Gene Details:
- Gene ID: A02p059430.1_BraROA
- Suggest Gene Name: MADS AFFECTING FLOWERING 4, AGAMOUS-LIKE 69;FLOWERING LOCUS C-like
- Description: putative flowering gene
- Species: Brassica rapa ro18
- Source: Putative flowering gene from PlantCFG
Protein Features:
Functional Descriptions:
- Encodes MADS-box containing FLC paralog. Five splice variants have been identified but not characterized with respect to expression patterns and/or differing function. Overexpression of the gene in the Landsberg ecotype leads to a delay in flowering, transcript levels of MAF4 are reduced after a 6 week vernalization.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT5G65070
- Glycine max — Glyma.05G148700
- Oryza sativa — LOC_Os07g41370
Sequences:
gDNA Sequence
- >A02p059430.1_BraROA
TGGGAAGAAGAAAAGTGGAGATCAAACGAATTGAGAGCAAAAGTAGTAGACAAGTCACTTTCTGTAAACGCCGCAATGGTCTCATAGAGAAAGCTCGTCAGCTCTCAGTTCTTTGTGAATCCTCAGTGGCCATTCTAATGGTTTCCTCCACCGGGAAACTCTATACCTCCTCCTATGGCGATAGGTAACACTATTATCTCCTCTTTCTGTTGATTATCTTTTGTTAGATCCTTTCTAGGAAAAATAGAAACTTAAACTAGGGTTTTTCATTTTACCCCTTTGAATCTCTACACCTGATCTTCTTGTTTAATCTATATCCATAATTGTTGTGTAGATCCAACCAAATTTAAGATTAAACAATGTGGTGGCCAAATATGTTTTTGGTGCTCGTTTTGTTTGTTGTTTCTCATTTTTTAATTGTTTTAGTTTGCTGCAAGGATTCTTGCTTTCTTATTTTCGCTGTGAGAATATTATTGCATGTGCTTGTAGAGTTTTATCTACACGTGGTAATTCACACATCATGTTCGTCAATGGGATTTCAAGTCATCTTAATTTTGTGTTGCATAAGAACAATGTAGGTTGTTTAATTTGAAATTAATTTAAGCTCATTATCCCCTTTATTCAATTCAATGCATATCTCCGCGGTAGGTTTGTTGAGAAATTGTGGGGGAGTAATGCTATTGATCAAGAAACTTTAGATTGGAACGGGTGCCATCTCTTCTATGCAATTTTTTGGTTAGTTACAAGTGTATTGTAGATGATTTCTTAATTTTTTTTTTTGATTTTTGGTGCTTGAGTAAAAGGTTTCTAGTTGATCTTGATGGTCAAATATAGTGCTTGGATATGAATTATGACATGTTGGTATAAATCACTAGGCTACAAACCACCATTATCGTATCCCTCTTTCACTAGTAATTTTTGTGTGCACATAATAACTGAAAAGATGCATGTGTACCACTTGTACCTTACCAGTACGTAGCTCTTTTTTTATCTTCTGAAATGGTTCCCCTCTCTTTATCAATGATTTTTTTTTTAAAATGGTTATTGGATCTCATGGGCCAGAGTCACTGAGCGCCAACAATGACCCGAGGACCTTATAGCTTCTTAGCATTGCTTTGATACACAAATGCTTGATCCTGAGAGTATATTTGTAATATTGGGTAATTGTGTACGAATTTACTTCATTTCTTTTTCTTTTATGCAATTCTTTATTGGTCAAAACAGTAGTTGTAGATACGTTGATGATACCTTAAGTTAGTTTTACTATGAAAAGGTTGTTGACTTGTGATTGTGGTTCTTATGTGCCTTACTAATTATTTCATAGTCTCAAGTCACAATTAGGAATAAGTCAAATTCACTCTATATTTGAGAACTTGTAATGGGTCTCTGGCAATACAAAGTAGAGTTTTTGGTGTATCAATAAAAATCTCACATTGAATAAGTAATGCCTTGTAATAAAGGTATATTCACACACAAACTAGCTTTTCGCAGTGAAACTTTTGGGCTTCATCCGGGCTCAATCATATTAATGTGAAATATTCACTAAAATGCTAAACTTTTGCAATCTATCTATCCACTCAATTTTTCTCTCTGGTGCTGCTAGTTCTCAAAATAACAAAAAGAGTTGTGAGGTAGTTAATCAAACTCATAGGACGATATTGTTCATCTTGCGCATATATATATGTCTAACCATTCTATGTCGAAACAATTTCAGCAGCTGTAAAGCTGATTAATATAACAAAAACTTAGAGCTGGACTTGTTGGCTTAAGCTAGGTGGTTTTTATATTTGATAATTGCAAGGTGGAAATTAGGGCATGTCTAGATTACGTTCTAAGTAGTAAATTTACCCATATATATGCCTCGACATTAAAATGTAAGACAAGATTATTTACTGATAAGTCTATAATATATTACATCACTAAATATGAATATATCATATGAATACAAGAAAAAACTATTAGATAACTGAGCTTGCTTGTGTTATCATTTAAGCGATGACACACTTATATTTGTATATAGAAGGCGTGGGTAAGGTAAGATACTGAACCTACACTTAAGAGTTAGTAACCCATTATATATATGGTTTGGCATGGATTGTTTCTAAAGCCTTTTTGTATTTCTCTTGATATCTCTCCAGCATGGAAAAAATCATCAAGCGTTATGAGATACAACATGCTGATGAACTTAAAAACTTGGTAAGTTCATCTTGGGTGCTCATGCATATGTAATTTGAGATGATCATTCAGAATCTAGCTTATACACTTATATTCCATTGGAGATGGTTGTTAAGTGATCAACACAGTGGATAGAGACCGGCACAGAGGTTTCTAAATTTGTTGTAGAATTTTATCTCTCAAGGGATGGAATGATCTCTTATTATATCCTTGTTTGCACTCATAACTGAGATGAGCGTTTCGAAGCTTTAGCTAGAATACTCCAGTGAGATGGTTGTCATATATTAGAAAGTCTGACAACGTCATAAATTTTTTGTATACCACACTTAAATCTGGAGGGTCTCGTTTTGTTTCTCTTAGTAATACATATTATGTCTAACCACTCCCATCGTTACTATTTTTTTTCGTGGCAGGATCTAGAAGAGAAATTTCGGAAATATCTTTCATACAAGGAGTTAGTAGATATAGTCCAGTGGTTAGCACTAAATACTATTTTCCCTCTCTTCTTCTGATCAAAATAGTTTTTATTTTCCGTTAATATTTATGCATGCAGCAAGTGTGAAGAAGCCAAAGTCGATGATGCAAGTGTAGAGTCTCTAAATTCCTTAGAAGAGCAGTTCAAGGCTGCTCTGTCTGTAACTAGAGCTAGGAAGGTATATATATGCTCTACTAAGTGATTCAGATGATTATTCCACAAAATATTCGGACTTTCCCAACTTTGGATCATGTTTCCAATTTGACACAATCCAAAATTTATTGTTGTAGACGCAACTAATGATGGAGTTTCTGAAAAATCTTGAAGAAAAGGTTAGTGCTTTGTTTTTCATTAGCCGCCAGGCGCTTATGCTGATCTCTGAATCCTCTTAGCCTCTGAACATTCCAACAAATAAACCATGTTTAAGCTCTAGTCCCTTGATATGTCTTTTGGTCTTCCTTTAGTTTCCTGATATTTTCTTGGCTTCATTGAAATGAAAGTCTAATGAAACACAGCCCGTTAAAATCTTGATAAAAAAATGGAAACTCCTCCTTGCTGATTCACCAAGTTGTGATGAGGATGTTTTGGAGCGTGTTTAAGGTGTAAAATGTCGTGGTCTTGGTGAAACAGGAGAAGCTGTTGAGAGAAGAGAACCAGATTTTGGCTAGCCAGCTAACAAAGGTACATATGCGTGGATAAGCTATTAATCATTTTATACACATATAGATGGGCTTTACCGCATTAGCTAGATACTTGCATGTATGCGTACAAATACTTAGGAAAGTCGGACTTTGTAACAACAAAAAACTATGCTATTAAAGGTCTTTATCTTTCCAATGATTTCTGCCGTAAAAATAAGCTAACTTCACCATTTTTTCTGCTGCCTCTTTATTTCAAGTATTGGCCCCGTTCATACCCAAGCATATTGTTTCTCTTATTTACAGTGGCTAATAGGGTTTGGTTGAGGTCAATTTGGTTCATTGTTTTCTGAAATTGTGGGTTCCCATAGAGGGTGAACTGCTCTCTATTCATTTGAAATCTCGTATTTTAACCACATAATTTAGGTCTGTATTTCTTGTTAATGTTTAGTATATGTAGAAAATAATGTTTCTTACTATGGAAGTTAAGGACTTTGATGGCTTTTATGCTACATAATTTTGGAGTGAAACCCATGATTATGCTATTTATTTTAAACGTACTTTTAAAGCCTAGATTTCTTGTTAGTTAGTATTTATTTAGTATATGTAGAAAAGGTAAAGTTTATAGAAGTCTCTTACAGATGGAGAAGAAGAGGCTTCCGGAAACAGAGGGTGAAGGAGCAATGTCATCGGAAAATAGCTCCCGCAACAGCCCACCAGAGACCCTCCCGCTCCTAAAGTAA
CDS Sequence
- >A02p059430.1_BraROA
ATGGGAAGAAGAAAAGTGGAGATCAAACGAATTGAGAGCAAAAGTAGTAGACAAGTCACTTTCTGTAAACGCCGCAATGGTCTCATAGAGAAAGCTCGTCAGCTCTCAGTTCTTTGTGAATCCTCAGTGGCCATTCTAATGGTTTCCTCCACCGGGAAACTCTATACCTCCTCCTATGGCGATAGGTTTGTTGAGAAATTGTGGGGGAGTAATGCTATTGATCAAGAAACTTTAGATTGGAACGGGTGCCATCTCTTCTATGCAATTTTTTGCATGGAAAAAATCATCAAGCGTTATGAGATACAACATGCTGATGAACTTAAAAACTTGGATCTAGAAGAGAAATTTCGGAAATATCTTTCATACAAGGAGTTAGTAGATATAGTCCAGTGCAAGTGTGAAGAAGCCAAAGTCGATGATGCAAGTGTAGAGTCTCTAAATTCCTTAGAAGAGCAGTTCAAGGCTGCTCTGTCTGTAACTAGAGCTAGGAAGACGCAACTAATGATGGAGTTTCTGAAAAATCTTGAAGAAAAGGAGAAGCTGTTGAGAGAAGAGAACCAGATTTTGGCTAGCCAGCTAACAAAGATGGAGAAGAAGAGGCTTCCGGAAACAGAGGGTGAAGGAGCAATGTCATCGGAAAATAGCTCCCGCAACAGCCCACCAGAGACCCTCCCGCTCCTAAAGTAA
Protein Sequence
- >A02p059430.1_BraROA
MGRRKVEIKRIESKSSRQVTFCKRRNGLIEKARQLSVLCESSVAILMVSSTGKLYTSSYGDRFVEKLWGSNAIDQETLDWNGCHLFYAIFCMEKIIKRYEIQHADELKNLDLEEKFRKYLSYKELVDIVQCKCEEAKVDDASVESLNSLEEQFKAALSVTRARKTQLMMEFLKNLEEKEKLLREENQILASQLTKMEKKRLPETEGEGAMSSENSSRNSPPETLPLLK