Information report for OsSHL1
Gene Details
|
|
Functional Descriptions
Literature and News
Sequences
cDNA Sequence
- >LOC_Os07g08880.3
GAGACCCAAAAAGAAAACCACGAATTCCCAATAAAGAAATAGGCAAAATTCCCCATCTCCTCGTCTCCTCCCAACTCCAAACCCTAGCTCCCACCCCCTCTCGCCGTCGCCGTCGCGTCCCATGGCGAAGTCGCGGCCGCCCAAGCGGATCCTCGAGTCCTACACCATCAAGGGCTCCGACAAAGTCATCAAGCCTGGGGACTGTGTGCTAATGAGGGCATCTGATACATCAAAGCCACCCTATGTGGCAAGAGTTGAGGCTATTGAGGCTGCAGGGTCACGAGGCACAAATGTGAGAGTACGGGTGCGGTGGTACTATCGGCCAGAGGAGTCCATGGGTGGAAGGCGTCCATTTCATGGTGCCAAAGAGGTGTTCCTCTCGGATCACTATGACGTACAGAGTGCTGACACCATAGAGGGAAAGTGCAACGTTCACAGCTTCCGTAGCTACACAAAGCTTGATTCTGTCAATGCTGAGGACTTCTTCTGTCGCTTTGAGTACAAATCAGCCACAGGAAGCTTCGTGCCCGACCGCATTGCTGTGTTCTGCAAGTGTGAGATGCCATACAATCCTGATGACCTTATGATCCAATGTTTCACCCTTCTTGCATTGGAATGACTATTAAAGATGCAAAAAAACTAGAGCATTTTTTCTGCCAGAGCTGTACTGCGGAAAATGGAAAGATGGCTGAGAATTCTCATGAAGCTACAGCGCAATCCGAAGAAAAGCAGGTGGAGTCAAAAAGACGGAGAAGGTGACTGCCCCCCAGATTCATTGACGAGATACACCTGGATGTACAAAGCCTTCTCAAGTTGGTGTAATGCTATTTATTTGTCATGGCAAGTGTGTGTGACCCACGACCACGAGAGTCCCTTCCTGTAATGTCAGTCGCATGGTGTACATAAACTTTTCAACCTGAGACTGTTGTATTAGGAGACGACACGACCTGTTGTTGTTGCATGATGTTTTTAGCAGCGTCAGAATTAGCATGGTAGAGTCGGGTGATGAAGCCCCTCGCGGGCATTAGGACTCCCGTATGGATGTTATCACTGATCATACATTGATACTACATTGGATGCAGTTGAGTCTGTCATCTGCGTTTGTCTTTGGAGAATTCTTGTACCATCAATCCATCATGTGAACTTTGATTCTTTTCGAGACGCTTCGTAATTAATGCAGGCATTTCTGTGTGGGTAGTCA - >LOC_Os07g08880.2
GAGACCCAAAAAGAAAACCACGAATTCCCAATAAAGAAATAGGCAAAATTCCCCATCTCCTCGTCTCCTCCCAACTCCAAACCCTAGCTCCCACCCCCTCTCGCCGTCGCCGTCGCGTCCCATGGCGAAGTCGCGGCCGCCCAAGCGGATCCTCGAGTCCTACACCATCAAGGGCTCCGACAAAGTCATCAAGCCTGGGGACTGTGTGCTAATGAGGGCATCTGATACATCAAAGCCACCCTATGTGGCAAGAGTTGAGGCTATTGAGGCTGCAGGGTCACGAGGCACAAATGTGAGAGTACGGGTGCGGTGGTACTATCGGCCAGAGGAGTCCATGGGTGGAAGGCGTCCATTTCATGGTGCCAAAGAGGTGTTCCTCTCGGATCACTATGACGTACAGAGTGCTGACACCATAGAGGGAAAGTGCAACGTTCACAGCTTCCGTAGCTACACAAAGCTTGATTCTGTCAATGCTGAGGACTTCTTCTGTCGCTTTGAGTACAAATCAGCCACAGGAAGCTTCGTGCCCGACCGCATTGCTGTGTTCTGCAAGTGTGAGATGCCATACAATCCTGATGACCTTATGATCCAATGTTTCACCCTTCTTGCATTGGAATGACTATTAAAGATGCAAAAAAACTAGAGCATTTTTTCTGCCAGAGCTGTACTGCGGAAAATGGAAAGATGGCTGAGAATTCTCATGAAGCTACAGCGCAATCCGAAGAAAAGCAGGTGGAGTCAAAAAGACGGAGAAGGTGACTGCCCCCCAGATTCATTGACGAGATACACCTGGATGTACAAAGCCTTCTCAAGTTGGTGTAATGCTATTTATTTGTCATGGCAAGTGTGTGTGACCCACGACCACGAGAGTCCCTTCCTGTAATGTCAGTCGCATGGTGTACATAAACTTTTCAACCTGAGACTGTTGTATTAGGAGACGACACGACCTGTTGTTGTTGCATGATGTTTTTAGCAGCGTCAGAATTAGCATGGTAGAGTCGGGTGATGAAGCCCCTCGCGGGCATTAGGACTCCCGTATGGATGTTATCACTGATCATACATTGATACTACATTGGATGCAGTTGAGTCTGTCATCTGCGTTTGTCTTTGGAGAATTCTTGTACCATCAATCCATCATGTGAACTTTGATTCTTTTCGAGACGCTTCGTAATTAATGCAGGCATTTCTGTGTGGGTAGTCA - >LOC_Os07g08880.1
GAGACCCAAAAAGAAAACCACGAATTCCCAATAAAGAAATAGGCAAAATTCCCCATCTCCTCGTCTCCTCCCAACTCCAAACCCTAGCTCCCACCCCCTCTCGCCGTCGCCGTCGCGTCCCATGGCGAAGTCGCGGCCGCCCAAGCGGATCCTCGAGTCCTACACCATCAAGGGCTCCGACAAAGTCATCAAGCCTGGGGACTGTGTGCTAATGAGGGCATCTGATACATCAAAGCCACCCTATGTGGCAAGAGTTGAGGCTATTGAGGCTGCAGGGTCACGAGGCACAAATGTGAGAGTACGGGTGCGGTGGTACTATCGGCCAGAGGAGTCCATGGGTGGAAGGCGTCCATTTCATGGTGCCAAAGAGGTGTTCCTCTCGGATCACTATGACGTACAGAGTGCTGACACCATAGAGGGAAAGTGCAACGTTCACAGCTTCCGTAGCTACACAAAGCTTGATTCTGTCAATGCTGAGGACTTCTTCTGTCGCTTTGAGTACAAATCAGCCACAGGAAGCTTCGTGCCCGACCGCATTGCTGTGTTCTGCAAGTGTGAGATGCCATACAATCCTGATGACCTTATGATCCAATGTTTCACCCTTCTTGCATTGGAATGACTATTAAAGATGCAAAAAAACTAGAGCATTTTTTCTGCCAGAGCTGTACTGCGGAAAATGGAAAGATGGCTGAGAATTCTCATGAAGCTACAGCGCAATCCGAAGAAAAGCAGGTGGAGTCAAAAAGACGGAGAAGGTGACTGCCCCCCAGATTCATTGACGAGATACACCTGGATGTACAAAGCCTTCTCAAGTTGGTGTAATGCTATTTATTTGTCATGGCAAGTGTGTGTGACCCACGACCACGAGAGTCCCTTCCTGTAATGTCAGTCGCATGGTGTACATAAACTTTTCAACCTGAGACTGTTGTATTAGGAGACGACACGACCTGTTGTTGTTGCATGATGTTTTTAGCAGCGTCAGAATTAGCATGGTAGAGTCGGGTGATGAAGCCCCTCGCGGGCATTAGGACTCCCGTATGGATGTTATCACTGATCATACATTGATACTACATTGGATGCAGTTGAGTCTGTCATCTGCGTTTGTCTTTGGAGAATTCTTGTACCATCAATCCATCATGTGAACTTTGATTCTTTTCGAGACGCTTCGTAATTAATGCAGGCATTTCTGTGTGGGTAGTCA - >LOC_Os07g08880.4
