Gene Details:
- MSU gene ID: None
- RAPdb gene ID: Os07g0604350
- Gene Symbol: OsBC1L6
- Genome: MSU7 , IRGSP-1.0
- Species: Oryza sativa
Functional Descriptions:
- These findings suggest that OsBC1L6 modulates β-glucan synthesis during endosperm cell wall formation by interacting with cellulose moieties on the plasma membrane during seed ripening.
- OsBC1L6 mRNA was expressed in ripening seeds during endosperm enlargement.
Function-related keywords:
- seed , cellulose , cell-wall , endosperm , plasma-membrane
Literature:
- Oryza sativa Brittle Culm 1-like 6 modulates β-glucan levels in the endosperm cell wall . DOI: 10.1371/journal.pone.0217212 ; PMID: 31120929
Related News:
Gene Resources:
Sequences:
cDNA Sequence
- >LOC_Os12g44380.3
TGTGGTCTTTGTTATGCCTTTGCATTCTATGGGAAACACCTGATGCAAACATTACATTCAGAAGGCATGATTGTGCTTTTTGTCATGGAAATGCTGGAGTTCCACGAGAATGACCCAAGGAGGACTCGGATAGCTAATGCTTACTTCTCATTGTTCATGGCCCTGGGAAACATACTTGGATATGCCACTGGAGCATACAGTGGCTGGTACAAGATATTCCCGTTCACCGTTACTCCATCATGTAGCATCAGCTGTGCCAACCTCAAGTCTGCCTTTCTACTTGATATTATCATTTTGGTGGTCACTACATGCATCACTGTAGCATCAGTGCAAGAGCCTCAATCCTTTGGAAGTGATGAAGCAGATCACCCTAGCACAGAACAGGAAGCTTTCCTCTGGGAACTTTTTGGATCATTCCGGTACTTTACATTACCGGTTTGGATGGTTTTGATTGTTACTGCCCTCACATGGATTGGATGGTTTCCATTTATCCTCTTTGATACCGATTGGATGGGTCGAGAGATCTATCGTGGAAGTCCAGATGATCCAAGTATAACTCAGAGCTATCATGATGGTGTGAGAATGGGTTCTTTTGGTCTGATGCTGAACTCGGTCCTTCTTGGATTCACTTCTATTGTACTAGAGAAGTTATGTCGGAAGTGGGGAGCTGGACTGGTGTGGGGTGTCTCCAATATCCTAATGGCATTGTGCTTTGTGGCAATGCTTGTAATAACATATGTGGCAAAGAATATGGATTATCCACCTAGTGGAGTACCACCAACCGGCATTGTCATTGCTTCCCTGGTAGTTTTTACAATTTTAGGAGCGCCCCTGGCGATCACGTACAGTATACCATATGCAATGGCTGCTAGTCGGGTTGAAAATCTGGGACTTGGCCAAGGTCTAGCAATGGGCATTCTTAATTTGGCTATTGTCATACCACAGGTTATTGTGTCACTGGGTAGCGGGCCCTGGGACCAACTGTTTGGTGGTGGCAATGCACCAGCCTTTGCAGTGGCTGCTGCTGCATCTTTTATCGGTGGGCTGGTGGCTATTCTGGGCCTTCCACGAGCCCGCATTGCATCAAGGAGGAGAGGTCACCGATAAGAATATTGCTACATATAAATTGTCGGCCATTCTTTGCAATTCGACTCATAAGAGGCACTCGGAACGCTATGCAGTGCATGGGGGAATTGTATATTATCTCCGAATCAAGAAGGGGATAATGCTTGCTTTCTCCATGAGCTATTTTTGCCTTTTTCATGCCGGATCATCATATGCTGTCGTACATTGGATGATCTTATGCTGTTGTACATTGGATGTTGGTCATTTGTAGAGATACTAGTGAATAAAAGTTGCAGGAGTTGGTTCACTCGAGAAAATTCTGGTCAGTATGTCGTCCATCTGCTGCACGACAGCAGTTAGGAGCCGAATAGCATGTCCATGGGTTTTCATCAAATGTTGTATCATCATTTGTTTTTTGATACGTTCAGACGGCTTCAGTGCTGTGTGAATATATATGTATGGAATATATCGAGAAAATGTTGTTGTAACATTTGGTTTTTGATCGTTGAGACGA - >LOC_Os12g44380.2
TGTGGTCTTTGTTATGCCTTTGCATTCTATGGGAAACACCTGATGCAAACATTACATTCAGAAGGCATGATTGTGCTTTTTGTCATGGAAATGCTGGAGTTCCACGAGAATGACCCAAGGAGGACTCGGATAGCTAATGCTTACTTCTCATTGTTCATGGCCCTGGGAAACATACTTGGATATGCCACTGGAGCATACAGTGGCTGGTACAAGATATTCCCGTTCACCGTTACTCCATCATGTAGCATCAGCTGTGCCAACCTCAAGTCTGCCTTTCTACTTGATATTATCATTTTGGTGGTCACTACATGCATCACTGTAGCATCAGTGCAAGAGCCTCAATCCTTTGGAAGTGATGAAGCAGATCACCCTAGCACAGAACAGGAAGCTTTCCTCTGGGAACTTTTTGGATCATTCCGGTACTTTACATTACCGGTTTGGATGGTTTTGATTGTTACTGCCCTCACATGGATTGGATGGTTTCCATTTATCCTCTTTGATACCGATTGGATGGGTCGAGAGATCTATCGTGGAAGTCCAGATGATCCAAGTATAACTCAGAGCTATCATGATGGTGTGAGAATGGGTTCTTTTGGTCTGATGCTGAACTCGGTCCTTCTTGGATTCACTTCTATTGTACTAGAGAAGTTATGTCGGAAGTGGGGAGCTGGACTGGTGTGGGGTGTCTCCAATATCCTAATGGCATTGTGCTTTGTGGCAATGCTTGTAATAACATATGTGGCAAAGAATATGGATTATCCACCTAGTGGAGTACCACCAACCGGCATTGTCATTGCTTCCCTGGTAGTTTTTACAATTTTAGGAGCGCCCCTGGCGATCACGTACAGTATACCATATGCAATGGCTGCTAGTCGGGTTGAAAATCTGGGACTTGGCCAAGGTCTAGCAATGGGCATTCTTAATTTGGCTATTGTCATACCACAGGTTATTGTGTCACTGGGTAGCGGGCCCTGGGACCAACTGTTTGGTGGTGGCAATGCACCAGCCTTTGCAGTGGCTGCTGCTGCATCTTTTATCGGTGGGCTGGTGGCTATTCTGGGCCTTCCACGAGCCCGCATTGCATCAAGGAGGAGAGGTCACCGATAAGAATATTGCTACATATAAATTGTCGGCCATTCTTTGCAATTCGACTCATAAGAGGCACTCGGAACGCTATGCAGTGCATGGGGGAATTGTATATTATCTCCGAATCAAGAAGGGGATAATGCTTGCTTTCTCCATGAGCTATTTTTGCCTTTTTCATGCCGGATCATCATATGCTGTCGTACATTGGATGATCTTATGCTGTTGTACATTGGATGTTGGTCATTTGTAGAGATACTAGTGAATAAAAGTTGCAGGAGTTGGTTCACTCGAGAAAATTCTGGTCAGTATGTCGTCCATCTGCTGCACGACAGCAGTTAGGAGCCGAATAGCATGTCCATGGGTTTTCATCAAATGTTGTATCATCATTTGTTTTTTGATACGTTCAGACGGCTTCAGTGCTGTGTGAATATATATGTATGGAATATATCGAGAAAATGTTGTTGTAACATTTGGTTTTTGATCGTTGAGACGA - >LOC_Os12g44380.1
