Gene Details:
- Gene ID: AT5G25560
- Gene Symbol: CHYR2
- Gene Name: CHY ZINC FINGER AND RING PROTEIN 2
- Description: CHY-type/CTCHY-type/RING-type Zinc finger protein;(source:Araport11)
- TAIR Accession: locus:2179474
- Genome: Araport11_genome_release
- Species: Arabidopsis thaliana
Transcripts:
Plant Ontology Annotations:
- PO:0009005 — root — raíz (Spanish, exact), radices (exact, plural), radix (exact), 根 (Japanese, exact), aerial root (narrow), climbing root (narrow)
- PO:0000084 — plant sperm cell — célula espermática o esperma (Spanish, exact), male gamete (exact), microgamete (exact), 植物精子細胞 (Japanese, exact), sperm nucleus (related), sperm cell (broad)
Gene Ontology:
- GO:0008270 — enables — zinc ion binding
- GO:0006511 — involved in — ubiquitin-dependent protein catabolic process
- GO:0010255 — involved in — glucose mediated signaling pathway
- GO:0005634 — located in — nucleus
- GO:0061630 — enables — ubiquitin protein ligase activity
- GO:0005737 — located in — cytoplasm
- GO:0005634 — is active in — nucleus
Function-related keywords:
Literature:
- Evaluation and classification of RING-finger domains encoded by the Arabidopsis genome. DOI: 10.1186/gb-2002-3-4-research0016 ; PMID: 11983057
- Transcriptome analyses show changes in gene expression to accompany pollen germination and tube growth in Arabidopsis. DOI: 10.1104/pp.108.126375 ; PMID: 18775970
- Endogenous Arabidopsis messenger RNAs transported to distant tissues. DOI: 10.1038/nplants.2015.25 ; PMID: 27247031
- