Information report for PCF1
Gene Details
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Functional Descriptions
- Our results suggest that PCF1 and PCF2 are involved in meristematic tissue-specific expression of the rice PCNA gene through binding to sites IIa and IIb and formation of homodimers or heterodimers.
Functional Keywords
Literature and News
Homologs
- Brachypodium distachyon: Bradi5g02880.1.p
- Panicum virgatum: Pavir.7KG023900.7.p, Pavir.7KG023900.6.p, Pavir.7KG023900.5.p, Pavir.7KG023900.4.p, Pavir.7KG023900.3.p, Pavir.7KG023900.2.p, Pavir.7KG023900.1.p
- Setaria viridis: Sevir.7G022600.1.p
- Zea mays: GRMZM2G096610_P01
Sequences
cDNA Sequence
- >LOC_Os04g11830.1
ACCACCAATGATGGCTTCTTCCTCCGACCTCATCCTCTACAACCTCGTCCCCGCCCAACCCCTAAACCCTAGCGCCATCCCCAACCCTAACCCCGACCTCTCCATCGCCGCCGCCGAGCCCCCCTCCTCCGACGGCGCCACCCCTCGCCGCGTCAGGCCCAGGAAGTCCCCCTCCTCCTCCGACCGCCACTCCAAGGTCGCCGGCCGCGGCCGCCGCGTCCGCATCCCGGCCATGGTGGCCGCCCGCGTCTTCCAGCTCACCCGCGAGCTCGGCCACCGCACCGACGGGGAGACCATCGAGTGGCTACTCCGCCAGGCCGAGCCCTCCATCATCGCCGCCACCGGGACGGGCGTCACCCCGGAGGAGGCGCCCCCCGCCGCCGTCGCCATCGGCTCTTCCTCGGTCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCGGGCATGGGGGCGCGTTCGTCCATGTGCCTTACTACACCGCGCTCCTCATGCAGCCGCCTAACGCGGACGAGCCCCCCATGGCATCCGCTGCCTCCGCCTCGGGCACCACCGCCGCCGACGAGAACAATAATTAATTTAGAACTGCCGCTGTTAGGTTTAGGAGCTTGGAGCGTGTTAGGGTTAGGGTTCCCCGGCTTATTTAGGAGAGGTCTCCCCCTCCTCAATAATTTAACCTCATTGTCCTTGTGGCGGTTGCGGCGGCGGCATGGATTTAGGTTATTTAGATGCCTTATTCAGGCAAGCAAATGAGGGGGTGATTCAGATGGTTTCTTAGAGAGGAGGGCAGAAAAATGGAGAGCTCTCTGTAAGTGGTGGGTGAGGACTGGAGTGAGTGGTACTGATGTTCTGATGAAACAATGCCTGAGTTATTGTGAATGTTTAGATCTGCTGATTTATTCTCCGTGTGCGCTTTTTATGTGCTATAGTAGATGATTCCATTTGGTGTTTACCTTGACTAGGAAGTAGGAACATGGTTTGGTTGTGCCGCAGAAGGAACAGCCTTGGGTTGTATCATGAGAGGAGCTTGGAAGTTGGAAACATAACCAAATTGACTTGGCTGTTACTGTCAGCTGGTTATTTTTGAATCTAACCAGAATTCAGATGCAGATTAACAAAAAAGGTTTTATTTGGAAATTGCTTGGAAGGGTTTTAGTGCTCAGGACATGTGTTCTGCGGTTGCATCTTGTCGTATTCTGAAGACGACGGTTCTGGATTGCCAAATACATGCTTTTATTCCTACTATGCTTGTTTTGGACGTCAAATAAAATGCATGTGCTCTTCCACAAGTGGATACACATCTCATTTGGAGGATTAGGTTTCCTTTTGTTGTAACTGTTTGCTCTATTTCTTGTTTATTACTTTTGTTTATTCTTAAATCATGTAGAAGAACTATAGTTGTAGTGGTTAATGTTTTTTGTCTGTTTGGTTTCCCTTGTCATAAAAAATTATACCTTTTGTCTTTGAGTTGGGAAACGACTTTATATGATGCTTAATTTATTTCATTGCTTTCTGGACATATTTATATCAATAGCAATGTGTTGGTGCATTCAACTTGCTACTGAAGACCTACAGTTTGTTGACCTCAATGCTTGGCATGGCTGCAAAGATTCAGGTATGGTGCTTTTGCTATGCTATAGTATTTTCTCTAAAAATTAGCTTCTTCACATGATCTTCCGAAGCATTAGTCTTCTGCAGAAATTAAAATAATACAGCTAGCCTTGTGGATGTGGAATTTAGTGATAGATTTAAAATTTTCATTATTCTCATATGCCATCATTTTCCATTTTATTTAGATGTAAATTTGCATGGATTTTCCCCAAGAATGCTTGATCGTTTCACGATTTACAGGTAACAGGCTATGTACCTTTTTGGAATTTTATAATTGTTGGGCATTTAAATGTTATTGAGTAATGTTATATGTATACTAACAAGCAAACATCAGATCAAAACTGAGTCGTGTAAGGAAATTTTTGGGTTGGATGTTCCAGAACATCTTGATAATCCATCAATTCTTTTAAAAGCGGTACGCGGTTTCATGTGGTCACCACACCTCGTAGCGCTTATGCGGCATAATTGGCCGCTTATGCGGTGGATTGGCCGCTTATGTGGCTTAAGCGGTACAAGGTTGGGGCACCTGTTCCTTGTATGCGGCCTTGTAAATGTTTTTTTAGAACACTGTAATCCACTATTTTGATCAGGGGGCTGATATGGTAACTGGATCCTTGTTCTAAATTAGTACCCTGTACAATCAATTTTTGTTTATTAACGTGGAATTTTTATATCCAAAGAAGGCCTCACGCAGGGCTGGTGCACCAATTTTGATGGGTAGCTGAATACCCATTTATTTTGTGTCTATGTTATATCGTGATAAAATGGAGTTTTGCTCTATTGGTTCATATATTTTCTGTATCTATGTATATAGTGAAGAAGGTGAATTTTGCTCTATTGGTTAGGCCTTGGATGCATCATTCTGGCTGTGGGTTTGATTCCCATGCTCTCCAGCCCCATGTCACCTTTTTTTCCCAGTATCTCTTGTTCGCCTCAATATCTTTGTATTGTTTCTCTCTTCCACCCGGTAAGATTTGAGAAACCTGCCATATTTTCTCAGAAATTCATCAGTTCTTTTCAAAAACAACCTATCATTGCATAAAAAAACTTGCATCTTTTCTACTGACGACATTAAATCTTTTATTTAAATACCACCACATAAGCTTCATATCTCCTGTGTTTGCCGCTGTGCCACCGCTTGTCCTAGCGCCATATGCTCCACGCTCCTCCCCTTGTGTCTTTATCTTTGCCCCATCTACTATTGTGCACTTGGGTCTTGGTCAAACAGCTCAACATGGAATCAATCGACTCAAGCCTAGCCTATCATGCAACTTGTACCTCTCCCCTACAATCAGGTTGTTACCACACTGCCATAGGCAGATTGCCACCTAGCTGCCACACATTTCCTTGCCTTGCAGCCTCCAACATGGCTCTAATCCCTGTTGAGCGGTGCAGATATGCTAATTAGGTGCATCACAAACTGTCATACTTGCCAGTTGCTTGACAAAATGATTGACTTCTTAAACTTTGAACCATTTGTGCATGTACTCTGTCCTTCTGTTGGATAAACTGTAGTGCTTGTGAGAGTGACGTGGTAATTCCATTTAACGTCAAAGGTGGAGTCTAGGGGTTGTGGGATTTCATGTCAAAGGGGAGTCCAGTTATCCTGCCATTTCAGTATTTAGCAGTTCATTATTTCCTTTTGACCATGCTCCATGCCGATAGATTATGCAACTGGGGCATTAATTGAACCATGTTACGATTTCTCTATATTCAGTCGAGTGATTGCTTATATTGCACCTGGTCTGATCATGAATGAGGTTATGAACCTGACTACTGCTTTCCAATTGCTCTTTGGGATGATATATGAATCTATGTTCTCTGAACTGCATGCTTTAGATTATTGCAAACATGTTGACCATTAAGTATAAATAATGTAGAGTTCTCAATTTGCAGTTCATTTTGATATATTTTCATTTTTCTATGTTCTTTGCAGCTGATACTTGAAGGAAATGCTTCTGATTGTTGTGTGTGCAACTGTGCATGTCACTCATTTTTCAATTTGGTTAAGTCTAATCATGGATTCCAGGTGTAGTTCCCTCTTCGCACATTCATACCTACGCAACATCCTGTTTCTGCATATGTATTGCCGTTAATTGTTGAAACTGCATCATAAACAAATTTTGCACTGAGAATATTTGACTTCTTACCTTTGTGGAGAATGCGTGGCCAGAGCATAGCTCATAACAAAATGGTAAGAGTGACTAAAGTCAATTGTCACTGGTTAGAGCATGGACTGTTTCTAAGTAAGATTTCTTTCTTCTGTAACATTTACTGGTTAACATATCTGAGTTCTGTGGGTGCTCACAAGTGAGCGTATTGTTTATGTATATTGACATATTGTTTCACTTCTAGACGATAAAGAAATCACGAATTTGTAGATAATGTGGGCCATTCCTATGGGCTTCTCCTTTTGCATCTGCATATTACATCTTTAAGTCTTCAATATGAACAAGAAATGATCTTTCTTGATTGGGAAAAAGTCAGTTATGTCAGGTCACTGGTTATTTCTTGATTGTTGAAATGGACTTTGATCATGGATCAGAACATGGTATTTTCTCCATTGAATTCTACAGGTACAGTTTCTTTTCCTTGTTACTGACCAATGCACTTTTGTCATCATCTGATTAGTGTTATCATCTGAAAACCAATCTGTATTTCAATGTGTTTTAATCTTCATCTGAAACCCATTGTACCAGCTCTGTTCCTTGACCACAAATCCAACTTGCAGAGAAGTACACTGACCTAGGATGGCTCCCAAGCAAGGACCAGGAAGTATACATCTAAAAAATAAAGCATTTTTTGTGCCCAAACATTTATGGTCTTGAACATCTTGGGTGTGTTTTGGGAGTCGTTTTTTAGCAGCGGTAGCAGCTGGAGCAGTTCAAAGTGGCTGCAGTTTGCAGCAATTTTGAACTGCCGCAGCCTCAGCAGCTGTGGCAGGTATGGCTGCTGAACAGAGCCCTTATTGTTCAATTATCACCCTGTGACAGGACTTTCTGAAGGCAAGCTTCTGCATCTAGAATTTCTATTTTGGTACTTATAGTTCTTGCGTGACATTTGTTCTGGCACAATGTACCAACAATTTTGATAGTGAATAACTGAGTACAATTTAAAAGATGAACTTTC
CDS Sequence
- >LOC_Os04g11830.1
ATGATGGCTTCTTCCTCCGACCTCATCCTCTACAACCTCGTCCCCGCCCAACCCCTAAACCCTAGCGCCATCCCCAACCCTAACCCCGACCTCTCCATCGCCGCCGCCGAGCCCCCCTCCTCCGACGGCGCCACCCCTCGCCGCGTCAGGCCCAGGAAGTCCCCCTCCTCCTCCGACCGCCACTCCAAGGTCGCCGGCCGCGGCCGCCGCGTCCGCATCCCGGCCATGGTGGCCGCCCGCGTCTTCCAGCTCACCCGCGAGCTCGGCCACCGCACCGACGGGGAGACCATCGAGTGGCTACTCCGCCAGGCCGAGCCCTCCATCATCGCCGCCACCGGGACGGGCGTCACCCCGGAGGAGGCGCCCCCCGCCGCCGTCGCCATCGGCTCTTCCTCGGTCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCGGGCATGGGGGCGCGTTCGTCCATGTGCCTTACTACACCGCGCTCCTCATGCAGCCGCCTAACGCGGACGAGCCCCCCATGGCATCCGCTGCCTCCGCCTCGGGCACCACCGCCGCCGACGAGAACAATAATTAA
Protein Sequence
- >LOC_Os04g11830.1
MMASSSDLILYNLVPAQPLNPSAIPNPNPDLSIAAAEPPSSDGATPRRVRPRKSPSSSDRHSKVAGRGRRVRIPAMVAARVFQLTRELGHRTDGETIEWLLRQAEPSIIAATGTGVTPEEAPPAAVAIGSSSVAAAAAAGGHGGAFVHVPYYTALLMQPPNADEPPMASAASASGTTAADENNN*