Information report for RBP-L
Gene Details
|
|
Functional Descriptions
- Transcriptome analysis showed that RBP-L knockdown greatly affected the expression of prolamine family genes and several classes of transcription factors.
- Moreover, distinct from RBP-P, RBP-L exhibits additional regulatory roles in development, either directly through its binding to corresponding RNAs or indirectly through its effect on transcription factors.
- Reduced amounts of RBP-L caused partial mislocalization of glutelin and prolamine RNAs and conferred other general growth defects, including dwarfism, late flowering, and smaller seeds.
Functional Keywords
Literature and News
Gene Resources
- UniProt: Q0J9Y2
- EMBL: AK120834, AL606669, AP008210
- AlphaFoldDB: Q0J9Y2
- EnsemblPlants: Os04t0625800-01
- Gramene: Os04t0625800-01
- KEGG: dosa:Os04g0625800, osa:4337064
- Orthologous matrix: RNLNGMQ
- InterPro: IPR000504, IPR012677, IPR035979
Homologs
- Arabidopsis thaliana: AT3G19130, AT3G16380
- Brassica napus: GSBRNA2T00136766001
- Brassica rapa: Brara.C00787
- Gossypium hirsutum: Gohir.D11G105000
- Juglans regia: Jr12_05930, Jr12_05920, Jr12_05910
- Setaria italica: SETIT_013687mg
- Setaria viridis: SEVIR_6G086600v2
- Zea mays: GRMZM2G103430
Sequences
cDNA Sequence
- >LOC_Os04g53440.2
TCTCAGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCGTTCGTGCGTGCTAGCTAGGGCATCTCGTCGCATTGATGCAGCAGCCGCCGTCGCAGCCGCAGCCCGGCATGGGCGGCCCGCCTCCGCCGCCACAGGGCGCGGCGGGGCAGCCGCCGCAGTGGGGCGCGATCCCGCCGCCGATGCCGCCGCACCAGTACGGCGCGCCGCCGCCCCAGCAGCCGCCGGCGATGTGGGGCCAGCCCCCGCCGCAGGCGCACTACGGGCAGGTGCCCCCGCCCCAGCCGTACTACGCCGCGCCACCGCCGCAGGCGATGCCCGCCCCCGCGGCCGCGGACGAGGTGAAGACGCTCTGGATCGGCGACCTGCAGCCCTGGATGGACGAGAGCTACATCTACAACTGCTTCGCGGCCACCGGGGAGGTTCAATCTGTGAAGCTTATCCGGGACAAACAAAGTGGACAGCTTCAGGGTTATGGCTTTGTTGAGTTTACAAGTCGTGCAGCTGCTGATCGAATTCTTCAGACTTATAATGGACAGATGATGCCGAATGTTGAGATGGTCTTCCGATTGAATTGGGCCAGTGCTGGCGAGAAGCGTGATGATACCCCTGACTACACCATTTTTGTCGGGGATTTGGCTGCAGATGTTACAGACTACCTACTACAAGAGACATTCAGGGTCCATTACCCTTCGGTTAAGGGTGCAAAAGTTGTAACTGACAAAATGACAATGCGTTCAAAGGGTTATGGGTTTGTGAAATTTGGTGATCCTACAGAGCAAGCTCGTGCAATGACTGAAATGAATGGAATGCTTTGCTCTTCCAGACCGATGCGTATTGGTCCAGCGGCAAATAAGAAAACAACAGGGGTTCAGGAGAGAGTACCAAATGCTCAAGGAGCTCAGTCTGAGAATGATCCTAACAATACCACCATATTCGTTGGTGGTCTTGACCCCAACGTCACTGAAGATGTCTTGAAACAAGTTTTCGCTCCTTATGGAGAAGTTGTCCATGTTAAGATTCCTGTTGGGAAAAGATGTGGTTTTGTTCAATATGTTAACAGGCCTTCTGCTGAGCAAGCACTGGCAGTGCTACAAGGGACCTTGATTGGTGGGCAGAATGTTAGACTTTCGTGGGGTCGAAGCCTTTCAAACAAACAGCCTCAGCACGACTCGAATCAGTGGGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGGTTACTATGGTGGCTATGGACAAGGTTATGAGGCTTATGGTGGGTATGCACAACCTCAGGATCCTAACATGTATGGTTATGGAGCCTATGCTGGTTATCCCAATTACCAACAGCAACAAGTAGCACAGCAGCAGCCGCCGCAGCAGTGAGCCCTGTTTGATCGATCGCGTCTTTGGGCTGTGAGGCACACAACCCATTTCAAGCTACAGCTTTAGCTATGTTATTGCTATTCTCAATAGAGAGACGGTTTCTGAAGACTCCAGATTTCGATTGAGGTTTTAATGTATGAACTGTATTATGATTATGAACAACGGATGCTGCCATATCGTGGTTCCTATATTGAGTCATGTATTTTGAAAACATATCCTCTGTTTCCATCTCACCCTTATCATCGATTATTATTATTGCTATGTACCGTTTGTTTCCC - >LOC_Os04g53440.1
TCTCAGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCGTTCGTGCGTGCTAGCTAGGGCATCTCGTCGCATTGATGCAGCAGCCGCCGTCGCAGCCGCAGCCCGGCATGGGCGGCCCGCCTCCGCCGCCACAGGGCGCGGCGGGGCAGCCGCCGCAGTGGGGCGCGATCCCGCCGCCGATGCCGCCGCACCAGTACGGCGCGCCGCCGCCCCAGCAGCCGCCGGCGATGTGGGGCCAGCCCCCGCCGCAGGCGCACTACGGGCAGGTGCCCCCGCCCCAGCCGTACTACGCCGCGCCACCGCCGCAGGCGATGCCCGCCCCCGCGGCCGCGGACGAGGTGAAGACGCTCTGGATCGGCGACCTGCAGCCCTGGATGGACGAGAGCTACATCTACAACTGCTTCGCGGCCACCGGGGAGGTTCAATCTGTGAAGCTTATCCGGGACAAACAAAGTGGACAGCTTCAGGGTTATGGCTTTGTTGAGTTTACAAGTCGTGCAGCTGCTGATCGAATTCTTCAGACTTATAATGGACAGATGATGCCGAATGTTGAGATGGTCTTCCGATTGAATTGGGCCAGTGCTGGCGAGAAGCGTGATGATACCCCTGACTACACCATTTTTGTCGGGGATTTGGCTGCAGATGTTACAGACTACCTACTACAAGAGACATTCAGGGTCCATTACCCTTCGGTTAAGGGTGCAAAAGTTGTAACTGACAAAATGACAATGCGTTCAAAGGGTTATGGGTTTGTGAAATTTGGTGATCCTACAGAGCAAGCTCGTGCAATGACTGAAATGAATGGAATGCTTTGCTCTTCCAGACCGATGCGTATTGGTCCAGCGGCAAATAAGAAAACAACAGGGGTTCAGGAGAGAGTACCAAATGCTCAAGGAGCTCAGTCTGAGAATGATCCTAACAATACCACCATATTCGTTGGTGGTCTTGACCCCAACGTCACTGAAGATGTCTTGAAACAAGTTTTCGCTCCTTATGGAGAAGTTGTCCATGTTAAGATTCCTGTTGGGAAAAGATGTGGTTTTGTTCAATATGTTAACAGGCCTTCTGCTGAGCAAGCACTGGCAGTGCTACAAGGGACCTTGATTGGTGGGCAGAATGTTAGACTTTCGTGGGGTCGAAGCCTTTCAAACAAACAGCCTCAGCACGACTCGAATCAGTGGGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGGTTACTATGGTGGCTATGGACAAGGTTATGAGGCTTATGGTGGGTATGCACAACCTCAGGATCCTAACATGTATGGTTATGGAGCCTATGCTGGTTATCCCAATTACCAACAGCAACAAGTAGCACAGCAGCAGCCGCCGCAGCAGTGAGCCCTGTTTGATCGATCGCGTCTTTGGGCTGTGAGGCACACAACCCATTTCAAGCTACAGCTTTAGCTATGTTATTGCTATTCTCAATAGAGAGACGGTTTCTGAAGACTCCAGATTTCGATTGAGGTTTTAATGTATGAACTGTATTATGATTATGAACAACGGATGCTGCCATATCGTGGTTCCTATATTGAGTCATGTATTTTGAAAACATATCCTCTGTTTCCATCTCACCCTTATCATCGATTATTATTATTGCTATGTACCGTTTGTTTCCC
CDS Sequence
- >LOC_Os04g53440.2
ATGCAGCAGCCGCCGTCGCAGCCGCAGCCCGGCATGGGCGGCCCGCCTCCGCCGCCACAGGGCGCGGCGGGGCAGCCGCCGCAGTGGGGCGCGATCCCGCCGCCGATGCCGCCGCACCAGTACGGCGCGCCGCCGCCCCAGCAGCCGCCGGCGATGTGGGGCCAGCCCCCGCCGCAGGCGCACTACGGGCAGGTGCCCCCGCCCCAGCCGTACTACGCCGCGCCACCGCCGCAGGCGATGCCCGCCCCCGCGGCCGCGGACGAGGTGAAGACGCTCTGGATCGGCGACCTGCAGCCCTGGATGGACGAGAGCTACATCTACAACTGCTTCGCGGCCACCGGGGAGGTTCAATCTGTGAAGCTTATCCGGGACAAACAAAGTGGACAGCTTCAGGGTTATGGCTTTGTTGAGTTTACAAGTCGTGCAGCTGCTGATCGAATTCTTCAGACTTATAATGGACAGATGATGCCGAATGTTGAGATGGTCTTCCGATTGAATTGGGCCAGTGCTGGCGAGAAGCGTGATGATACCCCTGACTACACCATTTTTGTCGGGGATTTGGCTGCAGATGTTACAGACTACCTACTACAAGAGACATTCAGGGTCCATTACCCTTCGGTTAAGGGTGCAAAAGTTGTAACTGACAAAATGACAATGCGTTCAAAGGGTTATGGGTTTGTGAAATTTGGTGATCCTACAGAGCAAGCTCGTGCAATGACTGAAATGAATGGAATGCTTTGCTCTTCCAGACCGATGCGTATTGGTCCAGCGGCAAATAAGAAAACAACAGGGGTTCAGGAGAGAGTACCAAATGCTCAAGGAGCTCAGTCTGAGAATGATCCTAACAATACCACCATATTCGTTGGTGGTCTTGACCCCAACGTCACTGAAGATGTCTTGAAACAAGTTTTCGCTCCTTATGGAGAAGTTGTCCATGTTAAGATTCCTGTTGGGAAAAGATGTGGTTTTGTTCAATATGTTAACAGGCCTTCTGCTGAGCAAGCACTGGCAGTGCTACAAGGGACCTTGATTGGTGGGCAGAATGTTAGACTTTCGTGGGGTCGAAGCCTTTCAAACAAACAGCCTCAGCACGACTCGAATCAGTGGGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGGTTACTATGGTGGCTATGGACAAGGTTATGAGGCTTATGGTGGGTATGCACAACCTCAGGATCCTAACATGTATGGTTATGGAGCCTATGCTGGTTATCCCAATTACCAACAGCAACAAGTAGCACAGCAGCAGCCGCCGCAGCAGTGA - >LOC_Os04g53440.1
