Gene Details:

Functional Descriptions:

  • miRNA_157-CsCuRX, miRNA_411-CsGH3.6, and miRNA_161/297/257-CsHD-Zip might be responsible for corolla opening in the super ovary in cucumber.
  • The down-regulated CsHD-Zip gene (Csa6G525430) identified in this study was regulated by 28 up-regulated miRNAs at the yellow bud stage.
  • miRNA_161, miRNA_297, and miRNA_257 were highly expressed at the yellow bud stage, suggesting that they regulate the CsHD-Zip response to corolla opening in the cucumber super ovary.

Literature:

Gene Resources:

Orthologs:

Sequences:

cDNA Sequence
  • >Csa_6G525430
    CTTTTTCTTTTCCTCTTCTTCATTGTGTTTTAAGTCCTCGAAATTGGTGTTTTCTTGATAAAGACCAGTGGACTCTGTTCATACTCTTCTTCAACCTGTGTGCTTTGAGGAAGAAGCAGGGCACTAACTGATGAAGGAGAGAGGAGGCTCTCTTGGAGGAGAGAGCCTGCCTGGTAAAAAGACTAACAGCAACAGCAACAGCAACACCGCCATAGAAGAAGACCAAGACGACCCTAAAACCCCATTCTGCTAACTTCCCATTTTTCCTTAGCAAAAAAATTCAGTTCTTGAAGCTCTCTTTTTAGTAGGTTTTGAATCTCTTGAGCTCTTAAATCTTGTGTTTGCCTCTTTGTTTGAGTTTTCTGCTTAAGGTCTATGGCGTTAGTTATCCACAAAGATACATCAAACAAACAAATGGATTCAAGCAAATACGTACGGTATACACCCGAGCAAGTTGAGGCATTAGAGAGAGTTTATGCCGAATGTCCAAAGCCTAGTTCTCTCAGAAGGCAGCAGCTCATTAGAGAGTGCCCAATTCTTTCTAACATTGAACCTAAACAGATCAAAGTTTGGTTTCAAAATCGCAGATGCCGTGAGAAGCAGCGTAAGGAATCATCTCGCCTCCAGAGCGTAAACAGAAAGTTGTCTGCGATGAACAAATTGTTAATGGAGGAGAATGACCGTTTACAGAAACAGGTGTCCCATTTGGTCTATGAGAATGGCTTTATGCGCCAGCAACTGCATAGTGCATCTGGGACGACTACAGACAATAGCTGTGAGTCTGTAGTCATGAGCGGTCAGCCTCAACAACAGCAAAACCCAAATCCTCAGCATCCTAATAGGGATGTTAACAACCCAGCTGGTCTTCTCGCGGTAGCTGAGGAGACCCTGGCAGAGTTCCTTTCCAAGGCTACAGGAACTGCTGTCGACTGGGTCCAGATGATTGGGATGAAGCCTGGTCCGGATTCTATTGGAATCGTTGCTGTTTCCCGCAATTGCAGTGGGGTAGCAGCACGAGCCTGTGGTCTTGTTAGTCTAGAGCCGACAAAGGTTGCAGAAATTCTCAAAGATCGCCTTTCATGGTATCGTGACTGCCGCTGTCTTAATGTTTTAAGTGTAATTCCTACTGGAAATGGAGGAACAATAGAGCTCATATATATGCAGACTTATGCTCCAACGACATTAGCAGCAGCACGTGACTTCTGGACGATGAGATATACAACAAGTTTAGAAGATGGCAGTCTAGTGGTTTGTGAGAGGTCATTATCTTCTTCAAGTGGCGGCCCTGCAGGGCCTCCGCCATCTACTTTTGTAAGAGCTGAGATGCTTCCTAGTGGCTATTTAATACGAGCGTGCGAGGGGGGTGGATCAATTATTCACATTGTCGATCACATTGATTTGGATGTTTGGAGTGTCCCTGAAGTTCTTAGGCCACTTTATGAGTCATCCAAGATCCTTGCTCAGAAAATAACAATCGCTGCATTGCGTCACATTAGACAAATTGCTCAAGAGACTAACGGAGAAATTCAATGTACTGGCGGACGTCAACCTGCTGTACTGCGGACGTTTAGTCAAAAACTCTGCAGGGGTTTCAATGATGCTGTCAATGGGTTTGCTGATGATGGCTGGTCACCTATGGGAAGTGATGGTGTGGAGGATGTGACAATTCTTATAAACACATCAGCAAACAAGTTTTCTGGATCCCAGTATAACACATCCTTGTATCCCTCTTTTGGTGGAGGAGTTATGTGTGCAAAGGCGTCAATGTTACTTCAGAATGTTCCCCCTGCTTTGCTTGTTCGATTCCTGAGAGAGCATCGGTCTGAATGGGCTGATTATGGAGTTGATGCCTACTCTGCTGCAAGTTTAAAAGCCAGTCCGTATGCTGTTCCATGTGCAAGGCCTGGTGGCTTCCCTAGCAGCCAGGTTATTTTGCCTCTTGCTACTACTGTGGAGCATGAGGAGTTTTTGGAGGTGGTTCGGCTGGAGGGCCTTGCATTCTCTCCTGAAGATGTTGCTTTGGCTGGACGAGATATGTACTTACTGCAGCTCTGCAGTGGGGTTGATGAGAATGCAGTTGGAGCTTGCGCTCAGCTTGTGTTTGCACCTATAGATGAATCTTTTGCTGATGATGCTCCACTACTTCCTTCGGGGTTCCGTGTCATACCGCTGGATCCAAAAACGGATGAACCTACTGCTGCTAGAACATTGGATTTAGCCTCTACCCTTGAAGTTGGTGCCAATGCTGCACGTTCTGCTGGTGAAACTGATTTGAGCAACTATAACCTTCGGTCAGTCCTGACCATTGCTTTCCAGTTCACCTTTGAGAATCACTTACAGGAAAATGTGGCTGCTATGGCTCGACAATATGTTCGTAGTGTTGTGGGCTCTGTTCAGAGGGTTGCCATGGCCATTTCCCCATCGCGGTTGAGTTCCAATATGGGACTAAAGCCTCTTCCTGGTTCACCTGAAGCTCTCACTTTGGCTCGATGGATTTGCCGAAGCTACAGGGTCCATGTTGGAGCTGAGCTCCTTCAAGCTGATTCCCAGTCTGGAGATGCCATGTTGAAGCAGCTCTGGCACCACTCCGATGCAATCATGTGTTGCTCCGTTAAAACCAACGCATCTGCTGTGTTCACCTTTGCTAACCAGGCTGGTCTGGATATGCTTGAAACCACTCTTGTTGGCCTACAAGATATAATGCTAGACAAAATTCTTGATGAGGCAGGTCGGAAGATTCTCTGCTCTGAATTCCCCAAAATAATGCAGCAGGGGTTTGCAAATCTTCCCTCTGGCATCTGCGTATCCAGTATGGGTCGTCCCATTTCTTATGAGCAAGCGGTTGCCTGGAAGGTTTTAAATGATGATGATTCCAATCACTGTCTTGCTTTCATGTTCATAAACTGGTCCTTTGTTTGATGCGGAGAAGAAACATGACTCTGGTTAACTACTAGTGGGATTGTAATTTCAACCTAGACATGATATCTTTCTGTTACTGCAGGACTTATGTTCTTTTGCTGTTCTTCCTTTTTGGTTTGCCAAACAAATGTGCTTAGCTTAGCTCGCTATTTGGATCCTTTGTTTCCAACCTAGACGAAGTGACTTAATGTCGTTAATTTCATGAACACTATTATACTATCTGAAGTTATTTTTCT
