Information report for GmPPR576
Gene Details
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Functional Descriptions
- GmPPR576 is a fertility restorer gene of NJCMS1A.
- GmPPR576 was knocked out in soybean N8855 using CRISPR/Cas9. The T1 plants showed sterile pollen, and T2 plants produced few pods at maturity.
- The application of GmPPR576 can be expected to promote the wider use of heterosis in soybean breeding.
Literature and News
Gene Resources
- NCBI ID: 100812093
- UniProt accessions: K7MHP6
- EMBL: CM000849
- EnsemblPlants: KRH08623 , KRH08624 , KRH08625 , KRH08626
- Gramene: KRH08623 , KRH08624 , KRH08625 , KRH08626
- KEGG: gmx:100812093
- OMA: FKDMVDC
- InterPro: IPR002885 , IPR011990
- PANTHER: PTHR47941
- SUPFAM: SSF81901
- PROSITE: PS51375
- Gene3D: 1.25.40.10
- OrthoDB: K7MHP6
- SMR: K7MHP6
Homologs
- Arabidopsis thaliana: AT3G22470, AT1G64100.2, AT3G16710, AT1G06580
- Arachis hypogaea: arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.FA2NZF, arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.4NT8ND, arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.IGD5ZI, arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.8Z4KH7, arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.KEB86C, arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.P9T7FJ, arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.D88Z08, arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.HV5MI3, arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.HPMJ5J, arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.U637CY, arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.QCQD61, arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.U8UX16
- Capsicum annuum: T459_15790
- Cicer arietinum: Ca_13889
- Daucus carota: DCAR_016546
- Oryza sativa: YSA, Rf4;PPR782a
- Solanum melongena: Sme2.5_00319.1_g00004.1
Sequences
cDNA Sequence
- >Glyma.16G161900.3
GTTAGCGCATTGCCCTCTATCAGTTCATGCCTCGAATCGGAGCAAACTGAGCTTTGATCTCTGTTTCACATAAACCAACCAAACAAACACAATCCATTCAACACAACAATGTCATTCTCATTCTCATTGTCAAGAAGGTTAAGCTCTTCTCCCTCTCTTTCCATTCCCACCTTTCCTCCTTCTCTTCCAAACCCCACTTTCACTCTTTGCTTTCACTCTCAGCCTCCATCCATTGAAAATGTTGTTGATGATGCTGTTTCCCAGTTCAATCGCATGCTCCTTGTGCGTCGTACCCCACCCATCATTGAATTTGGCAAGATTTTAGGATACCTTGTAAAGATGGAGCATTATCCTACTGCCATTCCCCTTTTTAGACAAATGGAAGTCAAAGGAATTGAGCCAAATCTTGTTACTTTGAGCATCCTCATCAATTGTTTCTGCCACTTGGGCCAAATGGCCTTTTCTTTTTCTGTATTGGCCAAAATTCTAAAATTAGGTTATCAGCCGGATACCATAACCTTGACTACACTCCTGAAAGGTCTATGTCTCAAAGGTGAGGTCAAGAAATCACTGCACTTTCATGACAAGGTCGTAGCACAAGGATTTCAGATGAACCAGGTTAGTTACGGGATCCTGCTCAATGGACTATGTAAAATAGGAGAAACTAGATGCGCCATCAAGTTGCTGAGAAAGATTGAAGACAGATCAATTAGGCCTGATGTGGTAATGTACAGCACAATCATTGATAGCTTATGCAAAGATAAACTTGTAAACGAGGCTTATGATTTTTATTCTGAAATGGATGCTAGAGGAATTTTCCCTGATGTTATCACTTACACTACTCTAATATGTGGCTTTTGCCTTGCCAGTCAGTTAATGGGAGCATTCAGTTTATTAAATGAAATGATATTGAAGAACATCAACCCGGATGTTCATACCTTTAGTATATTGATTGATGCATTATGTAAAGAAGGAAAGGTGAAAGAAGCCAAAAATTTATTAGCTGTGATGATGAAAGAAGGAGTAAAACCTAATGTTGTTACTTATAATACTTTAATGGATGGATATTGTTTAGTTGGTGAAGTGCAGAATACAAAACAGATATTACACGCCATGGTCCAAACGGGAGTAAATCCTAATGTTCGTAGCTACACTATAATGATTAATGGATTATGTAAGAGTAAAAGGATGGATGAGGCCATGAATCTCCTAAGAGAAATGCTGTATAAAGATATGATTCCTGATACAGTGACATACAGTTCTCTTATTGATGGTTTCTGTAAATCAGGGAGAATTACTTCTGCTTTGAATCTTTTGAAGGAGATGCACCACAGAGGTCAACCAGCTGATGTAGTCACCTACAATTCCTTGTTAGATGGTTTATGCAAAAACCAAAACCTTGAAAAGGCAACTGCACTATTCATGAAAATGAAGGAGCGGGGAATTCAGCCAAATAAGTACACATACACGGCACTTATTGATGGATTATGTAAAGGTGGAAGACTTAAGAATGCACAAAAACTTTTTCAAAATCTCTTAGTTAAAGGCTGTCGTATAAATGTCTGGACATATAATGTGATGATCAGTGGGCTTTGTAAAGAGGGCATGTTTGATGAAGCATTGGCCATGAAGTCAAAAATGGAAGAGAATGGTTGCATCCCCGATGCTGTAACTTTTGAAATTATTATTCGTTCTCTTTTTGTGAAGGATCAAAATGATAAGGCCGAGAAACTTCTGCATGAAATGATTGCTAAAGGCCTATTACCTTTTAGGGATTTTCATGGTGAGCGATCTCCAGTTACAAATAAAGTTATTGTGAATTTTCATGGTCATTGCTGATAAATTAATGGAAGCTTCTTGAAAGGACAGAACTTATTTTGGTTGTACTCATTCCGGATTGTGCGTTCCGGTGAGTAATTTGTTGCGGCTGGTTTCCTGTACTTTTTGTGGTCTTACAAGGCCTTGCTGCTTCAATGTTGTGAGGGACAATTTTGCCGTGTGTCACCCATTCCAACTGTCCTTTACTTGAGAATATAATTGAAATGTATGATTTTGAATTGATTCACCCAATTAACTGTGAAATCTAATATAACTTTGTTGCGCTTTGATTTCTATTTTCAATTGACTGCAGTTGAACAAATCTATACTCACATCACAGGTGACTAGCATATTTAATTTCGATTTTGAAACATGATTTCTTTTGATCATTTTACTATGGACCCTCGATGACATATTTGGGGAATTGGAATTTGAAACTTGAAAGTTGGTGTCGACATCCAATGCTTATATATCCCCATAGTACCAAGTGGAATTTTACTGTTTAAGTCGCAGCTTAGTATTGTTCACCTTGAAACATTTGATACAGAGCTTGTTGCTATGCATTAAGTTAGCAGAGCATAATTTGACAATTATATATTACATAATTAAGATTACTTTCTTTATATTTTTATCATTTTGTTGTAAACACATTTTTAAAATTATATTCCAAAATCTAAGAAAATAGCCTTTTGCTGTCTGAAATTTTGTTCACAAAACATTATCCTTATGTTATGATGTGCTCTAAAATGTACCCTTCATAAGCTGAAAAAAAAAATACTGGATTAAGAGTACCTGCTAAATTTTAAACATTTTAGATTGTTATTTCCCCATTACTTTCTCATTTCTATGGAGTACGATATGATAAAGTTTTGACGTTTAGGTTTATTATAGTAGCAGAACTACCTCAGGCACTGGAGGAGTGATTGCACTAGTAGAAATAGGAAGTACAATACTACGAAGTTTGAGCATAACAAATGAACTGCGCTTGAAAGGATGTTAACTTGTTTCAAGATAGGATCACATCAGGACAATTGATCAGGTGACTCAATGTCGTCTATTTGGTGTTATATCCTCTTAGGAATGCCACATGCACCTTGGTTGGTTTTAAATTAATTCTTGAAAAAAGTGTCTTTAAAACAAAGAAATGGAGCAAAACCAGTTACGATTCTGCAGAGAGAAACAAGATACCCTACACTGAATTAGAAAGTATTGCAATAACGTAAGAGCAGTGGTTGCTCAAGCCAAGGATAATTCCTATGGCCCCATATATATCTTCCTAGGAGACTTAAAAGTTACAGTTGCTCTTGTTATTAATTTCTTGAAAAGAAAATCTGACATGAAAGTGAGCATTAAAGGGAAGAGCATCCAAATTGGAACAGAAGAGTGACTGTGACTGCAACAATGCAGAATGTGGTTTTCCATTCATGGGAGAGAAACAGCGCAACAAAAAGAGTTGCAGGACTGTTAATTTGCTCGAGACACCTGGTAGGATTGAGTAGAAGAGGTCGTCACGTGTGAATCTTTAGTTGTTTAATACAACCCATTAGTTTAAGACAGATTCTACCGTTCGAAATTGAAACAAGTTTCACACGGTGGGAAAGTTCAAGTTTCGCATGGTAGGAAAGTTCATTTAAATCCATTAGATAAGCTTATTTTGAAATCAATGACTATCATTTTTTGTTTTTTGTTTTGCTTTAGTTTTTTGTTTTTATTCTAGTTTTCCGATTTTTCTCTCTTCGCTCTCCCACTTTTCTTCTTCTCCTCTATTTCTTCGCGCCATGTCTCCACCTTCTCTACCTCTACTTCTCTACCTCTACTGCAGTTGTTTATCACCTCATGAATATCTTGTTGTTAGCGCATTGCTCTCTATCAGTTCATGCCCCAAATCAGAGCAAACTAAGCTTTGATCTCTGTCTCACATAAACCGATTCAACACAACAATGTCACTGTCATTCTCATTGTCAAGAAGGTTAAGCTCTTTTCTTCCAAACCCCATTTTCCCTCTTTGCTTTCACTCTCAGCCTCCATCCATTGACAATGTTGTTGATGATGCTGTTTCCCAGTTCAATCGCATGCTCCTTATGCGTCATACCCCACCCATCATCAAATTTAACAAGATTTTAGGATCACCTGTAAAGATGAAGTACTATCCCGCTGCCATTTCCCTTTCTAAACAAATGGAAGTCAAAGGAATTGAGCCAAATCTTGTTACTTTGAACATCCTCATCAATTGTTTCTGTCACTTGGGCCATATGGCCTTTTCTTTTTCTGTATTGGGCAAAATTCTAAAATTAGGTTATCAGCCAAATACCCTAACCTTGACTACACTCATAAAAGGTCTGTGTCTCAAGGATGAGGTCAGGAAATCACTGCACTTTCATGACAAGCTCGTAGCACAAGGATTTCAGATTAACCATGTTAGTTGCGGAACCTTGCTCAATGGACTATGTAAAATAGGAGAAATGAGAGGCGCTAATGAAGTTGCTGAGGGTGATTGAAGACAGATCAACTATAACTAATGTTGTAATGTACAACACCATCATTGACGGCTTATGCAAAGATAAACTCGTAAACGAGGCTTATGATTTATATTCTGAAATGGATGTTAGAGGAAATTTTCCTAATGTTATCACTTACCATACTCTAATTTGTGGCTTTTGCCTTGCGGGTCAGTTAATGGAAGCATTTGGTTTATTAAAAGAAATGATACTGAAGAACATTGACCCAGATGTTTATACCTATAATATATTGATGGATGCATTATGTAAAGAAGGAAAAGTGAAAGAAGCCAAAAATTTATTAGCTGTGTGATGAAAAGGAGTAAAAATTTATTTTGTTACTTACAATACTTCAATGGATGGGTATTGTTTAGTTGGTGAAGTGCAGAATACAAAACAAATATTCCACGCTATGGGCCAAATAGAAGTAAATCCTAATGTGTTTACAACTACAATATAATGATTAATGGATTATGTAAGAGTAAAAGGGTGGATGAAGACATGAATCTCCTAAAAGAAAGGCTGAAAACAAATATGGTTCCTAATACAATGACATACAGTTCTCTTGTTGATGGATTGTGCAAATCAGGGAGAAAGTCTTATGCTTTGGATCTTATTGATGAGATACACCGCAGACGTCAACCAGCTGATGTAGTCACCTACACTTCCTTATTAGACGGTTGA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CDS Sequence
- >Glyma.16G161900.3