TGTGGTCTTTGTTATGCCTTTGCATTCTATGGGAAACACCTGATGCAAACATTACATTCAGAAGGCATGATTGTGCTTTTTGTCATGGAAATGCTGGAGTTCCACGAGAATGACCCAAGGAGGACTCGGATAGCTAATGCTTACTTCTCATTGTTCATGGCCCTGGGAAACATACTTGGATATGCCACTGGAGCATACAGTGGCTGGTACAAGATATTCCCGTTCACCGTTACTCCATCATGTAGCATCAGCTGTGCCAACCTCAAGTCTGCCTTTCTACTTGATATTATCATTTTGGTGGTCACTACATGCATCACTGTAGCATCAGTGCAAGAGCCTCAATCCTTTGGAAGTGATGAAGCAGATCACCCTAGCACAGAACAGGAAGCTTTCCTCTGGGAACTTTTTGGATCATTCCGGTACTTTACATTACCGGTTTGGATGGTTTTGATTGTTACTGCCCTCACATGGATTGGATGGTTTCCATTTATCCTCTTTGATACCGATTGGATGGGTCGAGAGATCTATCGTGGAAGTCCAGATGATCCAAGTATAACTCAGAGCTATCATGATGGTGTGAGAATGGGTTCTTTTGGTCTGATGCTGAACTCGGTCCTTCTTGGATTCACTTCTATTGTACTAGAGAAGTTATGTCGGAAGTGGGGAGCTGGACTGGTGTGGGGTGTCTCCAATATCCTAATGGCATTGTGCTTTGTGGCAATGCTTGTAATAACATATGTGGCAAAGAATATGGATTATCCACCTAGTGGAGTACCACCAACCGGCATTGTCATTGCTTCCCTGGTAGTTTTTACAATTTTAGGAGCGCCCCTGGCGATCACGTACAGTATACCATATGCAATGGCTGCTAGTCGGGTTGAAAATCTGGGACTTGGCCAAGGTCTAGCAATGGGCATTCTTAATTTGGCTATTGTCATACCACAGGTTATTGTGTCACTGGGTAGCGGGCCCTGGGACCAACTGTTTGGTGGTGGCAATGCACCAGCCTTTGCAGTGGCTGCTGCTGCATCTTTTATCGGTGGGCTGGTGGCTATTCTGGGCCTTCCACGAGCCCGCATTGCATCAAGGAGGAGAGGTCACCGATAAGAATATTGCTACATATAAATTGTCGGCCATTCTTTGCAATTCGACTCATAAGAGGCACTCGGAACGCTATGCAGTGCATGGGGGAATTGTATATTATCTCCGAATCAAGAAGGGGATAATGCTTGCTTTCTCCATGAGCTATTTTTGCCTTTTTCATGCCGGATCATCATATGCTGTCGTACATTGGATGATCTTATGCTGTTGTACATTGGATGTTGGTCATTTGTAGAGATACTAGTGAATAAAAGTTGCAGGAGTTGGTTCACTCGAGAAAATTCTGGTCAGTATGTCGTCCATCTGCTGCACGACAGCAGTTAGGAGCCGAATAGCATGTCCATGGGTTTTCATCAAATGTTGTATCATCATTTGTTTTTTGATACGTTCAGACGGCTTCAGTGCTGTGTGAATATATATGTATGGAATATATCGAGAAAATGTTGTTGTAACATTTGGTTTTTGATCGTTGAGACGA
CDS Sequence
- >LOC_Os12g44380.3
ATGCAAACATTACATTCAGAAGGCATGATTGTGCTTTTTGTCATGGAAATGCTGGAGTTCCACGAGAATGACCCAAGGAGGACTCGGATAGCTAATGCTTACTTCTCATTGTTCATGGCCCTGGGAAACATACTTGGATATGCCACTGGAGCATACAGTGGCTGGTACAAGATATTCCCGTTCACCGTTACTCCATCATGTAGCATCAGCTGTGCCAACCTCAAGTCTGCCTTTCTACTTGATATTATCATTTTGGTGGTCACTACATGCATCACTGTAGCATCAGTGCAAGAGCCTCAATCCTTTGGAAGTGATGAAGCAGATCACCCTAGCACAGAACAGGAAGCTTTCCTCTGGGAACTTTTTGGATCATTCCGGTACTTTACATTACCGGTTTGGATGGTTTTGATTGTTACTGCCCTCACATGGATTGGATGGTTTCCATTTATCCTCTTTGATACCGATTGGATGGGTCGAGAGATCTATCGTGGAAGTCCAGATGATCCAAGTATAACTCAGAGCTATCATGATGGTGTGAGAATGGGTTCTTTTGGTCTGATGCTGAACTCGGTCCTTCTTGGATTCACTTCTATTGTACTAGAGAAGTTATGTCGGAAGTGGGGAGCTGGACTGGTGTGGGGTGTCTCCAATATCCTAATGGCATTGTGCTTTGTGGCAATGCTTGTAATAACATATGTGGCAAAGAATATGGATTATCCACCTAGTGGAGTACCACCAACCGGCATTGTCATTGCTTCCCTGGTAGTTTTTACAATTTTAGGAGCGCCCCTGGCGATCACGTACAGTATACCATATGCAATGGCTGCTAGTCGGGTTGAAAATCTGGGACTTGGCCAAGGTCTAGCAATGGGCATTCTTAATTTGGCTATTGTCATACCACAGGTTATTGTGTCACTGGGTAGCGGGCCCTGGGACCAACTGTTTGGTGGTGGCAATGCACCAGCCTTTGCAGTGGCTGCTGCTGCATCTTTTATCGGTGGGCTGGTGGCTATTCTGGGCCTTCCACGAGCCCGCATTGCATCAAGGAGGAGAGGTCACCGATAA - >LOC_Os12g44380.2
ATGCAAACATTACATTCAGAAGGCATGATTGTGCTTTTTGTCATGGAAATGCTGGAGTTCCACGAGAATGACCCAAGGAGGACTCGGATAGCTAATGCTTACTTCTCATTGTTCATGGCCCTGGGAAACATACTTGGATATGCCACTGGAGCATACAGTGGCTGGTACAAGATATTCCCGTTCACCGTTACTCCATCATGTAGCATCAGCTGTGCCAACCTCAAGTCTGCCTTTCTACTTGATATTATCATTTTGGTGGTCACTACATGCATCACTGTAGCATCAGTGCAAGAGCCTCAATCCTTTGGAAGTGATGAAGCAGATCACCCTAGCACAGAACAGGAAGCTTTCCTCTGGGAACTTTTTGGATCATTCCGGTACTTTACATTACCGGTTTGGATGGTTTTGATTGTTACTGCCCTCACATGGATTGGATGGTTTCCATTTATCCTCTTTGATACCGATTGGATGGGTCGAGAGATCTATCGTGGAAGTCCAGATGATCCAAGTATAACTCAGAGCTATCATGATGGTGTGAGAATGGGTTCTTTTGGTCTGATGCTGAACTCGGTCCTTCTTGGATTCACTTCTATTGTACTAGAGAAGTTATGTCGGAAGTGGGGAGCTGGACTGGTGTGGGGTGTCTCCAATATCCTAATGGCATTGTGCTTTGTGGCAATGCTTGTAATAACATATGTGGCAAAGAATATGGATTATCCACCTAGTGGAGTACCACCAACCGGCATTGTCATTGCTTCCCTGGTAGTTTTTACAATTTTAGGAGCGCCCCTGGCGATCACGTACAGTATACCATATGCAATGGCTGCTAGTCGGGTTGAAAATCTGGGACTTGGCCAAGGTCTAGCAATGGGCATTCTTAATTTGGCTATTGTCATACCACAGGTTATTGTGTCACTGGGTAGCGGGCCCTGGGACCAACTGTTTGGTGGTGGCAATGCACCAGCCTTTGCAGTGGCTGCTGCTGCATCTTTTATCGGTGGGCTGGTGGCTATTCTGGGCCTTCCACGAGCCCGCATTGCATCAAGGAGGAGAGGTCACCGATAA - >LOC_Os12g44380.1
