Gene Details:

  • Gene ID: A01p059860.1_BraROA
  • Suggest Gene Name: METHYL-CPG-BINDING DOMAIN 9
  • Description: putative flowering gene
  • Species: Brassica rapa ro18
  • Source: Putative flowering gene from PlantCFG

Protein Features:

Functional Descriptions:

  • Encodes a protein with a methyl-CpG-binding domain. Has sequence similarity to human MBD proteins. Involved in the modification of the FLC chromatin acetylation state to affect FLC expression. Mutants show an early flowering, and enhanced shoot branching phenotypes.

Homologous

Sequences:

gDNA Sequence
  • >A01p059860.1_BraROA
    TGGAACTCACTGATTCTACGAAAAAGCAACTCGGAGAGACCAGGAGCGCCGCTCTCGACGAAGATAATCGCTCCTTTCTCGGCATCGATCTTAACGAAATCCCTACCGGCGTTACTCCCGGCGGCGCTGTACAGGACGATGACGGAGAGTATGAACCCGTTGAAGTTGTTAGGTCAATTCATGATAATCCGGACCCAGCCCCTGGAGCCCCTGCTGAGGTTCCTGAGCCGGATCGGGATGCCGCGTGCGGCGCCTGTGGAAGGCCGGAGTCGATGGAGCTCGTAGTAGTCTGCGACGCTTGCGAGCGAGGGTTTCATCTTAACTGTGTTAACGACGGAGTGGAGGCTGCTCCTTCCGCCGATTGGATGTGCAGCGACTGTGTTGCCGGCGGCGGGAGGAGTAAACTGTGGCCGTTGGGGGTGAAGTCCAAGCTCATCCTGGATATGAACGCCTCGCCGCCGAGTGATGCCGAGGGATACGGAGGCGAGGATACGTCAGATTCGAGGTACGCAGCTGTGGTTCCATTTTCCGACTATTCGTTAGGGTTTATTTTTTTGACGAACTGAATATTGGTTTGAGCTCGACAAGAAAAGCACTGATGGCTCATGTGCTTCCTTGTTTGTTTTTCTTCTCCAGAAAGCATATGCTGGCCATGGGGAACTCTTTTGAACATTCAATGACGCATTCAAGCTTTCTGGATCCTGGTAGAGCACATACTTTAGATTTTGGCTTCCCATCAAACCTCGGGAACAGTAGTTTGCCCATCAGATTCCCATCCTTGGATCCAAGCGAGCTCTTGTTGCATAATCTCAGGCATTTCATATCTGAAAGGCACGGAGTTTTAGAAGATGGTTGGCATGTCGAATTTAAACAGCCTTTAAATGGCTATCATCTCTGTCCAGTGTATTGTTCTCCGAGTGGAAAAACATTTAGTTCAATACAAGATGTTGCTTGTTATCTCGGCTTGGCAACTAATGGTAACTACAGCTGTATGGATACTGATATCAGGAATGAGAGTTCTCTTCTTCAAGAAAGATTGAATATGCCCAAGAGAAGAAAGACATCAAGATGGCCAAACAATAGTTTCCCTGACCTAAAGGGTAGTTCAGTGAGTGCTCAGCTCAGTCGTTTTCCATACAATGGTCAGACGATGCCCCCTTTTGCCATTTCATCTGGTGAATCTCTTAGCTCTGGGAATAATGGATGCGGTTGTGAGGAAGCTAATGTAAGTGTAGACTTCGATTCTCAACTGGTTTCTCTTTGTTTTTTTTGTTTTTAAACCCTCATGTTTGTGTATTTTGACTTTCAGAAAGGACTTCCTATGCAATTTGAAGATTTCTTTGTCCTCTCGCTTGGACGAATTGACATAAGACAGTCTTACCACAATGTCAACATGATTTATCCAATAGGATATAAGTCCTGCTGGCATGATAAAATCACGGGGTCTTTATTTACTTGTGAAGTATCTGGTGGTAGTTCTGGGCCTGTTTTCAAGATTACACGGTCACCATGCTCTAAATCATTTGTTCCAGTTGGATCAACTGTCTTCTCCTGCCCAAAGATTGATGAAATGGTGGAACAGAACATTGACAAACGAGGTGATCGGAGAGACAGTATTCAAGAACATGATGACGACACTGTTGAAATCCTTCTTTCAGATCCATCGCCACCACTTGGAGATGATATATTGTCTTGTTTACAGGAGAAGAGTTTCTCCAGTACATTCTATTGCTTGCGCTCGGAAGTTGGTTCTTCTCAAGTAGACTTAAATAATACTCTATCCTATAATCAGCAGCATGAGGTTGAGATTGGCGATATTATTGTGGAAGAAGATTCATTGTCTGTTGCATGGCAAAAGGTGTCTCAAAAACTTGTTGATGCATGTTCCAATGTCCTGAAGCACAAGGGTACCATGAACTTCCGTTGCAAGCATGTTGACAGAGAAACGAGGGAAATCAACTGGGATACAAGAAATGAGAAAGATAATGTGATTTTATCTTTGTCAAGATTTTGCTGTTCTTTGGCTCCTCACAGTGCTACATGTGGTGGAAAGGATAATAGCGAGATTGCATCTCTAGTTGATGTTTTGTCAAGGTGGCTGGATCAAAGCAGGTTTGGGCTTGATGCAGATTTTGTACAGGAAATGATTGAACGTATGCCTGGTGCCGAATCATGTTCAAATTATAGGTCTCTGAAGACTAGAAGTTCTTCTGTTTCTGTAACTGTAGCAGAAGGAGCGCTTATTGCCAATCCAAAAGTTGGAGAAAATGTCAGGGAAGAAGTTTTTGGTGAGATATCTCGGAAAGCCAAAAGGCATAAACTAAATGGTGGTCATGGTTTCAGCAATCCACACCCTCCTCCCGGGAGGCCTATGTGTTTGAGGCTTCCTCCTGTGGTTGTTGGTGACTTCCTTCAGGTACATTCATGTGTTTTTTTATTATATAGTAATCTACAAAGTACCCCTCCATTCACTAAGTCCTGCCACATGTATAACACTCATTTTTATGTTTGCCTGATCAGGTATCTGAAGTGTTCTGGCGTTTCCGTGAAATTTTGGGTTTGGGAGAGGCTTTCTCCCCTGAGAAGCTTGAACAAGAGATTGTCAATCCAGTGTTCGATGGTTTGTTTCTTGATAAATCTGGGAAAGAAGTTAATAGAAGTGAGATGAACATTAGTGATGAGGATCGTACAGCTACTAAATTTTTATCTTTGTTGGATGAATCTCGCCAACCTTTTTCTTCGGAAAATACCTTTGCTTCTGTACTAAAAGAGACGAAAGCAGGGGATTCTACTGAGTTCAACATTTCAAATTCCTCTCGTGGGCCGTGCGTGGGTGCACTTCTAACAAAGACTCACATTTCGCTTCTGCAAGTGCTAATATGTGAGTTGCAATCCAAGGTAGCTGCATTTGTTGATCCAAACTTTGATTCTGGAGAATCAAGATCCAGACGGGGACGGAAAAAGGATGACTGTACACTTTCTGCTAAAAGAAATAAGCTGCATATGCTTCCTGTTAACGAGTTCACATGGCCTGAATTGGCCCGTAGGTACATTTTGTCTCTTTTATCAATGGATGGGAACCTCGAATCAGCGGAGATTGCTGCTCGTGAAAGTGGTAAGGTATTCCGTTGCTTACAAGGGGATGGTGGTTTGCTCTGTGGTTCACTTACAGGAGTGGATGGGATGGAAGCCGATTCAATGGTATGTTTTTGTTATTTTTCTATTTATTTTCTGGGTTACATATCTTACTTGTATTACTGGTTGACGGGATCACAAATTGAGTGTCTCTTTTGGAACCTATGTGCGGTTTTTCTTGGCCTTCAAATGTTCTATAGTCAGGTTGATCTTTCTCAAGCTTATTAGAAGATATGTTCCAATTGTAGGTGAGTCTAGAGTGTTAAGTTCTTTTGTCTTCTATATTTTGACATTCATATTCTGTTACTCTTGAATATCCCGAAGGTCCTGTTTAATTATACAGTCTGAAAAATCGATTTGCTTTGTGTTGTTATGAGTATTAACTTCCGGGCAAGTCTTTGATTGTTGAGTGTTAATATACGTACATTCCTAAACCACTCTCACAGAGACAGAATGATCTTTGGATTTACGTATACATATTAACTCTTTATCTTCAGTTACTTGCAGAGGCTATTAAAAAAATATTTGGTTCTTTGACAAGAGAAAATGATGTTCTCTCTGTGGAAGATGATGATTCTGATGGCCTTGATGCTACTGAGACAAACGCTTGCAATGGTGATATTCCAGAATGGGCACTGGTTCTGGAACCTGTGAGAAAGCTTCCAACAAATGTTGGGACTAGAATCAGAAAGTGTGTCTATGATGCTTTAGAGAGAAATCCACCAGAGTGGGCAAAGAAGATATTAGAGCATTCCATCAGTAAAGAAGTATATAAAGGCAATGCATCAGGACCGACAAAGGTTCAATCTCTAAAACCAATGCTCTTCCCTCCTGAAGTACATTAAATTTTGAATTGCGTAATTGGAAATTTCTTGTTTCTCGAATTCCCTTTTCTGTCACTTGTTCTTCCGGTGATTTAATCTCAAGTCTGATGACATATGATATTATTTCCCTTTACTGAATACAGAAAGCTGTCCTCTCATTGCTAGCCGATGTTCGAGGTGGTGATTTGGTGCAGAAGTCTGTCAAAGGAACCAAAAAGAGGACGTCTATTGGTGTTTCTGATGTCATTATGAAGAAATGTCGTGCTGTGTTGCGTGATGTTGCAGCTGTAGACGAGGATAAAGTGTTTTGTACTTTATTGGGGCGAAAGTTACTGAATTTAAATGATAATGATGATGACGGACTCTTGGGATCACCTGCAATGGTTTCGCGTCCCCTAGACTTTAGAACTATTGATTTGCGGTTGGCTGTCGGTGCGTATGACGGATCAACTGAAGCTTTTCTTGAGGATATTCTTGAGGTAGGATTCTCCCTCTTTGTCTGATTTTTCTGCAATTGATGGCATGATGCTTTTTGTGCGATATGAGAACTAGTTTCTAAAAGTGACACATCTCCATTTTGGGTATTGCATCTTTGTGCTGTTAGTTTTGCACTATTCATTTGGATGCATGAATGTAAAAGTGTTAACACCATAAATTTAGCTGCTCAGCTGTTGGATAACGTTTTAGCTATGATTAGAAATCGAACCAATTGAGTCTGCCAGTACATGCTTGACTTATTTTTTAAATTTCATTGTGATGGTATACTCGTGGACTCCGTTTTGTTTATGCATGCAACTTTATCTTGTTTCATGGATGACATGCTAATTTTCACTTTCTGATTTGCAGCTGTGGAGTTGTATACGTGTTATGTATGCGGATCAGCCTGATTCTTTAGAACTGGTTGAAAAATTGTCTAAAAAATTTAAGTCACTATACGAAGCCGAGGTTTGTGTCTTTTTCTCCCTTTTCTGCTATGCTCTGTACAACGTATGTTCACAGCTTGGTAGCCTCTTGAAGTCAAATGGTCGAGACAGTCTCATC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CDS Sequence
  • >A01p059860.1_BraROA
    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Protein Sequence
  • >A01p059860.1_BraROA
