Information report for PH13
Gene Details
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Functional Descriptions
- Identify a plant height regulating gene on chromosome 13 (PH13) encoding a WD40 protein with three main haplotypes in natural populations.
- PH13 improves soybean shade traits and enhances yield for high-density planting at high latitudes
- PH13 and PHP redundantly regulate LBL-induced exaggerated stem elongation.
- Deletion of both PH13 and its paralogue PHP can prevent shade-induced ESE and allow high-density planting. This study provides insights into the mechanism of shade-resistance and offers potential solutions for breeding high-yielding soybean cultivar for high-latitude regions.
Functional Keywords
- stem , resistance , yield , breeding , height , plant-height
Literature and News
Gene Resources
- NCBI ID: 100809718
- UniProt accessions: K7M2B8
- EMBL: CM000846
- EnsemblPlants: KRH22083 , KRH22084 , KRH22085
- Gramene: KRH22083 , KRH22084 , KRH22085
- KEGG: gmx:100809718
- GO: GO:0004672 , GO:0005524 , GO:0009640
- OMA: VHSFMGH
- InterPro: IPR000719 , IPR001680 , IPR011009 , IPR015943 , IPR019775 , IPR020472 , IPR036322 , IPR044630
- PANTHER: PTHR44218 , PTHR44218:SF1
- SUPFAM: SSF50978 , SSF56112
- PROSITE: PS00678 , PS50011 , PS50082 , PS50294
- Gene3D: 1.10.510.10 , 2.130.10.10
- OrthoDB: K7M2B8
Homologs
- Cicer arietinum: Ca_06865
- Juglans regia: Jr02_21850, Jr09_14070
- Malus domestica: MD11G1247500
- Manihot esculenta: MANES_15G087200
- Medicago truncatula: Medtr2g085210
- Prunus avium: Pav_sc0002828.1_g660.1.mk
- Prunus persica: PRUPE_4G180900
- Ricinus communis: 27755.t000002
- Rosa chinensis: RchiOBHm_Chr5g0033591
Sequences
cDNA Sequence
- >Glyma.13G276700.2
AATGTGGAAACAAAAGGAGAGGCTAATACTAGAGTATGCAAAATACGGCAGAGATTACTTTGGTTAATTCTCAAACGACTTTTTTTAATTCCAATATTAGTTTTATATTACTGTAATTGTTTGTGTGGGGGAGGTTTTATTTGTTCTGTACTTTTGTTTTAACTTTTTATTATTATTACTGTGTTATTTTTTCTTCTTCTGATTTTCCTATAATAAGAGAAATGTTGGGAATTTATGAGGCTGTGGAGCTTCAATGTGCTTGTGTTGTGTGTGCAACTAGAAAGTTTTTGTTGTGTGGCTCTGTTGTGAGGTTGGCCTAGCAGAAACAGGAGATCCTCCTATGGTGACACTGACTTGACAGAGGAAGTTGTGATCGTGTTCAGTGTGAAAAAAAGGTTGAAAGGTTGATCTTGATTGATATTGGAGTCTTTGTGATGAAATGAGTTTGAGTTATAATGGTGATGGTGGAGGTGCTAGAGTGTGAGGCAAGTTGGAGGAGGGCCATAGTTTATGGATGTGTTGTTGTACTTGGCCTACATGCAACTCTAGCTGGATGAAGATGGAGCCTTCTGGGTCTGCTTTTCAGAATTCTGGCAGTTCTAGGGCCTTGAACAGTTCTGGAGTCTCAGATAGGAACCAAAGGGTTCATTGTCCTCAAAGGAACCCCTTCTTGGGTGAGGCATCCCAGGATTCGGGGTTCAGAAAGGAAAGGGATAGGTTTCTGTTGGCTCAAGGTGGTCAGCCTAAGAACTTGGGCGGTGGTTTTTCGGGGTTGTGTGAGGACGAGGTGGAGGTTGACCCCTTTTTCTGTGCTGTAGAATGGGGTGATATTAGCTTGAGGCAATGGTTGGATAAACCTGAACGATCGGTGGGTGCCTTCGAATGCTTGCACATATTTAGGCAAATAGTAGAGATTGTCAGTGTAGCGCATTCTCAAGGAGTTGTAGTTCACAATGTGAGGCCTTCCTGCTTTGTCATGTCCTCTTTCAACCATATCTCATTTATTGAATCAGCATCTTGTTCAGATACTGGATCGGATTCTTTGGGAGAAGGATTAAACAACCAAGGCGGTGAGGTTAAAACTCCAACATCTCTCTGTCCCCATGATATGCCTCAGCAGAGTATGGGAAGTGAAGATTTTATGCCTGTCAAGACTTTAACCACCCCTGCTCAGTCAGATTCTAGTTGCATGTTGTCGAGTGCCGTGTATGCGGCTCGTGCATCATTGATAGAAGAAACAGAAGAAAATAAAATGAAAGATAGGAGAAAGGATGACGAAGTAGAAGGAAAGAAGCAATCATTTCCAATGAAACAGATACTACTAATGGAGATGAGTTGGTACACTAGTCCTGAAGAGGGTGCTGGTGAATCTAGTTCTTGTGCTTCAGACGTTTATCGATTGGGGGTTCTCCTTTTTGAGCTATTTTGTCCGCTCAGCTCAAGAGAAGAAAAGAGTAGAACCATGTCTAGCCTTAGACACAGAGTTCTTCCTCCACAGTTACTTCTAAAGTGGCCTAAAGAAGCTTCTTTTTGTTTATGGTTACTGCATCCTGACCCTAGTGGTCGTCCAACACTCGGGGAGTTGTTGCAGAGCGACTTCCTTAATGAACAGAGAGATGATATGGAAGAACGTGAAGCAGCGATAGAGCTGAGACAAAGGATAGATGATCAGGAGTTGCTGTTAGAATTCCTTTTATTACTTCAACAGAGAAAACAGGAAGTTGCTGAGAAGTTGCAACATACTGTCTCTTTTCTGTGTTCAGATATTGAAGAAGTGACCAAGCAGCACGTTAGATTTAAAGAGATTACTGGTGCTGAACTGGGGAGTGATGAGCATTCAGCATCAAGTTTCCCATCCATGACAGTTGTTGATAGTGAGGGTTCTGCTTTTCTAGGGACTAGAAAACGAGTCAGACTAGGGATGGATGTTAAAAACATTGAGGAATGTGTCGATGATGTAGGGGATGATCAGAAAAGTAACGGAAGTTTTCTTTCAAAAAGTTCACGGCTAATGAAGAACTTTAAGAAACTTGAGTCAGCATACTTTTTAACACGATGTAGACCAGCCTATTCCTCTGGGAAACTGGCGGTTAGACATCCACCTGTAACAAGTGATGGTAGAGGGTCTGTTGTCATGACTGAAAGAAGTTGCATCAATGACTTGAAATCTAAAGAGCAGTGCAGGGAGGGTGCGAGTGCTTGGATAAATCCTTTTCTTGAGGGTTTGTGCAAGTATTTATCATTCAGTAAGCTAAAGGTTAAGGCTGACCTAAAGCAAGGAGATCTTTTGCATTCTTCCAACCTAGTATGCTCACTCAGCTTTGATCGTGATGGAGAGTTTTTCGCTACTGCCGGTGTGAATAAGAAAATTAAAGTGTTTGAATGTGATTCAATAATAAATGAGGATCGTGATATCCACTATCCAGTTGTGGAGATGGCTAGCAGGTCAAAGTTAAGCAGTATATGTTGGAATACATATATCAAAAGTCAAATTGCTTCAAGCAACTTTGAAGGTGTTGTACAGTTATGGGATGTAACAAGAAGTCAAGTAATCTCTGAAATGAGGGAGCATGAGCGGCGGGTGTGGTCAATTGATTTCTCATCAGCAGACCCAACAATGTTAGCAAGTGGGAGCGATGACGGTTCTGTCAAGCTATGGAGTATCAATCAGGGAGTTAGTGTTGGTACCATCAAAACCAAGGCAAATGTTTGCTGCGTTCAGTTCCCTCTGGATTCTGCTCGTTTTCTTGCTTTTGGCTCAGCAGATCACCGAATATATTACTATGATCTACGCAACCTAAAAATGCCGCTTTGTACTTTAGTTGGACATAACAAGACTGTGAGCTACATCAAGTTTGTAGACACTGTGAACCTTGTCTCTGCTTCCACAGATAACACTTTGAAGCTTTGGGATTTGTCTACATGTGCATCTCGAGTTATAGACTCACCGATTCAATCATTCACGGGTCATGCGAATGTTAAGAACTTTGTGGGGTTATCAGTATCTGATGGTTACATTGCCACTGGTTCAGAGACAAATGAGGTGTTCATATACCACAAAGCCTTCTCCATGCCAGCATTGTCATTCAAGTTTCAGAACACAGACCCTCTTTCCGGTAATGAAGTGGACGACGCTGCGCAGTTTGTGTCCTCGGTTTGCTGGCGCGGCCAGTCGTCCACCTTGCTCGCTGCAAATTCCACAGGGAATGTCAAAATTCTGGAGATGGTTTAATAAGTTGTTGGCGTCTACACATCAATCTACTACAAAAATGATAGAGTTTGCTGAGCATGAGGTGACAGAGCCTATGCTTAAGATTATAGCTTCTGTTGCCACTGAATGCTATACAAAGGGGTATATAGATTCCTTGATTATTATTTGTAAGTTGTAACATAACAAATTTTTGCATTAGTAGTTCATAGCGGAAGCAGTTAAAGAAAAGAGAGATTGATCGCGTGGAAAACCAAAAAAGCTCATGTAGATAGTGTCACATTGAAGAAAAAGTGAACGTCACAACAATCAATATCAGATTTTTACGGTTATGATCCATATTCAATGATAGTTACATTCACCTAGTGGAAGCTACTCATTTTGTGTAGAATTCGATAATATTTACAGATAAAAAATCTATTGCATTTTCTAAAATATTTCTTGTTTTTAATGTGCTAAGTTGGTGCAAGCTTTTATGAATTGAATGTCCCGTATCATGTGGATTGTGGAACGTGGCACATTAAATGCCTTTT - >Glyma.13G276700.3
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