Information report for OsPPR6
Gene Details
|
|
Functional Descriptions
- Using map-based cloning and complementation tests, we determined that OsPPR6 encoded a new Pentatricopeptide Repeat (PPR) protein localized in plastids.
Functional Keywords
Literature and News
Gene Resources
- UniProt: Q6F363
- EMBL: AP014961
- AlphaFoldDB: Q6F363
- EnsemblPlants: Os05t0574800-00
- Gramene: Os05t0574800-00
- KEGG: osa:4339686
- Orthologous matrix: INNRCFE
- InterPro: IPR002885, IPR011990, IPR032867
- PANTHER: PTHR47926, PTHR47926:SF533
- PROSITE: PS51375
- Gene3D: 1.25.40.10
- OrthoDB: Q6F363
- SWISS-MODEL: Q6F363
- eggNOG: KOG4197
Sequences
cDNA Sequence
- >LOC_Os05g49920.1
ATGCCGCCACCGCCAGCTAGAACCCACCCGAACCCTCCCCTCCTCCACCTCCTCGCCTCCCACCGCGCGCCGCAGCCGCTCCCGCTCACGCCGGCGCACGGCCACCTCCCGCCGCGGAAGCGTCCCCGCGGAGTCGGCTCCGCAGCGGCGCCGCCGCCGCCGCGTGCCGCCGCCTCCGCGGAGGCCACCTACTCTGACCGGAGCGCCGCGCTGCGGGCGCTCTGTAGCCATGGCCAGCTGGCGCAGGCGCTCTGGCTCCTCGAGTCCTCCCCGGAGCCGCCCGACGAGGGCGCCTACGTCGCGCTGTTCCGGCTCTGCGAGTGGCGCCGCGCGGTCGACGCCGGGATGCGGGCGTGCGCGCGCGCCGACGCCGAGCACCCGAGCTTCGGGCTCCGCCTCGGGAACGCTATGCTCAGCATGCTCGTCAGGTTCGGGGAGATATGGCACGCGTGGAGGGTGTTCGCCAAAATGCCTGAGAGGGACGTCTTCTCCTGGAACGTCATGGTAGGCGGGTACGGCAAGGTGGGCTTCCTCGAGGAGGCGCTGGACCTGTACTACAGGATGCTGTGGGCAGGGATGAGGCCGGATGTCTACACGTTCCCCTGCGTGCTGCGTACCTGCGGGGGCATCCCTGACTGGAGGATGGGGAGGGAGGTGCATGCTCATGTGCTTCGATTTGGTTTTGGAGACGAGGTCGATGTATTGAATGCTCTGGTGACCATGTATGCAAAATGTGGGGATATTGTGGCGGCGAGGAAGGTGTTTGATGGAATGGCCGTGACAGACTGCATATCATGGAATGCGATGATAGCTGGGCATTTTGAGAATCATGAGTGTGAGGCAGGGTTGGAGTTGTTTCTCACCATGCTGGAGAATGAGGTACAACCGAATCTCATGACAATAACCAGTGTGACTGTTGCATCTGGAATGTTGTCTGAAGTGGGTTTTGCAAAAGAAATGCATGGGTTTGCTGTAAAGAGAGGTTTCGCCATTGATGTTGCATTCTGTAACTCGTTGATTCAGATGTACACCAGTCTCGGGAGGATGGGGGATGCAGGTAAAATATTCTCAAGAATGGAAACTAAAGATGCCATGTCATGGACTGCAATGATATCGGGGTATGAGAAAAATGGTTTCCCAGATAAAGCCCTTGAAGTTTATGCACTGATGGAATTGCATAATGTAAGTCCTGATGATGTTACAATTGCAAGTGCCCTTGCTGCTTGTGCCTGCTTGGGGAGGTTAGATGTAGGCATCAAATTGCATGAGCTTGCTCAGAACAAGGGATTCATCAGGTATGTTGTCGTTGCTAATGCGCTCCTTGAAATGTATGCTAAATCCAAGCACATTGATAAGGCTATTGAAGTATTTAAGTTCATGGCTGAGAAGGATGTGGTATCATGGAGTTCAATGATTGCTGGATTTTGCTTTAACCACAGGAGTTTTGAGGCTTTGTACTATTTCCGGTATATGCTAGGACATGTAAAACCCAATTCTGTTACATTTATAGCTGCTCTAAGTGCTTGTGCTGCTACTGGGGCTTTGAGATCTGGTAAGGAAATCCATGCATATGTTTTAAGGTGTGGTATTGGATCTGAAGGTTATGTACCCAATGCTCTTCTAGACTTGTATGTGAAATGTGGCCAGACAAGCTATGCTTGGGCACAATTCAGCGTGCATAGTGAAAAGGATGTTGTCTCTTGGAATATAATGCTTTCTGGTTTTGTAGCTCATGGGCTTGGAGATATTGCTTTATCACTCTTTAACCAAATGGTAGAAATGGGAGAGCATCCGGATGAAGTTACATTTGTTGCTTTATTGTGTGCTTGTAGTAGGGCTGGAATGGTTATTCAAGGCTGGGAGCTTTTTCACATGATGACTGAGAAATTTTCAATAGTTCCAAATCTCAAGCACTATGCATGTATGGTAGATCTATTGAGTCGTGTTGGGAAATTAACAGAAGCTTACAACCTCATAAATCGAATGCCTATCAAACCTGATGCTGCAGTGTGGGGAGCCTTGTTGAATGGATGCCGGATCCACCGACATGTTGAACTTGGCGAGCTTGCTGCAAAAGTTATCCTTGAGTTGGAACCTAATGATGTTGCATATCATGTTCTTCTGTGTGATTTATATACTGATGCTGGCAAATGGGCTCAAGTGGCTAGAGTGAGAAAAACCATGCGAGAGAAGGGATTGGAGCAAGATAATGGATGTAGCTGGGTTGAGGTTAAGGGAGTAACTCACGCATTTCTTACAGATGATGAATCACATCCACAGATAAAAGAAATAAATGTTGTTCTACATGGCATATATGAGCGAATGAAAGCATGTGGTTTTGCTCCTGTTGAGTCCTTAGAAGATAAAGAAGTATCCGAGGACGACATCTTGTGCGGTCACAGTGAAAGATTAGCTGTAGCTTTTGGTTTGATCAATACTACACCTGGTACCACTATTTCTGTCACAAAGAACCGATACACTTGCCAGAGTTGTCATGTGATATTCAAGGCAATTTCTGAAATTGTTCGAAGAGAGATAACTGTTAGAGACACTAAGCAATTACACTGCTTTAAGGATGGAGATTGTTCATGTGGAGATATAGGATATGGATGAAAAACTTATAGAAAGAGGGCTGTATAACAATACAAGATGTGGCCATGCATTATTATGCATCTGCTGCAAGCACTGCTACAGAAATCCTTTGCAACAACAGTTATTAACCACGTCTAACAATACAAATACTC
CDS Sequence
- >LOC_Os05g49920.1
ATGCCGCCACCGCCAGCTAGAACCCACCCGAACCCTCCCCTCCTCCACCTCCTCGCCTCCCACCGCGCGCCGCAGCCGCTCCCGCTCACGCCGGCGCACGGCCACCTCCCGCCGCGGAAGCGTCCCCGCGGAGTCGGCTCCGCAGCGGCGCCGCCGCCGCCGCGTGCCGCCGCCTCCGCGGAGGCCACCTACTCTGACCGGAGCGCCGCGCTGCGGGCGCTCTGTAGCCATGGCCAGCTGGCGCAGGCGCTCTGGCTCCTCGAGTCCTCCCCGGAGCCGCCCGACGAGGGCGCCTACGTCGCGCTGTTCCGGCTCTGCGAGTGGCGCCGCGCGGTCGACGCCGGGATGCGGGCGTGCGCGCGCGCCGACGCCGAGCACCCGAGCTTCGGGCTCCGCCTCGGGAACGCTATGCTCAGCATGCTCGTCAGGTTCGGGGAGATATGGCACGCGTGGAGGGTGTTCGCCAAAATGCCTGAGAGGGACGTCTTCTCCTGGAACGTCATGGTAGGCGGGTACGGCAAGGTGGGCTTCCTCGAGGAGGCGCTGGACCTGTACTACAGGATGCTGTGGGCAGGGATGAGGCCGGATGTCTACACGTTCCCCTGCGTGCTGCGTACCTGCGGGGGCATCCCTGACTGGAGGATGGGGAGGGAGGTGCATGCTCATGTGCTTCGATTTGGTTTTGGAGACGAGGTCGATGTATTGAATGCTCTGGTGACCATGTATGCAAAATGTGGGGATATTGTGGCGGCGAGGAAGGTGTTTGATGGAATGGCCGTGACAGACTGCATATCATGGAATGCGATGATAGCTGGGCATTTTGAGAATCATGAGTGTGAGGCAGGGTTGGAGTTGTTTCTCACCATGCTGGAGAATGAGGTACAACCGAATCTCATGACAATAACCAGTGTGACTGTTGCATCTGGAATGTTGTCTGAAGTGGGTTTTGCAAAAGAAATGCATGGGTTTGCTGTAAAGAGAGGTTTCGCCATTGATGTTGCATTCTGTAACTCGTTGATTCAGATGTACACCAGTCTCGGGAGGATGGGGGATGCAGGTAAAATATTCTCAAGAATGGAAACTAAAGATGCCATGTCATGGACTGCAATGATATCGGGGTATGAGAAAAATGGTTTCCCAGATAAAGCCCTTGAAGTTTATGCACTGATGGAATTGCATAATGTAAGTCCTGATGATGTTACAATTGCAAGTGCCCTTGCTGCTTGTGCCTGCTTGGGGAGGTTAGATGTAGGCATCAAATTGCATGAGCTTGCTCAGAACAAGGGATTCATCAGGTATGTTGTCGTTGCTAATGCGCTCCTTGAAATGTATGCTAAATCCAAGCACATTGATAAGGCTATTGAAGTATTTAAGTTCATGGCTGAGAAGGATGTGGTATCATGGAGTTCAATGATTGCTGGATTTTGCTTTAACCACAGGAGTTTTGAGGCTTTGTACTATTTCCGGTATATGCTAGGACATGTAAAACCCAATTCTGTTACATTTATAGCTGCTCTAAGTGCTTGTGCTGCTACTGGGGCTTTGAGATCTGGTAAGGAAATCCATGCATATGTTTTAAGGTGTGGTATTGGATCTGAAGGTTATGTACCCAATGCTCTTCTAGACTTGTATGTGAAATGTGGCCAGACAAGCTATGCTTGGGCACAATTCAGCGTGCATAGTGAAAAGGATGTTGTCTCTTGGAATATAATGCTTTCTGGTTTTGTAGCTCATGGGCTTGGAGATATTGCTTTATCACTCTTTAACCAAATGGTAGAAATGGGAGAGCATCCGGATGAAGTTACATTTGTTGCTTTATTGTGTGCTTGTAGTAGGGCTGGAATGGTTATTCAAGGCTGGGAGCTTTTTCACATGATGACTGAGAAATTTTCAATAGTTCCAAATCTCAAGCACTATGCATGTATGGTAGATCTATTGAGTCGTGTTGGGAAATTAACAGAAGCTTACAACCTCATAAATCGAATGCCTATCAAACCTGATGCTGCAGTGTGGGGAGCCTTGTTGAATGGATGCCGGATCCACCGACATGTTGAACTTGGCGAGCTTGCTGCAAAAGTTATCCTTGAGTTGGAACCTAATGATGTTGCATATCATGTTCTTCTGTGTGATTTATATACTGATGCTGGCAAATGGGCTCAAGTGGCTAGAGTGAGAAAAACCATGCGAGAGAAGGGATTGGAGCAAGATAATGGATGTAGCTGGGTTGAGGTTAAGGGAGTAACTCACGCATTTCTTACAGATGATGAATCACATCCACAGATAAAAGAAATAAATGTTGTTCTACATGGCATATATGAGCGAATGAAAGCATGTGGTTTTGCTCCTGTTGAGTCCTTAGAAGATAAAGAAGTATCCGAGGACGACATCTTGTGCGGTCACAGTGAAAGATTAGCTGTAGCTTTTGGTTTGATCAATACTACACCTGGTACCACTATTTCTGTCACAAAGAACCGATACACTTGCCAGAGTTGTCATGTGATATTCAAGGCAATTTCTGAAATTGTTCGAAGAGAGATAACTGTTAGAGACACTAAGCAATTACACTGCTTTAAGGATGGAGATTGTTCATGTGGAGATATAGGATATGGATGA
Protein Sequence
- >LOC_Os05g49920.1
MPPPPARTHPNPPLLHLLASHRAPQPLPLTPAHGHLPPRKRPRGVGSAAAPPPPRAAASAEATYSDRSAALRALCSHGQLAQALWLLESSPEPPDEGAYVALFRLCEWRRAVDAGMRACARADAEHPSFGLRLGNAMLSMLVRFGEIWHAWRVFAKMPERDVFSWNVMVGGYGKVGFLEEALDLYYRMLWAGMRPDVYTFPCVLRTCGGIPDWRMGREVHAHVLRFGFGDEVDVLNALVTMYAKCGDIVAARKVFDGMAVTDCISWNAMIAGHFENHECEAGLELFLTMLENEVQPNLMTITSVTVASGMLSEVGFAKEMHGFAVKRGFAIDVAFCNSLIQMYTSLGRMGDAGKIFSRMETKDAMSWTAMISGYEKNGFPDKALEVYALMELHNVSPDDVTIASALAACACLGRLDVGIKLHELAQNKGFIRYVVVANALLEMYAKSKHIDKAIEVFKFMAEKDVVSWSSMIAGFCFNHRSFEALYYFRYMLGHVKPNSVTFIAALSACAATGALRSGKEIHAYVLRCGIGSEGYVPNALLDLYVKCGQTSYAWAQFSVHSEKDVVSWNIMLSGFVAHGLGDIALSLFNQMVEMGEHPDEVTFVALLCACSRAGMVIQGWELFHMMTEKFSIVPNLKHYACMVDLLSRVGKLTEAYNLINRMPIKPDAAVWGALLNGCRIHRHVELGELAAKVILELEPNDVAYHVLLCDLYTDAGKWAQVARVRKTMREKGLEQDNGCSWVEVKGVTHAFLTDDESHPQIKEINVVLHGIYERMKACGFAPVESLEDKEVSEDDILCGHSERLAVAFGLINTTPGTTISVTKNRYTCQSCHVIFKAISEIVRREITVRDTKQLHCFKDGDCSCGDIGYG*