Information report for GmPUB21
Gene Details
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Functional Descriptions
- We conclude that GmPUB21 and GmDi19-5 collaborate to regulate drought and salinity tolerance via an ABA-dependent pathway.
- This finding suggests that GmPUB21 and GmDi19-5 work together to mediate drought and salinity response via an ABA-dependent pathway and regulate the transcription of stress-responsive genes.
- The soybean GmPUB21-interacting protein GmDi19-5 responds to drought and salinity stresses via an ABA-dependent pathway.
- GmPUB21, an E3 ubiquitin ligase, negatively regulates drought and salinity response in soybean.
- We conclude that GmPUB21 and GmDi19-5 collaborate to regulate drought and salinity tolerance via an ABA-dependent pathway.
Functional Keywords
Literature and News
Gene Resources
- NCBI ID: 100790182
- UniProt accessions: I1JHU5
- EMBL: CM000835
- EnsemblPlants: KRH72959
- Gramene: KRH72959
- KEGG: gmx:100790182
- GO: GO:0016567 , GO:0061630
- OMA: GALTWMR
- InterPro: IPR003613 , IPR011989 , IPR013083 , IPR016024 , IPR045185 , IPR045210
- PANTHER: PTHR22849 , PTHR22849:SF136
- SUPFAM: SSF48371 , SSF57850
- PROSITE: PS51698
- Gene3D: 1.25.10.10 , 3.30.40.10
- OrthoDB: I1JHU5
- SMR: I1JHU5
- CDD: cd16664
Sequences
cDNA Sequence
- >Glyma.02G242900.3
ACATAGGCATGCACCAGTAGACTTACCCAATGCCAAAATCAGAAAAGACTAAGGAGTATAAAAAAGAAAACGGGAATGTTACAACTGCAAACAAAAAAGCCAAAAAAACAGTATTATTGTACTAGTAAAAAACAAAGATCATGCATGCAAATGATGCAATTGCAAATTGTAAATGCAAACTTTAGATAGGGATGCAAGTCAGCACACCGACCTTTGCTGACTCAGTCTCAGTCAGCTCCAAACCCACGCCATTCAACTTCGTCCGCGTCTTGTTGGTACAACAACATCAACTATACTACTATTACTTCACTTCCTTATTTTAATTAATTAATTAACCCATTTCAAAATCATCCAACCCCGAGTGACTTTTCAACTTTCAAACTTCAACGTTCAAACAATAATCCCAAAGTCCTAACACACACACGCACACACAAAAAAAAAAATAAATAACTCTTTGAACTATTTCTCTCTCACGGTCTTACCTCAAGCTTTGACCCATGTACCACAAAGCATGTTGTACTATAAAATACCAAACACTCACCACTTTCTTTCCTTCATAACATTCACATACAATTCTTCTAAGCTCTACCCAACAAGCATACATACAAAAAATCGAAAATTTTACTATTATTATTACTATAGCAACATGGTTTTGTCATGGACAAAAGGGAGAGTGTTCCGGCGTGCCAGAAAGGGGAAAGAGTTGAAAAATTTCGGTGGCGACTTGGAGATAGACATTGCGATCCCCACCCACTTCCGGTGCCCGGTAACATTGGACATGATGAAGGACCCCGTGACCGTTTCCACGGGCATAACCTACGACCGCGACAGCATCGAGAAGTGGATCGAGTCCGGGAACCGCACGTGCCCGGTCACCAAAACGGAGTTGACAACCTTCGACATGATCCCGAACCACGCCATCCGTAGGATGATCCAGGACTGGTGCGTGGAGCACCGTTCCCACGGCATCGAACGGATCCCCACTCCTCGTATCCCCGTCACCCCGTACGAGGTTGCTGACACGTGTACGAGGATCTTGTCGGCGGCGCAACACGGGGACGAGAACAAGTGCGTGGAGTTGGTGAGCAAAATTAAAGCGTGGGGAAGGGAAAGTGAGAGAAATAAGAGATGCATAGTTTCTAACGGTGCTGCTTTAGCACTAGCGAACGCTTTCAACTCTTTCTCATCGCGTGGGTTGTTAATTGAGAAGAACGTGGTTGTGTTGGATGAGATTCTGGGTGCTTTGGTATGGATGCGTCCTCTTTCTGAAGAGGGTAGATCCGTGTTGGGGTCATCGAGTTCTATCTCTTGCATGGTTTGGTTCATGAACGGTAAACAATTATCCACAAGGCAAAACGCTGCTTTGGTTCTTAAGGAGATGCATGTTGAGGCTTTGGTGAAATGTGTAGGAGTTTTTGAGGCTTTGATTAACATGATTAAGGAGCCTGTTGGGAGTGGTTCCACCAAGGCCTGTTTGTCAACGATTTTCAACTTGGTTAATAATAAAAGAGGCGTGACGACTTGTCAAAGGTTTGTGGAATTGGGTTTGGTTGATGTGGTGTTGGAGGTTCTTGTTGATGCGGAGAGAGGGGTGTGTGAGAAGGCTTTGGGGGTGTTGGATAGCGTTTGTGATTGCAAGCAAGGGGTGGAGATGGCAAAGGCTAATGCTTTGACTTTGCCTCTTGTGATTAAGAAGCTCTTGAGGGTGTCTGAGTTGTGTTCAAGCTTCGCGGTTTCGGTTCTTTGGAAGCTTTGTGACAAGAATATTGAAGAAGGGGTGTTGATTGAGGCGCTTCAAATGGGGGTGTTTCATAAACTACTTGTTTTGTTGCAAGTGGGTTGTGGTGAGGGAACCAAAGAGAAGGCTACGGAGTTGTTGAAGTTGTTGAATAGTTGCAGGAGCAAAGCTGAGTGTGTTCATCATTCTTCGTTGGATTTCAAGCATTTGAAGAATCCCTTCTAATTTGATCTGGCTATAGGATATGAGATTTGATTTCACTTCTTTTTTTTTGTATAGGTTGATCATACTGTAGAAACAGAATATAATACTCTTGTACAAAGACGTACACATACGGAGGATACAAATTGTATCTCTTAACACTCAATTGAAGTTTTGAAATTCTTTTTTTTCCATGGAAGGTTTAGATTTGAGACACACGGACTTGTAATTCACAAATTCAGAAATTACAATAGAAGAAAATGTTTTGGTTTATTACAAACCGGGGATTGTTATGTATGTTTTGATTATTAATTAAGGATTTATTAAAGCAC - >Glyma.02G242900.1
ACATAGGCATGCACCAGTAGACTTACCCAATGCCAAAATCAGAAAAGACTAAGGAGTATAAAAAAGAAAACGGGAATGTTACAACTGCAAACAAAAAAGCCAAAAAAACAGTATTATTGTACTAGTAAAAAACAAAGATCATGCATGCAAATGATGCAATTGCAAATTGTAAATGCAAACTTTAGATAGGGATGCAAGTCAGCACACCGACCTTTGCTGACTCAGTCTCAGTCAGCTCCAAACCCACGCCATTCAACTTCGTCCGCGTCTTGTTGGTACAACAACATCAACTATACTACTATTACTTCACTTCCTTATTTTAATTAATTAATTAACCCATTTCAAAATCATCCAACCCCGAGTGACTTTTCAACTTTCAAACTTCAACGTTCAAACAATAATCCCAAAGTCCTAACACACACACGCACACACAAAAAAAAAAATAAATAACTCTTTGAACTATTTCTCTCTCACGGTCTTACCTCAAGCTTTGACCCATGTACCACAAAGCATGTTGTACTATAAAATACCAAACACTCACCACTTTCTTTCCTTCATAACATTCACATACAATTCTTCTAAGCTCTACCCAACAAGCATACATACAAAAAATCGAAAATTTTACTATTATTATTACTATAGCAACATGGTTTTGTCATGGACAAAAGGGAGAGTGTTCCGGCGTGCCAGAAAGGGGAAAGAGTTGAAAAATTTCGGTGGCGACTTGGAGATAGACATTGCGATCCCCACCCACTTCCGGTGCCCGGTAACATTGGACATGATGAAGGACCCCGTGACCGTTTCCACGGGCATAACCTACGACCGCGACAGCATCGAGAAGTGGATCGAGTCCGGGAACCGCACGTGCCCGGTCACCAAAACGGAGTTGACAACCTTCGACATGATCCCGAACCACGCCATCCGTAGGATGATCCAGGACTGGTGCGTGGAGCACCGTTCCCACGGCATCGAACGGATCCCCACTCCTCGTATCCCCGTCACCCCGTACGAGGTTGCTGACACGTGTACGAGGATCTTGTCGGCGGCGCAACACGGGGACGAGAACAAGTGCGTGGAGTTGGTGAGCAAAATTAAAGCGTGGGGAAGGGAAAGTGAGAGAAATAAGAGATGCATAGTTTCTAACGGTGCTGCTTTAGCACTAGCGAACGCTTTCAACTCTTTCTCATCGCGTGGGTTGTTAATTGAGAAGAACGTGGTTGTGTTGGATGAGATTCTGGGTGCTTTGGTATGGATGCGTCCTCTTTCTGAAGAGGGTAGATCCGTGTTGGGGTCATCGAGTTCTATCTCTTGCATGGTTTGGTTCATGAACGGTAAACAATTATCCACAAGGCAAAACGCTGCTTTGGTTCTTAAGGAGATGCATGTTGAGGCTTTGGTGAAATGTGTAGGAGTTTTTGAGGCTTTGATTAACATGATTAAGGAGCCTGTTGGGAGTGGTTCCACCAAGGCCTGTTTGTCAACGATTTTCAACTTGGTTAATAATAAAAGAGGCGTGACGACTTGTCAAAGGTTTGTGGAATTGGGTTTGGTTGATGTGGTGTTGGAGGTTCTTGTTGATGCGGAGAGAGGGGTGTGTGAGAAGGCTTTGGGGGTGTTGGATAGCGTTTGTGATTGCAAGCAAGGGGTGGAGATGGCAAAGGCTAATGCTTTGACTTTGCCTCTTGTGATTAAGAAGCTCTTGAGGGTGTCTGAGTTGTGTTCAAGCTTCGCGGTTTCGGTTCTTTGGAAGCTTTGTGACAAGAATATTGAAGAAGGGGTGTTGATTGAGGCGCTTCAAATGGGGGTGTTTCATAAACTACTTGTTTTGTTGCAAGTGGGTTGTGGTGAGGGAACCAAAGAGAAGGCTACGGAGTTGTTGAAGTTGTTGAATAGTTGCAGGAGCAAAGCTGAGTGTGTTCATCATTCTTCGTTGGATTTCAAGCATTTGAAGAATCCCTTCTAATTTGATCTGGCTATAGGATATGAGATTTGATTTCACTTCTTTTTTTTTGTATAGGTTGATCATACTGTAGAAACAGAATATAATACTCTTGTACAAAGACGTACACATACGGAGGATACAAATTGTATCTCTTAACACTCAATTGAAGTTTTGAAATTCTTTTTTTTCCATGGAAGGTTTAGATTTGAGACACACGGACTTGTAATTCACAAATTCAGAAATTACAATAGAAGAAAATGTTTTGGTTTATTACAAACCGGGGATTGTTATGTATGTTTTGATTATTAATTAAGGATTTATTAAAGCAC
CDS Sequence
- >Glyma.02G242900.3