    MELTDSTKKQLGETRSAALDEDNRSFLGIDLNEIPTGVTPGGAVQDDDGEYEPVEVVRSIHDNPDPAPGAPAEVPEPDRDAACGACGRPESMELVVVCDACERGFHLNCVNDGVEAAPSADWMCSDCVAGGGRSKLWPLGVKSKLILDMNASPPSDAEGYGGEDTSDSRYAAVVPFSDYSLGKHMLAMGNSFEHSMTHSSFLDPGRAHTLDFGFPSNLGNSSLPIRFPSLDPSELLLHNLRHFISERHGVLEDGWHVEFKQPLNGYHLCPVYCSPSGKTFSSIQDVACYLGLATNGNYSCMDTDIRNESSLLQERLNMPKRRKTSRWPNNSFPDLKGSSVSAQLSRFPYNGQTMPPFAISSGESLSSGNNGCGCEEANKGLPMQFEDFFVLSLGRIDIRQSYHNVNMIYPIGYKSCWHDKITGSLFTCEVSGGSSGPVFKITRSPCSKSFVPVGSTVFSCPKIDEMVEQNIDKRGDRRDSIQEHDDDTVEILLSDPSPPLGDDILSCLQEKSFSSTFYCLRSEVGSSQVDLNNTLSYNQQHEVEIGDIIVEEDSLSVAWQKVSQKLVDACSNVLKHKGTMNFRCKHVDRETREINWDTRNEKDNVILSLSRFCCSLAPHSATCGGKDNSEIASLVDVLSRWLDQSRFGLDADFVQEMIERMPGAESCSNYRSLKTRSSSVSVTVAEGALIANPKVGENVREEVFGEISRKAKRHKLNGGHGFSNPHPPPGRPMCLRLPPVVVGDFLQVSEVFWRFREILGLGEAFSPEKLEQEIVNPVFDGLFLDKSGKEVNRSEMNISDEDRTATKFLSLLDESRQPFSSENTFASVLKETKAGDSTEFNISNSSRGPCVGALLTKTHISLLQVLICELQSKVAAFVDPNFDSGESRSRRGRKKDDCTLSAKRNKLHMLPVNEFTWPELARRYILSLLSMDGNLESAEIAARESGKVFRCLQGDGGLLCGSLTGVDGMEADSMLLAEAIKKIFGSLTRENDVLSVEDDDSDGLDATETNACNGDIPEWALVLEPVRKLPTNVGTRIRKCVYDALERNPPEWAKKILEHSISKEVYKGNASGPTKVQSLKPMLFPPEKAVLSLLADVRGGDLVQKSVKGTKKRTSIGVSDVIMKKCRAVLRDVAAVDEDKVFCTLLGRKLLNLNDNDDDGLLGSPAMVSRPLDFRTIDLRLAVGAYDGSTEAFLEDILELWSCIRVMYADQPDSLELVEKLSKKFKSLYEAEVCVFFSLFCYALYNVCSQLGSLLKSNGRDSLIKQILLRLIVCESYRSLRSELDAFEGFFLLCACRIIVVLAFQFPGVVLPLAQKLMDYRKLECLSAEMRKEIKDIVVSVNKLPKAPWDEGVCKICGVDKDDDSVLLCDTCDAEYHTYCLNPPLIRIPDGNWYCPSCVIAKRMAQDALESNKLVRRRKRRKYQGELTRASMETAARLVDVMGEKDYWEFSAEERILVLKLLCDELLSSSLVHQHLEQCAEALIEMQQKLRSLSSEWKNTKLRQEFLTAKLAKVEPSILKEMGEPQNSSSFADHHGRHQQQENVGEKVPHDDGTSSAAFLTNNQGKAPIETHAQTGGSNVISSENKIHTPEKVTSPGRNELPIEVTDHMSCEIEDTTETLDKSVGKNRETHSIKPNAAELKTAHDASSLASQELQACRQDLNATSNEIQNLQQSIRSIESQILRQSIRRDFLGSDGSGRLYWGCYFAEEHPRILVDGSMSLQKAVQVDLTGSKVPSPFLHAVDHGRLMVSPWTYYETEAEISELVLWLHDDDPKERELRESIMCWKRIRFGDLQREIKQAENSSSPIMAGDLVTKAAMAMEKRYGPCIKLEIETYKKRGKKTKCAEREKLCRCECLESILPSMIHCLICHKTFASDDEFEEHAESKCVPYSLATEEGKEKSDSSKAKESLKSDYLSVKSSAGKDKAEISNVSELGSGLIRYQEEESISPYHFEEICSKFVTKDSNRDLVKEIGLIGSNGSPTFLPLPSIHLNDSMLISATCNKLDGGDSGDQVIFTGSEANGEGLNSESLDRSVTNDLGNPLNKLSGMGCDKSEEKNKKSTGSGLKGCCVVPQASLKRVTGKALPVFRFLKTNLLDMDVALPEEALRPSKSHPDRRRAWRAFVKSAQSIFELVQAAIVVEDMIKTEYLKNEWWYWSSLSAAAKISTLSALSLHIFSLDAAIMYDKTITQSDPMDATKEIGLQEQKSQPVTDPQERSSRANRRSGKKRKEPEGA