Information report for OsRS33
Gene Details
|
|
Functional Descriptions
- The Rice Serine/Arginine Splicing Factor RS33 Regulates Pre-mRNA Splicing during Abiotic Stress Responses.
Functional Keywords
Literature and News
Gene Resources
- UniProt: Q6Z725
- EMBL: AK121372, AP014958
- AlphaFoldDB: Q6Z725
- EnsemblPlants: Os02t0122800-02
- Gramene: Os02t0122800-02
- KEGG: osa:4328133
- Orthologous matrix: GHRKERT
- InterPro: IPR000504, IPR012677, IPR035979
Homologs
- Actinidia chinensis: Achn233951
- Arabidopsis thaliana: AT1G02840, AT2G43410, AT3G16380
- Gossypium hirsutum: Gohir.D10G126300, Gohir.A11G100300
- Juglans regia: Jr16_20170
- Malus domestica: MDP0000288452
- Manihot esculenta: MANES_01G240900
- Prunus persica: PRUPE_1G516100
- Solanum lycopersicum: Solyc09g075080.3
- Vitis vinifera: VIT_15s0048g02700
Sequences
cDNA Sequence
- >LOC_Os02g03040.1
AATCCCCACTCTCTCCTCCTCTCCGCTTCTCCATTCGCCGGCGCCGCCCGAACCAATCGCCCCGAGGAGGAGGAGACCTAGGGTTTCCTCGTCCTCGTCGTCGTCGTCTTCCCCCGCGCCGCCGCCCGCTCCTCCCTTCGTCTATCCCCGGAGGTTTGAGAAGAGTTGCTTGTCCTAAAATGAGGCCAGTTTTCTGTGGAAACCTTGACTATGATGCTCGCCAATCTGAGATTGAGCGCCTCTTCAGCAAATATGGACGTGTGGAGCGTGTTGACATGAAGTCGGGGTTTGCCTTTGTCTACATGGAAGATGAACGTGATGCTGATGAAGCTATCCATAGGCTTGACAGAATTGAATTTGGCAGAAAAGGGAGGAGACTTAGGGTTGAATGGACAAAGGAGGATCGCAGTGGTGGTAGAAGAGGGAACTCAAAGAGATCTCCAAACAATACAAGGCCAACCAAAACTTTGTTTGTGATCAATTTTGATCCAATCAACACAAGGACAAGAGATCTGGAGAGGCACTTCGATCAATATGGCAAGATCTCGAATGTCAGAATCAGAAGGAACTTTGCCTTTGTCCAGTATGAGTTACAGGAAGATGCTACTAAAGCACTGGAGGGTACAAATGGAAGCACTCTTATGGACAGGGTTATCTCTGTGGAATATGCACTTCGTGATGATGATGAGAAAAGGAATGGATACAGCCCAGAAAGAAGAGGCCGTGATCGATCTCCAGACAGGAGGGACTATCGCGGGCGGTCTGCAAGTCCTTATGGCAGAGGGCGTGAGAGGGGCAGCCCTGACTATGGAAGAGGCAGGGAGAGGGGCAGCCCGGACTATGGCAGGGGTGGTGACAGAGGTAGCCCTGATTATCACCGTGGTGCAAGTCCGCAAGGGGGCAACAAAGGTGATGAGAGGGGCAGCCCCCCTAACAACTACGACCGTGAACGCCGTGAAGCCAGCCCTGGCTATGATAGGCCCCGCAGTCGCTCACCTGCGAGGTACGAGAGAGAATGAAGTTGCTCCACATGATGCCTGCGCTGCACCTTCCTGCTTCAGATCAATGGACGCACTATTATTATGTACTGAACTGCTGATGTTGTCTCTCTGAAAGTTGTATTAGTAATTGGTAGCAGACGATTCGTGTACTAGCTAGCTCTAGAACAATGTTTTGTGGATCTCAACTCGTGTTGTTAGCTTACACCTCTTTTCCCGCTTTGATATGAGATGCTTAAACTTCCAGTATTGACTATTTTGGCTGACAGCCTGACACTATGGTAGATTGCTGCACCAAAACGAATTTGCTCTTTGTCATTTGTCTGTTCAACATTTTTTTTCCTGTCCTTA - >LOC_Os02g03040.4
AATCCCCACTCTCTCCTCCTCTCCGCTTCTCCATTCGCCGGCGCCGCCCGAACCAATCGCCCCGAGGAGGAGGAGACCTAGGGTTTCCTCGTCCTCGTCGTCGTCGTCTTCCCCCGCGCCGCCGCCCGCTCCTCCCTTCGTCTATCCCCGGAGGTTTGAGAAGAGTTGCTTGTCCTAAAATGAGGCCAGTTTTCTGTGGAAACCTTGACTATGATGCTCGCCAATCTGAGATTGAGCGCCTCTTCAGCAAATATGGACGTGTGGAGCGTGTTGACATGAAGTCGGGGTTTGCCTTTGTCTACATGGAAGATGAACGTGATGCTGATGAAGCTATCCATAGGCTTGACAGAATTGAATTTGGCAGAAAAGGGAGGAGACTTAGGGTTGAATGGACAAAGGAGGATCGCAGTGGTGGTAGAAGAGGGAACTCAAAGAGATCTCCAAACAATACAAGGCCAACCAAAACTTTGTTTGTGATCAATTTTGATCCAATCAACACAAGGACAAGAGATCTGGAGAGGCACTTCGATCAATATGGCAAGATCTCGAATGTCAGAATCAGAAGGAACTTTGCCTTTGTCCAGTATGAGTTACAGGAAGATGCTACTAAAGCACTGGAGGGTACAAATGGAAGCACTCTTATGGACAGGGTTATCTCTGTGGAATATGCACTTCGTGATGATGATGAGAAAAGGAATGGATACAGCCCAGAAAGAAGAGGCCGTGATCGATCTCCAGACAGGAGGGACTATCGCGGGCGGTCTGCAAGTCCTTATGGCAGAGGGCGTGAGAGGGGCAGCCCTGACTATGGAAGAGGCAGGGAGAGGGGCAGCCCGGACTATGGCAGGGGTGGTGACAGAGGTAGCCCTGATTATCACCGTGGTGCAAGTCCGCAAGGGGGCAACAAAGGTGATGAGAGGGGCAGCCCCCCTAACAACTACGACCGTGAACGCCGTGAAGCCAGCCCTGGCTATGATAGGCCCCGCAGTCGCTCACCTGCGAGGTACGAGAGAGAATGAAGTTGCTCCACATGATGCCTGCGCTGCACCTTCCTGCTTCAGATCAATGGACGCACTATTATTATGTACTGAACTGCTGATGTTGTCTCTCTGAAAGTTGTATTAGTAATTGGTAGCAGACGATTCGTGTACTAGCTAGCTCTAGAACAATGTTTTGTGGATCTCAACTCGTGTTGTTAGCTTACACCTCTTTTCCCGCTTTGATATGAGATGCTTAAACTTCCAGTATTGACTATTTTGGCTGACAGCCTGACACTATGGTAGATTGCTGCACCAAAACGAATTTGCTCTTTGTCATTTGTCTGTTCAACATTTTTTTTCCTGTCCTTA - >LOC_Os02g03040.3
AATCCCCACTCTCTCCTCCTCTCCGCTTCTCCATTCGCCGGCGCCGCCCGAACCAATCGCCCCGAGGAGGAGGAGACCTAGGGTTTCCTCGTCCTCGTCGTCGTCGTCTTCCCCCGCGCCGCCGCCCGCTCCTCCCTTCGTCTATCCCCGGAGGTTTGAGAAGAGTTGCTTGTCCTAAAATGAGGCCAGTTTTCTGTGGAAACCTTGACTATGATGCTCGCCAATCTGAGATTGAGCGCCTCTTCAGCAAATATGGACGTGTGGAGCGTGTTGACATGAAGTCGGGGTTTGCCTTTGTCTACATGGAAGATGAACGTGATGCTGATGAAGCTATCCATAGGCTTGACAGAATTGAATTTGGCAGAAAAGGGAGGAGACTTAGGGTTGAATGGACAAAGGAGGATCGCAGTGGTGGTAGAAGAGGGAACTCAAAGAGATCTCCAAACAATACAAGGCCAACCAAAACTTTGTTTGTGATCAATTTTGATCCAATCAACACAAGGACAAGAGATCTGGAGAGGCACTTCGATCAATATGGCAAGATCTCGAATGTCAGAATCAGAAGGAACTTTGCCTTTGTCCAGTATGAGTTACAGGAAGATGCTACTAAAGCACTGGAGGGTACAAATGGAAGCACTCTTATGGACAGGGTTATCTCTGTGGAATATGCACTTCGTGATGATGATGAGAAAAGGAATGGATACAGCCCAGAAAGAAGAGGCCGTGATCGATCTCCAGACAGGAGGGACTATCGCGGGCGGTCTGCAAGTCCTTATGGCAGAGGGCGTGAGAGGGGCAGCCCTGACTATGGAAGAGGCAGGGAGAGGGGCAGCCCGGACTATGGCAGGGGTGGTGACAGAGGTAGCCCTGATTATCACCGTGGTGCAAGTCCGCAAGGGGGCAACAAAGGTGATGAGAGGGGCAGCCCCCCTAACAACTACGACCGTGAACGCCGTGAAGCCAGCCCTGGCTATGATAGGCCCCGCAGTCGCTCACCTGCGAGGTACGAGAGAGAATGAAGTTGCTCCACATGATGCCTGCGCTGCACCTTCCTGCTTCAGATCAATGGACGCACTATTATTATGTACTGAACTGCTGATGTTGTCTCTCTGAAAGTTGTATTAGTAATTGGTAGCAGACGATTCGTGTACTAGCTAGCTCTAGAACAATGTTTTGTGGATCTCAACTCGTGTTGTTAGCTTACACCTCTTTTCCCGCTTTGATATGAGATGCTTAAACTTCCAGTATTGACTATTTTGGCTGACAGCCTGACACTATGGTAGATTGCTGCACCAAAACGAATTTGCTCTTTGTCATTTGTCTGTTCAACATTTTTTTTCCTGTCCTTA - >LOC_Os02g03040.2
AATCCCCACTCTCTCCTCCTCTCCGCTTCTCCATTCGCCGGCGCCGCCCGAACCAATCGCCCCGAGGAGGAGGAGACCTAGGGTTTCCTCGTCCTCGTCGTCGTCGTCTTCCCCCGCGCCGCCGCCCGCTCCTCCCTTCGTCTATCCCCGGAGGTTTGAGAAGAGTTGCTTGTCCTAAAATGAGGCCAGTTTTCTGTGGAAACCTTGACTATGATGCTCGCCAATCTGAGATTGAGCGCCTCTTCAGCAAATATGGACGTGTGGAGCGTGTTGACATGAAGTCGGGGTTTGCCTTTGTCTACATGGAAGATGAACGTGATGCTGATGAAGCTATCCATAGGCTTGACAGAATTGAATTTGGCAGAAAAGGGAGGAGACTTAGGGTTGAATGGACAAAGGAGGATCGCAGTGGTGGTAGAAGAGGGAACTCAAAGAGATCTCCAAACAATACAAGGCCAACCAAAACTTTGTTTGTGATCAATTTTGATCCAATCAACACAAGGACAAGAGATCTGGAGAGGCACTTCGATCAATATGGCAAGATCTCGAATGTCAGAATCAGAAGGAACTTTGCCTTTGTCCAGTATGAGTTACAGGAAGATGCTACTAAAGCACTGGAGGGTACAAATGGAAGCACTCTTATGGACAGGGTTATCTCTGTGGAATATGCACTTCGTGATGATGATGAGAAAAGGAATGGATACAGCCCAGAAAGAAGAGGCCGTGATCGATCTCCAGACAGGAGGGACTATCGCGGGCGGTCTGCAAGTCCTTATGGCAGAGGGCGTGAGAGGGGCAGCCCTGACTATGGAAGAGGCAGGGAGAGGGGCAGCCCGGACTATGGCAGGGGTGGTGACAGAGGTAGCCCTGATTATCACCGTGGTGCAAGTCCGCAAGGGGGCAACAAAGGTGATGAGAGGGGCAGCCCCCCTAACAACTACGACCGTGAACGCCGTGAAGCCAGCCCTGGCTATGATAGGCCCCGCAGTCGCTCACCTGCGAGGTACGAGAGAGAATGAAGTTGCTCCACATGATGCCTGCGCTGCACCTTCCTGCTTCAGATCAATGGACGCACTATTATTATGTACTGAACTGCTGATGTTGTCTCTCTGAAAGTTGTATTAGTAATTGGTAGCAGACGATTCGTGTACTAGCTAGCTCTAGAACAATGTTTTGTGGATCTCAACTCGTGTTGTTAGCTTACACCTCTTTTCCCGCTTTGATATGAGATGCTTAAACTTCCAGTATTGACTATTTTGGCTGACAGCCTGACACTATGGTAGATTGCTGCACCAAAACGAATTTGCTCTTTGTCATTTGTCTGTTCAACATTTTTTTTCCTGTCCTTA
CDS Sequence
- >LOC_Os02g03040.1
ATGAGGCCAGTTTTCTGTGGAAACCTTGACTATGATGCTCGCCAATCTGAGATTGAGCGCCTCTTCAGCAAATATGGACGTGTGGAGCGTGTTGACATGAAGTCGGGGTTTGCCTTTGTCTACATGGAAGATGAACGTGATGCTGATGAAGCTATCCATAGGCTTGACAGAATTGAATTTGGCAGAAAAGGGAGGAGACTTAGGGTTGAATGGACAAAGGAGGATCGCAGTGGTGGTAGAAGAGGGAACTCAAAGAGATCTCCAAACAATACAAGGCCAACCAAAACTTTGTTTGTGATCAATTTTGATCCAATCAACACAAGGACAAGAGATCTGGAGAGGCACTTCGATCAATATGGCAAGATCTCGAATGTCAGAATCAGAAGGAACTTTGCCTTTGTCCAGTATGAGTTACAGGAAGATGCTACTAAAGCACTGGAGGGTACAAATGGAAGCACTCTTATGGACAGGGTTATCTCTGTGGAATATGCACTTCGTGATGATGATGAGAAAAGGAATGGATACAGCCCAGAAAGAAGAGGCCGTGATCGATCTCCAGACAGGAGGGACTATCGCGGGCGGTCTGCAAGTCCTTATGGCAGAGGGCGTGAGAGGGGCAGCCCTGACTATGGAAGAGGCAGGGAGAGGGGCAGCCCGGACTATGGCAGGGGTGGTGACAGAGGTAGCCCTGATTATCACCGTGGTGCAAGTCCGCAAGGGGGCAACAAAGGTGATGAGAGGGGCAGCCCCCCTAACAACTACGACCGTGAACGCCGTGAAGCCAGCCCTGGCTATGATAGGCCCCGCAGTCGCTCACCTGCGAGGTACGAGAGAGAATGA - >LOC_Os02g03040.4
