Information report for A02p059430.1_BraROA
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes MADS-box containing FLC paralog. Five splice variants have been identified but not characterized with respect to expression patterns and/or differing function. Overexpression of the gene in the Landsberg ecotype leads to a delay in flowering, transcript levels of MAF4 are reduced after a 6 week vernalization.
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT5G65070.3, AT5G65070.1, AT5G65060.1
- Brassica napus: GSBRNA2T00047454001, GSBRNA2T00047451001, BnaA06G0300300ZS, BnaC03G0526000ZS, GSBRNA2T00000786001
- Brassica oleracea: XP_013628774.1, Bo3g100540
- Brassica rapa: XP_009130488.1, XP_009130489.1, Bra031884, XP_009150583.1, Bra024351, XP_009150582.1, XP_009150584.1
Sequences
gDNA Sequence
- >A02p059430.1_BraROA
TGGGAAGAAGAAAAGTGGAGATCAAACGAATTGAGAGCAAAAGTAGTAGACAAGTCACTTTCTGTAAACGCCGCAATGGTCTCATAGAGAAAGCTCGTCAGCTCTCAGTTCTTTGTGAATCCTCAGTGGCCATTCTAATGGTTTCCTCCACCGGGAAACTCTATACCTCCTCCTATGGCGATAGGTAACACTATTATCTCCTCTTTCTGTTGATTATCTTTTGTTAGATCCTTTCTAGGAAAAATAGAAACTTAAACTAGGGTTTTTCATTTTACCCCTTTGAATCTCTACACCTGATCTTCTTGTTTAATCTATATCCATAATTGTTGTGTAGATCCAACCAAATTTAAGATTAAACAATGTGGTGGCCAAATATGTTTTTGGTGCTCGTTTTGTTTGTTGTTTCTCATTTTTTAATTGTTTTAGTTTGCTGCAAGGATTCTTGCTTTCTTATTTTCGCTGTGAGAATATTATTGCATGTGCTTGTAGAGTTTTATCTACACGTGGTAATTCACACATCATGTTCGTCAATGGGATTTCAAGTCATCTTAATTTTGTGTTGCATAAGAACAATGTAGGTTGTTTAATTTGAAATTAATTTAAGCTCATTATCCCCTTTATTCAATTCAATGCATATCTCCGCGGTAGGTTTGTTGAGAAATTGTGGGGGAGTAATGCTATTGATCAAGAAACTTTAGATTGGAACGGGTGCCATCTCTTCTATGCAATTTTTTGGTTAGTTACAAGTGTATTGTAGATGATTTCTTAATTTTTTTTTTTGATTTTTGGTGCTTGAGTAAAAGGTTTCTAGTTGATCTTGATGGTCAAATATAGTGCTTGGATATGAATTATGACATGTTGGTATAAATCACTAGGCTACAAACCACCATTATCGTATCCCTCTTTCACTAGTAATTTTTGTGTGCACATAATAACTGAAAAGATGCATGTGTACCACTTGTACCTTACCAGTACGTAGCTCTTTTTTTATCTTCTGAAATGGTTCCCCTCTCTTTATCAATGATTTTTTTTTTAAAATGGTTATTGGATCTCATGGGCCAGAGTCACTGAGCGCCAACAATGACCCGAGGACCTTATAGCTTCTTAGCATTGCTTTGATACACAAATGCTTGATCCTGAGAGTATATTTGTAATATTGGGTAATTGTGTACGAATTTACTTCATTTCTTTTTCTTTTATGCAATTCTTTATTGGTCAAAACAGTAGTTGTAGATACGTTGATGATACCTTAAGTTAGTTTTACTATGAAAAGGTTGTTGACTTGTGATTGTGGTTCTTATGTGCCTTACTAATTATTTCATAGTCTCAAGTCACAATTAGGAATAAGTCAAATTCACTCTATATTTGAGAACTTGTAATGGGTCTCTGGCAATACAAAGTAGAGTTTTTGGTGTATCAATAAAAATCTCACATTGAATAAGTAATGCCTTGTAATAAAGGTATATTCACACACAAACTAGCTTTTCGCAGTGAAACTTTTGGGCTTCATCCGGGCTCAATCATATTAATGTGAAATATTCACTAAAATGCTAAACTTTTGCAATCTATCTATCCACTCAATTTTTCTCTCTGGTGCTGCTAGTTCTCAAAATAACAAAAAGAGTTGTGAGGTAGTTAATCAAACTCATAGGACGATATTGTTCATCTTGCGCATATATATATGTCTAACCATTCTATGTCGAAACAATTTCAGCAGCTGTAAAGCTGATTAATATAACAAAAACTTAGAGCTGGACTTGTTGGCTTAAGCTAGGTGGTTTTTATATTTGATAATTGCAAGGTGGAAATTAGGGCATGTCTAGATTACGTTCTAAGTAGTAAATTTACCCATATATATGCCTCGACATTAAAATGTAAGACAAGATTATTTACTGATAAGTCTATAATATATTACATCACTAAATATGAATATATCATATGAATACAAGAAAAAACTATTAGATAACTGAGCTTGCTTGTGTTATCATTTAAGCGATGACACACTTATATTTGTATATAGAAGGCGTGGGTAAGGTAAGATACTGAACCTACACTTAAGAGTTAGTAACCCATTATATATATGGTTTGGCATGGATTGTTTCTAAAGCCTTTTTGTATTTCTCTTGATATCTCTCCAGCATGGAAAAAATCATCAAGCGTTATGAGATACAACATGCTGATGAACTTAAAAACTTGGTAAGTTCATCTTGGGTGCTCATGCATATGTAATTTGAGATGATCATTCAGAATCTAGCTTATACACTTATATTCCATTGGAGATGGTTGTTAAGTGATCAACACAGTGGATAGAGACCGGCACAGAGGTTTCTAAATTTGTTGTAGAATTTTATCTCTCAAGGGATGGAATGATCTCTTATTATATCCTTGTTTGCACTCATAACTGAGATGAGCGTTTCGAAGCTTTAGCTAGAATACTCCAGTGAGATGGTTGTCATATATTAGAAAGTCTGACAACGTCATAAATTTTTTGTATACCACACTTAAATCTGGAGGGTCTCGTTTTGTTTCTCTTAGTAATACATATTATGTCTAACCACTCCCATCGTTACTATTTTTTTTCGTGGCAGGATCTAGAAGAGAAATTTCGGAAATATCTTTCATACAAGGAGTTAGTAGATATAGTCCAGTGGTTAGCACTAAATACTATTTTCCCTCTCTTCTTCTGATCAAAATAGTTTTTATTTTCCGTTAATATTTATGCATGCAGCAAGTGTGAAGAAGCCAAAGTCGATGATGCAAGTGTAGAGTCTCTAAATTCCTTAGAAGAGCAGTTCAAGGCTGCTCTGTCTGTAACTAGAGCTAGGAAGGTATATATATGCTCTACTAAGTGATTCAGATGATTATTCCACAAAATATTCGGACTTTCCCAACTTTGGATCATGTTTCCAATTTGACACAATCCAAAATTTATTGTTGTAGACGCAACTAATGATGGAGTTTCTGAAAAATCTTGAAGAAAAGGTTAGTGCTTTGTTTTTCATTAGCCGCCAGGCGCTTATGCTGATCTCTGAATCCTCTTAGCCTCTGAACATTCCAACAAATAAACCATGTTTAAGCTCTAGTCCCTTGATATGTCTTTTGGTCTTCCTTTAGTTTCCTGATATTTTCTTGGCTTCATTGAAATGAAAGTCTAATGAAACACAGCCCGTTAAAATCTTGATAAAAAAATGGAAACTCCTCCTTGCTGATTCACCAAGTTGTGATGAGGATGTTTTGGAGCGTGTTTAAGGTGTAAAATGTCGTGGTCTTGGTGAAACAGGAGAAGCTGTTGAGAGAAGAGAACCAGATTTTGGCTAGCCAGCTAACAAAGGTACATATGCGTGGATAAGCTATTAATCATTTTATACACATATAGATGGGCTTTACCGCATTAGCTAGATACTTGCATGTATGCGTACAAATACTTAGGAAAGTCGGACTTTGTAACAACAAAAAACTATGCTATTAAAGGTCTTTATCTTTCCAATGATTTCTGCCGTAAAAATAAGCTAACTTCACCATTTTTTCTGCTGCCTCTTTATTTCAAGTATTGGCCCCGTTCATACCCAAGCATATTGTTTCTCTTATTTACAGTGGCTAATAGGGTTTGGTTGAGGTCAATTTGGTTCATTGTTTTCTGAAATTGTGGGTTCCCATAGAGGGTGAACTGCTCTCTATTCATTTGAAATCTCGTATTTTAACCACATAATTTAGGTCTGTATTTCTTGTTAATGTTTAGTATATGTAGAAAATAATGTTTCTTACTATGGAAGTTAAGGACTTTGATGGCTTTTATGCTACATAATTTTGGAGTGAAACCCATGATTATGCTATTTATTTTAAACGTACTTTTAAAGCCTAGATTTCTTGTTAGTTAGTATTTATTTAGTATATGTAGAAAAGGTAAAGTTTATAGAAGTCTCTTACAGATGGAGAAGAAGAGGCTTCCGGAAACAGAGGGTGAAGGAGCAATGTCATCGGAAAATAGCTCCCGCAACAGCCCACCAGAGACCCTCCCGCTCCTAAAGTAA
CDS Sequence
- >A02p059430.1_BraROA
ATGGGAAGAAGAAAAGTGGAGATCAAACGAATTGAGAGCAAAAGTAGTAGACAAGTCACTTTCTGTAAACGCCGCAATGGTCTCATAGAGAAAGCTCGTCAGCTCTCAGTTCTTTGTGAATCCTCAGTGGCCATTCTAATGGTTTCCTCCACCGGGAAACTCTATACCTCCTCCTATGGCGATAGGTTTGTTGAGAAATTGTGGGGGAGTAATGCTATTGATCAAGAAACTTTAGATTGGAACGGGTGCCATCTCTTCTATGCAATTTTTTGCATGGAAAAAATCATCAAGCGTTATGAGATACAACATGCTGATGAACTTAAAAACTTGGATCTAGAAGAGAAATTTCGGAAATATCTTTCATACAAGGAGTTAGTAGATATAGTCCAGTGCAAGTGTGAAGAAGCCAAAGTCGATGATGCAAGTGTAGAGTCTCTAAATTCCTTAGAAGAGCAGTTCAAGGCTGCTCTGTCTGTAACTAGAGCTAGGAAGACGCAACTAATGATGGAGTTTCTGAAAAATCTTGAAGAAAAGGAGAAGCTGTTGAGAGAAGAGAACCAGATTTTGGCTAGCCAGCTAACAAAGATGGAGAAGAAGAGGCTTCCGGAAACAGAGGGTGAAGGAGCAATGTCATCGGAAAATAGCTCCCGCAACAGCCCACCAGAGACCCTCCCGCTCCTAAAGTAA
Protein Sequence
- >A02p059430.1_BraROA
MGRRKVEIKRIESKSSRQVTFCKRRNGLIEKARQLSVLCESSVAILMVSSTGKLYTSSYGDRFVEKLWGSNAIDQETLDWNGCHLFYAIFCMEKIIKRYEIQHADELKNLDLEEKFRKYLSYKELVDIVQCKCEEAKVDDASVESLNSLEEQFKAALSVTRARKTQLMMEFLKNLEEKEKLLREENQILASQLTKMEKKRLPETEGEGAMSSENSSRNSPPETLPLLK