTTATACTATGTTTTTTAGGTACATAAGATCACTCTTTTATTGTTTCATATTTGTTTATACGTATGTTTTTTTATATACGCGGTACGTAAAACAACATAGTAGAAATTTTGTCTGTCGAATATAGGTAATGACATATCTTACGTACGTAAGATCAATCTTTTTCATTTAACCTTGATTAATGCATTCTTTAACCTTATAGTGGAGAGGGAGATCAAAATTATCAGATTGTTGATGCATCCTCATATCATCCGTCAATATGAAGTTATAGAGACACCAGAAGACATTTACGTTGTCATGGAGTATGTTAAGGCTGGCGAACTGTTTGACTATATTGTAGAGAAAGGTAAATTACATGAAGACGAGGCTCGCTATCTTTTTCAGCAGGTTAGTTTTTCTTTTAACTTTTTACGGTATTTTGCAAAATATATCTTACCTTCTTTGATTTCTAGTATTTTCTTAAAATCTTTTTCTTATTCAGATCATATCTGGTGTGGAGTATTGTCACCGCAATATGATCGCTCATCGAGATCTCAAACCGGAGAATATACTCATGGATTCGAAATTCAACATAAAGATTGCAGATTTTGGATTGAGTAATGTCATGCATGATGGTCACTTTTTGAAGACCAGTTGTGGAAGCCCTAACTATGCTGCTCCGGAGGTATATATCATTTGGAAAAACTAATAATCATTTCATTAAATTCAGTTTCTATATCAAGTTTCAATTAATGACATCCGAAAATTTGTTTTCATAGGTTATTTCAGGAAAACTGTATGCGGGACCAGAAGTGGATATTTGGAGCTGTGGAGTCATATTATACGCTCTACTATGCGGTAATCTTCCTTTCGATGACGAAAATATGCCTGGTCTATTCAGCAAAATCAAGGTATATTATCCAACGATCTTTCGCAAAATCATCTATTATACATGTTTAGCAGTCAAATATTTATGTTCTTTTTTTTCAGAAGGGAGAGTATATTCTTCCAGATCATTTATCGTACGCCGCTAGAGATTTGATACCGAGAATTCTTACGGTTGATCCTATGATGAGAATTAGCATTCCTGGGATTCGTCAACATCCTTGGTTCAGTAGTAAACTTCCCCCTTATCTTGCTGCTCCTCCATTGGATACTACAGAACAAGCTAGAGAGGTTAGAGCCCTTTTCATTTTATCGTAGCAAAATAATATCATTCGTATGAATTAGTGAAGTTCACATATATTTTTTTCCAGATTAATGAGGAGATCATTCGAGACGTGGTCAACCTAGGGTTTGTTGAAAAACACGTTAAGGAATCTCTTTTAAACAGAATCCAAAACGAGGTATAAAGTATTTTCTCAATAATTAGTTAGGTATGTTTATACCTTAAATAGTTTTAAAAAGATTACTGAGGCTTCATATTTCACTGTTTTAGGCAACCGTTGCATACTATCTGTTACTGGACAGTCGACGTCGTAGTCCCAGTGACTATTTCGAGTCCAATGTTAATAGGATTTCGGTATTAATTTGCTCTCTTTCTCTACAACATAAACTCTAAACGAATTAATAAAACTATATAATTAAAAAAACATGGATGTTTTTACCAAAAAAAGACATGGATGCAATAACACTACCAGTTACTCATTTGATCTTACCATTTGTTGTATTGGTCTCTAATAGCCTGTGTCGTAATTTCTTTTAGAGTTTTAATTCGACGATTCCAGCTCAAACGGTTGCTCCGTTTCCTGCATTGGTTAATCATCACCTCATGGCTGGACTAAGACCACGGGTTAGCGCTGATAAAAAATGGACCCTTGGACTTCAGGTCAGTCCATGGTTGTTGAACCTTTGTCATTAATTTGACTTTTCATTTATTTTATGGCTGGAAATTTAGGACAATTGATAATCGTGGAATCTCTCTCCATTATACTTTTTAATGTAACCTCTCTCTCCTCTATACAGACATTATACTTTTCGACTTAATCGTTTTTGTTTGTAGAATACAATTATATAATACTAAAATAACTTTTAGTGTGTACTACTTATCTAAACTGCTATAGTTTAGTTTGAATTGTTACAGCTTAACTAATATAGTATATTGAGTATGTTTTCATATATCTTTTATTTCTCACTTCCATCGTAAATACTTTTGGATTGCACATGTTGTTACTTTATAACTTTTACCAGTCAGAACTTAGGATTGCTGTAGTTTAAGTTTTGTTCTTTCTATGTTGACAGTCTCAAGCGCGTCCTAAGGACATCATGACTGCTGTTTTTAAGGCTCTTCAAGACCTTAAAGTGAGCTGGAAACAGATTGGAGAGTACAACATAAAATGCAGATGGGTTCACCAAAGTAGTATCTCCAAAGAGAAATCTAACATGATGGAAGCTGAACTTGCGATGATCTCACCAACCGTTCTCAAGTTTGAACTTCAGGTATATATACATGGTTTATCGAATAAAGTTAAATCGAAAATAATTTGTATCTTTTTGTGTTTATAGCTGTACAAAGCAGGTGAGGGAAAGTACGTGCTGGACATCCAGATAGCTGATGGACCTCAATTTCTCTTCTTGGACCTGTCCGTCTCTCTTCTCAGAGAGCTAAATGTGGTCTGA
