Gene Details:

  • Gene ID: AT5G40490
  • Gene Symbol: HLP1, RBGD5
  • Gene Name: RNA-binding glycine-rich protein D5
  • Description: RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein;(source:Araport11)
  • TAIR Accession: locus:2168848
  • Genome: Araport11_genome_release
  • Species: Arabidopsis thaliana

Transcripts:

Plant Ontology Annotations:

  • PO:0009005  — root — raíz (Spanish, exact), radices (exact, plural), radix (exact), 根 (Japanese, exact), aerial root (narrow), climbing root (narrow)
  • PO:0000084  — plant sperm cell — célula espermática o esperma (Spanish, exact), male gamete (exact), microgamete (exact), 植物精子細胞 (Japanese, exact), sperm nucleus (related), sperm cell (broad)
  • PO:0000293  — guard cell — célula guardiana (Spanish, exact), occlusive cell (exact), 孔辺細胞 (Japanese, exact)

Gene Ontology:

  • GO:0048578  — acts upstream of or within — positive regulation of long-day photoperiodism, flowering
  • GO:0048576  — acts upstream of or within — positive regulation of short-day photoperiodism, flowering
  • GO:0003729  — enables — mRNA binding

Literature:

Sequences:

cDNA Sequence
  • >AT5G40490.1
    TGTTTCTAAATCAAAGACACAACACAAGTGCTACGCGAAGTACAATAAGTGTCGCTCCTTTCTCTTCTCCAAGGGTTTTAGGGCTTTTAGGCGGCTGCCGCTTCTTTTTCATCTTCTTCTTCGTTCTCCGAAGGTTTAGGGTTTCGATTTTCCCATCATGGATCCTTATGGAACGGAAACAGTTATCGAAGACGAAATCCACGATCCTAAACCATCCGAAGATATTGAAGACGATGACGACAAATCTCAGCCTCACTCTGGTGGCGGCGTCGATAGTGCTGGAAAGATATTTGTTGGAGGTTTAGCCAGGGAGACAACTTCAGCTGAATTCCTCAAGCATTTTGGGAAATATGGAGAGATCACTGATTCTGTGATTATGAAGGATAGGAAAACTGGACAGCCTCGGGGATTTGGGTTTGTCACATATGCTGATTCCTCTGTGGTCGACAAAGTTATCCAAGACAATCACATTATAATTGGCAAGCAGGTTGAAATTAAGCGGACGATACCAAGAGGATCCATGAGCTCTAACGATTTCAAAACCAAGAAGATATTTGTTGGTGGAATTCCTTCATCTGTGGATGATGATGAATTCAAGGAGTTCTTTATGCAATTTGGAGAGCTGAAGGAACATCAGATTATGCGTGATCACTCAACTGGAAGATCACGTGGCTTTGGGTTTGTTACATATGAAAGTGAAGATATGGTTGATCATCTCTTGGCGAAAGGGAACAGAATTGAGCTTTCAGGGACTCAGGTAGAGATAAAGAAGGCAGAGCCTAAAAAACCAAACTCGGTTACAACCCCATCGAAGCGGTTCGGTGACTCTCGCTCTAACTTTGGTGGAGGTTATGGAGATGGTTATGGTGGCGGACACGGTGGAGGATATGGTGGTCCAGGTGGTCCTTACAAGTCAGGTGGCGGTTATGGAGGTGGCCGGTCTGGTGGTTATGGAGGGTACGGAGGAGAATTCGGTGGGTATGGCGGTGGTGGATATGGTGGTGGTGTGGGACCTTATAGAGGAGAACCAGCTCTTGGATATTCTGGTCGTTATGGAGGAGGAGGCGGTGGTTACAATAGAGGTGGATACAGTATGGGAGGGGGCGGTGGGTACGGTGGTGGACCAGGTGATATGTATGGTGGGTCATACGGTGAACCAGGAGGTGGTTATGGTGGACCTAGTGGCAGTTATGGAGGCGGGTATGGTAGTAGCGGAATAGGTGGGTATGGTGGTGGAATGGGTGGTGCTGGTGGCGGAGGCTATAGAGGAGGTGGTGGCTATGATATGGGTGGAGTTGGAGGGGGAGGCGCAGGAGGATATGGTGCTGGTGGTGGCGGAAACGGTGGAGGATCATTTTATGGAGGAGGAGGAGGTAGAGGTGGATATGGAGGCGGGGGCAGCGGACGGTACCATCCTTATGGAAGGTAGAGAGTTCGATGAAAGCTTGAATCTTCTTCTTACTTGTTGTGTCATGCTTAGCATCATGTATGGTTATCAAGATTGATAGCTAGTCATTGTATTTTGAGAGATGAGGCTTTTAGGGCTTTGATTCCCCTGAGTAGTTTAAATCAATACATTTTTTAGATTATAATTATCTCGGCGTAACAATGCCAGATTATTTTTTACTCTCATGTGACATCTTTAGAGTTAGCTTGTAGCAACGCTTTTGAGGTTTTGGCTCAAATCTTATTAGAAGAAGACTCTTGTTTGTACCATTGCATATTTTTCATCATAAGCCTCTGTATGTGTCCGAAGGTTTGAT
  • >AT5G40490.2
    TGTTTCTAAATCAAAGACACAACACAAGTGCTACGCGAAGTACAATAAGTGTCGCTCCTTTCTCTTCTCCAAGGGTTTTAGGGCTTTTAGGCGGCTGCCGCTTCTTTTTCATCTTCTTCTTCGTTCTCCGAAGGTTTAGGGTTTCGATTTTCCCATCATGGATCCTTATGGAACGGAAACAGTTATCGAAGACGAAATCCACGATCCTAAACCATCCGAAGATATTGAAGACGATGACGACAAATCTCAGCCTCACTCTGGTGGCGGCGTCGATAGTGCTGGAAAGATATTTGTTGGAGGTTTAGCCAGGGAGACAACTTCAGCTGAATTCCTCAAGCATTTTGGGAAATATGGAGAGATCACTGATTCTGTGATTATGAAGGATAGGAAAACTGGACAGCCTCGGGGATTTGGGTTTGTCACATATGCTGATTCCTCTGTGGTCGACAAAGTTATCCAAGACAATCACATTATAATTGGCAAGCAGGTTGAAATTAAGCGGACGATACCAAGAGGATCCATGAGCTCTAACGATTTCAAAACCAAGAAGATATTTGTTGGTGGAATTCCTTCATCTGTGGATGATGATGAATTCAAGGAGTTCTTTATGCAATTTGGAGAGCTGAAGGAACATCAGATTATGCGTGATCACTCAACTGGAAGATCACGTGGCTTTGGGTTTGTTACATATGAAAGTGAAGATATGGTTGATCATCTCTTGGCGAAAGGGAACAGAATTGAGCTTTCAGGGACTCAGGTAGAGATAAAGAAGGCAGAGCCTAAAAAACCAAACTCGGTTACAACCCCATCGAAGCGGTTCGGTGACTCTCGCTCTAACTTTGGTGGAGGTTATGGAGATGGTTATGGTGGCGGACACGGTGGAGGATATGGTGGTCCAGGTGGTCCTTACAAGTCAGGTGGCGGTTATGGAGGTGGCCGGTCTGGTGGTTATGGAGGGTACGGAGGAGAATTCGGTGGGTATGGCGGTGGTGGATATGGTGGTGGTGTGGGACCTTATAGAGGAGAACCAGCTCTTGGATATTCTGGTCGTTATGGAGGAGGAGGCGGTGGTTACAATAGAGGTGGATACAGTATGGGAGGGGGCGGTGGGTACGGTGGTGGACCAGGTGATATGTATGGTGGGTCATACGGTGAACCAGGAGGTGGTTATGGTGGACCTAGTGGCAGTTATGGAGGCGGGTATGGTAGTAGCGGAATAGGTGGGTATGGTGGTGGAATGGGTGGTGCTGGTGGCGGAGGCTATAGAGGAGGTGGTGGCTATGATATGGGTGGAGTTGGAGGGGGAGGCGCAGGAGGATATGGTGCTGGTGGTGGCGGAAACGGTGGAGGATCATTTTATGGAGGAGGAGGAGGTAGAGGTGGATATGGAGGCGGGGGCAGCGGACGGTACCATCCTTATGGAAGGTAGAGAGTTCGATGAAAGCTTGAATCTTCTTCTTACTTGTTGTGTCATGCTTAGCATCATGTATGGTTATCAAGATTGATAGCTAGTCATTGTATTTTGAGAGATGAGGCTTTTAGGGCTTTGATTCCCCTGAGTAGTTTAAATCAATACATTTTTTAGATTATAATTATCTCGGCGTAACAATGCCAGATTATTTTTTACTCTCATGTGACATCTTTAGAGTTAGCTTGTAGCAACGCTTTTGAGGTTTTGGCTCAAATCTTATTAGAAGAAGACTCTTGTTTGTACCATTGCATATTTTTCATCATAAGCCTCTGTATGTGTCCGAAGGTTTGAT
CDS Sequence
Protein Sequence