ATGCAAACATTACATTCAGAAGGCATGATTGTGCTTTTTGTCATGGAAATGCTGGAGTTCCACGAGAATGACCCAAGGAGGACTCGGATAGCTAATGCTTACTTCTCATTGTTCATGGCCCTGGGAAACATACTTGGATATGCCACTGGAGCATACAGTGGCTGGTACAAGATATTCCCGTTCACCGTTACTCCATCATGTAGCATCAGCTGTGCCAACCTCAAGTCTGCCTTTCTACTTGATATTATCATTTTGGTGGTCACTACATGCATCACTGTAGCATCAGTGCAAGAGCCTCAATCCTTTGGAAGTGATGAAGCAGATCACCCTAGCACAGAACAGGAAGCTTTCCTCTGGGAACTTTTTGGATCATTCCGGTACTTTACATTACCGGTTTGGATGGTTTTGATTGTTACTGCCCTCACATGGATTGGATGGTTTCCATTTATCCTCTTTGATACCGATTGGATGGGTCGAGAGATCTATCGTGGAAGTCCAGATGATCCAAGTATAACTCAGAGCTATCATGATGGTGTGAGAATGGGTTCTTTTGGTCTGATGCTGAACTCGGTCCTTCTTGGATTCACTTCTATTGTACTAGAGAAGTTATGTCGGAAGTGGGGAGCTGGACTGGTGTGGGGTGTCTCCAATATCCTAATGGCATTGTGCTTTGTGGCAATGCTTGTAATAACATATGTGGCAAAGAATATGGATTATCCACCTAGTGGAGTACCACCAACCGGCATTGTCATTGCTTCCCTGGTAGTTTTTACAATTTTAGGAGCGCCCCTGGCGATCACGTACAGTATACCATATGCAATGGCTGCTAGTCGGGTTGAAAATCTGGGACTTGGCCAAGGTCTAGCAATGGGCATTCTTAATTTGGCTATTGTCATACCACAGGTTATTGTGTCACTGGGTAGCGGGCCCTGGGACCAACTGTTTGGTGGTGGCAATGCACCAGCCTTTGCAGTGGCTGCTGCTGCATCTTTTATCGGTGGGCTGGTGGCTATTCTGGGCCTTCCACGAGCCCGCATTGCATCAAGGAGGAGAGGTCACCGATAA
Protein Sequence
- >LOC_Os12g44380.3
MQTLHSEGMIVLFVMEMLEFHENDPRRTRIANAYFSLFMALGNILGYATGAYSGWYKIFPFTVTPSCSISCANLKSAFLLDIIILVVTTCITVASVQEPQSFGSDEADHPSTEQEAFLWELFGSFRYFTLPVWMVLIVTALTWIGWFPFILFDTDWMGREIYRGSPDDPSITQSYHDGVRMGSFGLMLNSVLLGFTSIVLEKLCRKWGAGLVWGVSNILMALCFVAMLVITYVAKNMDYPPSGVPPTGIVIASLVVFTILGAPLAITYSIPYAMAASRVENLGLGQGLAMGILNLAIVIPQVIVSLGSGPWDQLFGGGNAPAFAVAAAASFIGGLVAILGLPRARIASRRRGHR* - >LOC_Os12g44380.2
MQTLHSEGMIVLFVMEMLEFHENDPRRTRIANAYFSLFMALGNILGYATGAYSGWYKIFPFTVTPSCSISCANLKSAFLLDIIILVVTTCITVASVQEPQSFGSDEADHPSTEQEAFLWELFGSFRYFTLPVWMVLIVTALTWIGWFPFILFDTDWMGREIYRGSPDDPSITQSYHDGVRMGSFGLMLNSVLLGFTSIVLEKLCRKWGAGLVWGVSNILMALCFVAMLVITYVAKNMDYPPSGVPPTGIVIASLVVFTILGAPLAITYSIPYAMAASRVENLGLGQGLAMGILNLAIVIPQVIVSLGSGPWDQLFGGGNAPAFAVAAAASFIGGLVAILGLPRARIASRRRGHR* - >LOC_Os12g44380.1
MQTLHSEGMIVLFVMEMLEFHENDPRRTRIANAYFSLFMALGNILGYATGAYSGWYKIFPFTVTPSCSISCANLKSAFLLDIIILVVTTCITVASVQEPQSFGSDEADHPSTEQEAFLWELFGSFRYFTLPVWMVLIVTALTWIGWFPFILFDTDWMGREIYRGSPDDPSITQSYHDGVRMGSFGLMLNSVLLGFTSIVLEKLCRKWGAGLVWGVSNILMALCFVAMLVITYVAKNMDYPPSGVPPTGIVIASLVVFTILGAPLAITYSIPYAMAASRVENLGLGQGLAMGILNLAIVIPQVIVSLGSGPWDQLFGGGNAPAFAVAAAASFIGGLVAILGLPRARIASRRRGHR*