Information report for GmVSPβ
Gene Details
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Functional Descriptions
- GmN:IFR play crucial roles in coordinated plant defense regulation, which provides valuable information for understanding the molecular mechanisms involved in insect-induced transcriptional regulation in soybean.
- Two defense-related genes, GmVSPβ and GmN:IFR, a high proportion of transcription factors (TFs) participate in the incompatible soybean-common cutworm interaction networks.
- GmVSPα, GmVSPβ, and GmN:IFR, revealed the enrichment of various TF-binding sites for defense and stress responses.
- Suggesting that GmVSPβ and GmN:IFR most likely represent inducible promoters related to the induced defense mechanism in soybean.
Literature and News
Gene Resources
- NCBI ID: 547820
- UniProt accessions: P10743
- EMBL: M20038 , M37529 , M76980
- AlphaFoldDB: P10743
- EnsemblPlants: KRH44262
- Gramene: KRH44262
- KEGG: gmx:547820
- GO: GO:0045735
- OMA: CVAYIAN
- InterPro: IPR005519 , IPR011267 , IPR014403 , IPR023214 , IPR036412
- PANTHER: PTHR31284 , PTHR31284:SF19
- SUPFAM: SSF56784
- Gene3D: 3.40.50.1000
- OrthoDB: P10743
- SMR: P10743
- CDD: cd07535
Sequences
cDNA Sequence
- >Glyma.08G200100.1
AAGGTGCAAGAGTTTGTTGTGAGCTATAAGCTAGTTTATCGTGAGGAGAATATGAAGTTGTTTGTTTTCTTTGTTGCTGCAGTAGTTTTGGTAGCATGGCCATGCCATGGCGCAGGCTACCAAAGGTTCCCTCTCCGAATGAAAACTGGCTATGGTGAGCGTTCTTCGGAGGTAAAATGCGCAAGTTTTAGGCTTGCTGTGGAAGCACACAACATCCGAGCCTTTAAAACCATTCCTGAAGAGTGCGTTGAACCAACAAAGGACTACATTAATGGCGAACAATTTAGATCAGACTCTAAAACAGTTAACCAACAAGCTTTCTTTTATGCTAGTGAACGCGAAGTCCATCACAACGACATATTTATATTCGGCATAGATAACACCGTACTCTCTAATATCCCATACTATGAAAAACATGGATATGGGGTGGAGGAATTTAATGAAACCTTATATGATGAATGGGTTAACAAGGGCGACGCACCGGCATTGCCAGAGACTCTTAAAAATTACAACAAGCTGTTGTCTCTTGGCTTCAAGATTGTATTCTTGTCAGGAAGATATCTTGACAAAATGGCCGTAACAGAAGCAAACCTAAAGAAGGCTGGCTTCCACACATGGGAGCAGTTAATTCTCAAGGATCCACATCTTATCACTCCAAATGCACTTTCATACAAATCAGCAATGAGAGAGAATCTGTTGAGGCAGGGATACAGAATTGTTGGAATCATTGGAGACCAATGGAGCGATCTGCTTGGAGACCACAGAGGCGAAAGCAGGACCTTTAAGCTTCCTAATCCCATGTACTACATTGAGTAGTACCTTCACCTCTCTCAACAATCTAGCTAGAGTTTGCTCCTATCTATATGTAATAAGGTATGCTGATATGCACTATTCAAATAGGAGCATTAGCTATGTTTGTTAATGTCACTTTATGTTATGTGGGTAAGTCACCTAAGACACTCCACGTACCTACTTGTTGTCTCTTACGCGGCTTTAATAAATCTTCTGCCCTTGTTCCATATTTACTAATTATCCCTTTCTTCACTAAAAGAAAATTGTTATCATTAAGTATTAGTCTTTAGAACATATGAGGTCTTTAATTGGGTAGGTTTTACAAATTAACTAATATAAAATGTCATAAAATCCACGTGGTTAAACAAATGCAGAAAATCGACGTCGTCTATTGGACCGACAGTTGCTATTAATATAATGGGCCACCATAGTAGACTGACAAATAAATTACCTGACAACATCGTTTCACAAAAAAACAAACACAAAAAGGGAGTGCATTTTCCAGGGCATTTTTGTAATAAAAAACAGTTAAAAGGGAGTGCAATAGAAATATAGGGGTGTGGAAATAGTGATTTGAGCACGTCTTGAAGCAAATTGGGTTGTTCAGTTTTGGGCTGGCCGAAGAAAATTAAAAGATAGTGGAGCTCAACCCAACTAATTTTCTTCTATTCCACTTTAATCTAACCCTCAATTAATTAGTTTAATTTTATGACTAATTTTTTTAATGCACATACAATGAATTCTAAAAATTTACTTCACACACAAACTATCAATTTATATAAATTCATTATACTTATTTCAAAAGCGAACTAATTATAAACTCTTTGCATTATTTTGGTTTAGCTAGAAATACATGCAATTCCACAAATAGTTACAAACACAGTTATTCGAGTGATGGATGGATGTCTCAATTATGGCTGCACAAATACACGAGTTGTGCCTTAGGGAGAGGGGGCGGGGGAATCATGCTTTTGGGTGGAAAAAATTCATTTCTAATGCTTTGTCTGTTTCACTGAAAAGATAATTAGTCTATTCATAAGAGGAGATGAGATCATATGAAAAATATAATCGATTCTTTCATTTGTTTGGACTAGTAGTCATCCGTGAAAGTTTTGGGTTTAATATTGATATTTTAACAATAAATCCAATAAATCTTAGTGTAATGTTAGATATATTGATTTTTTTTTTGGAAAAGAAGTGTGTGCGAGCTGCTTATTTCAAAGAATAGAGAGATGAAAAACAACTTCATGTTTACTACGTGTATACATTTGGACTTTGGAGTATCTGGAGAAAGGAAGGAATAAAAGTATGCACGTATCATGTATGGTTCCATATATTAACTTTATATCTCGTTTAATTTAGAACGAAAAGGGAAGAAAATTAGTTTTTTTTTTCTTTCAATACGAAGATAAAAATATTATAATTTATATTATATCTCATGTTTTACTATTAAGGCATTATCTTTTTCCTCTTTAATTGTTTTTGTCATGAAATAACATAAAAAGTCATTTTGTTGTTTTTTTAGTTTTAATTTTTTTATATCAAACTCCAACTATATTTTGCTTTTAAAATATAAACTGTAGAGATATGCCGTCGATTTTTTAAATATAAAATACCAGCAAGGACCACGAGCATTTATCTAGTCTCTATATATTTAAAAGTTAGGACTAGAGTGGACCCAACAGTAAAAGCGACTGCAAATATTTTTGTTGGCATGATAAATGATTGTGAATGAGTTACGATTTTTATATTATAGCAGTATTTAATAAAAAGTAAATTGAAATTTGAAAATCAATACTTTAATGATATAGGTATGTTTGGATTAATTTCTCCCGAAATACTTCTAGAAGATAAATAAAAAATAACTTTTTGTAAGTTAATTTTTGCACTAATTATAGAAGCTGTATCACATAATTTTTTTAAAGATAACTTTTAACTTATGAAAAATTAATTTTAATCAATAAAGAAATTTATTTCATTTCTTGTTTTTGAACTTTAGAAGTGTTTATAAAGATGTTTATATAAACATACTGATATCAATAAAAATTAGAATGAAAGTTACCAATTCGATATATATTAATAAAAAATTATAAATTATACATCACGTGTGCTGATTTTAAAAAGTTTTTTTAAAAAATTATTAAAATCGTAGATAACAATTACGACTTTTGTATCTCATTCGTTAAAATAAATCATAAGACTAAAATTATTTTATTTTGTTTCATTTTTTCACACTGTTTTCTTAATACTTAAAATAAAATAATAGTTTTAAGAAGAAAAAAAATTAAATTTAAATAAATAAGAACTAAATTATTTATGAATGGATTGAATTATCAAATTTGATTAAATTGATTTTAAATTTGATCAAAATTGAATCAAGCTGGTCTATAAACACTCCAATGTAGAGGGCATAACCTTCCGAATTGGATGCTTTATTTCCGGAGTATAAAAAAAGAAAGAATTAAAATCTAAAAACAATGTCAACAAACATTGTTAATTTGATATGATTACCAGATATAATCTTATCTTTTAAATACGTTATTTTTTGGAGATCCCTATAATACTCATGTTTGTGTAAATGAAACAAAATATACGTTTAAAAAGATGAAATCCTTAAATGAGTCTTACCCGGTTGAAAGACACTCTGAGTTCACCAATGTAATCAAGCAAAAAAAATTACCATTAACGTAAGTTTACGAATCCTTAATTCACTAATAAAGACAAACATTAAGTTAATGGGGATAAATTAAATAACTAATTGTTTTTCATATATGTTTTATTCATTGTTATTATC
CDS Sequence
- >Glyma.08G200100.1
ATGAAGTTGTTTGTTTTCTTTGTTGCTGCAGTAGTTTTGGTAGCATGGCCATGCCATGGCGCAGGCTACCAAAGGTTCCCTCTCCGAATGAAAACTGGCTATGGTGAGCGTTCTTCGGAGGTAAAATGCGCAAGTTTTAGGCTTGCTGTGGAAGCACACAACATCCGAGCCTTTAAAACCATTCCTGAAGAGTGCGTTGAACCAACAAAGGACTACATTAATGGCGAACAATTTAGATCAGACTCTAAAACAGTTAACCAACAAGCTTTCTTTTATGCTAGTGAACGCGAAGTCCATCACAACGACATATTTATATTCGGCATAGATAACACCGTACTCTCTAATATCCCATACTATGAAAAACATGGATATGGGGTGGAGGAATTTAATGAAACCTTATATGATGAATGGGTTAACAAGGGCGACGCACCGGCATTGCCAGAGACTCTTAAAAATTACAACAAGCTGTTGTCTCTTGGCTTCAAGATTGTATTCTTGTCAGGAAGATATCTTGACAAAATGGCCGTAACAGAAGCAAACCTAAAGAAGGCTGGCTTCCACACATGGGAGCAGTTAATTCTCAAGGATCCACATCTTATCACTCCAAATGCACTTTCATACAAATCAGCAATGAGAGAGAATCTGTTGAGGCAGGGATACAGAATTGTTGGAATCATTGGAGACCAATGGAGCGATCTGCTTGGAGACCACAGAGGCGAAAGCAGGACCTTTAAGCTTCCTAATCCCATGTACTACATTGAGTAG
Protein Sequence
- >Glyma.08G200100.1
MKLFVFFVAAVVLVAWPCHGAGYQRFPLRMKTGYGERSSEVKCASFRLAVEAHNIRAFKTIPEECVEPTKDYINGEQFRSDSKTVNQQAFFYASEREVHHNDIFIFGIDNTVLSNIPYYEKHGYGVEEFNETLYDEWVNKGDAPALPETLKNYNKLLSLGFKIVFLSGRYLDKMAVTEANLKKAGFHTWEQLILKDPHLITPNALSYKSAMRENLLRQGYRIVGIIGDQWSDLLGDHRGESRTFKLPNPMYYIE*