Gene Details:

Functional Descriptions:

  • Using map-based cloning and complementation tests, we determined that OsPPR6 encoded a new Pentatricopeptide Repeat (PPR) protein localized in plastids.

Literature:

Gene Resources:

  • NCBI ID:
  • UniProt accessions:

Sequences:

cDNA Sequence
  • >LOC_Os05g49920.1
    ATGCCGCCACCGCCAGCTAGAACCCACCCGAACCCTCCCCTCCTCCACCTCCTCGCCTCCCACCGCGCGCCGCAGCCGCTCCCGCTCACGCCGGCGCACGGCCACCTCCCGCCGCGGAAGCGTCCCCGCGGAGTCGGCTCCGCAGCGGCGCCGCCGCCGCCGCGTGCCGCCGCCTCCGCGGAGGCCACCTACTCTGACCGGAGCGCCGCGCTGCGGGCGCTCTGTAGCCATGGCCAGCTGGCGCAGGCGCTCTGGCTCCTCGAGTCCTCCCCGGAGCCGCCCGACGAGGGCGCCTACGTCGCGCTGTTCCGGCTCTGCGAGTGGCGCCGCGCGGTCGACGCCGGGATGCGGGCGTGCGCGCGCGCCGACGCCGAGCACCCGAGCTTCGGGCTCCGCCTCGGGAACGCTATGCTCAGCATGCTCGTCAGGTTCGGGGAGATATGGCACGCGTGGAGGGTGTTCGCCAAAATGCCTGAGAGGGACGTCTTCTCCTGGAACGTCATGGTAGGCGGGTACGGCAAGGTGGGCTTCCTCGAGGAGGCGCTGGACCTGTACTACAGGATGCTGTGGGCAGGGATGAGGCCGGATGTCTACACGTTCCCCTGCGTGCTGCGTACCTGCGGGGGCATCCCTGACTGGAGGATGGGGAGGGAGGTGCATGCTCATGTGCTTCGATTTGGTTTTGGAGACGAGGTCGATGTATTGAATGCTCTGGTGACCATGTATGCAAAATGTGGGGATATTGTGGCGGCGAGGAAGGTGTTTGATGGAATGGCCGTGACAGACTGCATATCATGGAATGCGATGATAGCTGGGCATTTTGAGAATCATGAGTGTGAGGCAGGGTTGGAGTTGTTTCTCACCATGCTGGAGAATGAGGTACAACCGAATCTCATGACAATAACCAGTGTGACTGTTGCATCTGGAATGTTGTCTGAAGTGGGTTTTGCAAAAGAAATGCATGGGTTTGCTGTAAAGAGAGGTTTCGCCATTGATGTTGCATTCTGTAACTCGTTGATTCAGATGTACACCAGTCTCGGGAGGATGGGGGATGCAGGTAAAATATTCTCAAGAATGGAAACTAAAGATGCCATGTCATGGACTGCAATGATATCGGGGTATGAGAAAAATGGTTTCCCAGATAAAGCCCTTGAAGTTTATGCACTGATGGAATTGCATAATGTAAGTCCTGATGATGTTACAATTGCAAGTGCCCTTGCTGCTTGTGCCTGCTTGGGGAGGTTAGATGTAGGCATCAAATTGCATGAGCTTGCTCAGAACAAGGGATTCATCAGGTATGTTGTCGTTGCTAATGCGCTCCTTGAAATGTATGCTAAATCCAAGCACATTGATAAGGCTATTGAAGTATTTAAGTTCATGGCTGAGAAGGATGTGGTATCATGGAGTTCAATGATTGCTGGATTTTGCTTTAACCACAGGAGTTTTGAGGCTTTGTACTATTTCCGGTATATGCTAGGACATGTAAAACCCAATTCTGTTACATTTATAGCTGCTCTAAGTGCTTGTGCTGCTACTGGGGCTTTGAGATCTGGTAAGGAAATCCATGCATATGTTTTAAGGTGTGGTATTGGATCTGAAGGTTATGTACCCAATGCTCTTCTAGACTTGTATGTGAAATGTGGCCAGACAAGCTATGCTTGGGCACAATTCAGCGTGCATAGTGAAAAGGATGTTGTCTCTTGGAATATAATGCTTTCTGGTTTTGTAGCTCATGGGCTTGGAGATATTGCTTTATCACTCTTTAACCAAATGGTAGAAATGGGAGAGCATCCGGATGAAGTTACATTTGTTGCTTTATTGTGTGCTTGTAGTAGGGCTGGAATGGTTATTCAAGGCTGGGAGCTTTTTCACATGATGACTGAGAAATTTTCAATAGTTCCAAATCTCAAGCACTATGCATGTATGGTAGATCTATTGAGTCGTGTTGGGAAATTAACAGAAGCTTACAACCTCATAAATCGAATGCCTATCAAACCTGATGCTGCAGTGTGGGGAGCCTTGTTGAATGGATGCCGGATCCACCGACATGTTGAACTTGGCGAGCTTGCTGCAAAAGTTATCCTTGAGTTGGAACCTAATGATGTTGCATATCATGTTCTTCTGTGTGATTTATATACTGATGCTGGCAAATGGGCTCAAGTGGCTAGAGTGAGAAAAACCATGCGAGAGAAGGGATTGGAGCAAGATAATGGATGTAGCTGGGTTGAGGTTAAGGGAGTAACTCACGCATTTCTTACAGATGATGAATCACATCCACAGATAAAAGAAATAAATGTTGTTCTACATGGCATATATGAGCGAATGAAAGCATGTGGTTTTGCTCCTGTTGAGTCCTTAGAAGATAAAGAAGTATCCGAGGACGACATCTTGTGCGGTCACAGTGAAAGATTAGCTGTAGCTTTTGGTTTGATCAATACTACACCTGGTACCACTATTTCTGTCACAAAGAACCGATACACTTGCCAGAGTTGTCATGTGATATTCAAGGCAATTTCTGAAATTGTTCGAAGAGAGATAACTGTTAGAGACACTAAGCAATTACACTGCTTTAAGGATGGAGATTGTTCATGTGGAGATATAGGATATGGATGAAAAACTTATAGAAAGAGGGCTGTATAACAATACAAGATGTGGCCATGCATTATTATGCATCTGCTGCAAGCACTGCTACAGAAATCCTTTGCAACAACAGTTATTAACCACGTCTAACAATACAAATACTC
CDS Sequence
  • >LOC_Os05g49920.1
    ATGCCGCCACCGCCAGCTAGAACCCACCCGAACCCTCCCCTCCTCCACCTCCTCGCCTCCCACCGCGCGCCGCAGCCGCTCCCGCTCACGCCGGCGCACGGCCACCTCCCGCCGCGGAAGCGTCCCCGCGGAGTCGGCTCCGCAGCGGCGCCGCCGCCGCCGCGTGCCGCCGCCTCCGCGGAGGCCACCTACTCTGACCGGAGCGCCGCGCTGCGGGCGCTCTGTAGCCATGGCCAGCTGGCGCAGGCGCTCTGGCTCCTCGAGTCCTCCCCGGAGCCGCCCGACGAGGGCGCCTACGTCGCGCTGTTCCGGCTCTGCGAGTGGCGCCGCGCGGTCGACGCCGGGATGCGGGCGTGCGCGCGCGCCGACGCCGAGCACCCGAGCTTCGGGCTCCGCCTCGGGAACGCTATGCTCAGCATGCTCGTCAGGTTCGGGGAGATATGGCACGCGTGGAGGGTGTTCGCCAAAATGCCTGAGAGGGACGTCTTCTCCTGGAACGTCATGGTAGGCGGGTACGGCAAGGTGGGCTTCCTCGAGGAGGCGCTGGACCTGTACTACAGGATGCTGTGGGCAGGGATGAGGCCGGATGTCTACACGTTCCCCTGCGTGCTGCGTACCTGCGGGGGCATCCCTGACTGGAGGATGGGGAGGGAGGTGCATGCTCATGTGCTTCGATTTGGTTTTGGAGACGAGGTCGATGTATTGAATGCTCTGGTGACCATGTATGCAAAATGTGGGGATATTGTGGCGGCGAGGAAGGTGTTTGATGGAATGGCCGTGACAGACTGCATATCATGGAATGCGATGATAGCTGGGCATTTTGAGAATCATGAGTGTGAGGCAGGGTTGGAGTTGTTTCTCACCATGCTGGAGAATGAGGTACAACCGAATCTCATGACAATAACCAGTGTGACTGTTGCATCTGGAATGTTGTCTGAAGTGGGTTTTGCAAAAGAAATGCATGGGTTTGCTGTAAAGAGAGGTTTCGCCATTGATGTTGCATTCTGTAACTCGTTGATTCAGATGTACACCAGTCTCGGGAGGATGGGGGATGCAGGTAAAATATTCTCAAGAATGGAAACTAAAGATGCCATGTCATGGACTGCAATGATATCGGGGTATGAGAAAAATGGTTTCCCAGATAAAGCCCTTGAAGTTTATGCACTGATGGAATTGCATAATGTAAGTCCTGATGATGTTACAATTGCAAGTGCCCTTGCTGCTTGTGCCTGCTTGGGGAGGTTAGATGTAGGCATCAAATTGCATGAGCTTGCTCAGAACAAGGGATTCATCAGGTATGTTGTCGTTGCTAATGCGCTCCTTGAAATGTATGCTAAATCCAAGCACATTGATAAGGCTATTGAAGTATTTAAGTTCATGGCTGAGAAGGATGTGGTATCATGGAGTTCAATGATTGCTGGATTTTGCTTTAACCACAGGAGTTTTGAGGCTTTGTACTATTTCCGGTATATGCTAGGACATGTAAAACCCAATTCTGTTACATTTATAGCTGCTCTAAGTGCTTGTGCTGCTACTGGGGCTTTGAGATCTGGTAAGGAAATCCATGCATATGTTTTAAGGTGTGGTATTGGATCTGAAGGTTATGTACCCAATGCTCTTCTAGACTTGTATGTGAAATGTGGCCAGACAAGCTATGCTTGGGCACAATTCAGCGTGCATAGTGAAAAGGATGTTGTCTCTTGGAATATAATGCTTTCTGGTTTTGTAGCTCATGGGCTTGGAGATATTGCTTTATCACTCTTTAACCAAATGGTAGAAATGGGAGAGCATCCGGATGAAGTTACATTTGTTGCTTTATTGTGTGCTTGTAGTAGGGCTGGAATGGTTATTCAAGGCTGGGAGCTTTTTCACATGATGACTGAGAAATTTTCAATAGTTCCAAATCTCAAGCACTATGCATGTATGGTAGATCTATTGAGTCGTGTTGGGAAATTAACAGAAGCTTACAACCTCATAAATCGAATGCCTATCAAACCTGATGCTGCAGTGTGGGGAGCCTTGTTGAATGGATGCCGGATCCACCGACATGTTGAACTTGGCGAGCTTGCTGCAAAAGTTATCCTTGAGTTGGAACCTAATGATGTTGCATATCATGTTCTTCTGTGTGATTTATATACTGATGCTGGCAAATGGGCTCAAGTGGCTAGAGTGAGAAAAACCATGCGAGAGAAGGGATTGGAGCAAGATAATGGATGTAGCTGGGTTGAGGTTAAGGGAGTAACTCACGCATTTCTTACAGATGATGAATCACATCCACAGATAAAAGAAATAAATGTTGTTCTACATGGCATATATGAGCGAATGAAAGCATGTGGTTTTGCTCCTGTTGAGTCCTTAGAAGATAAAGAAGTATCCGAGGACGACATCTTGTGCGGTCACAGTGAAAGATTAGCTGTAGCTTTTGGTTTGATCAATACTACACCTGGTACCACTATTTCTGTCACAAAGAACCGATACACTTGCCAGAGTTGTCATGTGATATTCAAGGCAATTTCTGAAATTGTTCGAAGAGAGATAACTGTTAGAGACACTAAGCAATTACACTGCTTTAAGGATGGAGATTGTTCATGTGGAGATATAGGATATGGATGA
Protein Sequence
  • >LOC_Os05g49920.1
    MPPPPARTHPNPPLLHLLASHRAPQPLPLTPAHGHLPPRKRPRGVGSAAAPPPPRAAASAEATYSDRSAALRALCSHGQLAQALWLLESSPEPPDEGAYVALFRLCEWRRAVDAGMRACARADAEHPSFGLRLGNAMLSMLVRFGEIWHAWRVFAKMPERDVFSWNVMVGGYGKVGFLEEALDLYYRMLWAGMRPDVYTFPCVLRTCGGIPDWRMGREVHAHVLRFGFGDEVDVLNALVTMYAKCGDIVAARKVFDGMAVTDCISWNAMIAGHFENHECEAGLELFLTMLENEVQPNLMTITSVTVASGMLSEVGFAKEMHGFAVKRGFAIDVAFCNSLIQMYTSLGRMGDAGKIFSRMETKDAMSWTAMISGYEKNGFPDKALEVYALMELHNVSPDDVTIASALAACACLGRLDVGIKLHELAQNKGFIRYVVVANALLEMYAKSKHIDKAIEVFKFMAEKDVVSWSSMIAGFCFNHRSFEALYYFRYMLGHVKPNSVTFIAALSACAATGALRSGKEIHAYVLRCGIGSEGYVPNALLDLYVKCGQTSYAWAQFSVHSEKDVVSWNIMLSGFVAHGLGDIALSLFNQMVEMGEHPDEVTFVALLCACSRAGMVIQGWELFHMMTEKFSIVPNLKHYACMVDLLSRVGKLTEAYNLINRMPIKPDAAVWGALLNGCRIHRHVELGELAAKVILELEPNDVAYHVLLCDLYTDAGKWAQVARVRKTMREKGLEQDNGCSWVEVKGVTHAFLTDDESHPQIKEINVVLHGIYERMKACGFAPVESLEDKEVSEDDILCGHSERLAVAFGLINTTPGTTISVTKNRYTCQSCHVIFKAISEIVRREITVRDTKQLHCFKDGDCSCGDIGYG*