Information report for OsIBH1;IBH1
Gene Details
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Functional Descriptions
- Overexpression of ILI1 or PRE1 increases cell elongation and suppresses dwarf phenotypes caused by overexpression of IBH1 in Arabidopsis.
- ILI1 and PRE1 interact with basic helix-loop-helix (bHLH) protein IBH1 (ILI1 binding bHLH), whose overexpression causes erect leaf in rice and dwarfism in Arabidopsis.
- BR increases the RNA levels of ILI1 and PRE1 but represses IBH1 through the transcription factor BZR1.
- The spatial and temporal expression patterns support roles of ILI1 in laminar joint bending and PRE1/At IBH1 in the transition from growth of young organs to growth arrest.
Functional Keywords
- cell-elongation , dwarf , transcription-factor , BR , erect , leaf , growth
Literature and News
- Dynamics of brassinosteroid response modulated by negative regulator LIC in rice . DOI: 10.1371/journal.pgen.1002686 ; PMID: 22570626
- Antagonistic HLH/bHLH transcription factors mediate brassinosteroid regulation of cell elongation and plant development in rice and Arabidopsis . DOI: 10.1105/tpc.109.070441 ; PMID: 20009022
Gene Resources
- UniProt: Q7XR02
- EMBL: AK109923, AL606608, AP008210
- AlphaFoldDB: Q7XR02
- EnsemblPlants: Os04t0660100-01
- Gramene: Os04t0660100-01
- KEGG: dosa:Os04g0660100
- Orthologous matrix: KHMLAFH
- InterPro: IPR044660
- PANTHER: PTHR33124, PTHR33124:SF40
- OrthoDB: Q7XR02
- SWISS-MODEL: Q7XR02
- eggNOG: ENOG502S9NU
Sequences
cDNA Sequence
- >LOC_Os04g56500.1
GTGTCAGAGCCGTGTTCCTCGCTCTCTTCCCTTTCCTTTTTTTCTCTCTCTAAAATCGCAACCCACAAATCCTTCTGATCCGTTTGTGTCAGAGCCAAATCTTCTTCTTCTTCTCCATCTCTCTCCTCTCCTCTTCTCTTCTCTCGTTGGAAGGTGAGGAGGTGAGGTGAGGTTGGGGGCGCCGTTTGATGGACGCGAAGAGGACGCCGCCGCCGCCGACGCCGCCGAACCCTAACCCTAGCGTAATTGGCAGCGGCGCCGCCGCGGACGGCGGCGGATTTGGGAGGGGGGAAGCGGCGGCGGCGACGAAGCACATGCTGGCCTTCCACTTCCTGCGCGCGCTGTCGCGGATCCACCGGGCGACACCCGTGACGCGGCGCACGCGGACCATCCGCCGGGCGGCCTACTCCTCCATGGCGCGGGCGGCGAGCCCGCGCCGCGCGTGGAGCCGGGCGCTGCTCGGCCAGGTCCGCGCGCGGAGGTCCAGGACGCTGATGAGGCGCGCCGCCGTGCTGGTGCGGAGGCGCGTCGTAGCCGCTCCTGCGCCTTCTCCCGCCTCCGCCAGAGGCGTCAGGATTATTGCTGCCGGAGAGACGTCGGCGGCGGCTCGGGCTGTTCCGCCGCCTCCGCGGCAGCAGGGCGAGCCGCCGAGGGCCGAAGCGCTCCGGCGCCTGGTCCCCGGCGGCGCCGGCATGGAGTACTCCAGCCTCCTGGAGGAGACCGCCGACTACCTCCGCTCGCTTCGCGCGCAGGTGCAGCTGATGCAAGGCCTCGTCGACCTCTTCTCCTACCAATGATCCATCCATCGAGTACGTCTTCTATCTGATTGGGGAAGAAACAGGTAATTACTTAATCAAAGAACTTAACAATGAGGTCATAGATGAATGGATGTTGCATATATATCATGCATGATAATCTGCATGTGTGCAGATTCGTTTTGTTCTAGTAGAATTAAGTATTAATTGGTTGCTAGCTAGCTGCACATGCATGATGCATATGTGTGTACTACCTCTATATCATCGTTCCCATGCATCCGCTACTCGTATTAGCTAGGGATTGACAGCTAGATGATGCTCCATTAGCTAGTTGTTGCCTAGCTTGTCTAATTAGACTATTAGAGTACTGCTAGCTTGCTAACTAGGAGGGTGGTTATGTTGAATTGGTTGTTTGGTAGAGTGTTTTTTCTTTTCTCCTCTCTCAAATTTGGGAAAGTGGGAGCCACAATCTATGAGGGATAGGGTTGCTAATCTTTGAGCTTGATGAGAAGACACACATAACTTGTGGCCAAAGGAACCAAACAAAAGACATTCTCTCCATGGGCGGTTAGCATCTTTTGATTAAAGGGCCTTGTGTTTTTCCCTTTGGAAATAAGCATATATGTATTTGTGTTTTTGCTATTATTTTTCTTCTCTCTTCTTGTTGCCCTTCCATCATCTCTCTCTACCAACTTATCCCTGTTCCTTTTTAGGTGCCACCGGTTCTCTATTGAGTATTCTTTGTGTACTTGATGCTGCTGGCAAGTTTTTCTGCTTGGCTCTTTTGTCGTGTTTTTTTTTCTCTCAGTTGGCTAGCTTTGACACATGCGTTTGTTGCTTCCTTTATGGGGTAAGAATCCGAAAGGGTTGAAGCTAGCCTCTTCTGCTTGTAAGCTTCCTATTAAGTGTTATGTTACATCGGGATCATATATATATGTACAACACAAACAGTAGTTAATCAACTGGACGTAGAAAAAGACTAGCTGGTACCATGCAAGTTTGACATGCATGGTTGAAACCACATTCTTTACTTTTACTTAACTGATATAATAATATAGTTAAGTCTTTTGCATGTCCCTGAAAAAAAAAGGTAAAAAGATACAGACGAAGCAGATGCAAAGAATCTTAGTAGAACTATATGTATTTACATATGTGTGTTTTCACACTAGCTAGCTAACAGATTATGTCTTGTGCACCGTGGTATATTGAGAGAAGAAGAGCCTGCTGCCTGCTGCATCCATAAAATACCCTAAATTTCTGCTTTTGCTTTTTTAATTTTTTTATTTGTACTTGCATATATTGTTTTTAGTTGTGATCACAGAGCTAGATATAATTTCCACTTAAGACGATATTGTAGTGTGTGGTTTTAATCTGTTTTCTATTTGGATATTCGATAGGGGGGCGTTTTTGGTTCAGATATCGAATTTGCTCATTGGCCATAGCTAGCTGTCATATATGACAAAATTAGTACACCTATTGACAGGACAAAGCTAGCTACATGCATGTGTGCATTTTGCTTGGAATCATGTAAGATCACCATCCAATTCGCAATTGGGCCACAAAATAGCTATATTAGGGAGCCATTTCACATCACTAAAAACATTTTTGGTACTTGAATCAACAGCTAATCATAATTGGCCCACTGATTAGCTGTACTCATTTGATCAGCTGGCTATAATCATCTCCTTCAACAGACATGCATGTATATATGCTATATAGTACTATACCTTGGAATGTACATATTGAAATAAAATAAACATGGATCGGTGTGTAGCGTATCATATATGCATCGAGACACATATTTGTGACAGTACATCGGAATTTTCTAACATCATGCATGTTTAATTACTGCATATATGACTTTCTGTCACTTCTATTTTTCAGAATACTATCTTTGATCATCTGCTGGTTAGCCTTGCCATTAGTTCATATATAGACTTATATATAATTTTGTTTTCAATGTTAATGCACTAAAAATTGTGCTCCATTCGAACAAAATGCAGAGAAATTAAAAGATGATTCAGATTGGTCCAAAATACATATATATAGTTAGCATGGTCAAGTAATTTAATGAGTTTGCCGATTTGATATATCAGTTTTTTATTTCGTCAAATACACGATGATATATATAGGTGCATGAAATAATTCTCAGTATTGCTAATTGATCGTTATTTCAGCAGGATGTGAAATTAGTTAATAATTGCCGCTATATATACCTGTCATATCTTCGTATTAGGACTTATCCACATGGACACATCCATTTTATGTCACTGAAAGCTCACTATACTTCTTAATTTTTAATATGCTTGCTTATAATTTATCTATTAGCGGGAGAAGCATCAATGATATACGATGGAATAATAAATTAATGCATGATATTTTATCCATCATGATTAAAATACAGTGCGATAGCGCCCATGAATATTACGATACACGAGTATATATGCTTTTAATAAGATTTTAGTGAAGCTAGTGAGTTACAATCGCTACTATAGCTTCATCTCTTTGAGCATATGTTAGGGAACATATTTAGAGATGAGTAAGTGTGGTGTGCCGCACGCGTAAGAGTACTTTGTGAAATCGGAAAAATTAATCTTTATTAACAGACCGTGCGTGGGACATATTTTAGGCCGTGTGAGTATTGTGGTAATCGAAAAAAATATTGTTAATAAACCATGTGCACGAGATAGATGGATGTACTAGTTAATGGGGGTACTAGTTATTTTAACAAGTAGTGCTGTTGCATATCAAATATGCACATTTAATTTCTCTCTTATATATACAGCATATATATGTATCCGGGATAAATATGCCGTGCAAATTAAATTGATTTTTGTGCCATCAGCTATATATTCTTATGCACGGAATGCAGATATATAGAAAATTCAGTACATGGCTTTCTTTATACCGTGGCTAACGTACGTATACGCATCCATATGCATGGATCCGTATATATGCCTCCAGGGACTTTTGTATGTGTATCGCCTCGTACTCTCTGTTGTTTGAATGTTTTTGTAGATCTAGCGATCAATGTGTTTAATTAATTAACCGAACGCTACCAACAGTACTACACCACTTATACAGCACCTGCTGACTTTAATTTAAAGTATATATACTTTTTGAGATTTAACCAAGTTATAGTTGATGAATGTTACGTGCTACACAGCGCTTGTGCTTTAATTAGATCGACCAAACCTAGCTGGCTAGCTAGCGTATTACTCTAATTAATATACTCGATCGGTATATATATAAGAGCTTAGCATGCGTGGAACAGTACGGTACAAATTAATTTTGTGTCATTTTGACTCATTGTGTGTGTGTAAGTCTGTATAGAATTGTTCATTGTGTATAATTAAGCTTGTATACAATTAATTAATTGTGCAATTATATATATTGTGTGTAAGATTATAACATGGGAAAGCTGTTCGTGTATGCACCATGTATGCGTGTAAGCTAACGAGGATATATTGCGGCCGATGGATACATGGCACCTATCCCTAAAATTCATTTTTTTAATTAGTCCCTTTTACTGTCCTTTCCTGCTGCTTAATTGAGCCCATATATATTAATCTACTCTGGCATCAATATAGAAGAAACGAGAAGAAGTCTAAGGCCCATTCCATTATTTGTACTGAGAGCTGCAGAATTTGTAAGAACTTTGGTATACGAAATATTCCCACTAATTTGAATGTTGGTTTTCCTACAAAATTCTCGATACACTAGAGTGAAGTGCTCAAGACAACAAACATGAATTGGAGTGCGTGTAGTGGTTAGCTAGCTAATTATAATTAATCTTTGATTAATGATATAGATATAGTAAAGGGAAACATATATCCTATGCACACAAACTTTCCGTGCATACCAACTAATAAATATCATGAAAAATTATAGAAAAAATTGGATATTTATTCATAATAGTCGAGATGATGCAGTACATATATATCCTATCTGTTTCTAATTAACATTAACACGAGATTTATGGCGAGGGGCAGCAGAAAATTACTCAGAATTAAATAACAACCTTTTCTGTCTTAGCAAGTAGTAGCAACGTCAGACTGACGTCGTTGCATAAATATATGTACAGTTGTCTCCAACTACAAGGACGTACAGACTGACGCTACGGAGATATGTCGAATACGTCATAAGTTAGGACCATGTCCAAAGCATGCATGACATTGTTGTTGTTTTCCTGAAATATTTGGAAATTATATATTCAGAAGACTTAGCTATATATATACACGCATA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Protein Sequence
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