Gene Details:

  • Gene ID: Glyma.19G206800
  • Gene Symbol: GmTIR1C
  • Gene Name: TRANSPORT INHIBITOR RESPONSE 1C
  • Genome: Wm82.a4.v1
  • Species: Glycine max

Functional Descriptions:

  • GmTIR1/GmAFB3-based auxin perception regulated by miR393 modulates soybean nodulation.
  • GmTIR1A and GmTIR1C play major roles in soybean nodulation.
  • The GmTIR1A, GmTIR1C and GmAFB3A genes are the direct targets of soybean miR393.

Literature:

Gene Resources:

Sequences:

cDNA Sequence
  • >Glyma.19G206800.1
    GGGCAGCATAAGCATAAACTTAAACTCCTTATCCGTCTTTCTCTCCCTCACATCACACATCACACATCACACAAACAGAGACACATTATTATTACATACTACCACTCTCGTAGTCTCGCTTGGTGTTAATGGCGTTTCAGATCTAACAGTGCAAGTGGTTCGGCGTGGTTGTTAGTGAGTTGGTTAAGCGACGGCGTTTGGTTGGGGTTAGTATTATGCAGAGAATGGCGTACACGTTTTCGTTTCCGGAGGAGGTGCTGGAGCACGTGTTCTCGTTCATATGGAACGAGAGGGACAGGAACGCGATCTCGCTGGTGTGTAAGTCATGGTACGAGATCGAGAGGTGGTGCAGGAGGAAGGTGTTCGTGGGGAACTGCTACGCGGTGAGCCCTCTGATGGTGGTCAAGCGGTTCCCGGAGGTGAGATCCATTGCGCTCAAAGGGAAGCCGCACTTTGCGGACTTCAATTTGGTCCCCGATGGCTGGGGAGGTTACGTCTGCCCCTGGATCGCCGCCATGGCTCGCGCCTTCCCCTGCCTCGAAGAAATCAGGCTCAAGAGGATGGTCATCACCGACGAGAGCTTGGAACTCATCGCTAAGTCCTTCAAGAACTTCAAGGTCTTGGTTCTCACTTCCTGTGAGGGTTTTACCACTGATGGACTTGCCGCCATTGCTGCCAACTGCAGGAATTTGAGGGAATTGGACTTGCAAGAGAGTGAAGTGGAGGAGGACCTTAGTGGGCACTGGCTAAGCCATTTTCCTGATTCCTATACGTCATTAGTTTCACTTAACATCTCTTGCTTAAACAATGAGGTGAGTTTATCTGCGCTAGAGCGTCTGCTTGGGAGGTGTCCCAACCTGCGGACCCTCCGTCTCAATCGTGCCGTGCCCCTTGATAGACTACCCAACCTACTTCTCCAGTGTCCTCAGCTGGTTGAGTTAGGCACAGGAGTCTACTCAACTGAGATGCGACCAGAGGTCTTCTCAAACCTGGAAGCAGCATTTTCTGGCTGCAAGCAGTTGAAGAGCTTGTCTGGCTTTTGGGATGTGCTCCCATCCTACCTTCCAGCTGTCTACCCCATCTGCTCAAGGCTAACATCGCTAAACTTGAGTTATGCTATTATTCAAAGCTCTGATCTTATTAAGCTTATCAGTCAATGCCCAAATTTGTTGCGATTATGGGTGCTGGATTACATAGAAGATGCTGGTCTTTATGCCCTTGCTGCATCATGTAAGGATCTAAGAGAGTTAAGGGTGTTTCCTTCTGACCCATTTGGTTTAGAACCAAATGTTGCATTGACAGAACAGGGCCTTGTCTCTGTGTCTGAAGGTTGCCCCAAGCTCCAATCAGTTCTATATTTTTGTCGTCAAATGTCGAATGCAGCCCTACATACAATTGCGCGGAACAGGACTAATTTGACTCGTTTTCGGCTTTGTATTATTGAGCCTCGGACTCCTGACTATCTAACCCATGAACCCCTGGATTCTGGTTTTGGGGCTATTGTAGAGCAATGCAAGGATCTTCAACGCCTATCCCTATCTGGTCTTCTTACTGACCGTGTTTTCGAGTATATCGGGACTTGTGGTAAGAAGCTGGAGATGCTATCTGTGGCTTTTGCTGGAGATAGTGATTTGGGACTTCATCATGTGCTATCAGGGTGTGATAATCTTAGGAAGCTGGAGATCAGGGACTGCCCCTTTGGTGACAAGGCCCTTTTGGCAAATGCTGAAAAGCTGGAGACAATGCGATCCCTTTGGATGTCCTCCTGCTCGGTGAGTTATGGAGCATGTAAGCTACTGGGTCAGAAAATGCCAAGACTCAACGTTGAAGTCATTGATGAAAGAGGACCTCCAGATTCAAGGCCAGATGATTGTCCAGTTGAGAAGCTTTATATATACAGGACTATTGCCGGGCCAAGGTTGGACATGCCTGGTTTTGTGTGGACAATGGAAGATGATTCTTCACTAAGGCTTGAGTGATCACGCTGTGGATTGAGCCAAGGAAATCTAATGCCACTTTGGTTTCTGACATCGATAATGGCAGGTACATGCTCAGTATGCAATTCTCTAGTGGATTTACTGTTGCCTGGCTTATATATATAGTTAGTTACGGCTTTTGGTTGAGCTAGGTAAAGGAGAGTACTCAGAAGGCTTGAGCTCGATTGCCATTCATTTTACACTTTGGCTGAGCTATGGGATGCCAATTTTACTGATAAATAAAGAGTCTGAAACCGTGTTGTTGTATGTGCGTTAGATACAGTTGTTATATTATTCTTCATACTATAATATTTGCGGGCTTCAATTTATTTGTATGTTAACTTTCTCTTTCGTATTAGGATGTTGGACACATTTGTCATTGTCACTTGTTAGCCTTCCCAATGAATAATGTTCGTATTCTAATGCAGCCAGCGTTATTAGCTCTTCG
CDS Sequence
  • >Glyma.19G206800.1
    ATGCAGAGAATGGCGTACACGTTTTCGTTTCCGGAGGAGGTGCTGGAGCACGTGTTCTCGTTCATATGGAACGAGAGGGACAGGAACGCGATCTCGCTGGTGTGTAAGTCATGGTACGAGATCGAGAGGTGGTGCAGGAGGAAGGTGTTCGTGGGGAACTGCTACGCGGTGAGCCCTCTGATGGTGGTCAAGCGGTTCCCGGAGGTGAGATCCATTGCGCTCAAAGGGAAGCCGCACTTTGCGGACTTCAATTTGGTCCCCGATGGCTGGGGAGGTTACGTCTGCCCCTGGATCGCCGCCATGGCTCGCGCCTTCCCCTGCCTCGAAGAAATCAGGCTCAAGAGGATGGTCATCACCGACGAGAGCTTGGAACTCATCGCTAAGTCCTTCAAGAACTTCAAGGTCTTGGTTCTCACTTCCTGTGAGGGTTTTACCACTGATGGACTTGCCGCCATTGCTGCCAACTGCAGGAATTTGAGGGAATTGGACTTGCAAGAGAGTGAAGTGGAGGAGGACCTTAGTGGGCACTGGCTAAGCCATTTTCCTGATTCCTATACGTCATTAGTTTCACTTAACATCTCTTGCTTAAACAATGAGGTGAGTTTATCTGCGCTAGAGCGTCTGCTTGGGAGGTGTCCCAACCTGCGGACCCTCCGTCTCAATCGTGCCGTGCCCCTTGATAGACTACCCAACCTACTTCTCCAGTGTCCTCAGCTGGTTGAGTTAGGCACAGGAGTCTACTCAACTGAGATGCGACCAGAGGTCTTCTCAAACCTGGAAGCAGCATTTTCTGGCTGCAAGCAGTTGAAGAGCTTGTCTGGCTTTTGGGATGTGCTCCCATCCTACCTTCCAGCTGTCTACCCCATCTGCTCAAGGCTAACATCGCTAAACTTGAGTTATGCTATTATTCAAAGCTCTGATCTTATTAAGCTTATCAGTCAATGCCCAAATTTGTTGCGATTATGGGTGCTGGATTACATAGAAGATGCTGGTCTTTATGCCCTTGCTGCATCATGTAAGGATCTAAGAGAGTTAAGGGTGTTTCCTTCTGACCCATTTGGTTTAGAACCAAATGTTGCATTGACAGAACAGGGCCTTGTCTCTGTGTCTGAAGGTTGCCCCAAGCTCCAATCAGTTCTATATTTTTGTCGTCAAATGTCGAATGCAGCCCTACATACAATTGCGCGGAACAGGACTAATTTGACTCGTTTTCGGCTTTGTATTATTGAGCCTCGGACTCCTGACTATCTAACCCATGAACCCCTGGATTCTGGTTTTGGGGCTATTGTAGAGCAATGCAAGGATCTTCAACGCCTATCCCTATCTGGTCTTCTTACTGACCGTGTTTTCGAGTATATCGGGACTTGTGGTAAGAAGCTGGAGATGCTATCTGTGGCTTTTGCTGGAGATAGTGATTTGGGACTTCATCATGTGCTATCAGGGTGTGATAATCTTAGGAAGCTGGAGATCAGGGACTGCCCCTTTGGTGACAAGGCCCTTTTGGCAAATGCTGAAAAGCTGGAGACAATGCGATCCCTTTGGATGTCCTCCTGCTCGGTGAGTTATGGAGCATGTAAGCTACTGGGTCAGAAAATGCCAAGACTCAACGTTGAAGTCATTGATGAAAGAGGACCTCCAGATTCAAGGCCAGATGATTGTCCAGTTGAGAAGCTTTATATATACAGGACTATTGCCGGGCCAAGGTTGGACATGCCTGGTTTTGTGTGGACAATGGAAGATGATTCTTCACTAAGGCTTGAGTGA
Protein Sequence
  • >Glyma.19G206800.1
    MQRMAYTFSFPEEVLEHVFSFIWNERDRNAISLVCKSWYEIERWCRRKVFVGNCYAVSPLMVVKRFPEVRSIALKGKPHFADFNLVPDGWGGYVCPWIAAMARAFPCLEEIRLKRMVITDESLELIAKSFKNFKVLVLTSCEGFTTDGLAAIAANCRNLRELDLQESEVEEDLSGHWLSHFPDSYTSLVSLNISCLNNEVSLSALERLLGRCPNLRTLRLNRAVPLDRLPNLLLQCPQLVELGTGVYSTEMRPEVFSNLEAAFSGCKQLKSLSGFWDVLPSYLPAVYPICSRLTSLNLSYAIIQSSDLIKLISQCPNLLRLWVLDYIEDAGLYALAASCKDLRELRVFPSDPFGLEPNVALTEQGLVSVSEGCPKLQSVLYFCRQMSNAALHTIARNRTNLTRFRLCIIEPRTPDYLTHEPLDSGFGAIVEQCKDLQRLSLSGLLTDRVFEYIGTCGKKLEMLSVAFAGDSDLGLHHVLSGCDNLRKLEIRDCPFGDKALLANAEKLETMRSLWMSSCSVSYGACKLLGQKMPRLNVEVIDERGPPDSRPDDCPVEKLYIYRTIAGPRLDMPGFVWTMEDDSSLRLE*