CDS Sequence
  • >Csa_6G525430
    ATGGCGTTAGTTATCCACAAAGATACATCAAACAAACAAATGGATTCAAGCAAATACGTACGGTATACACCCGAGCAAGTTGAGGCATTAGAGAGAGTTTATGCCGAATGTCCAAAGCCTAGTTCTCTCAGAAGGCAGCAGCTCATTAGAGAGTGCCCAATTCTTTCTAACATTGAACCTAAACAGATCAAAGTTTGGTTTCAAAATCGCAGATGCCGTGAGAAGCAGCGTAAGGAATCATCTCGCCTCCAGAGCGTAAACAGAAAGTTGTCTGCGATGAACAAATTGTTAATGGAGGAGAATGACCGTTTACAGAAACAGGTGTCCCATTTGGTCTATGAGAATGGCTTTATGCGCCAGCAACTGCATAGTGCATCTGGGACGACTACAGACAATAGCTGTGAGTCTGTAGTCATGAGCGGTCAGCCTCAACAACAGCAAAACCCAAATCCTCAGCATCCTAATAGGGATGTTAACAACCCAGCTGGTCTTCTCGCGGTAGCTGAGGAGACCCTGGCAGAGTTCCTTTCCAAGGCTACAGGAACTGCTGTCGACTGGGTCCAGATGATTGGGATGAAGCCTGGTCCGGATTCTATTGGAATCGTTGCTGTTTCCCGCAATTGCAGTGGGGTAGCAGCACGAGCCTGTGGTCTTGTTAGTCTAGAGCCGACAAAGGTTGCAGAAATTCTCAAAGATCGCCTTTCATGGTATCGTGACTGCCGCTGTCTTAATGTTTTAAGTGTAATTCCTACTGGAAATGGAGGAACAATAGAGCTCATATATATGCAGACTTATGCTCCAACGACATTAGCAGCAGCACGTGACTTCTGGACGATGAGATATACAACAAGTTTAGAAGATGGCAGTCTAGTGGTTTGTGAGAGGTCATTATCTTCTTCAAGTGGCGGCCCTGCAGGGCCTCCGCCATCTACTTTTGTAAGAGCTGAGATGCTTCCTAGTGGCTATTTAATACGAGCGTGCGAGGGGGGTGGATCAATTATTCACATTGTCGATCACATTGATTTGGATGTTTGGAGTGTCCCTGAAGTTCTTAGGCCACTTTATGAGTCATCCAAGATCCTTGCTCAGAAAATAACAATCGCTGCATTGCGTCACATTAGACAAATTGCTCAAGAGACTAACGGAGAAATTCAATGTACTGGCGGACGTCAACCTGCTGTACTGCGGACGTTTAGTCAAAAACTCTGCAGGGGTTTCAATGATGCTGTCAATGGGTTTGCTGATGATGGCTGGTCACCTATGGGAAGTGATGGTGTGGAGGATGTGACAATTCTTATAAACACATCAGCAAACAAGTTTTCTGGATCCCAGTATAACACATCCTTGTATCCCTCTTTTGGTGGAGGAGTTATGTGTGCAAAGGCGTCAATGTTACTTCAGAATGTTCCCCCTGCTTTGCTTGTTCGATTCCTGAGAGAGCATCGGTCTGAATGGGCTGATTATGGAGTTGATGCCTACTCTGCTGCAAGTTTAAAAGCCAGTCCGTATGCTGTTCCATGTGCAAGGCCTGGTGGCTTCCCTAGCAGCCAGGTTATTTTGCCTCTTGCTACTACTGTGGAGCATGAGGAGTTTTTGGAGGTGGTTCGGCTGGAGGGCCTTGCATTCTCTCCTGAAGATGTTGCTTTGGCTGGACGAGATATGTACTTACTGCAGCTCTGCAGTGGGGTTGATGAGAATGCAGTTGGAGCTTGCGCTCAGCTTGTGTTTGCACCTATAGATGAATCTTTTGCTGATGATGCTCCACTACTTCCTTCGGGGTTCCGTGTCATACCGCTGGATCCAAAAACGGATGAACCTACTGCTGCTAGAACATTGGATTTAGCCTCTACCCTTGAAGTTGGTGCCAATGCTGCACGTTCTGCTGGTGAAACTGATTTGAGCAACTATAACCTTCGGTCAGTCCTGACCATTGCTTTCCAGTTCACCTTTGAGAATCACTTACAGGAAAATGTGGCTGCTATGGCTCGACAATATGTTCGTAGTGTTGTGGGCTCTGTTCAGAGGGTTGCCATGGCCATTTCCCCATCGCGGTTGAGTTCCAATATGGGACTAAAGCCTCTTCCTGGTTCACCTGAAGCTCTCACTTTGGCTCGATGGATTTGCCGAAGCTACAGGGTCCATGTTGGAGCTGAGCTCCTTCAAGCTGATTCCCAGTCTGGAGATGCCATGTTGAAGCAGCTCTGGCACCACTCCGATGCAATCATGTGTTGCTCCGTTAAAACCAACGCATCTGCTGTGTTCACCTTTGCTAACCAGGCTGGTCTGGATATGCTTGAAACCACTCTTGTTGGCCTACAAGATATAATGCTAGACAAAATTCTTGATGAGGCAGGTCGGAAGATTCTCTGCTCTGAATTCCCCAAAATAATGCAGCAGGGGTTTGCAAATCTTCCCTCTGGCATCTGCGTATCCAGTATGGGTCGTCCCATTTCTTATGAGCAAGCGGTTGCCTGGAAGGTTTTAAATGATGATGATTCCAATCACTGTCTTGCTTTCATGTTCATAAACTGGTCCTTTGTTTGA
Protein Sequence
  • >Csa_6G525430
    MALVIHKDTSNKQMDSSKYVRYTPEQVEALERVYAECPKPSSLRRQQLIRECPILSNIEPKQIKVWFQNRRCREKQRKESSRLQSVNRKLSAMNKLLMEENDRLQKQVSHLVYENGFMRQQLHSASGTTTDNSCESVVMSGQPQQQQNPNPQHPNRDVNNPAGLLAVAEETLAEFLSKATGTAVDWVQMIGMKPGPDSIGIVAVSRNCSGVAARACGLVSLEPTKVAEILKDRLSWYRDCRCLNVLSVIPTGNGGTIELIYMQTYAPTTLAAARDFWTMRYTTSLEDGSLVVCERSLSSSSGGPAGPPPSTFVRAEMLPSGYLIRACEGGGSIIHIVDHIDLDVWSVPEVLRPLYESSKILAQKITIAALRHIRQIAQETNGEIQCTGGRQPAVLRTFSQKLCRGFNDAVNGFADDGWSPMGSDGVEDVTILINTSANKFSGSQYNTSLYPSFGGGVMCAKASMLLQNVPPALLVRFLREHRSEWADYGVDAYSAASLKASPYAVPCARPGGFPSSQVILPLATTVEHEEFLEVVRLEGLAFSPEDVALAGRDMYLLQLCSGVDENAVGACAQLVFAPIDESFADDAPLLPSGFRVIPLDPKTDEPTAARTLDLASTLEVGANAARSAGETDLSNYNLRSVLTIAFQFTFENHLQENVAAMARQYVRSVVGSVQRVAMAISPSRLSSNMGLKPLPGSPEALTLARWICRSYRVHVGAELLQADSQSGDAMLKQLWHHSDAIMCCSVKTNASAVFTFANQAGLDMLETTLVGLQDIMLDKILDEAGRKILCSEFPKIMQQGFANLPSGICVSSMGRPISYEQAVAWKVLNDDDSNHCLAFMFINWSFV