Information report for A01p059860.1_BraROA
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a protein with a methyl-CpG-binding domain. Has sequence similarity to human MBD proteins. Involved in the modification of the FLC chromatin acetylation state to affect FLC expression. Mutants show an early flowering, and enhanced shoot branching phenotypes.
Homologous
- Brassica napus: BnaA01G0420600ZS, BnaC01G0494500ZS, BnaC05G0560100ZS, BnaA01G0420700ZS
- Brassica oleracea: Bo1g158920, Bo5g155130
- Brassica rapa: Bra040518, Bra039117
- Daucus carota: DCAR_007093
- Lactuca sativa: gene-LSAT_4X6960, gene-LSAT_4X181301
- Vitis vinifera: VIT_01s0026g00150
Sequences
gDNA Sequence
- >A01p059860.1_BraROA
TGGAACTCACTGATTCTACGAAAAAGCAACTCGGAGAGACCAGGAGCGCCGCTCTCGACGAAGATAATCGCTCCTTTCTCGGCATCGATCTTAACGAAATCCCTACCGGCGTTACTCCCGGCGGCGCTGTACAGGACGATGACGGAGAGTATGAACCCGTTGAAGTTGTTAGGTCAATTCATGATAATCCGGACCCAGCCCCTGGAGCCCCTGCTGAGGTTCCTGAGCCGGATCGGGATGCCGCGTGCGGCGCCTGTGGAAGGCCGGAGTCGATGGAGCTCGTAGTAGTCTGCGACGCTTGCGAGCGAGGGTTTCATCTTAACTGTGTTAACGACGGAGTGGAGGCTGCTCCTTCCGCCGATTGGATGTGCAGCGACTGTGTTGCCGGCGGCGGGAGGAGTAAACTGTGGCCGTTGGGGGTGAAGTCCAAGCTCATCCTGGATATGAACGCCTCGCCGCCGAGTGATGCCGAGGGATACGGAGGCGAGGATACGTCAGATTCGAGGTACGCAGCTGTGGTTCCATTTTCCGACTATTCGTTAGGGTTTATTTTTTTGACGAACTGAATATTGGTTTGAGCTCGACAAGAAAAGCACTGATGGCTCATGTGCTTCCTTGTTTGTTTTTCTTCTCCAGAAAGCATATGCTGGCCATGGGGAACTCTTTTGAACATTCAATGACGCATTCAAGCTTTCTGGATCCTGGTAGAGCACATACTTTAGATTTTGGCTTCCCATCAAACCTCGGGAACAGTAGTTTGCCCATCAGATTCCCATCCTTGGATCCAAGCGAGCTCTTGTTGCATAATCTCAGGCATTTCATATCTGAAAGGCACGGAGTTTTAGAAGATGGTTGGCATGTCGAATTTAAACAGCCTTTAAATGGCTATCATCTCTGTCCAGTGTATTGTTCTCCGAGTGGAAAAACATTTAGTTCAATACAAGATGTTGCTTGTTATCTCGGCTTGGCAACTAATGGTAACTACAGCTGTATGGATACTGATATCAGGAATGAGAGTTCTCTTCTTCAAGAAAGATTGAATATGCCCAAGAGAAGAAAGACATCAAGATGGCCAAACAATAGTTTCCCTGACCTAAAGGGTAGTTCAGTGAGTGCTCAGCTCAGTCGTTTTCCATACAATGGTCAGACGATGCCCCCTTTTGCCATTTCATCTGGTGAATCTCTTAGCTCTGGGAATAATGGATGCGGTTGTGAGGAAGCTAATGTAAGTGTAGACTTCGATTCTCAACTGGTTTCTCTTTGTTTTTTTTGTTTTTAAACCCTCATGTTTGTGTATTTTGACTTTCAGAAAGGACTTCCTATGCAATTTGAAGATTTCTTTGTCCTCTCGCTTGGACGAATTGACATAAGACAGTCTTACCACAATGTCAACATGATTTATCCAATAGGATATAAGTCCTGCTGGCATGATAAAATCACGGGGTCTTTATTTACTTGTGAAGTATCTGGTGGTAGTTCTGGGCCTGTTTTCAAGATTACACGGTCACCATGCTCTAAATCATTTGTTCCAGTTGGATCAACTGTCTTCTCCTGCCCAAAGATTGATGAAATGGTGGAACAGAACATTGACAAACGAGGTGATCGGAGAGACAGTATTCAAGAACATGATGACGACACTGTTGAAATCCTTCTTTCAGATCCATCGCCACCACTTGGAGATGATATATTGTCTTGTTTACAGGAGAAGAGTTTCTCCAGTACATTCTATTGCTTGCGCTCGGAAGTTGGTTCTTCTCAAGTAGACTTAAATAATACTCTATCCTATAATCAGCAGCATGAGGTTGAGATTGGCGATATTATTGTGGAAGAAGATTCATTGTCTGTTGCATGGCAAAAGGTGTCTCAAAAACTTGTTGATGCATGTTCCAATGTCCTGAAGCACAAGGGTACCATGAACTTCCGTTGCAAGCATGTTGACAGAGAAACGAGGGAAATCAACTGGGATACAAGAAATGAGAAAGATAATGTGATTTTATCTTTGTCAAGATTTTGCTGTTCTTTGGCTCCTCACAGTGCTACATGTGGTGGAAAGGATAATAGCGAGATTGCATCTCTAGTTGATGTTTTGTCAAGGTGGCTGGATCAAAGCAGGTTTGGGCTTGATGCAGATTTTGTACAGGAAATGATTGAACGTATGCCTGGTGCCGAATCATGTTCAAATTATAGGTCTCTGAAGACTAGAAGTTCTTCTGTTTCTGTAACTGTAGCAGAAGGAGCGCTTATTGCCAATCCAAAAGTTGGAGAAAATGTCAGGGAAGAAGTTTTTGGTGAGATATCTCGGAAAGCCAAAAGGCATAAACTAAATGGTGGTCATGGTTTCAGCAATCCACACCCTCCTCCCGGGAGGCCTATGTGTTTGAGGCTTCCTCCTGTGGTTGTTGGTGACTTCCTTCAGGTACATTCATGTGTTTTTTTATTATATAGTAATCTACAAAGTACCCCTCCATTCACTAAGTCCTGCCACATGTATAACACTCATTTTTATGTTTGCCTGATCAGGTATCTGAAGTGTTCTGGCGTTTCCGTGAAATTTTGGGTTTGGGAGAGGCTTTCTCCCCTGAGAAGCTTGAACAAGAGATTGTCAATCCAGTGTTCGATGGTTTGTTTCTTGATAAATCTGGGAAAGAAGTTAATAGAAGTGAGATGAACATTAGTGATGAGGATCGTACAGCTACTAAATTTTTATCTTTGTTGGATGAATCTCGCCAACCTTTTTCTTCGGAAAATACCTTTGCTTCTGTACTAAAAGAGACGAAAGCAGGGGATTCTACTGAGTTCAACATTTCAAATTCCTCTCGTGGGCCGTGCGTGGGTGCACTTCTAACAAAGACTCACATTTCGCTTCTGCAAGTGCTAATATGTGAGTTGCAATCCAAGGTAGCTGCATTTGTTGATCCAAACTTTGATTCTGGAGAATCAAGATCCAGACGGGGACGGAAAAAGGATGACTGTACACTTTCTGCTAAAAGAAATAAGCTGCATATGCTTCCTGTTAACGAGTTCACATGGCCTGAATTGGCCCGTAGGTACATTTTGTCTCTTTTATCAATGGATGGGAACCTCGAATCAGCGGAGATTGCTGCTCGTGAAAGTGGTAAGGTATTCCGTTGCTTACAAGGGGATGGTGGTTTGCTCTGTGGTTCACTTACAGGAGTGGATGGGATGGAAGCCGATTCAATGGTATGTTTTTGTTATTTTTCTATTTATTTTCTGGGTTACATATCTTACTTGTATTACTGGTTGACGGGATCACAAATTGAGTGTCTCTTTTGGAACCTATGTGCGGTTTTTCTTGGCCTTCAAATGTTCTATAGTCAGGTTGATCTTTCTCAAGCTTATTAGAAGATATGTTCCAATTGTAGGTGAGTCTAGAGTGTTAAGTTCTTTTGTCTTCTATATTTTGACATTCATATTCTGTTACTCTTGAATATCCCGAAGGTCCTGTTTAATTATACAGTCTGAAAAATCGATTTGCTTTGTGTTGTTATGAGTATTAACTTCCGGGCAAGTCTTTGATTGTTGAGTGTTAATATACGTACATTCCTAAACCACTCTCACAGAGACAGAATGATCTTTGGATTTACGTATACATATTAACTCTTTATCTTCAGTTACTTGCAGAGGCTATTAAAAAAATATTTGGTTCTTTGACAAGAGAAAATGATGTTCTCTCTGTGGAAGATGATGATTCTGATGGCCTTGATGCTACTGAGACAAACGCTTGCAATGGTGATATTCCAGAATGGGCACTGGTTCTGGAACCTGTGAGAAAGCTTCCAACAAATGTTGGGACTAGAATCAGAAAGTGTGTCTATGATGCTTTAGAGAGAAATCCACCAGAGTGGGCAAAGAAGATATTAGAGCATTCCATCAGTAAAGAAGTATATAAAGGCAATGCATCAGGACCGACAAAGGTTCAATCTCTAAAACCAATGCTCTTCCCTCCTGAAGTACATTAAATTTTGAATTGCGTAATTGGAAATTTCTTGTTTCTCGAATTCCCTTTTCTGTCACTTGTTCTTCCGGTGATTTAATCTCAAGTCTGATGACATATGATATTATTTCCCTTTACTGAATACAGAAAGCTGTCCTCTCATTGCTAGCCGATGTTCGAGGTGGTGATTTGGTGCAGAAGTCTGTCAAAGGAACCAAAAAGAGGACGTCTATTGGTGTTTCTGATGTCATTATGAAGAAATGTCGTGCTGTGTTGCGTGATGTTGCAGCTGTAGACGAGGATAAAGTGTTTTGTACTTTATTGGGGCGAAAGTTACTGAATTTAAATGATAATGATGATGACGGACTCTTGGGATCACCTGCAATGGTTTCGCGTCCCCTAGACTTTAGAACTATTGATTTGCGGTTGGCTGTCGGTGCGTATGACGGATCAACTGAAGCTTTTCTTGAGGATATTCTTGAGGTAGGATTCTCCCTCTTTGTCTGATTTTTCTGCAATTGATGGCATGATGCTTTTTGTGCGATATGAGAACTAGTTTCTAAAAGTGACACATCTCCATTTTGGGTATTGCATCTTTGTGCTGTTAGTTTTGCACTATTCATTTGGATGCATGAATGTAAAAGTGTTAACACCATAAATTTAGCTGCTCAGCTGTTGGATAACGTTTTAGCTATGATTAGAAATCGAACCAATTGAGTCTGCCAGTACATGCTTGACTTATTTTTTAAATTTCATTGTGATGGTATACTCGTGGACTCCGTTTTGTTTATGCATGCAACTTTATCTTGTTTCATGGATGACATGCTAATTTTCACTTTCTGATTTGCAGCTGTGGAGTTGTATACGTGTTATGTATGCGGATCAGCCTGATTCTTTAGAACTGGTTGAAAAATTGTCTAAAAAATTTAAGTCACTATACGAAGCCGAGGTTTGTGTCTTTTTCTCCCTTTTCTGCTATGCTCTGTACAACGTATGTTCACAGCTTGGTAGCCTCTTGAAGTCAAATGGTCGAGACAGTCTCATC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CDS Sequence
- >A01p059860.1_BraROA
ATGGAACTCACTGATTCTACGAAAAAGCAACTCGGAGAGACCAGGAGCGCCGCTCTCGACGAAGATAATCGCTCCTTTCTCGGCATCGATCTTAACGAAATCCCTACCGGCGTTACTCCCGGCGGCGCTGTACAGGACGATGACGGAGAGTATGAACCCGTTGAAGTTGTTAGGTCAATTCATGATAATCCGGACCCAGCCCCTGGAGCCCCTGCTGAGGTTCCTGAGCCGGATCGGGATGCCGCGTGCGGCGCCTGTGGAAGGCCGGAGTCGATGGAGCTCGTAGTAGTCTGCGACGCTTGCGAGCGAGGGTTTCATCTTAACTGTGTTAACGACGGAGTGGAGGCTGCTCCTTCCGCCGATTGGATGTGCAGCGACTGTGTTGCCGGCGGCGGGAGGAGTAAACTGTGGCCGTTGGGGGTGAAGTCCAAGCTCATCCTGGATATGAACGCCTCGCCGCCGAGTGATGCCGAGGGATACGGAGGCGAGGATACGTCAGATTCGAGGTACGCAGCTGTGGTTCCATTTTCCGACTATTCGTTAGGAAAGCATATGCTGGCCATGGGGAACTCTTTTGAACATTCAATGACGCATTCAAGCTTTCTGGATCCTGGTAGAGCACATACTTTAGATTTTGGCTTCCCATCAAACCTCGGGAACAGTAGTTTGCCCATCAGATTCCCATCCTTGGATCCAAGCGAGCTCTTGTTGCATAATCTCAGGCATTTCATATCTGAAAGGCACGGAGTTTTAGAAGATGGTTGGCATGTCGAATTTAAACAGCCTTTAAATGGCTATCATCTCTGTCCAGTGTATTGTTCTCCGAGTGGAAAAACATTTAGTTCAATACAAGATGTTGCTTGTTATCTCGGCTTGGCAACTAATGGTAACTACAGCTGTATGGATACTGATATCAGGAATGAGAGTTCTCTTCTTCAAGAAAGATTGAATATGCCCAAGAGAAGAAAGACATCAAGATGGCCAAACAATAGTTTCCCTGACCTAAAGGGTAGTTCAGTGAGTGCTCAGCTCAGTCGTTTTCCATACAATGGTCAGACGATGCCCCCTTTTGCCATTTCATCTGGTGAATCTCTTAGCTCTGGGAATAATGGATGCGGTTGTGAGGAAGCTAATAAAGGACTTCCTATGCAATTTGAAGATTTCTTTGTCCTCTCGCTTGGACGAATTGACATAAGACAGTCTTACCACAATGTCAACATGATTTATCCAATAGGATATAAGTCCTGCTGGCATGATAAAATCACGGGGTCTTTATTTACTTGTGAAGTATCTGGTGGTAGTTCTGGGCCTGTTTTCAAGATTACACGGTCACCATGCTCTAAATCATTTGTTCCAGTTGGATCAACTGTCTTCTCCTGCCCAAAGATTGATGAAATGGTGGAACAGAACATTGACAAACGAGGTGATCGGAGAGACAGTATTCAAGAACATGATGACGACACTGTTGAAATCCTTCTTTCAGATCCATCGCCACCACTTGGAGATGATATATTGTCTTGTTTACAGGAGAAGAGTTTCTCCAGTACATTCTATTGCTTGCGCTCGGAAGTTGGTTCTTCTCAAGTAGACTTAAATAATACTCTATCCTATAATCAGCAGCATGAGGTTGAGATTGGCGATATTATTGTGGAAGAAGATTCATTGTCTGTTGCATGGCAAAAGGTGTCTCAAAAACTTGTTGATGCATGTTCCAATGTCCTGAAGCACAAGGGTACCATGAACTTCCGTTGCAAGCATGTTGACAGAGAAACGAGGGAAATCAACTGGGATACAAGAAATGAGAAAGATAATGTGATTTTATCTTTGTCAAGATTTTGCTGTTCTTTGGCTCCTCACAGTGCTACATGTGGTGGAAAGGATAATAGCGAGATTGCATCTCTAGTTGATGTTTTGTCAAGGTGGCTGGATCAAAGCAGGTTTGGGCTTGATGCAGATTTTGTACAGGAAATGATTGAACGTATGCCTGGTGCCGAATCATGTTCAAATTATAGGTCTCTGAAGACTAGAAGTTCTTCTGTTTCTGTAACTGTAGCAGAAGGAGCGCTTATTGCCAATCCAAAAGTTGGAGAAAATGTCAGGGAAGAAGTTTTTGGTGAGATATCTCGGAAAGCCAAAAGGCATAAACTAAATGGTGGTCATGGTTTCAGCAATCCACACCCTCCTCCCGGGAGGCCTATGTGTTTGAGGCTTCCTCCTGTGGTTGTTGGTGACTTCCTTCAGGTATCTGAAGTGTTCTGGCGTTTCCGTGAAATTTTGGGTTTGGGAGAGGCTTTCTCCCCTGAGAAGCTTGAACAAGAGATTGTCAATCCAGTGTTCGATGGTTTGTTTCTTGATAAATCTGGGAAAGAAGTTAATAGAAGTGAGATGAACATTAGTGATGAGGATCGTACAGCTACTAAATTTTTATCTTTGTTGGATGAATCTCGCCAACCTTTTTCTTCGGAAAATACCTTTGCTTCTGTACTAAAAGAGACGAAAGCAGGGGATTCTACTGAGTTCAACATTTCAAATTCCTCTCGTGGGCCGTGCGTGGGTGCACTTCTAACAAAGACTCACATTTCGCTTCTGCAAGTGCTAATATGTGAGTTGCAATCCAAGGTAGCTGCATTTGTTGATCCAAACTTTGATTCTGGAGAATCAAGATCCAGACGGGGACGGAAAAAGGATGACTGTACACTTTCTGCTAAAAGAAATAAGCTGCATATGCTTCCTGTTAACGAGTTCACATGGCCTGAATTGGCCCGTAGGTACATTTTGTCTCTTTTATCAATGGATGGGAACCTCGAATCAGCGGAGATTGCTGCTCGTGAAAGTGGTAAGGTATTCCGTTGCTTACAAGGGGATGGTGGTTTGCTCTGTGGTTCACTTACAGGAGTGGATGGGATGGAAGCCGATTCAATGTTACTTGCAGAGGCTATTAAAAAAATATTTGGTTCTTTGACAAGAGAAAATGATGTTCTCTCTGTGGAAGATGATGATTCTGATGGCCTTGATGCTACTGAGACAAACGCTTGCAATGGTGATATTCCAGAATGGGCACTGGTTCTGGAACCTGTGAGAAAGCTTCCAACAAATGTTGGGACTAGAATCAGAAAGTGTGTCTATGATGCTTTAGAGAGAAATCCACCAGAGTGGGCAAAGAAGATATTAGAGCATTCCATCAGTAAAGAAGTATATAAAGGCAATGCATCAGGACCGACAAAGGTTCAATCTCTAAAACCAATGCTCTTCCCTCCTGAAAAAGCTGTCCTCTCATTGCTAGCCGATGTTCGAGGTGGTGATTTGGTGCAGAAGTCTGTCAAAGGAACCAAAAAGAGGACGTCTATTGGTGTTTCTGATGTCATTATGAAGAAATGTCGTGCTGTGTTGCGTGATGTTGCAGCTGTAGACGAGGATAAAGTGTTTTGTACTTTATTGGGGCGAAAGTTACTGAATTTAAATGATAATGATGATGACGGACTCTTGGGATCACCTGCAATGGTTTCGCGTCCCCTAGACTTTAGAACTATTGATTTGCGGTTGGCTGTCGGTGCGTATGACGGATCAACTGAAGCTTTTCTTGAGGATATTCTTGAGCTGTGGAGTTGTATACGTGTTATGTATGCGGATCAGCCTGATTCTTTAGAACTGGTTGAAAAATTGTCTAAAAAATTTAAGTCACTATACGAAGCCGAGGTTTGTGTCTTTTTCTCCCTTTTCTGCTATGCTCTGTACAACGTATGTTCACAGCTTGGTAGCCTCTTGAAGTCAAATGGTCGAGACAGTCTCATCAAACAAATTTTGTTAAGGCTTATCGTTTGTGAAAGTTATAGGTCTTTGAGATCAGAGTTAGATGCTTTCGAAGGGTTTTTCCTTTTGTGTGCTTGTAGAATTATCGTTGTGCTTGCCTTTCAGTTTCCAGGAGTTGTTCTACCACTTGCTCAGAAACTTATGGACTACAGAAAATTGGAATGTCTGAGTGCAGAGATGAGGAAGGAAATTAAGGACATTGTTGTTTCAGTAAATAAGCTTCCCAAGGCCCCGTGGGATGAGGGGGTATGTAAAATATGTGGCGTTGACAAAGATGATGACAGTGTTCTCTTGTGTGATACATGCGATGCGGAGTATCACACATATTGTTTGAATCCCCCTCTTATTAGAATTCCTGATGGAAATTGGTATTGTCCCTCATGTGTCATTGCCAAGCGCATGGCTCAAGATGCTTTGGAATCGAACAAACTAGTCAGACGGCGGAAACGTAGAAAGTATCAGGGGGAACTTACCCGAGCTTCTATGGAAACAGCTGCTCGTCTGGTAGATGTGATGGGCGAAAAAGACTACTGGGAGTTCAGTGCTGAGGAGAGAATCCTGGTGCTTAAGCTTCTATGCGATGAACTGCTTAGCTCATCCCTTGTTCATCAACATCTCGAGCAGTGTGCCGAAGCCTTAATTGAAATGCAGCAGAAGTTGCGCTCTCTTTCCTCAGAATGGAAAAACACAAAATTGCGGCAAGAATTTCTGACGGCTAAACTCGCAAAGGTTGAACCTAGTATTCTAAAGGAGATGGGCGAACCACAAAATTCAAGTAGCTTTGCAGACCACCATGGACGTCATCAACAACAGGAGAATGTTGGAGAGAAGGTTCCTCATGATGATGGCACGTCCTCTGCTGCGTTTCTTACCAATAATCAGGGGAAAGCTCCGATTGAGACCCATGCTCAAACTGGAGGGTCAAATGTCATTTCCAGTGAGAACAAAATTCACACCCCAGAAAAAGTTACATCCCCTGGAAGGAACGAGTTGCCAATAGAGGTAACGGATCATATGTCTTGTGAAATAGAAGATACCACAGAGACCTTGGACAAATCAGTTGGAAAGAACCGTGAAACACACTCTATAAAACCTAATGCGGCGGAATTGAAGACAGCACATGATGCATCTTCTCTGGCTTCCCAAGAGTTGCAGGCTTGTCGACAGGATTTGAATGCCACTAGTAATGA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Protein Sequence
- >A01p059860.1_BraROA
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