Gene Details:
- Gene ID: A01p011670.1_BraROA
- Suggest Gene Name: AGAMOUS;AGAMOUS
- Description: putative flowering gene
- Species: Brassica rapa ro18
- Source: Putative flowering gene from PlantCFG
Protein Features:
Functional Descriptions:
- Floral homeotic gene encoding a MADS domain transcription factor. Specifies floral meristem and carpel and stamen identity. Binds CArG box sequences. It is the only C function gene. It interacts genetically with the other homeotic genes to specify the floral organs.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT4G18960
- Glycine max — Glyma.13G223300
Sequences:
gDNA Sequence
- >A01p011670.1_BraROA
TGGCTTACCAAATGGAGCTAGGAGGAGAATCCTCTCCACAAAGGAAAGCTGGGAGAGGAAAGATCGAAATAAAACGGATCGAGAACACAACGAACCGTCAAGTTACTTTCTGCAAACGCAGAAATGGTTTGCTCAAGAAAGCTTACGAACTCTCTGTTCTTTGTGATGCTGAAGTCGCACTCATTGTCTTCTCTAGCCGTGGCCGTCTCTATGAGTACTCAAACAACAGGTATCTTCTTTCTGATCTGTTCTTAATTAAAAATTTTAATAGATCAATTACTTTAAGAATTTTTAATAGATTAATTACTTTAAGAGTCACCGTGTTAGGGTTATGTTAGTGGTCGAATCTTTACTAGGGTTCTTGATCTTCTATGCTTGATTTGATTCGATTCTTCTTTGATGGGCATAATCCCTCTTGCGTGTCGATTAACTATTTTTCACTTTTTTCTTGACATTCCATTTTTAAACACACACTAACACACTTAACACTTGTGAGAATTTTTGTTGGTACTTATGTTTATGTTAATTATACTTTGCGATTTTATTCATAGATTTTGTACTTAATTATTATCTAGATCTGGCTTCTTCTTCATGTGTCTCTTTTCCCTTTATTAGACTAAAAAATTATTCCTTAGGTAAAACTTGTTATCTATTAAGTGATGAAAATGGTACAAAAGTTATGGAGATCTGAGTGAGTGTTAGATAATAAATGAAAAAATAAGAAAAAAAATCAGAGTTTTTCTAATGTGGAGTTTTAGATTCAGTTTTGTAGAACTAAGATTCACTTTGTTGGGGTTTCTTTCATCACTCCTTTCTGTTATATATAATATATTATAACTTTCTATTTTCCCTACTAACAAGTACTCCAAGATTTAGATATATTTTTAGATCTGGTGTTGTAATGGGTAAAATCTTGATTTTTATGACTATAAAAGTAAGTTTTGGGAAACAATTTGAGAGCGTAAGGACTATGAGGTCATATCTTCTGTTTTTGTGATCATATACCCATCCTCCATTGTTGCTAATGTCTGTGTCTCTCTTTCCCTTCTCTTCTTTCTCTTACTTTCCTTTCTCATCTTTGCCTCTTTTCTCTCTCATGAATTATCATATGTGATGCAACAACATGTGATGGTATGTGCGAGTAAATAAGGTGAAAGATATTGATTTTTGAGTGTCCAAAATTTTAAATTAATTAGTGCCAGAAATAATGGAAAGTACAAGTAGGACAATATGGTTTTTGTCTTGGTGAATGTTAAGTTTTATTTATTTTGCAGTTATGGAAAAATATCAAATATCTTTGAGCTTAGATTAGTTAGAAGTGGTTATAGCTAAAAGAAAAAAAGTTTTTCAACGCCAAACAATACGAAATTTCGATTTTCAGTTGGAGTTTTAAGATTTAAAATAAGACTGGCAGTCTCTAATCCCACACGTAATTCCCAATATTTGTTAGAATCCACGTGATTTTCTCTTCTCTCAAACATAAAACATGTCAAAAGTGAATGCTGTAAACAAAGTCTTGTTTTCCTAATAGCTTACAGTTGTCAACTCATGTCCAAAGAAAGAAAAGCTAACAAAGACTTCTAAGCTGAACGTACGTTTCATATATTCTTGTTTTCAAGATTTTTTACCTTTATTTAGAGGTTAGTATTGAGCGCAATATTAGGTTTGGCCTCTGTAAGATTTGTTGTCTTTGTTACAGAATCTTTGATCACGTCATCCCTCAGATATTATTTACTTTTATTTATCACTTATATTTATTAATAGTATAAAGTTTTGATAGTTTCAGTTCTTGACTTCTGACAAGAAGGTTATGTCATCATGAATTACTTGATAAATTCGAAAATCTCATATTACTACTTTTGACCATTTAATACTAGATTTCACATTTGGTCAATACCTAATATAATTATCCCTCCTGAAGAAAGCCAAATCAGAATTCAATTCACATTATGTGTACATGTACACAAAGAGATAAATAATAAAAGGATATACTTAATATTGTTTCATAGTTCTACGAATCTTAAAAAAGATTAATGATCGCTGAATCAGTAACTTTGGTATAGAAGAAGCTCGTTGGGGTTGCTTCAACATCTTTGCTGTAGATACATTTGTGCAATTTCATTTTCTTTGTTTTTGAATTATTTTTTGGTCTAAGGAGAGAAAGTTAGGGCTTTTCTCATTTTCTTTCTCCTATGGGCAGAGAAAGTCTTTTGAATAAATAAATAAATAAAATGAAACTTTTTGTGATGTCTTCTGTGATCCTATAATGAACGGCTATGGATTCTCCATCGAAGGGTCAGGCATCATAATTTATAATATGCCATTGTACTTAATAATATGTATATGTGTATGTATTAATGCATCTGTATACTTACAGAGACTCAGAAAAAGATAAATGGGTCGAATAGTAATTGAATGATATTCCAAATAAGGAAAGTATGGAACGTTGTGATGTTACTCGGACAAGTCATTTAGTTACATCACAATTAAATTAATCCGATGGTTAAGAACTATAAACTATCAAATGTCTACTGGATTTACCATTGTGCAATGGGTTTTCGACACGTGTAGAAAACCCTAGACATGTTCAGACCAATCATGTCACTCAATTTCGCCAGCATGGAAGTTGTAGCCAATCACTAGCTCGATAAATTTAAGGTTTCAGTAAATGATTCTTTATTTGTTACAACTTTGAGGAATATTTAATCAACGGTAATTTATTTCTTGTATCTACTTTTTTCTTTACATCATGTCACGTTATGTTTCATTTTGTTCTGACTCAAGAGAACCGATGTTTGCTTTTAAGGTTTCGTATTAAAATCACTCAACTGAGCAAGTGGATGATTTGACCCTTAGTTATTTTTCCATATTTTTCGAATTGGTGACTTTAGTTTTGATTGTATAGTTAATAGTAATTTTTCACAAAAAAGAGAGTTAATTCTAATCAACTTATTTATTCCATTGCAAAAATGTTGCAGTGTAAAAGGGACAATTGAGAGGTACAAGAAAGCAATATCGGATAATTCTAACACCGGATCCGTGGCAGAAATTAATGCACAGGTAACTTAATATTACAAGTACGATTTTAAGTTTTCCAAAAACTTATGTGCTAATATAAATGCTAACACTTCCATACCTCACTCTTTTTCAAGTATTATCAACAAGAATCTGCCAAATTGCGTCAACAAATTATCAGCATACAAAACTCGAACAGGTTAATATCTTTTAAATGACTTGAGATGCTTTTTGATTAATTCATTAGTACGCTGGTATGAACTATCTCAGATATCAATACTTTTTGTAAAATTAATTAGGCAATTGATGGGTGAGACGATTGGGTCAATGTCTCCCAAAGAGCTCAGGAACTTGGAAGGCAGATTAGACAGAAGTGTTAATCGAATCCGATCCAAGAAGGTAACTGTATTTAATTAATTAATGCTTCAATGTCAATTCATTTACTAGGAAGTTTATATATTCACTTTTACTAATTTTTTTTTTTATAGAACGAACTCTTATTCGCCGAAATTGACTACATGCAGAAGAGAGTAAGAAACCATATTATATCTACTTTTCTTTCCATTGTTAATTTGTATTTATGGTAATTTGGCTCATTTGTAAAGTCTGTGCAGGAAGTTGATTTGCATAACGATAACCAGCTTCTTCGTGCTAAGGTATTTTGCACATTTGTCTGTTTTTGCGTATTATTTTATTATAACATCAACAAGGTTATTAGAATGATTAAATACTAACCAAATACATGTGCGTAAATGTGTATATATATATAGATAGCTGAAAATGAGAGGAACAATCCAAGTATGAGTCTGATGCCAGGAGGATCTAACTACGAGCAGATCATGCCACCGCCACAAACGCAACCTCAACCGTTTGACTCACGGAACTATTTCCAAGTCGCGGCATTGCAACCTAACAATCACCATTACTCATCCGCAGGTCGCGAAGACCAAACCGCTCTTCAGTTAGTGTAAGACAACAAAAATTGTTATATAAATATTTCTAGGCATAAATTTGATCTTTTTGTTTCATGTACTTTGCAGGTAA
CDS Sequence
- >A01p011670.1_BraROA
ATGGCTTACCAAATGGAGCTAGGAGGAGAATCCTCTCCACAAAGGAAAGCTGGGAGAGGAAAGATCGAAATAAAACGGATCGAGAACACAACGAACCGTCAAGTTACTTTCTGCAAACGCAGAAATGGTTTGCTCAAGAAAGCTTACGAACTCTCTGTTCTTTGTGATGCTGAAGTCGCACTCATTGTCTTCTCTAGCCGTGGCCGTCTCTATGAGTACTCAAACAACAGTGTAAAAGGGACAATTGAGAGGTACAAGAAAGCAATATCGGATAATTCTAACACCGGATCCGTGGCAGAAATTAATGCACAGTATTATCAACAAGAATCTGCCAAATTGCGTCAACAAATTATCAGCATACAAAACTCGAACAGGCAATTGATGGGTGAGACGATTGGGTCAATGTCTCCCAAAGAGCTCAGGAACTTGGAAGGCAGATTAGACAGAAGTGTTAATCGAATCCGATCCAAGAAGAACGAACTCTTATTCGCCGAAATTGACTACATGCAGAAGAGAGAAGTTGATTTGCATAACGATAACCAGCTTCTTCGTGCTAAGATAGCTGAAAATGAGAGGAACAATCCAAGTATGAGTCTGATGCCAGGAGGATCTAACTACGAGCAGATCATGCCACCGCCACAAACGCAACCTCAACCGTTTGACTCACGGAACTATTTCCAAGTCGCGGCATTGCAACCTAACAATCACCATTACTCATCCGCAGGTCGCGAAGACCAAACCGCTCTTCAGTTAGTGTAA
Protein Sequence
- >A01p011670.1_BraROA
MAYQMELGGESSPQRKAGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYSNNSVKGTIERYKKAISDNSNTGSVAEINAQYYQQESAKLRQQIISIQNSNRQLMGETIGSMSPKELRNLEGRLDRSVNRIRSKKNELLFAEIDYMQKREVDLHNDNQLLRAKIAENERNNPSMSLMPGGSNYEQIMPPPQTQPQPFDSRNYFQVAALQPNNHHYSSAGREDQTALQLV