Gene Details:
- Gene ID: A04p016530.1_BraROA
- Suggest Gene Name: NA
- Description: putative flowering gene
- Species: Brassica rapa ro18
- Source: Putative flowering gene from PlantCFG
Protein Features:
Functional Descriptions:
- Encodes snf1‐related kinase interactor 2 that interacts with HDR1 and phosphorylates Hd1
Homologous
- Oryza sativa — LOC_Os08g37800
Sequences:
gDNA Sequence
- >A04p016530.1_BraROA
TGTGTTCATATGGTGTTTCAGATTTTCGTTTCTCTTTATCAATCAAGAATTTTTCCGATTTTGATCTTGAATTTTTATCTATTGCAGATTTCCCCAACAGTGAAATGAATGGATCATCGAGTCAAATTTCCAGTAAGAGGAAATCAGTTCTACCAACTTATAAGATTGGTAAAACTCTTGGACAAGGATCTTTTGCGAAAGTGAAATTAGCTGTGCATAAAACTACTGGACACAACGTTGCTATCAAAATCCTTAATCGTGAGAAGATTAAGCAGATGGGAATTGAAGCAAAAGGTATATAACTTCAGTATATCTAGAATAAAACTACAAGATTGTGGCAATCCTTCCATGGTAATCAATAGCTAATGTATGCTCTTGATAGTACAACTAGTTGGTATGGAATGTATACGAATCTTTCTCATACTCGATTTCGAAAACTGACCTGGAATGTGACTATGACATATAACCTAATTGATAGTTTGTGCTATTGTTGTCGATGTGTTACATATTCTACAAAAAAAAAAAGAATTAAGTTGAATGTCTTGGTATATGCATAAGATCACTTTTTCGTTTAATCTTCACTTTTTTTTTTTTTTTGACGTCGGTTTAATCTTCACTTATATATATACAAATTAGTGTTTCCAATATGTCGTTACCTATATTCGACAGACAAAATTTATACTATGTTTTTTAGGTACATAAGATCACTCTTTTATTGTTTCATATTTGTTTATACGTATGTTTTTTTATATACGCGGTACGTAAAACAACATAGTAGAAATTTTGTCTGTCGAATATAGGTAATGACATATCTTACGTACGTAAGATCAATCTTTTTCATTTAACCTTGATTAATGCATTCTTTAACCTTATAGTGGAGAGGGAGATCAAAATTATCAGATTGTTGATGCATCCTCATATCATCCGTCAATATGAAGTTATAGAGACACCAGAAGACATTTACGTTGTCATGGAGTATGTTAAGGCTGGCGAACTGTTTGACTATATTGTAGAGAAAGGTAAATTACATGAAGACGAGGCTCGCTATCTTTTTCAGCAGGTTAGTTTTTCTTTTAACTTTTTACGGTATTTTGCAAAATATATCTTACCTTCTTTGATTTCTAGTATTTTCTTAAAATCTTTTTCTTATTCAGATCATATCTGGTGTGGAGTATTGTCACCGCAATATGATCGCTCATCGAGATCTCAAACCGGAGAATATACTCATGGATTCGAAATTCAACATAAAGATTGCAGATTTTGGATTGAGTAATGTCATGCATGATGGTCACTTTTTGAAGACCAGTTGTGGAAGCCCTAACTATGCTGCTCCGGAGGTATATATCATTTGGAAAAACTAATAATCATTTCATTAAATTCAGTTTCTATATCAAGTTTCAATTAATGACATCCGAAAATTTGTTTTCATAGGTTATTTCAGGAAAACTGTATGCGGGACCAGAAGTGGATATTTGGAGCTGTGGAGTCATATTATACGCTCTACTATGCGGTAATCTTCCTTTCGATGACGAAAATATGCCTGGTCTATTCAGCAAAATCAAGGTATATTATCCAACGATCTTTCGCAAAATCATCTATTATACATGTTTAGCAGTCAAATATTTATGTTCTTTTTTTTCAGAAGGGAGAGTATATTCTTCCAGATCATTTATCGTACGCCGCTAGAGATTTGATACCGAGAATTCTTACGGTTGATCCTATGATGAGAATTAGCATTCCTGGGATTCGTCAACATCCTTGGTTCAGTAGTAAACTTCCCCCTTATCTTGCTGCTCCTCCATTGGATACTACAGAACAAGCTAGAGAGGTTAGAGCCCTTTTCATTTTATCGTAGCAAAATAATATCATTCGTATGAATTAGTGAAGTTCACATATATTTTTTTCCAGATTAATGAGGAGATCATTCGAGACGTGGTCAACCTAGGGTTTGTTGAAAAACACGTTAAGGAATCTCTTTTAAACAGAATCCAAAACGAGGTATAAAGTATTTTCTCAATAATTAGTTAGGTATGTTTATACCTTAAATAGTTTTAAAAAGATTACTGAGGCTTCATATTTCACTGTTTTAGGCAACCGTTGCATACTATCTGTTACTGGACAGTCGACGTCGTAGTCCCAGTGACTATTTCGAGTCCAATGTTAATAGGATTTCGGTATTAATTTGCTCTCTTTCTCTACAACATAAACTCTAAACGAATTAATAAAACTATATAATTAAAAAAACATGGATGTTTTTACCAAAAAAAGACATGGATGCAATAACACTACCAGTTACTCATTTGATCTTACCATTTGTTGTATTGGTCTCTAATAGCCTGTGTCGTAATTTCTTTTAGAGTTTTAATTCGACGATTCCAGCTCAAACGGTTGCTCCGTTTCCTGCATTGGTTAATCATCACCTCATGGCTGGACTAAGACCACGGGTTAGCGCTGATAAAAAATGGACCCTTGGACTTCAGGTCAGTCCATGGTTGTTGAACCTTTGTCATTAATTTGACTTTTCATTTATTTTATGGCTGGAAATTTAGGACAATTGATAATCGTGGAATCTCTCTCCATTATACTTTTTAATGTAACCTCTCTCTCCTCTATACAGACATTATACTTTTCGACTTAATCGTTTTTGTTTGTAGAATACAATTATATAATACTAAAATAACTTTTAGTGTGTACTACTTATCTAAACTGCTATAGTTTAGTTTGAATTGTTACAGCTTAACTAATATAGTATATTGAGTATGTTTTCATATATCTTTTATTTCTCACTTCCATCGTAAATACTTTTGGATTGCACATGTTGTTACTTTATAACTTTTACCAGTCAGAACTTAGGATTGCTGTAGTTTAAGTTTTGTTCTTTCTATGTTGACAGTCTCAAGCGCGTCCTAAGGACATCATGACTGCTGTTTTTAAGGCTCTTCAAGACCTTAAAGTGAGCTGGAAACAGATTGGAGAGTACAACATAAAATGCAGATGGGTTCACCAAAGTAGTATCTCCAAAGAGAAATCTAACATGATGGAAGCTGAACTTGCGATGATCTCACCAACCGTTCTCAAGTTTGAACTTCAGGTATATATACATGGTTTATCGAATAAAGTTAAATCGAAAATAATTTGTATCTTTTTGTGTTTATAGCTGTACAAAGCAGGTGAGGGAAAGTACGTGCTGGACATCCAGATAGCTGATGGACCTCAATTTCTCTTCTTGGACCTGTCCGTCTCTCTTCTCAGAGAGCTAAATGTGGTCTGA
CDS Sequence
- >A04p016530.1_BraROA
ATGTGTTCATATGGTGTTTCAGATTTTCGTTTCTCTTTATCAATCAAGAATTTTTCCGATTTTGATCTTGAATTTTTATCTATTGCAGATTTCCCCAACAGTGAAATGAATGGATCATCGAGTCAAATTTCCAGTAAGAGGAAATCAGTTCTACCAACTTATAAGATTGGTAAAACTCTTGGACAAGGATCTTTTGCGAAAGTGAAATTAGCTGTGCATAAAACTACTGGACACAACGTTGCTATCAAAATCCTTAATCGTGAGAAGATTAAGCAGATGGGAATTGAAGCAAAAGTGGAGAGGGAGATCAAAATTATCAGATTGTTGATGCATCCTCATATCATCCGTCAATATGAAGTTATAGAGACACCAGAAGACATTTACGTTGTCATGGAGTATGTTAAGGCTGGCGAACTGTTTGACTATATTGTAGAGAAAGGTAAATTACATGAAGACGAGGCTCGCTATCTTTTTCAGCAGATCATATCTGGTGTGGAGTATTGTCACCGCAATATGATCGCTCATCGAGATCTCAAACCGGAGAATATACTCATGGATTCGAAATTCAACATAAAGATTGCAGATTTTGGATTGAGTAATGTCATGCATGATGGTCACTTTTTGAAGACCAGTTGTGGAAGCCCTAACTATGCTGCTCCGGAGGTTATTTCAGGAAAACTGTATGCGGGACCAGAAGTGGATATTTGGAGCTGTGGAGTCATATTATACGCTCTACTATGCGGTAATCTTCCTTTCGATGACGAAAATATGCCTGGTCTATTCAGCAAAATCAAGAAGGGAGAGTATATTCTTCCAGATCATTTATCGTACGCCGCTAGAGATTTGATACCGAGAATTCTTACGGTTGATCCTATGATGAGAATTAGCATTCCTGGGATTCGTCAACATCCTTGGTTCAGTAGTAAACTTCCCCCTTATCTTGCTGCTCCTCCATTGGATACTACAGAACAAGCTAGAGAGATTAATGAGGAGATCATTCGAGACGTGGTCAACCTAGGGTTTGTTGAAAAACACGTTAAGGAATCTCTTTTAAACAGAATCCAAAACGAGGCAACCGTTGCATACTATCTGTTACTGGACAGTCGACGTCGTAGTCCCAGTGACTATTTCGAGTCCAATGTTAATAGGATTTCGAGTTTTAATTCGACGATTCCAGCTCAAACGGTTGCTCCGTTTCCTGCATTGGTTAATCATCACCTCATGGCTGGACTAAGACCACGGGTTAGCGCTGATAAAAAATGGACCCTTGGACTTCAGTCTCAAGCGCGTCCTAAGGACATCATGACTGCTGTTTTTAAGGCTCTTCAAGACCTTAAAGTGAGCTGGAAACAGATTGGAGAGTACAACATAAAATGCAGATGGGTTCACCAAAGTAGTATCTCCAAAGAGAAATCTAACATGATGGAAGCTGAACTTGCGATGATCTCACCAACCGTTCTCAAGTTTGAACTTCAGCTGTACAAAGCAGGTGAGGGAAAGTACGTGCTGGACATCCAGATAGCTGATGGACCTCAATTTCTCTTCTTGGACCTGTCCGTCTCTCTTCTCAGAGAGCTAAATGTGGTCTGA
Protein Sequence
- >A04p016530.1_BraROA
MCSYGVSDFRFSLSIKNFSDFDLEFLSIADFPNSEMNGSSSQISSKRKSVLPTYKIGKTLGQGSFAKVKLAVHKTTGHNVAIKILNREKIKQMGIEAKVEREIKIIRLLMHPHIIRQYEVIETPEDIYVVMEYVKAGELFDYIVEKGKLHEDEARYLFQQIISGVEYCHRNMIAHRDLKPENILMDSKFNIKIADFGLSNVMHDGHFLKTSCGSPNYAAPEVISGKLYAGPEVDIWSCGVILYALLCGNLPFDDENMPGLFSKIKKGEYILPDHLSYAARDLIPRILTVDPMMRISIPGIRQHPWFSSKLPPYLAAPPLDTTEQAREINEEIIRDVVNLGFVEKHVKESLLNRIQNEATVAYYLLLDSRRRSPSDYFESNVNRISSFNSTIPAQTVAPFPALVNHHLMAGLRPRVSADKKWTLGLQSQARPKDIMTAVFKALQDLKVSWKQIGEYNIKCRWVHQSSISKEKSNMMEAELAMISPTVLKFELQLYKAGEGKYVLDIQIADGPQFLFLDLSVSLLRELNVV