Gene Details:
- Gene ID: A01p035560.1_BraROA
- Suggest Gene Name: RRP6-LIKE 1
- Description: putative flowering gene
- Species: Brassica rapa ro18
- Source: Putative flowering gene from PlantCFG
Protein Features:
Functional Descriptions:
- Rrp6-like protein, controls RNA-directed DNA methylation by helping with the retention of noncoding RNAs in normal cells.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT1G54440
Sequences:
gDNA Sequence
- >A01p035560.1_BraROA
TGGCAGCCGACGATTCCCCGGGGCTGAAATCCCTGGAGGCGTTGATCGGTGGTTCTCTCCCGGAGAATCTCTCGAAGCTATCTTCTACTTGTCTTGCAATTCCAGCTAATAAGGATTTCCATTTTCTCTGCAATTTCGATGAGTTCAAGCTTCGGATTGATGAGATTTCAGGGACCTCGCAGTGTGTTCTTGAGACGATCGGTGGCTTCTGTGGGAAACCGATGAGATATTCAGGTGATGATGCGTATGACTGGCTTGTTAACCTGAACGATGAAGTTCTCCAGAGAATTGATTTGGATTTGGAAGACACAATGAAGAAGGAAACTGATCCGGTACATGGAAAGGCAAATGTTTCGTTTCATATAGCAACGATAAAGAAGCCTCAGGAGGAGTATAAGATTTTGGTGAACAACGCAAATGTACCGTTTGAGCATGTTTGGTTGGAGAAGAAGGAGAACAATCTAGGCTTTATTCATCCACTGGTTAGTTAATATCTGGAGACTAAAAAAAAAAAGAAGTAGTTTTTCTAATCTAAACATCCAGAATTGTAATCTTTGATCTTCTCTTCTCTTTTGATATGTGTTTGCAGGAGAAACTTTCAGTGATTGACTTTGTTGATAAAGATATATCAGAGATGAAACCTGTTGAACCCCTCTCTTTGGAAGGAATTCCATTCACGCTTGTTGAAGAAATCAATGATCTGAAGGATTTAGCTGCGAAGTTGTCTAGTGTTGATGAGTTTGCTGTAAATACCTTCCTCTGTTTTTCGTTCTCTCTTTTTTTTTTCTATAATAAAAAGAAATGTGCAATGCAGTGGAGGCTGTAAGAGTTTGATTATGCTATGAGTTTTGGTCAAACTATAAGAAAACTAAAATGGATGTGAACTATCAGTATGCTAGTCAGTTTTAGTAACGGACATTTATAGTTTCCCCTATATGTCTCTGTCCCCACTACATTTGTTACATTGACAGACAGAAGTGATGAGTTAGTGATGCTGGTTCTCTTTGATAGATCATGCTTAACCTGAAGTTTCATTGTTTTTGTTTGTTTTGTAGGTTGATCTGGAGCATAATCAGTATAGGTCTTTTCAAGGATTAACATGCTTGATGCAAATATCTACCAGAACGGAGGATTATATAGTCGATACATTCAAGCTTTGGGATCACATTGGTACATATCTCAGGGATATTTTCAAAGACCCTAAAAAGAAAAAGGTTTCCTCCAAAATGCCTAAAGTTTCTTTCCACAGATCCCCTAGTATATGACTACTGCAACATAAACAAATTTAATTTAACTAGGTTATGCATGGAGCAGATCGAGATATTATTTGGCTTCAACGTGACTTCGGCATATATGTTTGCAATCTCTTTGACACAGGACAGGTTTGATTTCTGCTGGAGTTTGTCTTCGCAAGCCATGTTACTTGTAGGCGCATAAAACCACCTTAGCAAAACAAATTTTGAATGTTGACGAATGGAGAAAATAAAATATAATCTTTCAGACCCTTTGTTATTATGTCCATTATCACGACACTGGAATTGCATTCACCCATTTGCGCAGGGTCATTTAGTAAATTTCTTGACGTTCTTGTGGCTATGAGATGATAGTTTTAGTTAGAACTTAGAAGGCACTCAGTTTCGAAAATACTCTTCAGCGCTGCTCTTTGTTTTCTGTCAGTCTTTTTGTGGGAATGTTGATTTTCTTGAATTTCTCAGGCCTCAAGGGTGCTAAAGCTGGAGAGAAAGAGTCTTGAATTTCTTCTGAAACATTATTGTGGAGTTGCTGCAAATAAACAGTGGGTCATAATTCAGCCTTTGTTAACCTTTCTTCTTAAGCACACTCTCACTCTTCGTTCAACGTCTATTATCCTAATTGCCTGCAGATACCAAAATGCAGACTGGAGAATACGACCCCTTCCAGATGTAATGACAAGGTTAGTATATTCTCTGCTCTCTCGTTATTATTGTTATGCATTGGGTGAGTAGAGCTCATACATTTTAATATGGTGGCAGATATGCTAGAGAAGATACACATTATCTTTTGTACATTTATGATGTGATGCGAGTAGATTTGCACACAGTAGCCAAAGAAGACGAGAAACCTGACTCCCCTCTGGTAGAGGTGATAATCATTAGCTATTCGCAAGATCTTCTACCCAGTATTATCCTATCTACGATTTGCCTTCTATATTTCGTTGCATTCAGGGGATGCATCGTGTCCTGCTTTGGTTTTTGGATAATTATTTTGACGAAATTGCTGCTGTTAACAGGTTTACAAGCGCAGCTATGATGTGTGCATGCAACTATATGAGAAAGAGCTTCTGACTGAGAATTCATATCTTCACATTAATGGGTTTGTTGCCTGTTGTCCTCTTCTTGAAAGAAAATATACTCTTTAGTTTTATTGGTTGGCTGTTGTACATGGTTTTTGATTATCCCTTGATCGTTTTCTGCTTTTTATCTAAGTGCAGTTCCCAGTTAGATATTACCCTCTGTGCATGATGTAGCTACCTAAGACTAATCTCTAGTATGTGTTTCCGTTTGGGCATTTTCAGGGTTCAGGCAGCTAATTTCAATGCGGTTCAACTTGCCATTGTTGCGGTATTTTCTCAACTTGCGCAAATACCGCAAGGCACCCTTCATCATATTATCATATGGAGCTTACACAGTAGTTGCTGCCTTGCAGGGGCTTTGTGAATGGCGAGATCGGATTGCACGAGCAGACGATGAAAGCACTGGTTATGTATTACCAAACAAAACTCTTCTTGAAATAGGTAGATATTCTACTTCCACATATCCAGCTTTTTGGATATGATCTCTTTTATCTTGGAAATAAGTGGTTTGGACTAGGTCATGATTTGTTTTAATTAATAATAATAATAGCGAAAGAGATGCCAATTAATGTGGGAAAGTTGCGACGGTTGTTAAAGTTAAAGCTTCCTTACATCGAGCGTAATGTTGACGCGGTGATCAGTGTCATCAGGCGATCAATGCAAAATGCAGCGGCGTTCGAGCCAGTTGTTCAATCCTTAAAAACATGGCATCCTGGAACGGTAAGACATTTGTTATGTTCTTCTGAATTGTTATTATTACTATTTTGGGGGTTTTTTCCTGTTTATATTAACACTAAAATCTATCTTTTCCCTTGTAGTATCCTGCGGTGGCTTATGGCAGTGTTGTTTTATAGAGTTTTTGGAAAGAAATTATGTATTTTTGAAATTGAAGGTTTCAGTTGGGAGTATGTGCTTTTTGAAATGCTTTATTGAATTGATAAGTTTTTAAAGACAGTATTTTAAGTATAAAGGTTTATTATTAGTATCTAAATCCTGCACCGTTCGAATGGTGGTCACTAATCCAAATTCCTAGTAGTTTAGTGGAGCATAACCTTGAGATCATGATTTGTTTTTCTACTTTCGCTATGGGTGCTTAGGTCTTTGAGAATAATATTGAAAGCACCGTTGAGGAAACATGCACAGAAGCTGTTGTAGCTTCTTCTCTGAGTTCAAAGAAGTTTTTGCAGGTTGAAAATGACATCGGGGGCGTCAGGACCACAGTCTTGTATGGTTCAGGAAAGGTGAACCTCTGTTATAAATTATTTGTCGTTTTCCCAAATCTAGGACACAAAAAGACATTATAATATTTTTGTTAGGTTAGTGTGGATGTTTCGGAGGAACAAAGCGGTGGTTTTGGAGCTTTGCCTTCAAAGAGGAAGTTTGGAAGTGAGAACAAGGTGATAACTAATGCTTACATAGAGATTAAGAAAAAGCTTGGATCAATCGGTTATTACCCCAATCTATTGAGAATATGCAGGCAAATGAAGAGGTCAAAGTGTCCAAGTCAAAGCCAGCATGTGTCTCTAAGCCAGCTGAGGTAATTATTCTGTCGGATGACGATGATGAGTATGATGAAGAAACATCGGAACCCGAAGATGCGGCGGATAGTGTTTCAGAAACGCCTTTTAAGGGACTGGATGCATCAATGAACGTGAAGACATTTGGTCCGGATATTATCGTGTTAGATGATGATGACTCAGATGATGATGACTCGGATGATGACTCAGAAACTGGAGATGGTAGGGAAAGGGAAGTTGAAAGGATGAATATGATAAGTGAACAGCAGGGGAAATTCATGAGTTTGAAACCGGGCTTTCTCAACATTTAG
CDS Sequence
- >A01p035560.1_BraROA
ATGGCAGCCGACGATTCCCCGGGGCTGAAATCCCTGGAGGCGTTGATCGGTGGTTCTCTCCCGGAGAATCTCTCGAAGCTATCTTCTACTTGTCTTGCAATTCCAGCTAATAAGGATTTCCATTTTCTCTGCAATTTCGATGAGTTCAAGCTTCGGATTGATGAGATTTCAGGGACCTCGCAGTGTGTTCTTGAGACGATCGGTGGCTTCTGTGGGAAACCGATGAGATATTCAGGTGATGATGCGTATGACTGGCTTGTTAACCTGAACGATGAAGTTCTCCAGAGAATTGATTTGGATTTGGAAGACACAATGAAGAAGGAAACTGATCCGGTACATGGAAAGGCAAATGTTTCGTTTCATATAGCAACGATAAAGAAGCCTCAGGAGGAGTATAAGATTTTGGTGAACAACGCAAATGTACCGTTTGAGCATGTTTGGTTGGAGAAGAAGGAGAACAATCTAGGCTTTATTCATCCACTGGAGAAACTTTCAGTGATTGACTTTGTTGATAAAGATATATCAGAGATGAAACCTGTTGAACCCCTCTCTTTGGAAGGAATTCCATTCACGCTTGTTGAAGAAATCAATGATCTGAAGGATTTAGCTGCGAAGTTGTCTAGTGTTGATGAGTTTGCTGTTGATCTGGAGCATAATCAGTATAGGTCTTTTCAAGGATTAACATGCTTGATGCAAATATCTACCAGAACGGAGGATTATATAGTCGATACATTCAAGCTTTGGGATCACATTGGTACATATCTCAGGGATATTTTCAAAGACCCTAAAAAGAAAAAGGTTATGCATGGAGCAGATCGAGATATTATTTGGCTTCAACGTGACTTCGGCATATATGTTTGCAATCTCTTTGACACAGGACAGGCCTCAAGGGTGCTAAAGCTGGAGAGAAAGAGTCTTGAATTTCTTCTGAAACATTATTGTGGAGTTGCTGCAAATAAACAATACCAAAATGCAGACTGGAGAATACGACCCCTTCCAGATGTAATGACAAGATATGCTAGAGAAGATACACATTATCTTTTGTACATTTATGATGTGATGCGAGTAGATTTGCACACAGTAGCCAAAGAAGACGAGAAACCTGACTCCCCTCTGGTAGAGGTTTACAAGCGCAGCTATGATGTGTGCATGCAACTATATGAGAAAGAGCTTCTGACTGAGAATTCATATCTTCACATTAATGGGGTTCAGGCAGCTAATTTCAATGCGGTTCAACTTGCCATTGTTGCGGGGCTTTGTGAATGGCGAGATCGGATTGCACGAGCAGACGATGAAAGCACTGGTTATGTATTACCAAACAAAACTCTTCTTGAAATAGCGAAAGAGATGCCAATTAATGTGGGAAAGTTGCGACGGTTGTTAAAGTTAAAGCTTCCTTACATCGAGCGTAATGTTGACGCGGTGATCAGTGTCATCAGGCGATCAATGCAAAATGCAGCGGCGTTCGAGCCAGTTGTTCAATCCTTAAAAACATGGCATCCTGGAACGGTCTTTGAGAATAATATTGAAAGCACCGTTGAGGAAACATGCACAGAAGCTGTTGTAGCTTCTTCTCTGAGTTCAAAGAAGTTTTTGCAGGTTGAAAATGACATCGGGGGCGTCAGGACCACAGTCTTGTATGGTTCAGGAAAGGTTAGTGTGGATGTTTCGGAGGAACAAAGCGGTGGTTTTGGAGCTTTGCCTTCAAAGAGGAAGTTTGGAAGTGAGAACAAGGCAAATGAAGAGGTCAAAGTGTCCAAGTCAAAGCCAGCATGTGTCTCTAAGCCAGCTGAGGTAATTATTCTGTCGGATGACGATGATGAGTATGATGAAGAAACATCGGAACCCGAAGATGCGGCGGATAGTGTTTCAGAAACGCCTTTTAAGGGACTGGATGCATCAATGAACGTGAAGACATTTGGTCCGGATATTATCGTGTTAGATGATGATGACTCAGATGATGATGACTCGGATGATGACTCAGAAACTGGAGATGGTAGGGAAAGGGAAGTTGAAAGGATGAATATGATAAGTGAACAGCAGGGGAAATTCATGAGTTTGAAACCGGGCTTTCTCAACATTTAG
Protein Sequence
- >A01p035560.1_BraROA
MAADDSPGLKSLEALIGGSLPENLSKLSSTCLAIPANKDFHFLCNFDEFKLRIDEISGTSQCVLETIGGFCGKPMRYSGDDAYDWLVNLNDEVLQRIDLDLEDTMKKETDPVHGKANVSFHIATIKKPQEEYKILVNNANVPFEHVWLEKKENNLGFIHPLEKLSVIDFVDKDISEMKPVEPLSLEGIPFTLVEEINDLKDLAAKLSSVDEFAVDLEHNQYRSFQGLTCLMQISTRTEDYIVDTFKLWDHIGTYLRDIFKDPKKKKVMHGADRDIIWLQRDFGIYVCNLFDTGQASRVLKLERKSLEFLLKHYCGVAANKQYQNADWRIRPLPDVMTRYAREDTHYLLYIYDVMRVDLHTVAKEDEKPDSPLVEVYKRSYDVCMQLYEKELLTENSYLHINGVQAANFNAVQLAIVAGLCEWRDRIARADDESTGYVLPNKTLLEIAKEMPINVGKLRRLLKLKLPYIERNVDAVISVIRRSMQNAAAFEPVVQSLKTWHPGTVFENNIESTVEETCTEAVVASSLSSKKFLQVENDIGGVRTTVLYGSGKVSVDVSEEQSGGFGALPSKRKFGSENKANEEVKVSKSKPACVSKPAEVIILSDDDDEYDEETSEPEDAADSVSETPFKGLDASMNVKTFGPDIIVLDDDDSDDDDSDDDSETGDGREREVERMNMISEQQGKFMSLKPGFLNI