Gene Details:
- Gene ID: Glyma.19G196000
- Gene Symbol: GmSSS1
- Gene Name: UDP-N-acetylglucosamine–peptide N-acetylglucosaminyltransferase SPINDLY
- Genome: Wm82.a4.v1
- Species: Glycine max
Functional Descriptions:
- Knocking out GmSSS1 resulted in small seeds, while overexpressing GmSSS1/GmSSS1 induced large seeds.
- GmSSS1 (Glyma.19G196000) encoded a putative O-GlcNAc transferase that consisted of tetratricopeptide repeat (TPR) and catalytic domains, and two of the four nonsynonymous substitutions (182nd and 638th) occurred in the conserved regions.
- GmSSS1 conferred an enhancing effect on seed weight.
Function-related keywords:
Literature:
- An enhancing effect attributed to a nonsynonymous mutation in SOYBEAN SEED SIZE 1, a SPINDLY-like gene, is exploited in soybean domestication and improvement. DOI: 10.1111/nph.18461 ; PMID: 36068955
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Gene Resources:
- NCBI ID: 100779014
- UniProt accessions: A0A0R0EQD2
Sequences:
cDNA Sequence
- >Glyma.19G196000.1
ACCGTAAAAACACACGCAACAAAAGCATGTGATGATTTAGTGCATCCTTGGTGAGAGAAAAAGCAAGAAAGCTTGAACGTTATAGCGAGGCAAAGGTGGGCCTTTGGGTTTGGCACACATCCAACTTGTCTTGTTGGAGGCCGAGAGAGAGAGAGACAATTGCTGCCAACTCCCATTCAATGCTCCCATCTCTCACAACCGATTACGCGCGCGTTGTTCTTCACGCTTTACTTTTAGTTTAGTTTTACTCTCTCTTTATGCTCTGCTATTCTTATTCATTCACTCTGCTCCCTCACTCCAACTTTCAAAACCCTAATTTCTTCCTCGAAATCTTCTCCTCCCTTCCCCGATTTCATTTCCACTGCTTTTTCCTTCGCTTGGTCGCTTCAATTGCGAATTCCGTCACATTCTTTGTGCAGATGGCAGGGGCGGATAATGGTGACGGCAACGGGAGTGAAAGGGAATTAGCGGGAAATAGCGATAACGGTTCTGTGGAAGTTGCAGAGGCTTCTGTTAGTGATAGTGGTTGTGAAGGGAACGACAGCGTTTCTTACGCGAACGTCTTGCGTTCGAGGAACAAGTTTGTTGATGCTCTTGCTATCTACGAGCGCGTGTTGGAGAGTGATGGTGCAAATGTAGAGGCGCTCATTGGAAAAGGAATATGCCTTCAGATGCAGAATAAGGGAAGGCTTGCGTACGAGAGTTTTTCTGAGGCTATCAAGGTGGATCCTCAAAATGCTTGTGCTCTAACGCATTGCGGCATTCTGCATAAGGACGAGGGTCGCCTTGTGGAGGCTGCTGAGTCATATCAGAAGGCTTTACAAGTGGATCCTTCATACAAAGCAGCTGCTGAATGCCTTGCCATTGTTTTAACAGATATTGGTACCAACATAAAGCTGGCAGGGAACACTCAGGATGGAATTCAAAAATATTTTGAGGCCCTCAAAGTAGATCCGCACTATGCTCCTGCATACTATAATCTTGGTGTGGTCTATTCTGAAATGATGCAATATGACACAGCCCTCAGTTTCTATGAAAAGGCTGCATCAGAGAGGCCAGTCTATGCCGAGGCTTATTGCAATATGGGTGTGATTTTTAAAAATCGCGGTGATTTGGAATCGGCTATTACTTGTTATGAGAGGTGTTTAACTGTTTCACCTAACTTTGAGATTGCAAAGAATAATATGGCTATAGCATTAACAGATTTGGGAACAAAGGTTAAATTGGAGGGGGACATCAACCAAGGTGTGACTTTGTATAAGAAAGCTTTGTATTACAACTGGCATTACGCTGATGCTATGTATAATCTTGGGGTTGCTTATGGTGAGATGCTTAAGTTTGATATGGCCATTGTATTCTATGAACTTGCCTTTCACTTCAATCCCCATTGTGCGGAAGCTTGTAACAATCTCGGAGTTATATATAAAGATCGTGAAAACCTTGATAAAGCTGTAGAGTGCTACCAGCTTGCTTTGTCAATCAAACCTAATTTTTCACAGTCGTTAAATAACCTCGGTGTTGTATACACTGTCCAGGGTAAAGTGGATGCTGCTGCAAGTATGATTGAGAAAGCTATTATTGCAAATCCAACATATGCAGAGGCATACAATAACCTAGGAGTTCTTTATAGGGATGCTGGTGATATAGCTCGAGCAATTAATGCTTATGAGCAATGTCTTAAGATTGATCCTGATTCTCGAAATGCTGGCCAGAATCGCTTGCTTGCAATGAATTACATAGAGGAAGGACATGATGACACACTTTTTGAGGTTCACAGGGACTGGGGTAGGCGATTCATGAGACTATATTCACAGTACACATCATGGGACAACTCAAAAGATCCTGAACGGCCCCTAGTGATAGGCTATGTATCTCCTGATTATTTTACTCATTCTGTGTCATATTTCATAGAAGCGCCTCTTGTCTATCATGACTACTCCAATTTCAAAGTGATTGTTTATTCAGCAGTTGTCAAGGCAGATTCAAAAACCATTAGATTTAGAGAGAAAGTTGTAAATAAGGGTGGTATCTGGAAAGATATTTATGGAATTGATGAAAAGATGGTTGCCAACATGGTTAGAGAAGATCAAGTTGATATTTTGGTAGAACTTACTGGACATACTGCAAACAATAAATTGGGAATGATGGCATGCCGACCTGCACCAATTCAGGTGACTTGGATTGGTTATCCCAATACAACAGGATTGCCTACAATTGATTATAGAATCACTGATTCACTGGCAGACCCTCCTGAAACAAAGCAGAAGCATGTTGAGGAGTTAGTTAGGTTGCCAGAATGCTTCCTTTGTTACACCCCTTCCCTGGAGGCTGGTCCTGTTTGTCCAACTCCTGCTCTTTCCAATGGTTTTGTCACATTTGGTAGTTTCAACAATCTTGCCAAGATTACACCCAAGGTATTGCAGGTTTGGGTGAGGATACTGTGTGCAATTCCGAATTCCCGCCTTGTGGTAAAATGTAAACCTTTTTGCAGTGACAGTGTGCGACAGATATTCCTTTCAACACTAGAGCAGTTAGGTTTAGAACCACTACGTGTTGATCTTCTGCCCCTTATTCTTCTTAACCATGATCATATGCAAGCCTATTCTCTGATGGACATCAGTTTGGATACATTTCCATATGCTGGAACAACAACAACATGTGAATCTTTATATATGGGAGTTCCATGTGTCACTATGGCTGGATCAGTACATGCGCACAATGTTGGTGTTAGTCTTCTTAGCAAAGTTGGACTGGAGCATTTGATTGCCAGAAATGAAGATGAATATGTTGAATTGGCTCAGCAGTTGGCCTCTGACATTTCCGCACTACAAAATTTGAGAATGAGTCTGCGAAATCTCATGTCCAAGTCCCCTCTCTGTGATGGTGCCAAATTTATCCTAGGTCTAGAGTCAACATACAGAAATATGTGGCACAGGTATTGTAGAGGAGATGTTCCATCTTTGAAACGCATGGAATTGTTGCAAGTTGCTACCGGTGACCTGTCAAATAAGAATTCTGAGCCAACAAGGATTGCAAACTCAAGGGAGGACAGTCCTGGATCTGTCAAGGCCAATGGATTTAAAACAAGGCCCGTGTCAAAGCTTAACATACACAGTTGCGAAGAAAACGACGGGTCATCAAATCACAGTAGTAAACAAGGAAAGACGAGTTAAAGTTGGATTCCATCTGAGAATCCTTTTGTAGCGATTCAAGGATGTTGAACTTCATTACAATAGTTGTACTATTAGGTTGCATGGTATATACTGTAGTTGCTGCTGGAAGAAGCTGGAAAGCAACCACAGCACCACACAAAGTTAACATGAATAGAGTAACATTGGGGGCGGGGGGCTATAGGCAGTTAAGTTATAAAGCCCCCTACGGTGCAGTGGATATTCCAAGACCAAGAGGTGAAGCTACCTTGAGCTGCAGTCTGTTACATTTTCTTTTGGTAGCCGTGGCCTGTTGCATATTTCCCCCCTCGATTATAATGATTGTGTATAGCTTGTGCAATTTGTTTGTTCTTACTCCTTTTCAACATTGCATTTTTATCGGCTCAATGTGCTATGTCTCCACATGAAGAGCAGAAATGGATATATATAAGATTGCCGGGTTAAAATGTACCCAAAAACAAGTCTGCGGGGGTTGGTTAAAACAAAACCCTGATAAAGTTCTAATTTTACGAGGTGCAATATGTATGAGATTTTAATCAATGTAAGATTAACTGAAAATAGTACTAGTCAAACCATTAATATGAATAACGTTGTACTTAATGTCTTTGAAATATTAAAAAAATGATATTTTCTTTATTTAGTAAGAGGAAAAAGAATGAAGTTTTAGAATTATATTATGACGTGTTTAGAAATTTGTAATTCAATAACCGGTCCTGTTATATTGACATGGGATTGGCATTTTAAATTTTATGACATGTTTGATGAATT - >Glyma.19G196000.3
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