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ATGTTGTACTATAAAATACCAAACACTCACCACTTTCTTTCCTTCATAACATTCACATACAATTCTTCTAAGCTCTACCCAACAAGCATACATACAAAAAATCGAAAATTTTACTATTATTATTACTATAGCAACATGGTTTTGTCATGGACAAAAGGGAGAGTGTTCCGGCGTGCCAGAAAGGGGAAAGAGTTGAAAAATTTCGGTGGCGACTTGGAGATAGACATTGCGATCCCCACCCACTTCCGGTGCCCGGTAACATTGGACATGATGAAGGACCCCGTGACCGTTTCCACGGGCATAACCTACGACCGCGACAGCATCGAGAAGTGGATCGAGTCCGGGAACCGCACGTGCCCGGTCACCAAAACGGAGTTGACAACCTTCGACATGATCCCGAACCACGCCATCCGTAGGATGATCCAGGACTGGTGCGTGGAGCACCGTTCCCACGGCATCGAACGGATCCCCACTCCTCGTATCCCCGTCACCCCGTACGAGGTTGCTGACACGTGTACGAGGATCTTGTCGGCGGCGCAACACGGGGACGAGAACAAGTGCGTGGAGTTGGTGAGCAAAATTAAAGCGTGGGGAAGGGAAAGTGAGAGAAATAAGAGATGCATAGTTTCTAACGGTGCTGCTTTAGCACTAGCGAACGCTTTCAACTCTTTCTCATCGCGTGGGTTGTTAATTGAGAAGAACGTGGTTGTGTTGGATGAGATTCTGGGTGCTTTGGTATGGATGCGTCCTCTTTCTGAAGAGGGTAGATCCGTGTTGGGGTCATCGAGTTCTATCTCTTGCATGGTTTGGTTCATGAACGGTAAACAATTATCCACAAGGCAAAACGCTGCTTTGGTTCTTAAGGAGATGCATGTTGAGGCTTTGGTGAAATGTGTAGGAGTTTTTGAGGCTTTGATTAACATGATTAAGGAGCCTGTTGGGAGTGGTTCCACCAAGGCCTGTTTGTCAACGATTTTCAACTTGGTTAATAATAAAAGAGGCGTGACGACTTGTCAAAGGTTTGTGGAATTGGGTTTGGTTGATGTGGTGTTGGAGGTTCTTGTTGATGCGGAGAGAGGGGTGTGTGAGAAGGCTTTGGGGGTGTTGGATAGCGTTTGTGATTGCAAGCAAGGGGTGGAGATGGCAAAGGCTAATGCTTTGACTTTGCCTCTTGTGATTAAGAAGCTCTTGAGGGTGTCTGAGTTGTGTTCAAGCTTCGCGGTTTCGGTTCTTTGGAAGCTTTGTGACAAGAATATTGAAGAAGGGGTGTTGATTGAGGCGCTTCAAATGGGGGTGTTTCATAAACTACTTGTTTTGTTGCAAGTGGGTTGTGGTGAGGGAACCAAAGAGAAGGCTACGGAGTTGTTGAAGTTGTTGAATAGTTGCAGGAGCAAAGCTGAGTGTGTTCATCATTCTTCGTTGGATTTCAAGCATTTGAAGAATCCCTTCTAA
Protein Sequence
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MLYYKIPNTHHFLSFITFTYNSSKLYPTSIHTKNRKFYYYYYYSNMVLSWTKGRVFRRARKGKELKNFGGDLEIDIAIPTHFRCPVTLDMMKDPVTVSTGITYDRDSIEKWIESGNRTCPVTKTELTTFDMIPNHAIRRMIQDWCVEHRSHGIERIPTPRIPVTPYEVADTCTRILSAAQHGDENKCVELVSKIKAWGRESERNKRCIVSNGAALALANAFNSFSSRGLLIEKNVVVLDEILGALVWMRPLSEEGRSVLGSSSSISCMVWFMNGKQLSTRQNAALVLKEMHVEALVKCVGVFEALINMIKEPVGSGSTKACLSTIFNLVNNKRGVTTCQRFVELGLVDVVLEVLVDAERGVCEKALGVLDSVCDCKQGVEMAKANALTLPLVIKKLLRVSELCSSFAVSVLWKLCDKNIEEGVLIEALQMGVFHKLLVLLQVGCGEGTKEKATELLKLLNSCRSKAECVHHSSLDFKHLKNPF*