Information report for GmSSS1
Gene Details
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Functional Descriptions
- Knocking out GmSSS1 resulted in small seeds, while overexpressing GmSSS1/GmSSS1 induced large seeds.
- GmSSS1 (Glyma.19G196000) encoded a putative O-GlcNAc transferase that consisted of tetratricopeptide repeat (TPR) and catalytic domains, and two of the four nonsynonymous substitutions (182nd and 638th) occurred in the conserved regions.
- GmSSS1 conferred an enhancing effect on seed weight.
Functional Keywords
Literature and News
Gene Resources
- NCBI ID: 100779014
- UniProt accessions: A0A0R0EQD2
- EMBL: CM000852
- EnsemblPlants: KRG96214
- Gramene: KRG96214
- GO: GO:0005634 , GO:0006486 , GO:0009740 , GO:0140842 , GO:0140843
- InterPro: IPR006597 , IPR011990 , IPR019734 , IPR029489 , IPR051939
- PANTHER: PTHR44835 , PTHR44835:SF1
- SUPFAM: SSF48452
- PROSITE: PS50005 , PS50293
- Gene3D: 1.25.40.10 , 3.40.50.11380 , 3.40.50.2000
Sequences
cDNA Sequence
- >Glyma.19G196000.1
ACCGTAAAAACACACGCAACAAAAGCATGTGATGATTTAGTGCATCCTTGGTGAGAGAAAAAGCAAGAAAGCTTGAACGTTATAGCGAGGCAAAGGTGGGCCTTTGGGTTTGGCACACATCCAACTTGTCTTGTTGGAGGCCGAGAGAGAGAGAGACAATTGCTGCCAACTCCCATTCAATGCTCCCATCTCTCACAACCGATTACGCGCGCGTTGTTCTTCACGCTTTACTTTTAGTTTAGTTTTACTCTCTCTTTATGCTCTGCTATTCTTATTCATTCACTCTGCTCCCTCACTCCAACTTTCAAAACCCTAATTTCTTCCTCGAAATCTTCTCCTCCCTTCCCCGATTTCATTTCCACTGCTTTTTCCTTCGCTTGGTCGCTTCAATTGCGAATTCCGTCACATTCTTTGTGCAGATGGCAGGGGCGGATAATGGTGACGGCAACGGGAGTGAAAGGGAATTAGCGGGAAATAGCGATAACGGTTCTGTGGAAGTTGCAGAGGCTTCTGTTAGTGATAGTGGTTGTGAAGGGAACGACAGCGTTTCTTACGCGAACGTCTTGCGTTCGAGGAACAAGTTTGTTGATGCTCTTGCTATCTACGAGCGCGTGTTGGAGAGTGATGGTGCAAATGTAGAGGCGCTCATTGGAAAAGGAATATGCCTTCAGATGCAGAATAAGGGAAGGCTTGCGTACGAGAGTTTTTCTGAGGCTATCAAGGTGGATCCTCAAAATGCTTGTGCTCTAACGCATTGCGGCATTCTGCATAAGGACGAGGGTCGCCTTGTGGAGGCTGCTGAGTCATATCAGAAGGCTTTACAAGTGGATCCTTCATACAAAGCAGCTGCTGAATGCCTTGCCATTGTTTTAACAGATATTGGTACCAACATAAAGCTGGCAGGGAACACTCAGGATGGAATTCAAAAATATTTTGAGGCCCTCAAAGTAGATCCGCACTATGCTCCTGCATACTATAATCTTGGTGTGGTCTATTCTGAAATGATGCAATATGACACAGCCCTCAGTTTCTATGAAAAGGCTGCATCAGAGAGGCCAGTCTATGCCGAGGCTTATTGCAATATGGGTGTGATTTTTAAAAATCGCGGTGATTTGGAATCGGCTATTACTTGTTATGAGAGGTGTTTAACTGTTTCACCTAACTTTGAGATTGCAAAGAATAATATGGCTATAGCATTAACAGATTTGGGAACAAAGGTTAAATTGGAGGGGGACATCAACCAAGGTGTGACTTTGTATAAGAAAGCTTTGTATTACAACTGGCATTACGCTGATGCTATGTATAATCTTGGGGTTGCTTATGGTGAGATGCTTAAGTTTGATATGGCCATTGTATTCTATGAACTTGCCTTTCACTTCAATCCCCATTGTGCGGAAGCTTGTAACAATCTCGGAGTTATATATAAAGATCGTGAAAACCTTGATAAAGCTGTAGAGTGCTACCAGCTTGCTTTGTCAATCAAACCTAATTTTTCACAGTCGTTAAATAACCTCGGTGTTGTATACACTGTCCAGGGTAAAGTGGATGCTGCTGCAAGTATGATTGAGAAAGCTATTATTGCAAATCCAACATATGCAGAGGCATACAATAACCTAGGAGTTCTTTATAGGGATGCTGGTGATATAGCTCGAGCAATTAATGCTTATGAGCAATGTCTTAAGATTGATCCTGATTCTCGAAATGCTGGCCAGAATCGCTTGCTTGCAATGAATTACATAGAGGAAGGACATGATGACACACTTTTTGAGGTTCACAGGGACTGGGGTAGGCGATTCATGAGACTATATTCACAGTACACATCATGGGACAACTCAAAAGATCCTGAACGGCCCCTAGTGATAGGCTATGTATCTCCTGATTATTTTACTCATTCTGTGTCATATTTCATAGAAGCGCCTCTTGTCTATCATGACTACTCCAATTTCAAAGTGATTGTTTATTCAGCAGTTGTCAAGGCAGATTCAAAAACCATTAGATTTAGAGAGAAAGTTGTAAATAAGGGTGGTATCTGGAAAGATATTTATGGAATTGATGAAAAGATGGTTGCCAACATGGTTAGAGAAGATCAAGTTGATATTTTGGTAGAACTTACTGGACATACTGCAAACAATAAATTGGGAATGATGGCATGCCGACCTGCACCAATTCAGGTGACTTGGATTGGTTATCCCAATACAACAGGATTGCCTACAATTGATTATAGAATCACTGATTCACTGGCAGACCCTCCTGAAACAAAGCAGAAGCATGTTGAGGAGTTAGTTAGGTTGCCAGAATGCTTCCTTTGTTACACCCCTTCCCTGGAGGCTGGTCCTGTTTGTCCAACTCCTGCTCTTTCCAATGGTTTTGTCACATTTGGTAGTTTCAACAATCTTGCCAAGATTACACCCAAGGTATTGCAGGTTTGGGTGAGGATACTGTGTGCAATTCCGAATTCCCGCCTTGTGGTAAAATGTAAACCTTTTTGCAGTGACAGTGTGCGACAGATATTCCTTTCAACACTAGAGCAGTTAGGTTTAGAACCACTACGTGTTGATCTTCTGCCCCTTATTCTTCTTAACCATGATCATATGCAAGCCTATTCTCTGATGGACATCAGTTTGGATACATTTCCATATGCTGGAACAACAACAACATGTGAATCTTTATATATGGGAGTTCCATGTGTCACTATGGCTGGATCAGTACATGCGCACAATGTTGGTGTTAGTCTTCTTAGCAAAGTTGGACTGGAGCATTTGATTGCCAGAAATGAAGATGAATATGTTGAATTGGCTCAGCAGTTGGCCTCTGACATTTCCGCACTACAAAATTTGAGAATGAGTCTGCGAAATCTCATGTCCAAGTCCCCTCTCTGTGATGGTGCCAAATTTATCCTAGGTCTAGAGTCAACATACAGAAATATGTGGCACAGGTATTGTAGAGGAGATGTTCCATCTTTGAAACGCATGGAATTGTTGCAAGTTGCTACCGGTGACCTGTCAAATAAGAATTCTGAGCCAACAAGGATTGCAAACTCAAGGGAGGACAGTCCTGGATCTGTCAAGGCCAATGGATTTAAAACAAGGCCCGTGTCAAAGCTTAACATACACAGTTGCGAAGAAAACGACGGGTCATCAAATCACAGTAGTAAACAAGGAAAGACGAGTTAAAGTTGGATTCCATCTGAGAATCCTTTTGTAGCGATTCAAGGATGTTGAACTTCATTACAATAGTTGTACTATTAGGTTGCATGGTATATACTGTAGTTGCTGCTGGAAGAAGCTGGAAAGCAACCACAGCACCACACAAAGTTAACATGAATAGAGTAACATTGGGGGCGGGGGGCTATAGGCAGTTAAGTTATAAAGCCCCCTACGGTGCAGTGGATATTCCAAGACCAAGAGGTGAAGCTACCTTGAGCTGCAGTCTGTTACATTTTCTTTTGGTAGCCGTGGCCTGTTGCATATTTCCCCCCTCGATTATAATGATTGTGTATAGCTTGTGCAATTTGTTTGTTCTTACTCCTTTTCAACATTGCATTTTTATCGGCTCAATGTGCTATGTCTCCACATGAAGAGCAGAAATGGATATATATAAGATTGCCGGGTTAAAATGTACCCAAAAACAAGTCTGCGGGGGTTGGTTAAAACAAAACCCTGATAAAGTTCTAATTTTACGAGGTGCAATATGTATGAGATTTTAATCAATGTAAGATTAACTGAAAATAGTACTAGTCAAACCATTAATATGAATAACGTTGTACTTAATGTCTTTGAAATATTAAAAAAATGATATTTTCTTTATTTAGTAAGAGGAAAAAGAATGAAGTTTTAGAATTATATTATGACGTGTTTAGAAATTTGTAATTCAATAACCGGTCCTGTTATATTGACATGGGATTGGCATTTTAAATTTTATGACATGTTTGATGAATT - >Glyma.19G196000.3
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CDS Sequence
- >Glyma.19G196000.1
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