GAGACCCAAAAAGAAAACCACGAATTCCCAATAAAGAAATAGGCAAAATTCCCCATCTCCTCGTCTCCTCCCAACTCCAAACCCTAGCTCCCACCCCCTCTCGCCGTCGCCGTCGCGTCCCATGGCGAAGTCGCGGCCGCCCAAGCGGATCCTCGAGTCCTACACCATCAAGGGCTCCGACAAAGTCATCAAGCCTGGGGACTGTGTGCTAATGAGGGCATCTGATACATCAAAGCCACCCTATGTGGCAAGAGTTGAGGCTATTGAGGCTGCAGGGTCACGAGGCACAAATGTGAGAGTACGGGTGCGGTGGTACTATCGGCCAGAGGAGTCCATGGGTGGAAGGCGTCCATTTCATGGTGCCAAAGAGGTGTTCCTCTCGGATCACTATGACGTACAGAGTGCTGACACCATAGAGGGAAAGTGCAACGTTCACAGCTTCCGTAGCTACACAAAGCTTGATTCTGTCAATGCTGAGGACTTCTTCTGTCGCTTTGAGTACAAATCAGCCACAGGAAGCTTCGTGCCCGACCGCATTGCTGTGTTCTGCAAGTGTGAGATGCCATACAATCCTGATGACCTTATGATCCAATGTTTCACCCTTCTTGCATTGGAATGACTATTAAAGATGCAAAAAAACTAGAGCATTTTTTCTGCCAGAGCTGTACTGCGGAAAATGGAAAGATGGCTGAGAATTCTCATGAAGCTACAGCGCAATCCGAAGAAAAGCAGGTGGAGTCAAAAAGACGGAGAAGGTGACTGCCCCCCAGATTCATTGACGAGATACACCTGGATGTACAAAGCCTTCTCAAGTTGGTGTAATGCTATTTATTTGTCATGGCAAGTGTGTGTGACCCACGACCACGAGAGTCCCTTCCTGTAATGTCAGTCGCATGGTGTACATAAACTTTTCAACCTGAGACTGTTGTATTAGGAGACGACACGACCTGTTGTTGTTGCATGATGTTTTTAGCAGCGTCAGAATTAGCATGGTAGAGTCGGGTGATGAAGCCCCTCGCGGGCATTAGGACTCCCGTATGGATGTTATCACTGATCATACATTGATACTACATTGGATGCAGTTGAGTCTGTCATCTGCGTTTGTCTTTGGAGAATTCTTGTACCATCAATCCATCATGTGAACTTTGATTCTTTTCGAGACGCTTCGTAATTAATGCAGGCATTTCTGTGTGGGTAGTCA
CDS Sequence
- >LOC_Os07g08880.3
ATGGCGAAGTCGCGGCCGCCCAAGCGGATCCTCGAGTCCTACACCATCAAGGGCTCCGACAAAGTCATCAAGCCTGGGGACTGTGTGCTAATGAGGGCATCTGATACATCAAAGCCACCCTATGTGGCAAGAGTTGAGGCTATTGAGGCTGCAGGGTCACGAGGCACAAATGTGAGAGTACGGGTGCGGTGGTACTATCGGCCAGAGGAGTCCATGGGTGGAAGGCGTCCATTTCATGGTGCCAAAGAGGTGTTCCTCTCGGATCACTATGACGTACAGAGTGCTGACACCATAGAGGGAAAGTGCAACGTTCACAGCTTCCGTAGCTACACAAAGCTTGATTCTGTCAATGCTGAGGACTTCTTCTGTCGCTTTGAGTACAAATCAGCCACAGGAAGCTTCGTGCCCGACCGCATTGCTGTGTTCTGCAAGTGTGAGATGCCATACAATCCTGATGACCTTATGATCCAATGTTTCACCCTTCTTGCATTGGAATGA - >LOC_Os07g08880.2
ATGGCGAAGTCGCGGCCGCCCAAGCGGATCCTCGAGTCCTACACCATCAAGGGCTCCGACAAAGTCATCAAGCCTGGGGACTGTGTGCTAATGAGGGCATCTGATACATCAAAGCCACCCTATGTGGCAAGAGTTGAGGCTATTGAGGCTGCAGGGTCACGAGGCACAAATGTGAGAGTACGGGTGCGGTGGTACTATCGGCCAGAGGAGTCCATGGGTGGAAGGCGTCCATTTCATGGTGCCAAAGAGGTGTTCCTCTCGGATCACTATGACGTACAGAGTGCTGACACCATAGAGGGAAAGTGCAACGTTCACAGCTTCCGTAGCTACACAAAGCTTGATTCTGTCAATGCTGAGGACTTCTTCTGTCGCTTTGAGTACAAATCAGCCACAGGAAGCTTCGTGCCCGACCGCATTGCTGTGTTCTGCAAGTGTGAGATGCCATACAATCCTGATGACCTTATGATCCAATGTTTCACCCTTCTTGCATTGGAATGA - >LOC_Os07g08880.1
