Information report for GmPIN1b
Gene Details
|
|
Functional Descriptions
- GmPIN1-mediated auxin asymmetry regulates leaf petiole angle and plant architecture in soybean.
- GmPIN1 transcripts and auxin were distributed asymmetrically in the petiole base.
- We demonstrate that the auxin efflux transporter PINFORMED1 (GmPIN1), which determines polar auxin transport, regulates the leaf petiole angle in soybean.
Functional Keywords
Literature and News
Gene Resources
- NCBI ID: 100499637
- UniProt accessions: I1KJ54
- EMBL: CM000840 , KC344366
- EnsemblPlants: KRH48642
- Gramene: KRH48642
- KEGG: gmx:100499637
- GO: GO:0005783 , GO:0005886 , GO:0009734 , GO:0009926 , GO:0010315 , GO:0010329
- OMA: FGSHEYG
- InterPro: IPR004776 , IPR014024 , IPR051107
- PANTHER: PTHR31752 , PTHR31752:SF18
- OrthoDB: I1KJ54
Sequences
cDNA Sequence
- >Glyma.07G102500.1
GTGCTTTGGAGACTGCGAGTGCAACCTTTCTTGCAGCTCGCAAAGCTGAAAAAATATTTGCTGTATTCTGCAGCATATTACCACCACCCACTCACTCACTTCCCCAAAAACACATGCTCTTCCACATCCCTATATATCTTTTCAATCTTCATCATCATCATCACCACCAACTCCAACTCTCCAAAACTTGCCACTTCAACCTTCCTATATATTCCTTCCTCCACTCTCTTTCTTTACTTCTTCTGCTATCTTTCTGAGAGACCTCACAAACCCACAAATATGATCACCTTAACAGACTTCTACCATGTCATGACTGCAATGGTGCCACTCTATGTGGCCATGATACTAGCCTATGGCTCAGTGAAGTGGTGGAAGATTTTCTCCCCTGACCAATGCTCTGGCATCAACCGTTTTGTGGCACTCTTTGCAGTGCCTCTTCTCTCCTTCCACTTCATAGCCTCCAACAACCCTTACGAAATGAACCTCAGGTTCCTAGCTGCTGACACCCTTCAAAAGATCATAATACTAGTCCTCCTTGCAGTTTGGAGCAACATCGCCAAAAGGGGTTGCTTGGAATGGGCCATAACCTTGTTCTCTCTCTCCACCCTCCCTAACACTTTGGTCATGGGCATCCCTTTGCTCAAAGGGATGTATGGTGACTTCTCAGGGTCCCTTATGGTGCAAATTGTGGTCCTCCAGTGTATCATTTGGTACACCTTGATGCTGTTCTTGTTTGAGTTTAGAGGTGCCAGAATGCTTATCTCTGAGCAGTTCCCTGACACTGCTGGCTCCATTGTCTCCATCCATGTTGACTCTGATGTCATGTCATTGGATGGAAGGCAACCACTTGAGACTGAAGCTGAGATCAAGGAAGATGGTAAACTCCATGTCACTGTGAGGAAGTCCAATGCCTCAAGATCAGACATCTTCTCAAGAAGGTCTCAGGGTCTCTCTTCCACCACTCCACGCCCTTCTAACCTCACTAATGCTGAGATATATTCTTTGCAATCCTCTAGGAACCCTACACCGAGAGGTTCCAGCTTCAACCACACTGATTTCTACTCTATGATGGCTGCTGGTGGCAGGAACTCCAACTTTGGTGCCTCTGATGTTTATGGCCTTTCAGCCTCAAGAGGGCCAACTCCAAGGCCTTCTAACTATGATGAAGATGGTGGGAAGCCAAAGTTCCATTACCATGCTGGTGGAACTGGACACTACCCTGCACCAAACCCTGGCATGTTCTCTCCCTCAAATGGGTCCAAAAGTGTTGCTGCTGCTAATGCTAATGCTAATGCCAAAAGGCCTAATGGGCAGGCTCAGCTGAAGCCTGAGGATGGGAATAGGGACCTTCATATGTTTGTTTGGAGTTCAAGTGCTTCACCAGTCTCTGACGTGTTTGGTGCCCATGAGTATGGAGGTCATGATCAGAAAGAAGTCAAATTGAATGTATCTCCAGGGAAAGTGGAGAATCATAGGGACACTCAAGAAGACTACCTAGAGAAAGATGAGTTCAGCTTTGGGAATAGAGGAATGGATAGGGAGATGAATCAGCTTGAAGGTGAGAAGGTTGGAGATGGGAAGCCAAAAACCATGCCTCCAGCAAGTGTGATGACAAGGCTTATATTGATTATGGTGTGGAGAAAACTCATCAGAAACCCCAACACCTACTCTAGCCTAATTGGCCTCACTTGGTCTCTTGTTTCATTCAAGTGGAATGTGGAGATGCCTGCCATAATAGCAAAGTCTATCTCCATATTGTCAGATGCAGGGCTTGGCATGGCCATGTTCAGTCTTGGTCTCTTCATGGCTTTGCAACCGAGGGTCATAGCATGTGGAAATTCCACCGCAGCTTTTGCCATGGCTGTGAGATTCCTTACAGGTCCAGCTGTCATGGCAGCTGCTTCCGTTGCTGTTGGACTCAAAGGTGTTCTCCTACATGTTGCCATTGTTCAGGCAGCTCTTCCCCAAGGAATTGTCCCATTTGTCTTTGCTAAGGAATATAATGTACATCCTGATATTCTCAGCACAGCTGTTATTTTTGGGATGTTGATTGCTTTGCCCATAACTCTAGTGTACTACATCTTGTTGGGGTTGTGAATGAAAGAAATGATGGATGATACAGAAGATTCACGTGTGGCATCCATGCAAAGCTCGGTTGAGGCTTGTTGAGCATCAGACAAAAAAAAGGGGGTCATAAAGCAACAATAGAAAAGAAGCATCACGAGAATTTGGATAGGAAGAACCCCAGGATCAGTTTTTTTTTTTTAAATTTATTTATTTGTTTTCTTTTTCTTTTTTGAATGAATTGCCCTTTGTTAGTGAAAATTAGTGTAAAATCATGATGTAGCTAATTTACAAAATGATTATCTCGTTAAATTTTTATATTATAATGTCCTCGGATTCCATGTCACTCATCAATTGAAGGATAAGAAAGCATGGGAAACTTTGTTG
CDS Sequence
- >Glyma.07G102500.1
ATGATCACCTTAACAGACTTCTACCATGTCATGACTGCAATGGTGCCACTCTATGTGGCCATGATACTAGCCTATGGCTCAGTGAAGTGGTGGAAGATTTTCTCCCCTGACCAATGCTCTGGCATCAACCGTTTTGTGGCACTCTTTGCAGTGCCTCTTCTCTCCTTCCACTTCATAGCCTCCAACAACCCTTACGAAATGAACCTCAGGTTCCTAGCTGCTGACACCCTTCAAAAGATCATAATACTAGTCCTCCTTGCAGTTTGGAGCAACATCGCCAAAAGGGGTTGCTTGGAATGGGCCATAACCTTGTTCTCTCTCTCCACCCTCCCTAACACTTTGGTCATGGGCATCCCTTTGCTCAAAGGGATGTATGGTGACTTCTCAGGGTCCCTTATGGTGCAAATTGTGGTCCTCCAGTGTATCATTTGGTACACCTTGATGCTGTTCTTGTTTGAGTTTAGAGGTGCCAGAATGCTTATCTCTGAGCAGTTCCCTGACACTGCTGGCTCCATTGTCTCCATCCATGTTGACTCTGATGTCATGTCATTGGATGGAAGGCAACCACTTGAGACTGAAGCTGAGATCAAGGAAGATGGTAAACTCCATGTCACTGTGAGGAAGTCCAATGCCTCAAGATCAGACATCTTCTCAAGAAGGTCTCAGGGTCTCTCTTCCACCACTCCACGCCCTTCTAACCTCACTAATGCTGAGATATATTCTTTGCAATCCTCTAGGAACCCTACACCGAGAGGTTCCAGCTTCAACCACACTGATTTCTACTCTATGATGGCTGCTGGTGGCAGGAACTCCAACTTTGGTGCCTCTGATGTTTATGGCCTTTCAGCCTCAAGAGGGCCAACTCCAAGGCCTTCTAACTATGATGAAGATGGTGGGAAGCCAAAGTTCCATTACCATGCTGGTGGAACTGGACACTACCCTGCACCAAACCCTGGCATGTTCTCTCCCTCAAATGGGTCCAAAAGTGTTGCTGCTGCTAATGCTAATGCTAATGCCAAAAGGCCTAATGGGCAGGCTCAGCTGAAGCCTGAGGATGGGAATAGGGACCTTCATATGTTTGTTTGGAGTTCAAGTGCTTCACCAGTCTCTGACGTGTTTGGTGCCCATGAGTATGGAGGTCATGATCAGAAAGAAGTCAAATTGAATGTATCTCCAGGGAAAGTGGAGAATCATAGGGACACTCAAGAAGACTACCTAGAGAAAGATGAGTTCAGCTTTGGGAATAGAGGAATGGATAGGGAGATGAATCAGCTTGAAGGTGAGAAGGTTGGAGATGGGAAGCCAAAAACCATGCCTCCAGCAAGTGTGATGACAAGGCTTATATTGATTATGGTGTGGAGAAAACTCATCAGAAACCCCAACACCTACTCTAGCCTAATTGGCCTCACTTGGTCTCTTGTTTCATTCAAGTGGAATGTGGAGATGCCTGCCATAATAGCAAAGTCTATCTCCATATTGTCAGATGCAGGGCTTGGCATGGCCATGTTCAGTCTTGGTCTCTTCATGGCTTTGCAACCGAGGGTCATAGCATGTGGAAATTCCACCGCAGCTTTTGCCATGGCTGTGAGATTCCTTACAGGTCCAGCTGTCATGGCAGCTGCTTCCGTTGCTGTTGGACTCAAAGGTGTTCTCCTACATGTTGCCATTGTTCAGGCAGCTCTTCCCCAAGGAATTGTCCCATTTGTCTTTGCTAAGGAATATAATGTACATCCTGATATTCTCAGCACAGCTGTTATTTTTGGGATGTTGATTGCTTTGCCCATAACTCTAGTGTACTACATCTTGTTGGGGTTGTGA
Protein Sequence
- >Glyma.07G102500.1
MITLTDFYHVMTAMVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFIASNNPYEMNLRFLAADTLQKIIILVLLAVWSNIAKRGCLEWAITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDFSGSLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEFRGARMLISEQFPDTAGSIVSIHVDSDVMSLDGRQPLETEAEIKEDGKLHVTVRKSNASRSDIFSRRSQGLSSTTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHTDFYSMMAAGGRNSNFGASDVYGLSASRGPTPRPSNYDEDGGKPKFHYHAGGTGHYPAPNPGMFSPSNGSKSVAAANANANAKRPNGQAQLKPEDGNRDLHMFVWSSSASPVSDVFGAHEYGGHDQKEVKLNVSPGKVENHRDTQEDYLEKDEFSFGNRGMDREMNQLEGEKVGDGKPKTMPPASVMTRLILIMVWRKLIRNPNTYSSLIGLTWSLVSFKWNVEMPAIIAKSISILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPRVIACGNSTAAFAMAVRFLTGPAVMAAASVAVGLKGVLLHVAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILSTAVIFGMLIALPITLVYYILLGL*