Information report for A04p003920.1_BraROA
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Encodes a protein that is found in not only the eif3 complex but also in association with subunits of the COP9 signalosome. eIF3e appears to be subjected to proteasome-dependent degradation that requires the PCI domain of eIF3e. The level of eIF3e present in cells appears to affect the rate of translation.
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc03957
- Brassica napus: BnaA04G0029800ZS, BnaC04G0300300ZS, BnaA09G0527800ZS, BnaC08G0371800ZS
- Brassica oleracea: Bo4g111270, Bo8g091700
- Brassica rapa: Bra014633, Bra007317
- Manihot esculenta: MANES_S071800
- Nicotiana attenuata: A4A49_07609
- Prunus avium: Pav_sc0000096.1_g180.1.mk
- Saccharum spontaneum: Sspon.02G0040990-1B
Sequences
gDNA Sequence
- >A04p003920.1_BraROA
TGGAGGAAACCAAAGAGAACTACGACCTAACCCCTCGAGTAGCTCCCAACCTAGACCGTCACCTGGTGTTCCCCATCCTCGAGTTCCTCCAAGAGCGTCAGCTCTACCCCGATGAGCAGATCCTCAAGTTCAAGATCGAGCTTTTGAACAAGACCAACATGGTTGATTACGCCATGGACATCCACAAGAGTCTTTACCACACCGAAGACGCTCCCCAAGGTAGTATAATAACGTCTGTGGAAAGTTTGCGTTTTTACGGCTTGTTTGGTTGGTTGGTTGATGAGTGTTGTGGTTTGTTTGATAGATATGGTGGAGAGGAGAGCTGAGGTTGTGGCGAGGCTTAAGTCTCTGGAGGAGGCGGCTGCACCGCTTGTGACGTTCCTTTTGAACCCTAATGCTGTTCAGGAGCTGAGGGCTGATAAGCAGTACAATCTCCAGATGCTCAAGGAATGCTACCAGGTTGTGTTTGGTTTGCATTTAGTATCGAAAGACTTGATTTTTTATGTGTTGTTTTGATCAGATTGGTCCAGACAAGATACAGTTGTGGTTTTGTCTTATTTTGTGTTGTTTGGTTTGCATTTAGTATTGAAAGACTTGATTTTTATGAGTAATGTTTGATCAGATTGGTCCAGGCCAGATAGAGTTGTGATTTTGGCTGTTAAAGTTGACATCTTTTGTCTGATGTTGTCTTGTTTGGTTTGCATTTCGTATGAAAGACTTGATTTTTATGTGTAATGTTTAATCAGATTGGTCCAGACCAGATAGAGTTATGATTTTGGCTGATAAAGTTAACATCTTTTGTGTTGTTTGATTTGCATAAAGACTCAGTTTTTATGTGTAATGTTCTTACCAGATTGGTCCAGACCAGATAGAGTTGTAATTTTCTCTTATTTTGTGTTGTTTGGTTTGCATTTTGTATTGAAAGACTCAATTTTTATGTGTAATGTTTGATCAGATTGGTCCGGACCAGATAAGAGTAGTGATTTCCTGTTGACATCTTTTGTGTTGTTTGATTTGCATGAACTCACTTTCACTATGTAATGTTCTTTATCAGATTGGTCCAGACCAGATAGAGGCTTTGTATCAGTACGCTAAGTTTCAGTTTGAATGTGGAAACTACTCTGGTGCAGCTGATTACCTTTACCAGTACAGGACACTTTGCTCTAACCTTGAGAGAAGTCTTAGCGCCTTGTGGGGAAAGCTCGCTTCTGAGATTCTGATGCAGAACTGGGACATTGCACTTGAAGAGCTTAACCGTGTTAAAGAAATTATCGACTCTAAGGTCTCCTTTTCAAGTTTCTTCTAGCTTTTGTTATAGCCTTTGAGAAACTAATTAGCGTTTTGGTGTTTCAGAGCTTTGCCTCGCCGTTAAACCAGGTGCAGAACAGGATTTGGTTGATGCATTGGGGTCTCTACATCTTCTTTAACCATGATAACGGAAGGACACAGATCATTGATCTTTTTATCCAGGACAAGTAAGTTTAAACCTCTCTGTTATCAGCTTTTCTAGCGCTATTCCTTAATACAGTTTTGTAGAAATTCCTTTCTCTTGTATATCAACTGAAACCAATCTATGCTTCCCCTTTTAATTGTTGTCCATCTAAGTTAGTTTTAGCTGAATTTGACATGGAAGATTGCTTTAATGTGCATGAGTGCATCACATATTTTAGGAATATAATTAAAAAATGTTACCAATCATGAATTATTTTTAATTTCTTGAGTTAATGTCTGAGTTACAGGTTTGAATTATTCCTTTAGAAAATCTGATAACTCCATTGTTAAGTTAACATCCAACAAATGTTTTTGGTTTTTGTTATTATGTATTAGAAGTTGCATTAGTAATTTAGTACTTTTGGTTTTTGTTAGTTATCTAACGTTATTTTTTGATTTTTAACAAGTTTAAAATTTTAATACATCTATGATTGTCTTAGTCCCAATAGAAGCTTGATCTGAGTGGATGCATTGGTGGTGGTTTGTGTATGAAACAATTTTTTGGAGTCAAAGTTAGTCTTGATGTATAATAAGTGAGAGTGTTTTCATTCTTTATGTCCGGACCATTCTGTTAGGATTGTGCTTTTAGTTTATGCAGTATTGCATTCTAATATTATATATATTATTAGGTATATGAATGCCATACAAACTAGTGCCCCACACTTGCTGCGTTACTTGGCAACTGCTTTCATTGTCAACAAAAGAAGAAGGCCTCAACTGAAAGAATTCATCAAGGTCGTTCAACAAGAACACTACTCCTACAAAGATCCCATTGTGGAGTTCCTGGCATGTGTCTTTGTCAATTATGACTTTGACGGAGCTCAAAAGAAGATGAAAGAGTGTGAAGAGGTAAAGCCATTTACATGTGGTGTAGGATAATATAATCAATAGTCTGACATGTTACTACGATGTATTAGGTGATTGTGAATGATCCATTCCTTGGAAAGCGAGTTGATGATGGAAACTTTTCAACTGTGCCACTGAAAGATGAGTTTCTTGAAAATGCCCGCCTCTTTATCTTCGAAACCTATTGCAGAATTCATCAGAGAATTGACATGGGGTAAGTTATCATCATGTTTTGTTTAATTGTATTCGTTTTCACCTCTCAATATAATGAGAATCTCATGGCCTTGTCAGGGTGCTTGCTGAGAAGCTGAATCTGAACTATGAGGAGGCAGAGAGATGGATTGTGAACCTTATCCGTACCTCAAAGCTTGATGCCAAGATTGATTCCGAGTCTGGAACCGTAATCATGGAGCCTACTCAGCCCAACGTGTAAGGAGAATACAATATTTTCGTAAGACAAATGTTTTGGAGATTCTACAATCTAAACTATGTTTCCAACGTAATGCAGGCATGAGCAGTTGGTTAATCACACCAAAGCCTTATCAGGAAGGACTTACAAGTTAGTGACTCAGCTCTTAGAACACTCACAGGGGCAAGCAGCTCGGTAA
CDS Sequence
- >A04p003920.1_BraROA
ATGGAGGAAACCAAAGAGAACTACGACCTAACCCCTCGAGTAGCTCCCAACCTAGACCGTCACCTGGTGTTCCCCATCCTCGAGTTCCTCCAAGAGCGTCAGCTCTACCCCGATGAGCAGATCCTCAAGTTCAAGATCGAGCTTTTGAACAAGACCAACATGGTTGATTACGCCATGGACATCCACAAGAGTCTTTACCACACCGAAGACGCTCCCCAAGATATGGTGGAGAGGAGAGCTGAGGTTGTGGCGAGGCTTAAGTCTCTGGAGGAGGCGGCTGCACCGCTTGTGACGTTCCTTTTGAACCCTAATGCTGTTCAGGAGCTGAGGGCTGATAAGCAGTACAATCTCCAGATGCTCAAGGAATGCTACCAGAGCTTTGCCTCGCCGTTAAACCAGGTGCAGAACAGGATTTGGTTGATGCATTGGGGTCTCTACATCTTCTTTAACCATGATAACGGAAGGACACAGATCATTGATCTTTTTATCCAGGACAAGTATATGAATGCCATACAAACTAGTGCCCCACACTTGCTGCGTTACTTGGCAACTGCTTTCATTGTCAACAAAAGAAGAAGGCCTCAACTGAAAGAATTCATCAAGGTCGTTCAACAAGAACACTACTCCTACAAAGATCCCATTGTGGAGTTCCTGGCATGTGTCTTTGTCAATTATGACTTTGACGGAGCTCAAAAGAAGATGAAAGAGGTGCTTGCTGAGAAGCTGAATCTGAACTATGAGGAGGCAGAGAGATGGATTGTGAACCTTATCCGTACCTCAAAGCTTGATGCCAAGATTGATTCCGAGTCTGGAACCGTAATCATGGAGCCTACTCAGCCCAACGTGCATGAGCAGTTGGTTAATCACACCAAAGCCTTATCAGGAAGGACTTACAAGTTAGTGACTCAGCTCTTAGAACACTCACAGGGGCAAGCAGCTCGGTAA
Protein Sequence
- >A04p003920.1_BraROA
MEETKENYDLTPRVAPNLDRHLVFPILEFLQERQLYPDEQILKFKIELLNKTNMVDYAMDIHKSLYHTEDAPQDMVERRAEVVARLKSLEEAAAPLVTFLLNPNAVQELRADKQYNLQMLKECYQSFASPLNQVQNRIWLMHWGLYIFFNHDNGRTQIIDLFIQDKYMNAIQTSAPHLLRYLATAFIVNKRRRPQLKEFIKVVQQEHYSYKDPIVEFLACVFVNYDFDGAQKKMKEVLAEKLNLNYEEAERWIVNLIRTSKLDAKIDSESGTVIMEPTQPNVHEQLVNHTKALSGRTYKLVTQLLEHSQGQAAR