ATGGCGAAGTCGCGGCCGCCCAAGCGGATCCTCGAGTCCTACACCATCAAGGGCTCCGACAAAGTCATCAAGCCTGGGGACTGTGTGCTAATGAGGGCATCTGATACATCAAAGCCACCCTATGTGGCAAGAGTTGAGGCTATTGAGGCTGCAGGGTCACGAGGCACAAATGTGAGAGTACGGGTGCGGTGGTACTATCGGCCAGAGGAGTCCATGGGTGGAAGGCGTCCATTTCATGGTGCCAAAGAGGTGTTCCTCTCGGATCACTATGACGTACAGAGTGCTGACACCATAGAGGGAAAGTGCAACGTTCACAGCTTCCGTAGCTACACAAAGCTTGATTCTGTCAATGCTGAGGACTTCTTCTGTCGCTTTGAGTACAAATCAGCCACAGGAAGCTTCGTGCCCGACCGCATTGCTGTGTTCTGCAAGTGTGAGATGCCATACAATCCTGATGACCTTATGATCCAATGTTTCACCCTTCTTGCATTGGAATGA - >LOC_Os07g08880.4
ATGGCGAAGTCGCGGCCGCCCAAGCGGATCCTCGAGTCCTACACCATCAAGGGCTCCGACAAAGTCATCAAGCCTGGGGACTGTGTGCTAATGAGGGCATCTGATACATCAAAGCCACCCTATGTGGCAAGAGTTGAGGCTATTGAGGCTGCAGGGTCACGAGGCACAAATGTGAGAGTACGGGTGCGGTGGTACTATCGGCCAGAGGAGTCCATGGGTGGAAGGCGTCCATTTCATGGTGCCAAAGAGGTGTTCCTCTCGGATCACTATGACGTACAGAGTGCTGACACCATAGAGGGAAAGTGCAACGTTCACAGCTTCCGTAGCTACACAAAGCTTGATTCTGTCAATGCTGAGGACTTCTTCTGTCGCTTTGAGTACAAATCAGCCACAGGAAGCTTCGTGCCCGACCGCATTGCTGTGTTCTGCAAGTGTGAGATGCCATACAATCCTGATGACCTTATGATCCAATGTTTCACCCTTCTTGCATTGGAATGA
Protein Sequence
- >LOC_Os07g08880.3
MAKSRPPKRILESYTIKGSDKVIKPGDCVLMRASDTSKPPYVARVEAIEAAGSRGTNVRVRVRWYYRPEESMGGRRPFHGAKEVFLSDHYDVQSADTIEGKCNVHSFRSYTKLDSVNAEDFFCRFEYKSATGSFVPDRIAVFCKCEMPYNPDDLMIQCFTLLALE* - >LOC_Os07g08880.2
MAKSRPPKRILESYTIKGSDKVIKPGDCVLMRASDTSKPPYVARVEAIEAAGSRGTNVRVRVRWYYRPEESMGGRRPFHGAKEVFLSDHYDVQSADTIEGKCNVHSFRSYTKLDSVNAEDFFCRFEYKSATGSFVPDRIAVFCKCEMPYNPDDLMIQCFTLLALE* - >LOC_Os07g08880.1
MAKSRPPKRILESYTIKGSDKVIKPGDCVLMRASDTSKPPYVARVEAIEAAGSRGTNVRVRVRWYYRPEESMGGRRPFHGAKEVFLSDHYDVQSADTIEGKCNVHSFRSYTKLDSVNAEDFFCRFEYKSATGSFVPDRIAVFCKCEMPYNPDDLMIQCFTLLALE* - >LOC_Os07g08880.4
MAKSRPPKRILESYTIKGSDKVIKPGDCVLMRASDTSKPPYVARVEAIEAAGSRGTNVRVRVRWYYRPEESMGGRRPFHGAKEVFLSDHYDVQSADTIEGKCNVHSFRSYTKLDSVNAEDFFCRFEYKSATGSFVPDRIAVFCKCEMPYNPDDLMIQCFTLLALE*