CDS Sequence
- >A04p016530.1_BraROA
ATGTGTTCATATGGTGTTTCAGATTTTCGTTTCTCTTTATCAATCAAGAATTTTTCCGATTTTGATCTTGAATTTTTATCTATTGCAGATTTCCCCAACAGTGAAATGAATGGATCATCGAGTCAAATTTCCAGTAAGAGGAAATCAGTTCTACCAACTTATAAGATTGGTAAAACTCTTGGACAAGGATCTTTTGCGAAAGTGAAATTAGCTGTGCATAAAACTACTGGACACAACGTTGCTATCAAAATCCTTAATCGTGAGAAGATTAAGCAGATGGGAATTGAAGCAAAAGTGGAGAGGGAGATCAAAATTATCAGATTGTTGATGCATCCTCATATCATCCGTCAATATGAAGTTATAGAGACACCAGAAGACATTTACGTTGTCATGGAGTATGTTAAGGCTGGCGAACTGTTTGACTATATTGTAGAGAAAGGTAAATTACATGAAGACGAGGCTCGCTATCTTTTTCAGCAGATCATATCTGGTGTGGAGTATTGTCACCGCAATATGATCGCTCATCGAGATCTCAAACCGGAGAATATACTCATGGATTCGAAATTCAACATAAAGATTGCAGATTTTGGATTGAGTAATGTCATGCATGATGGTCACTTTTTGAAGACCAGTTGTGGAAGCCCTAACTATGCTGCTCCGGAGGTTATTTCAGGAAAACTGTATGCGGGACCAGAAGTGGATATTTGGAGCTGTGGAGTCATATTATACGCTCTACTATGCGGTAATCTTCCTTTCGATGACGAAAATATGCCTGGTCTATTCAGCAAAATCAAGAAGGGAGAGTATATTCTTCCAGATCATTTATCGTACGCCGCTAGAGATTTGATACCGAGAATTCTTACGGTTGATCCTATGATGAGAATTAGCATTCCTGGGATTCGTCAACATCCTTGGTTCAGTAGTAAACTTCCCCCTTATCTTGCTGCTCCTCCATTGGATACTACAGAACAAGCTAGAGAGATTAATGAGGAGATCATTCGAGACGTGGTCAACCTAGGGTTTGTTGAAAAACACGTTAAGGAATCTCTTTTAAACAGAATCCAAAACGAGGCAACCGTTGCATACTATCTGTTACTGGACAGTCGACGTCGTAGTCCCAGTGACTATTTCGAGTCCAATGTTAATAGGATTTCGAGTTTTAATTCGACGATTCCAGCTCAAACGGTTGCTCCGTTTCCTGCATTGGTTAATCATCACCTCATGGCTGGACTAAGACCACGGGTTAGCGCTGATAAAAAATGGACCCTTGGACTTCAGTCTCAAGCGCGTCCTAAGGACATCATGACTGCTGTTTTTAAGGCTCTTCAAGACCTTAAAGTGAGCTGGAAACAGATTGGAGAGTACAACATAAAATGCAGATGGGTTCACCAAAGTAGTATCTCCAAAGAGAAATCTAACATGATGGAAGCTGAACTTGCGATGATCTCACCAACCGTTCTCAAGTTTGAACTTCAGCTGTACAAAGCAGGTGAGGGAAAGTACGTGCTGGACATCCAGATAGCTGATGGACCTCAATTTCTCTTCTTGGACCTGTCCGTCTCTCTTCTCAGAGAGCTAAATGTGGTCTGA
Protein Sequence
- >A04p016530.1_BraROA
MCSYGVSDFRFSLSIKNFSDFDLEFLSIADFPNSEMNGSSSQISSKRKSVLPTYKIGKTLGQGSFAKVKLAVHKTTGHNVAIKILNREKIKQMGIEAKVEREIKIIRLLMHPHIIRQYEVIETPEDIYVVMEYVKAGELFDYIVEKGKLHEDEARYLFQQIISGVEYCHRNMIAHRDLKPENILMDSKFNIKIADFGLSNVMHDGHFLKTSCGSPNYAAPEVISGKLYAGPEVDIWSCGVILYALLCGNLPFDDENMPGLFSKIKKGEYILPDHLSYAARDLIPRILTVDPMMRISIPGIRQHPWFSSKLPPYLAAPPLDTTEQAREINEEIIRDVVNLGFVEKHVKESLLNRIQNEATVAYYLLLDSRRRSPSDYFESNVNRISSFNSTIPAQTVAPFPALVNHHLMAGLRPRVSADKKWTLGLQSQARPKDIMTAVFKALQDLKVSWKQIGEYNIKCRWVHQSSISKEKSNMMEAELAMISPTVLKFELQLYKAGEGKYVLDIQIADGPQFLFLDLSVSLLRELNVV