Information report for GmTIR1C
Gene Details
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Functional Descriptions
- GmTIR1/GmAFB3-based auxin perception regulated by miR393 modulates soybean nodulation.
- GmTIR1A and GmTIR1C play major roles in soybean nodulation.
- The GmTIR1A, GmTIR1C and GmAFB3A genes are the direct targets of soybean miR393.
Functional Keywords
Literature and News
Gene Resources
- NCBI ID: 100779021
- UniProt accessions: I1NB13
- EMBL: CM000852
- EnsemblPlants: KRG96377
- Gramene: KRG96377
- GO: GO:0019005 , GO:0031146
- OMA: FPWIAEM
- InterPro: IPR006553 , IPR032675 , IPR041101 , IPR041567
- PANTHER: PTHR16134 , PTHR16134:SF147
- SUPFAM: SSF52047
- Gene3D: 1.20.1280.50 , 3.80.10.10
- OrthoDB: I1NB13
- SMR: I1NB13
- CDD: cd22159
Sequences
cDNA Sequence
- >Glyma.19G206800.1
GGGCAGCATAAGCATAAACTTAAACTCCTTATCCGTCTTTCTCTCCCTCACATCACACATCACACATCACACAAACAGAGACACATTATTATTACATACTACCACTCTCGTAGTCTCGCTTGGTGTTAATGGCGTTTCAGATCTAACAGTGCAAGTGGTTCGGCGTGGTTGTTAGTGAGTTGGTTAAGCGACGGCGTTTGGTTGGGGTTAGTATTATGCAGAGAATGGCGTACACGTTTTCGTTTCCGGAGGAGGTGCTGGAGCACGTGTTCTCGTTCATATGGAACGAGAGGGACAGGAACGCGATCTCGCTGGTGTGTAAGTCATGGTACGAGATCGAGAGGTGGTGCAGGAGGAAGGTGTTCGTGGGGAACTGCTACGCGGTGAGCCCTCTGATGGTGGTCAAGCGGTTCCCGGAGGTGAGATCCATTGCGCTCAAAGGGAAGCCGCACTTTGCGGACTTCAATTTGGTCCCCGATGGCTGGGGAGGTTACGTCTGCCCCTGGATCGCCGCCATGGCTCGCGCCTTCCCCTGCCTCGAAGAAATCAGGCTCAAGAGGATGGTCATCACCGACGAGAGCTTGGAACTCATCGCTAAGTCCTTCAAGAACTTCAAGGTCTTGGTTCTCACTTCCTGTGAGGGTTTTACCACTGATGGACTTGCCGCCATTGCTGCCAACTGCAGGAATTTGAGGGAATTGGACTTGCAAGAGAGTGAAGTGGAGGAGGACCTTAGTGGGCACTGGCTAAGCCATTTTCCTGATTCCTATACGTCATTAGTTTCACTTAACATCTCTTGCTTAAACAATGAGGTGAGTTTATCTGCGCTAGAGCGTCTGCTTGGGAGGTGTCCCAACCTGCGGACCCTCCGTCTCAATCGTGCCGTGCCCCTTGATAGACTACCCAACCTACTTCTCCAGTGTCCTCAGCTGGTTGAGTTAGGCACAGGAGTCTACTCAACTGAGATGCGACCAGAGGTCTTCTCAAACCTGGAAGCAGCATTTTCTGGCTGCAAGCAGTTGAAGAGCTTGTCTGGCTTTTGGGATGTGCTCCCATCCTACCTTCCAGCTGTCTACCCCATCTGCTCAAGGCTAACATCGCTAAACTTGAGTTATGCTATTATTCAAAGCTCTGATCTTATTAAGCTTATCAGTCAATGCCCAAATTTGTTGCGATTATGGGTGCTGGATTACATAGAAGATGCTGGTCTTTATGCCCTTGCTGCATCATGTAAGGATCTAAGAGAGTTAAGGGTGTTTCCTTCTGACCCATTTGGTTTAGAACCAAATGTTGCATTGACAGAACAGGGCCTTGTCTCTGTGTCTGAAGGTTGCCCCAAGCTCCAATCAGTTCTATATTTTTGTCGTCAAATGTCGAATGCAGCCCTACATACAATTGCGCGGAACAGGACTAATTTGACTCGTTTTCGGCTTTGTATTATTGAGCCTCGGACTCCTGACTATCTAACCCATGAACCCCTGGATTCTGGTTTTGGGGCTATTGTAGAGCAATGCAAGGATCTTCAACGCCTATCCCTATCTGGTCTTCTTACTGACCGTGTTTTCGAGTATATCGGGACTTGTGGTAAGAAGCTGGAGATGCTATCTGTGGCTTTTGCTGGAGATAGTGATTTGGGACTTCATCATGTGCTATCAGGGTGTGATAATCTTAGGAAGCTGGAGATCAGGGACTGCCCCTTTGGTGACAAGGCCCTTTTGGCAAATGCTGAAAAGCTGGAGACAATGCGATCCCTTTGGATGTCCTCCTGCTCGGTGAGTTATGGAGCATGTAAGCTACTGGGTCAGAAAATGCCAAGACTCAACGTTGAAGTCATTGATGAAAGAGGACCTCCAGATTCAAGGCCAGATGATTGTCCAGTTGAGAAGCTTTATATATACAGGACTATTGCCGGGCCAAGGTTGGACATGCCTGGTTTTGTGTGGACAATGGAAGATGATTCTTCACTAAGGCTTGAGTGATCACGCTGTGGATTGAGCCAAGGAAATCTAATGCCACTTTGGTTTCTGACATCGATAATGGCAGGTACATGCTCAGTATGCAATTCTCTAGTGGATTTACTGTTGCCTGGCTTATATATATAGTTAGTTACGGCTTTTGGTTGAGCTAGGTAAAGGAGAGTACTCAGAAGGCTTGAGCTCGATTGCCATTCATTTTACACTTTGGCTGAGCTATGGGATGCCAATTTTACTGATAAATAAAGAGTCTGAAACCGTGTTGTTGTATGTGCGTTAGATACAGTTGTTATATTATTCTTCATACTATAATATTTGCGGGCTTCAATTTATTTGTATGTTAACTTTCTCTTTCGTATTAGGATGTTGGACACATTTGTCATTGTCACTTGTTAGCCTTCCCAATGAATAATGTTCGTATTCTAATGCAGCCAGCGTTATTAGCTCTTCG
CDS Sequence
- >Glyma.19G206800.1
ATGCAGAGAATGGCGTACACGTTTTCGTTTCCGGAGGAGGTGCTGGAGCACGTGTTCTCGTTCATATGGAACGAGAGGGACAGGAACGCGATCTCGCTGGTGTGTAAGTCATGGTACGAGATCGAGAGGTGGTGCAGGAGGAAGGTGTTCGTGGGGAACTGCTACGCGGTGAGCCCTCTGATGGTGGTCAAGCGGTTCCCGGAGGTGAGATCCATTGCGCTCAAAGGGAAGCCGCACTTTGCGGACTTCAATTTGGTCCCCGATGGCTGGGGAGGTTACGTCTGCCCCTGGATCGCCGCCATGGCTCGCGCCTTCCCCTGCCTCGAAGAAATCAGGCTCAAGAGGATGGTCATCACCGACGAGAGCTTGGAACTCATCGCTAAGTCCTTCAAGAACTTCAAGGTCTTGGTTCTCACTTCCTGTGAGGGTTTTACCACTGATGGACTTGCCGCCATTGCTGCCAACTGCAGGAATTTGAGGGAATTGGACTTGCAAGAGAGTGAAGTGGAGGAGGACCTTAGTGGGCACTGGCTAAGCCATTTTCCTGATTCCTATACGTCATTAGTTTCACTTAACATCTCTTGCTTAAACAATGAGGTGAGTTTATCTGCGCTAGAGCGTCTGCTTGGGAGGTGTCCCAACCTGCGGACCCTCCGTCTCAATCGTGCCGTGCCCCTTGATAGACTACCCAACCTACTTCTCCAGTGTCCTCAGCTGGTTGAGTTAGGCACAGGAGTCTACTCAACTGAGATGCGACCAGAGGTCTTCTCAAACCTGGAAGCAGCATTTTCTGGCTGCAAGCAGTTGAAGAGCTTGTCTGGCTTTTGGGATGTGCTCCCATCCTACCTTCCAGCTGTCTACCCCATCTGCTCAAGGCTAACATCGCTAAACTTGAGTTATGCTATTATTCAAAGCTCTGATCTTATTAAGCTTATCAGTCAATGCCCAAATTTGTTGCGATTATGGGTGCTGGATTACATAGAAGATGCTGGTCTTTATGCCCTTGCTGCATCATGTAAGGATCTAAGAGAGTTAAGGGTGTTTCCTTCTGACCCATTTGGTTTAGAACCAAATGTTGCATTGACAGAACAGGGCCTTGTCTCTGTGTCTGAAGGTTGCCCCAAGCTCCAATCAGTTCTATATTTTTGTCGTCAAATGTCGAATGCAGCCCTACATACAATTGCGCGGAACAGGACTAATTTGACTCGTTTTCGGCTTTGTATTATTGAGCCTCGGACTCCTGACTATCTAACCCATGAACCCCTGGATTCTGGTTTTGGGGCTATTGTAGAGCAATGCAAGGATCTTCAACGCCTATCCCTATCTGGTCTTCTTACTGACCGTGTTTTCGAGTATATCGGGACTTGTGGTAAGAAGCTGGAGATGCTATCTGTGGCTTTTGCTGGAGATAGTGATTTGGGACTTCATCATGTGCTATCAGGGTGTGATAATCTTAGGAAGCTGGAGATCAGGGACTGCCCCTTTGGTGACAAGGCCCTTTTGGCAAATGCTGAAAAGCTGGAGACAATGCGATCCCTTTGGATGTCCTCCTGCTCGGTGAGTTATGGAGCATGTAAGCTACTGGGTCAGAAAATGCCAAGACTCAACGTTGAAGTCATTGATGAAAGAGGACCTCCAGATTCAAGGCCAGATGATTGTCCAGTTGAGAAGCTTTATATATACAGGACTATTGCCGGGCCAAGGTTGGACATGCCTGGTTTTGTGTGGACAATGGAAGATGATTCTTCACTAAGGCTTGAGTGA
Protein Sequence
- >Glyma.19G206800.1
MQRMAYTFSFPEEVLEHVFSFIWNERDRNAISLVCKSWYEIERWCRRKVFVGNCYAVSPLMVVKRFPEVRSIALKGKPHFADFNLVPDGWGGYVCPWIAAMARAFPCLEEIRLKRMVITDESLELIAKSFKNFKVLVLTSCEGFTTDGLAAIAANCRNLRELDLQESEVEEDLSGHWLSHFPDSYTSLVSLNISCLNNEVSLSALERLLGRCPNLRTLRLNRAVPLDRLPNLLLQCPQLVELGTGVYSTEMRPEVFSNLEAAFSGCKQLKSLSGFWDVLPSYLPAVYPICSRLTSLNLSYAIIQSSDLIKLISQCPNLLRLWVLDYIEDAGLYALAASCKDLRELRVFPSDPFGLEPNVALTEQGLVSVSEGCPKLQSVLYFCRQMSNAALHTIARNRTNLTRFRLCIIEPRTPDYLTHEPLDSGFGAIVEQCKDLQRLSLSGLLTDRVFEYIGTCGKKLEMLSVAFAGDSDLGLHHVLSGCDNLRKLEIRDCPFGDKALLANAEKLETMRSLWMSSCSVSYGACKLLGQKMPRLNVEVIDERGPPDSRPDDCPVEKLYIYRTIAGPRLDMPGFVWTMEDDSSLRLE*