Information report for A03p038680.1_BraROA
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Encodes a NAC transcription factor that physically associates with the histone H3K4 demethylase JMJ14 and through that association is involved in transcriptional repression and flowering time control.
Homologous
- Brassica napus: BnaA03G0319000ZS, GSBRNA2T00110506001, BnaC03G0382600ZS, GSBRNA2T00111649001, BnaA03G0319100ZS, GSBRNA2T00111648001, GSBRNA2T00110507001, GSBRNA2T00000394001, BnaA05G0449300ZS, GSBRNA2T00110954001, BnaC05G0496400ZS, BnaC03G0382700ZS
- Brassica oleracea: XP_013623093.1, Bo3g062700, XP_013622519.1, Bo3g062710, XP_013622520.1, XP_013586773.1, Bo5g137360
- Brassica rapa: XP_009135111.1, Bra001365, XP_009135113.1, XP_009135112.1, Bra001366, XP_009146835.1
- Raphanus raphanistrum: RrC1756_p2
Gene Resources
- Pfam: PF02365
Sequences
gDNA Sequence
- >A03p038680.1_BraROA
TGGGTCGCGAATCAGTGTCTGCTGTGTCTTCTCCGCCGACGACGACGGCCACTGCGGTGGCGACGGCGCTTGCTCCTGGGTTTCGATTTCACCCGACTGACGACGAGCTAGTGAGCTATTACTTGAAGCGGAAGGTTCTGGGTAAGCCTGTGCGATTCGATGCGATTGGGGATGTGGATATCTACAAGCATGAGCCGTGGGAATTGGCAGGTTCGATGGGTTTCTCTCTAAATGTCTCTTCTGTTTTGGGTATTGTGTGATTTAGGGTTTTATCTGTGAGACATTGGGGTTTGCTGATTCTGATTTGGGATTTTTTACGTCTTCTTACTTAGTTTAGGAGAAAGGTTTAGTTTTTTTTTTGTGGGCTTTGATTCATTTTCTGTGAGAATTTTGTTGATGTTTCTCTGTTAGTACATTTTATTATGTTTAGGCTGTAACACTGTAAAAAGTCTAGTTTTTTTTTCTTGCCGCTTGTGCTTCAGTTTGGTTTGCTTGTGTTTCAGGGAATGAAGTTTGTTGTTCTGTATTTCGTTATATGAAAGCTTTGAGTTTTAGCTTTATTAAGTCCGGTTTCATTTTTTGTCTTCTGGTGTGATGTATTTCCGATTCCTTGTGCTTGTGCTCCCGCTCTAGTTTGCTTGTGTATAAGGGCTTAAAGTTTGTTGCTGCATGTGTTGGGTATCTCAAAGTTTAGTGGTTATTATGTCTGGCTTGATTTTTATCTTCTGGTGTGTTGTGTGTGTTTCCATAAGAAGCATCTGACAAGCTGACTCAAGTGATGGTGTTTCAAGTGAAAAGTCTAGTTTTTTTTTTTTCGGATTCCTTAAGAGTTTCTTGCCATCTTGTGCCTTAGTTTAGTTTGCTTGTATTTTTAGGGAATGATGTTTGTTGTTCTGTGTTTGGTTATCTCAAGTTTTGAGCTTTAGTGTTAATAAGTCAAGTTTCAGTTTTTTCTGCCTTCTGGTGTGAACTTTTGCTTCCACATTAGTTTGCTTGTGTTTCAGCACATGAAGGTTATCGTTGTGTGTCTTGGAATCTGAAGTTCAGTGCTATTATGTCTGCTTGAATATCTCTTTTGCTTTGTTGTGTATGTTTCAGTGTTTTCGTGGCTGAAGACAAGGGACCAGGAATGGTACTTCTACTGCGCGTTAGACAAGAAGTACGGCAACGGCGCTAGGATGAACCGAGCCACCAACAAAGGCTACTGGAAAGCAACTGGCAAAGACAGAGAAATCCGCAGTGACGTTCAGATCCTCGGTATGAAAAAGACACTCGTTTTCCACAGCGGGCGTGCTCCGGATGGGCTCCGGACCAATTGGGTCATGCATGAGTATCGCCTTGTGGACTATGAGACCGAAAACAACGGAAACCCGGTGGTATGCACATTTTTAAAAAGATTTTAACTTTTGAATAAGCTTTTATCTGATACTGTCTAAGTAAGGGACCCTATCTCATCTCAATTGTTTGTTTGTTTGAATGCAGCAAGATGCATATGTGTTGTGCAGAATATTCCACAAGAATAACATTGGGCCACCATGTGGGAACAGATACGCGCCGTTCATGGAAGAGGAATGGGACGGTGATGGAGCAGCTCTGATTCCAGGAGTAAACGTTAGTGTCAGGGTAGAGCCAGTGCCAGTAGCCAATGGAAACATTCAGATGGATCAGGTTTGTATACTTCCTCCATAACCACTAACCTGCTTAGTTTCATTTCATTATTTGTTATATGCAAAAACCTCTGTGTTGGAAGTGAATCACCTTCCCTTAATTTGCAATATATCATAATGTTTCTTATTTGCAAAAACTGTATGATGAAATGAAGCTGCTCTAGTCCTGTTTGGACTAATCATTAACCTCATTTTATTGTGGTAATCCAGTCAGAAAGCAAGGGCCTCATTAACATCAACGAGGCACCAAGAGAGGCTACTCCAATGGATATCGAAGTTAATCATCAGGAGACTGCCCTCAAGCCGCATGAGAATAACAATGATGAAGATGAGAAAGCACTCAGACGTGAGAATGCAGATAAGGATGAAGGTCCTCCTGCCGTGTGCGTTCTCAACAAAGAAGCTCCGTTACCTCTCATCCAATACAAACGCAGACGCCAAAACGAGTCTAGCAACAACAACTCAAGCAGGACCGCTGAGGATTACTGCTCGTCCACAACAACAACCGTCGACAACACACCAACCTTAGTCTCATCGTCTACTGCTGCTGCTGCCACCAACAGCGCCATCTCTGCATTGCTTGAGTTCTCTCTCATGGGTATCTCCAAGAAGAAAGAAAACCTTCTACGTCCTCACAAGGAAGCTACACTTGAGGAGAAGCTTAATGATCTCCAGAAGGAGAGTAAGCAGATGTCTGATGAGAGAAAAAGTTTCAAGCTCGAGATGATGGGTGCAGAGGCTATGATCAGTATTCTCCAGTCGAGGATCGATGCACTGCGCCAGGAGAACGATGAGCTGAAGAAGAACAACAACAGCGCCAATGGACACTAATTTTATTCTTCTTTGCCGTTTTAGCTGTTTAATTTCCGTAATATTAGGAGTTATCTATGTAGCTTCTTCAGATGGATTGAGAACTTTGTTAGGTGTTTATTTTTCTTTCTGATGTTTCTACATCTTTTGAGAACATTCTAAGGTTACTCCATTGTAATATACTATCATCTAGTCTTTTCAGTCAAGAACTCTTTTAATCTGTCTCAAGGAATGTTCAACCTCTCCATAGTAGGGAACTTCATTGGGTTTTATATTTAGCGAATCTGGATTGAGTTTATAAGCGTACACGTTTTGAATTATCATATGGTCTTCGTTGGTTAATATACTAAAATTTGAATGTTCTTCTCGTCTTCTCATAATTTTCAGATTATATTTTTCCTTGCTTTCTCTTTTGATTCGATATGAAAACTCTTTGCTGCATTAAGGAGAAAAATCCTCATTAATTTATAGACTAGGTGGTGGTTGCCAGGGGTGGACTAGTACTTGGTCTGGCTAGCCATGGTGGTTCATTTTACTGTCTAGCTTTATACTCTTTATCAACTTCTAGATTATCATAGTGAAAATGTATTTAGAAATGGTTGTAAAATCAAATTGGGTGGATTTTTTTTTCATTTTAGACCATGTCGTAGGGTATACGTATCCTGTCTATGTTTAACTTTTCTTTATCATTTATGAGTTTGTGTGTTCTAGCAGACTAGTAGAATGATTGTACCATTTTTGAATGTGTGGAGCCTTGTTCTTCTCGTTTTTGATCTCTAGAGTTAAAAAAAACAAAGTTTAACTTTTTTTACCACAACGAAACGACGGCGTTTTATTCATTTTACTACATAATACGACAAAACTTGCTCAGTAAGATTTGATCGCTGGGGGTTTTATTACTGGACACACTTTAAAACAGAGAAAAAAGCAAAACTGGAATCGCAATCCGAAGACAACTTGTTGTCTAGCCTTCTGGGAAACGCAAAAAAAAGAGAAGAAAAATTAATTTCTTGCAATTGAAGGTACCTTTAATCTTCGCCGTCTCTCTTTGGTTCCTTCTCCGTCAAATCGAAAACCCATCTCCCAACTTCCTTTGTCTGTTCGTCTACCGTGGTCTGTAGAGCGAGAGATTTAGAACAAACCCTAGTAACAAAGTTTGGTCTTTTGCTTTAATGGATCGCGGTTCTGTGGCTGTTGAGTCCTCGCCGTCTACAACGACTGCGCCGAGTACTGCCGTGGCGGCGACGGCGCTGGCTCCCGGGTTCCGATTTCATCCCACTGACGAGGAGCTCGTGAGCTATTACTTGAAGCGAAAGGTTCTGGGTAGACCAGTGCGGTTCGATGCGATTGGGGATGCCGATATCTACAAGTACGAGCCTTGGGACTTAGCAGGTTCGTTGGGCTTCCTCTGTCTCTTCGTTTCTTTGAGACGTGTGAATTTGCTGATTCTGATTTGAGTGGCCATGGCCTCTTTGGTAACTCAATTCTGGAGAAAAAAGAGTTTAGCCTTGATTCATTTTCTTGGGAATTTCGATGCAGATTTATCATTTGCTATGTTTAGGCTGTAACACTGTGAAAAAGTTTTCATCTTGTCGACTTTTAAATGGGAAAGATCTAGACTTTTTACTTGATTCCTTAAGATTTTTTTTGTTTGTTGCTATTTTGTGCTTGAGTTTTGTTTGCTTGTGTTGCAGGGAACGAAGTTTGGTTACTTGAAGTTTTGAGTTTAATGTTACTAAATCCGGTTTCAGGCTTTGTCTTTGTGTGTGTATCTGATTCCTTAAGGATTTTTTTTGCTACCTTGTGCTTCCACATTAGTTTGCTTGTGTTTCAGGACATGAAGTTTGTTGTTCTGTGTTTGGTTATCTCATGTTTTGAGTTTAGTATTACTTTGTCCAGTTTCAAATGTTCGCCTTGTGTACTTTTAATTCCTTAAGGGGTTCTTGCTAACTTGTGCTTCCACATTAGTTTACTTGTGTTCCAGGGAATGAAGTTTGGTGTTTTGTTTTTGGTTATATGAAGTTTTGAGTTGGAGTGTTACGAAGTCCGGTTTCATTTAGTGCCTTGTGTATTTCCGATTCCTTGTAGATTTCTTGCTAACTTGTGCTTCCACGTTAGTTTGCTTGTGTGTCGGACTATCTTGCTATCTTATGTTTCAGTTTTGTTTCCTTGTGTTGCAGGGAATGACGTTTGTTGTTTCTGTGTTTGGTTACTTGAAGTTTTTGAGTTTATTGTTTATTTAGTCCAGTTTTATTTCCTTTTTTGCCTTGAGTAATTCCGATTAGTTTACCTTGAGTTTCACGACATAAAGTTAGTTTACTTGTGTTTCATGACATAAATTTGCTCAGGGAATGAAGTTTTGAGTTTCAGTCTTATTGTCCGGTTTCATGTTTTGCCTTGTGTAATTCCTCATTAGTTTGCTTGTGTTTCAGGACATGAAGTTTGTTGAAGTATGTCAAGCTTACTCCGGTCTAATTTTATCTTCTTCTATGTTGTATGTATGTTTCCAGTGTTTTCGAGGTTGAAGACAAGGGACCAAGAATGGTACTTCTACTGCGCGTTAGACAAGAAGTACGGCAACGGCGCTAGAATGAACCGATCCACCAACATAGGCTACTGGAAAGCCACCGGAAAAGACAGAGAGATCCGCCGCGCCGATCAGATCCTCGGTATGAAGAAGACGCTCGTTTTCCACAGCGGGCGTGCCCCGGACGGGCTCCGGACCAACTGGGTCATGCACGAGTATCGCCTTGTGGACTATGAAACCGAAAGCAACGGAAACTTGGTGGTATATAGTTTTATATCTGATACTGTTCCAAAAGAATCATCCTAAGTTAAACTTCCTTTTCTCATCTCAAGTCTTTGTTTGAATGCAGCAAGATGCATATGTGTTGGTCAAAGTGTTCCACAAGAAGAACATTGGACCACCAAGTGCGAACAGATATGCGCCGTTCATTGAAGAGGAGTGGGCTGATGATGGAGTAGTTAGAGTCAGGGCAGAGCCGTTACCAGTAGCCAATGGAAACAACCAGATGGGCCAGGTTTGTACTTCCTTCACTACCAAGAAGCTGCTTAGTTTCATATTTAGTACTCCCTCCGTTCTTAAGTATAAGATGTTGTAGGTAAAAACGCATATTAGTAAAGTTACTTTTTGTTGCTCCAAAAAAAAGAAAGTTTGATTAAAACTATAAAAAACTAGTCAATCAATTACAAAATAGACTAAAAAATATGATTGGATATATAGTTTTTGATAAAATTAAAAAATTTACCTAGAAATATGAGCATCTTACATAGTGAAATATCAAAAAAAAAATCTTTTAAACATCCTGTATTTTGGATAACGGAGGGAGTATTTTTTTATATGCAAAAGCTATGTGTTGAAACCATCTTTTAAATGGTTCCAGTGGGCTGAGCGAGTTTATTTGAACTTGACTACTCTACTTGAATGATACTAAGTTCAAGTGTTAAAAATTTATCTGATGAATCATCTCTCTTGATTTGCAAAATATTAAAAAAATTTATATGTAAAAACTTTTAGCTGAAGGGAAGCTAGTCTAAGTACTGTTTTCAGTTGATGGCTGAGTTCGTAGAATCTGGACTACATGAGCCTGTAACCAACACTTGTAGATCCTCTCTCGTTTGAACATATCATCCTTGTTTGAGAAGCACTTGCCACTTTGCATCATATGAAGTCATTTGATTTGATCGGTGAATGCTCTTATCAGAAGGACTACTTGTGTTATTTACTACTAGGCTTAATCTGTAAAGTTGACAAAAGCATTTGGTTTCAGATCTTTTGTGTGTGCACCTTCTTAAGTTCATATAACTTTTGTGATTTTTCTGTACCAGTCAGAAAGCAAGGAGCTTATTAACATCAACGAGACACCAAGAGAGGCTACTCCAATGGATATGGAAGTTAACCATCAGGAGAATGCTCTCAAGCCGCAGGAGAATAACAACAACAACAATAACAATTGTGATGAAGATGAGAAAGCACTCAAACGTGAGCACGCAGATGAGGTTGAGCGTCCTCCTCCTCCTCCGTTACCTCTCCTCCAATACAAACGCAGACGCCAAAACGAATCCAACAACAAAAACTCAAGCAGGACCACACCGGAGTCGTCCACAACAACAACCTTAATATCATCATCTGCTGCTGCCACCAGCACCGCCATCTCTGCATTGCTTGAGTTCTCCCTCATGGACATCTCCGAGAAGAAACCTCTTCACAAGGAAGGTTCTCCTCCTACTCCACTTCCATCTCTTGAAGAGAAGATGCTTAACGATCTCTATAAGGAGATTCACGAGATGTCTGTTGAGAGAGAGACTTTCAAGCTTGAGATGATGAGTGCAGAGGCTATGATCAGTATTCTCCAGTCCAGGATCGATGCACTTCGCCAGGAAAACGATGAGCTGAAGAAGAACAGCGACAAGGGACAAGGAACGCTCTAA
CDS Sequence
- >A03p038680.1_BraROA
ATGGGTCGCGAATCAGTGTCTGCTGTGTCTTCTCCGCCGACGACGACGGCCACTGCGGTGGCGACGGCGCTTGCTCCTGGGTTTCGATTTCACCCGACTGACGACGAGCTAGTGAGCTATTACTTGAAGCGGAAGGTTCTGGGTAAGCCTGTGCGATTCGATGCGATTGGGGATGTGGATATCTACAAGCATGAGCCGTGGGAATTGGCAGTGTTTTCGTGGCTGAAGACAAGGGACCAGGAATGGTACTTCTACTGCGCGTTAGACAAGAAGTACGGCAACGGCGCTAGGATGAACCGAGCCACCAACAAAGGCTACTGGAAAGCAACTGGCAAAGACAGAGAAATCCGCAGTGACGTTCAGATCCTCGGTATGAAAAAGACACTCGTTTTCCACAGCGGGCGTGCTCCGGATGGGCTCCGGACCAATTGGGTCATGCATGAGTATCGCCTTGTGGACTATGAGACCGAAAACAACGGAAACCCGGTGCAAGATGCATATGTGTTGTGCAGAATATTCCACAAGAATAACATTGGGCCACCATGTGGGAACAGATACGCGCCGTTCATGGAAGAGGAATGGGACGGTGATGGAGCAGCTCTGATTCCAGGAGTAAACGTTAGTGTCAGGGTAGAGCCAGTGCCAGTAGCCAATGGAAACATTCAGATGGATCAGTCAGAAAGCAAGGGCCTCATTAACATCAACGAGGCACCAAGAGAGGCTACTCCAATGGATATCGAAGTTAATCATCAGGAGACTGCCCTCAAGCCGCATGAGAATAACAATGATGAAGATGAGAAAGCACTCAGACGTGAGAATGCAGATAAGGATGAAGGTCCTCCTGCCGTGTGCGTTCTCAACAAAGAAGCTCCGTTACCTCTCATCCAATACAAACGCAGACGCCAAAACGAGTCTAGCAACAACAACTCAAGCAGGACCGCTGAGGATTACTGCTCGTCCACAACAACAACCGTCGACAACACACCAACCTTAGTCTCATCGTCTACTGCTGCTGCTGCCACCAACAGCGCCATCTCTGCATTGCTTGAGTTCTCTCTCATGGGTATCTCCAAGAAGAAAGAAAACCTTCTACGTCCTCACAAGGAAGCTACACTTGAGGAGAAGCTTAATGATCTCCAGAAGGAGAGTAAGCAGATGTCTGATGAGAGAAAAAGTTTCAAGCTCGAGATGATGGGTGCAGAGGCTATGATCATCCTCGCCGTCTACAACGACTGCGCCGAGTACTGCCGTGGCGGCGACGGCGCTGGCTCCCGGCGAAAGGTTCTGGGTAGACCAGTGCGGTTCGATGCGATTGGGGATGCCGATATCTACAAGTACGAGCCTTGGGACTTAGCAGTGTTTTCGAGGTTGAAGACAAGGGACCAAGAATGGTACTTCTACTGCGCGTTAGACAAGAAGTACGGCAACGGCGCTAGAATGAACCGATCCACCAACATAGGCTACTGGAAAGCCACCGGAAAAGACAGAGAGATCCGCCGCGCCGATCAGATCCTCGGTATGAAGAAGACGCTCGTTTTCCACAGCGGGCGTGCCCCGGACGGGCTCCGGACCAACTGGGTCATGCACGAGTATCGCCTTGTGGACTATGAAACCGAAAGCAACGGAAACTTGGTGCAAGATGCATATGTGTTGGTCAAAGTGTTCCACAAGAAGAACATTGGACCACCAAGTGCGAACAGATATGCGCCGTTCATTGAAGAGGAGTGGGCTGATGATGGAGTAGTTAGAGTCAGGGCAGAGCCGTTACCAGTAGCCAATGGAAACAACCAGATGGGCCAGTCAGAAAGCAAGGAGCTTATTAACATCAACGAGACACCAAGAGAGGCTACTCCAATGGATATGGAAGTTAACCATCAGGAGAATGCTCTCAAGCCGCAGGAGAATAACAACAACAACAATAACAATTGTGATGAAGATGAGAAAGCACTCAAACGTGAGCACGCAGATGAGGTTGAGCGTCCTCCTCCTCCTCCGTTACCTCTCCTCCAATACAAACGCAGACGCCAAAACGAATCCAACAACAAAAACTCAAGCAGGACCACACCGGAGTCGTCCACAACAACAACCTTAATATCATCATCTGCTGCTGCCACCAGCACCGCCATCTCTGCATTGCTTGAGTTCTCCCTCATGGACATCTCCGAGAAGAAACCTCTTCACAAGGAAGGTTCTCCTCCTACTCCACTTCCATCTCTTGAAGAGAAGATGCTTAACGATCTCTATAAGGAGATTCACGAGATGTCTGTTGAGAGAGAGACTTTCAAGCTTGAGATGATGAGTGCAGAGGCTATGATCAGTATTCTCCAGTCCAGGATCGATGCACTTCGCCAGGAAAACGATGAGCTGAAGAAGAACAGCGACAAGGGACAAGGAACGCTCTAA
Protein Sequence
- >A03p038680.1_BraROA
MGRESVSAVSSPPTTTATAVATALAPGFRFHPTDDELVSYYLKRKVLGKPVRFDAIGDVDIYKHEPWELAVFSWLKTRDQEWYFYCALDKKYGNGARMNRATNKGYWKATGKDREIRSDVQILGMKKTLVFHSGRAPDGLRTNWVMHEYRLVDYETENNGNPVQDAYVLCRIFHKNNIGPPCGNRYAPFMEEEWDGDGAALIPGVNVSVRVEPVPVANGNIQMDQSESKGLININEAPREATPMDIEVNHQETALKPHENNNDEDEKALRRENADKDEGPPAVCVLNKEAPLPLIQYKRRRQNESSNNNSSRTAEDYCSSTTTTVDNTPTLVSSSTAAAATNSAISALLEFSLMGISKKKENLLRPHKEATLEEKLNDLQKESKQMSDERKSFKLEMMGAEAMIILAVYNDCAEYCRGGDGAGSRRKVLGRPVRFDAIGDADIYKYEPWDLAVFSRLKTRDQEWYFYCALDKKYGNGARMNRSTNIGYWKATGKDREIRRADQILGMKKTLVFHSGRAPDGLRTNWVMHEYRLVDYETESNGNLVQDAYVLVKVFHKKNIGPPSANRYAPFIEEEWADDGVVRVRAEPLPVANGNNQMGQSESKELININETPREATPMDMEVNHQENALKPQENNNNNNNNCDEDEKALKREHADEVERPPPPPLPLLQYKRRRQNESNNKNSSRTTPESSTTTTLISSSAAATSTAISALLEFSLMDISEKKPLHKEGSPPTPLPSLEEKMLNDLYKEIHEMSVERETFKLEMMSAEAMISILQSRIDALRQENDELKKNSDKGQGTL