ATGAGGCCAGTTTTCTGTGGAAACCTTGACTATGATGCTCGCCAATCTGAGATTGAGCGCCTCTTCAGCAAATATGGACGTGTGGAGCGTGTTGACATGAAGTCGGGGTTTGCCTTTGTCTACATGGAAGATGAACGTGATGCTGATGAAGCTATCCATAGGCTTGACAGAATTGAATTTGGCAGAAAAGGGAGGAGACTTAGGGTTGAATGGACAAAGGAGGATCGCAGTGGTGGTAGAAGAGGGAACTCAAAGAGATCTCCAAACAATACAAGGCCAACCAAAACTTTGTTTGTGATCAATTTTGATCCAATCAACACAAGGACAAGAGATCTGGAGAGGCACTTCGATCAATATGGCAAGATCTCGAATGTCAGAATCAGAAGGAACTTTGCCTTTGTCCAGTATGAGTTACAGGAAGATGCTACTAAAGCACTGGAGGGTACAAATGGAAGCACTCTTATGGACAGGGTTATCTCTGTGGAATATGCACTTCGTGATGATGATGAGAAAAGGAATGGATACAGCCCAGAAAGAAGAGGCCGTGATCGATCTCCAGACAGGAGGGACTATCGCGGGCGGTCTGCAAGTCCTTATGGCAGAGGGCGTGAGAGGGGCAGCCCTGACTATGGAAGAGGCAGGGAGAGGGGCAGCCCGGACTATGGCAGGGGTGGTGACAGAGGTAGCCCTGATTATCACCGTGGTGCAAGTCCGCAAGGGGGCAACAAAGGTGATGAGAGGGGCAGCCCCCCTAACAACTACGACCGTGAACGCCGTGAAGCCAGCCCTGGCTATGATAGGCCCCGCAGTCGCTCACCTGCGAGGTACGAGAGAGAATGA - >LOC_Os02g03040.3
ATGAGGCCAGTTTTCTGTGGAAACCTTGACTATGATGCTCGCCAATCTGAGATTGAGCGCCTCTTCAGCAAATATGGACGTGTGGAGCGTGTTGACATGAAGTCGGGGTTTGCCTTTGTCTACATGGAAGATGAACGTGATGCTGATGAAGCTATCCATAGGCTTGACAGAATTGAATTTGGCAGAAAAGGGAGGAGACTTAGGGTTGAATGGACAAAGGAGGATCGCAGTGGTGGTAGAAGAGGGAACTCAAAGAGATCTCCAAACAATACAAGGCCAACCAAAACTTTGTTTGTGATCAATTTTGATCCAATCAACACAAGGACAAGAGATCTGGAGAGGCACTTCGATCAATATGGCAAGATCTCGAATGTCAGAATCAGAAGGAACTTTGCCTTTGTCCAGTATGAGTTACAGGAAGATGCTACTAAAGCACTGGAGGGTACAAATGGAAGCACTCTTATGGACAGGGTTATCTCTGTGGAATATGCACTTCGTGATGATGATGAGAAAAGGAATGGATACAGCCCAGAAAGAAGAGGCCGTGATCGATCTCCAGACAGGAGGGACTATCGCGGGCGGTCTGCAAGTCCTTATGGCAGAGGGCGTGAGAGGGGCAGCCCTGACTATGGAAGAGGCAGGGAGAGGGGCAGCCCGGACTATGGCAGGGGTGGTGACAGAGGTAGCCCTGATTATCACCGTGGTGCAAGTCCGCAAGGGGGCAACAAAGGTGATGAGAGGGGCAGCCCCCCTAACAACTACGACCGTGAACGCCGTGAAGCCAGCCCTGGCTATGATAGGCCCCGCAGTCGCTCACCTGCGAGGTACGAGAGAGAATGA - >LOC_Os02g03040.2