ATGTCATTCTCATTCTCATTGTCAAGAAGGTTAAGCTCTTCTCCCTCTCTTTCCATTCCCACCTTTCCTCCTTCTCTTCCAAACCCCACTTTCACTCTTTGCTTTCACTCTCAGCCTCCATCCATTGAAAATGTTGTTGATGATGCTGTTTCCCAGTTCAATCGCATGCTCCTTGTGCGTCGTACCCCACCCATCATTGAATTTGGCAAGATTTTAGGATACCTTGTAAAGATGGAGCATTATCCTACTGCCATTCCCCTTTTTAGACAAATGGAAGTCAAAGGAATTGAGCCAAATCTTGTTACTTTGAGCATCCTCATCAATTGTTTCTGCCACTTGGGCCAAATGGCCTTTTCTTTTTCTGTATTGGCCAAAATTCTAAAATTAGGTTATCAGCCGGATACCATAACCTTGACTACACTCCTGAAAGGTCTATGTCTCAAAGGTGAGGTCAAGAAATCACTGCACTTTCATGACAAGGTCGTAGCACAAGGATTTCAGATGAACCAGGTTAGTTACGGGATCCTGCTCAATGGACTATGTAAAATAGGAGAAACTAGATGCGCCATCAAGTTGCTGAGAAAGATTGAAGACAGATCAATTAGGCCTGATGTGGTAATGTACAGCACAATCATTGATAGCTTATGCAAAGATAAACTTGTAAACGAGGCTTATGATTTTTATTCTGAAATGGATGCTAGAGGAATTTTCCCTGATGTTATCACTTACACTACTCTAATATGTGGCTTTTGCCTTGCCAGTCAGTTAATGGGAGCATTCAGTTTATTAAATGAAATGATATTGAAGAACATCAACCCGGATGTTCATACCTTTAGTATATTGATTGATGCATTATGTAAAGAAGGAAAGGTGAAAGAAGCCAAAAATTTATTAGCTGTGATGATGAAAGAAGGAGTAAAACCTAATGTTGTTACTTATAATACTTTAATGGATGGATATTGTTTAGTTGGTGAAGTGCAGAATACAAAACAGATATTACACGCCATGGTCCAAACGGGAGTAAATCCTAATGTTCGTAGCTACACTATAATGATTAATGGATTATGTAAGAGTAAAAGGATGGATGAGGCCATGAATCTCCTAAGAGAAATGCTGTATAAAGATATGATTCCTGATACAGTGACATACAGTTCTCTTATTGATGGTTTCTGTAAATCAGGGAGAATTACTTCTGCTTTGAATCTTTTGAAGGAGATGCACCACAGAGGTCAACCAGCTGATGTAGTCACCTACAATTCCTTGTTAGATGGTTTATGCAAAAACCAAAACCTTGAAAAGGCAACTGCACTATTCATGAAAATGAAGGAGCGGGGAATTCAGCCAAATAAGTACACATACACGGCACTTATTGATGGATTATGTAAAGGTGGAAGACTTAAGAATGCACAAAAACTTTTTCAAAATCTCTTAGTTAAAGGCTGTCGTATAAATGTCTGGACATATAATGTGATGATCAGTGGGCTTTGTAAAGAGGGCATGTTTGATGAAGCATTGGCCATGAAGTCAAAAATGGAAGAGAATGGTTGCATCCCCGATGCTGTAACTTTTGAAATTATTATTCGTTCTCTTTTTGTGAAGGATCAAAATGATAAGGCCGAGAAACTTCTGCATGAAATGATTGCTAAAGGCCTATTACCTTTTAGGGATTTTCATGGTGAGCGATCTCCAGTTACAAATAAAGTTATTGTGAATTTTCATGGTCATTGCTGA
Protein Sequence
- >Glyma.16G161900.3
MSFSFSLSRRLSSSPSLSIPTFPPSLPNPTFTLCFHSQPPSIENVVDDAVSQFNRMLLVRRTPPIIEFGKILGYLVKMEHYPTAIPLFRQMEVKGIEPNLVTLSILINCFCHLGQMAFSFSVLAKILKLGYQPDTITLTTLLKGLCLKGEVKKSLHFHDKVVAQGFQMNQVSYGILLNGLCKIGETRCAIKLLRKIEDRSIRPDVVMYSTIIDSLCKDKLVNEAYDFYSEMDARGIFPDVITYTTLICGFCLASQLMGAFSLLNEMILKNINPDVHTFSILIDALCKEGKVKEAKNLLAVMMKEGVKPNVVTYNTLMDGYCLVGEVQNTKQILHAMVQTGVNPNVRSYTIMINGLCKSKRMDEAMNLLREMLYKDMIPDTVTYSSLIDGFCKSGRITSALNLLKEMHHRGQPADVVTYNSLLDGLCKNQNLEKATALFMKMKERGIQPNKYTYTALIDGLCKGGRLKNAQKLFQNLLVKGCRINVWTYNVMISGLCKEGMFDEALAMKSKMEENGCIPDAVTFEIIIRSLFVKDQNDKAEKLLHEMIAKGLLPFRDFHGERSPVTNKVIVNFHGHC*