ATGCAGCAGCCGCCGTCGCAGCCGCAGCCCGGCATGGGCGGCCCGCCTCCGCCGCCACAGGGCGCGGCGGGGCAGCCGCCGCAGTGGGGCGCGATCCCGCCGCCGATGCCGCCGCACCAGTACGGCGCGCCGCCGCCCCAGCAGCCGCCGGCGATGTGGGGCCAGCCCCCGCCGCAGGCGCACTACGGGCAGGTGCCCCCGCCCCAGCCGTACTACGCCGCGCCACCGCCGCAGGCGATGCCCGCCCCCGCGGCCGCGGACGAGGTGAAGACGCTCTGGATCGGCGACCTGCAGCCCTGGATGGACGAGAGCTACATCTACAACTGCTTCGCGGCCACCGGGGAGGTTCAATCTGTGAAGCTTATCCGGGACAAACAAAGTGGACAGCTTCAGGGTTATGGCTTTGTTGAGTTTACAAGTCGTGCAGCTGCTGATCGAATTCTTCAGACTTATAATGGACAGATGATGCCGAATGTTGAGATGGTCTTCCGATTGAATTGGGCCAGTGCTGGCGAGAAGCGTGATGATACCCCTGACTACACCATTTTTGTCGGGGATTTGGCTGCAGATGTTACAGACTACCTACTACAAGAGACATTCAGGGTCCATTACCCTTCGGTTAAGGGTGCAAAAGTTGTAACTGACAAAATGACAATGCGTTCAAAGGGTTATGGGTTTGTGAAATTTGGTGATCCTACAGAGCAAGCTCGTGCAATGACTGAAATGAATGGAATGCTTTGCTCTTCCAGACCGATGCGTATTGGTCCAGCGGCAAATAAGAAAACAACAGGGGTTCAGGAGAGAGTACCAAATGCTCAAGGAGCTCAGTCTGAGAATGATCCTAACAATACCACCATATTCGTTGGTGGTCTTGACCCCAACGTCACTGAAGATGTCTTGAAACAAGTTTTCGCTCCTTATGGAGAAGTTGTCCATGTTAAGATTCCTGTTGGGAAAAGATGTGGTTTTGTTCAATATGTTAACAGGCCTTCTGCTGAGCAAGCACTGGCAGTGCTACAAGGGACCTTGATTGGTGGGCAGAATGTTAGACTTTCGTGGGGTCGAAGCCTTTCAAACAAACAGCCTCAGCACGACTCGAATCAGTGGGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGGTTACTATGGTGGCTATGGACAAGGTTATGAGGCTTATGGTGGGTATGCACAACCTCAGGATCCTAACATGTATGGTTATGGAGCCTATGCTGGTTATCCCAATTACCAACAGCAACAAGTAGCACAGCAGCAGCCGCCGCAGCAGTGA
Protein Sequence
- >LOC_Os04g53440.2
MQQPPSQPQPGMGGPPPPPQGAAGQPPQWGAIPPPMPPHQYGAPPPQQPPAMWGQPPPQAHYGQVPPPQPYYAAPPPQAMPAPAAADEVKTLWIGDLQPWMDESYIYNCFAATGEVQSVKLIRDKQSGQLQGYGFVEFTSRAAADRILQTYNGQMMPNVEMVFRLNWASAGEKRDDTPDYTIFVGDLAADVTDYLLQETFRVHYPSVKGAKVVTDKMTMRSKGYGFVKFGDPTEQARAMTEMNGMLCSSRPMRIGPAANKKTTGVQERVPNAQGAQSENDPNNTTIFVGGLDPNVTEDVLKQVFAPYGEVVHVKIPVGKRCGFVQYVNRPSAEQALAVLQGTLIGGQNVRLSWGRSLSNKQPQHDSNQWGAGAGAGGYYGGYGQGYEAYGGYAQPQDPNMYGYGAYAGYPNYQQQQVAQQQPPQQ* - >LOC_Os04g53440.1
MQQPPSQPQPGMGGPPPPPQGAAGQPPQWGAIPPPMPPHQYGAPPPQQPPAMWGQPPPQAHYGQVPPPQPYYAAPPPQAMPAPAAADEVKTLWIGDLQPWMDESYIYNCFAATGEVQSVKLIRDKQSGQLQGYGFVEFTSRAAADRILQTYNGQMMPNVEMVFRLNWASAGEKRDDTPDYTIFVGDLAADVTDYLLQETFRVHYPSVKGAKVVTDKMTMRSKGYGFVKFGDPTEQARAMTEMNGMLCSSRPMRIGPAANKKTTGVQERVPNAQGAQSENDPNNTTIFVGGLDPNVTEDVLKQVFAPYGEVVHVKIPVGKRCGFVQYVNRPSAEQALAVLQGTLIGGQNVRLSWGRSLSNKQPQHDSNQWGAGAGAGGYYGGYGQGYEAYGGYAQPQDPNMYGYGAYAGYPNYQQQQVAQQQPPQQ*