ATGAGGCCAGTTTTCTGTGGAAACCTTGACTATGATGCTCGCCAATCTGAGATTGAGCGCCTCTTCAGCAAATATGGACGTGTGGAGCGTGTTGACATGAAGTCGGGGTTTGCCTTTGTCTACATGGAAGATGAACGTGATGCTGATGAAGCTATCCATAGGCTTGACAGAATTGAATTTGGCAGAAAAGGGAGGAGACTTAGGGTTGAATGGACAAAGGAGGATCGCAGTGGTGGTAGAAGAGGGAACTCAAAGAGATCTCCAAACAATACAAGGCCAACCAAAACTTTGTTTGTGATCAATTTTGATCCAATCAACACAAGGACAAGAGATCTGGAGAGGCACTTCGATCAATATGGCAAGATCTCGAATGTCAGAATCAGAAGGAACTTTGCCTTTGTCCAGTATGAGTTACAGGAAGATGCTACTAAAGCACTGGAGGGTACAAATGGAAGCACTCTTATGGACAGGGTTATCTCTGTGGAATATGCACTTCGTGATGATGATGAGAAAAGGAATGGATACAGCCCAGAAAGAAGAGGCCGTGATCGATCTCCAGACAGGAGGGACTATCGCGGGCGGTCTGCAAGTCCTTATGGCAGAGGGCGTGAGAGGGGCAGCCCTGACTATGGAAGAGGCAGGGAGAGGGGCAGCCCGGACTATGGCAGGGGTGGTGACAGAGGTAGCCCTGATTATCACCGTGGTGCAAGTCCGCAAGGGGGCAACAAAGGTGATGAGAGGGGCAGCCCCCCTAACAACTACGACCGTGAACGCCGTGAAGCCAGCCCTGGCTATGATAGGCCCCGCAGTCGCTCACCTGCGAGGTACGAGAGAGAATGA
Protein Sequence
- >LOC_Os02g03040.1
MRPVFCGNLDYDARQSEIERLFSKYGRVERVDMKSGFAFVYMEDERDADEAIHRLDRIEFGRKGRRLRVEWTKEDRSGGRRGNSKRSPNNTRPTKTLFVINFDPINTRTRDLERHFDQYGKISNVRIRRNFAFVQYELQEDATKALEGTNGSTLMDRVISVEYALRDDDEKRNGYSPERRGRDRSPDRRDYRGRSASPYGRGRERGSPDYGRGRERGSPDYGRGGDRGSPDYHRGASPQGGNKGDERGSPPNNYDRERREASPGYDRPRSRSPARYERE* - >LOC_Os02g03040.4
MRPVFCGNLDYDARQSEIERLFSKYGRVERVDMKSGFAFVYMEDERDADEAIHRLDRIEFGRKGRRLRVEWTKEDRSGGRRGNSKRSPNNTRPTKTLFVINFDPINTRTRDLERHFDQYGKISNVRIRRNFAFVQYELQEDATKALEGTNGSTLMDRVISVEYALRDDDEKRNGYSPERRGRDRSPDRRDYRGRSASPYGRGRERGSPDYGRGRERGSPDYGRGGDRGSPDYHRGASPQGGNKGDERGSPPNNYDRERREASPGYDRPRSRSPARYERE* - >LOC_Os02g03040.3
MRPVFCGNLDYDARQSEIERLFSKYGRVERVDMKSGFAFVYMEDERDADEAIHRLDRIEFGRKGRRLRVEWTKEDRSGGRRGNSKRSPNNTRPTKTLFVINFDPINTRTRDLERHFDQYGKISNVRIRRNFAFVQYELQEDATKALEGTNGSTLMDRVISVEYALRDDDEKRNGYSPERRGRDRSPDRRDYRGRSASPYGRGRERGSPDYGRGRERGSPDYGRGGDRGSPDYHRGASPQGGNKGDERGSPPNNYDRERREASPGYDRPRSRSPARYERE* - >LOC_Os02g03040.2
MRPVFCGNLDYDARQSEIERLFSKYGRVERVDMKSGFAFVYMEDERDADEAIHRLDRIEFGRKGRRLRVEWTKEDRSGGRRGNSKRSPNNTRPTKTLFVINFDPINTRTRDLERHFDQYGKISNVRIRRNFAFVQYELQEDATKALEGTNGSTLMDRVISVEYALRDDDEKRNGYSPERRGRDRSPDRRDYRGRSASPYGRGRERGSPDYGRGRERGSPDYGRGGDRGSPDYHRGASPQGGNKGDERGSPPNNYDRERREASPGYDRPRSRSPARYERE*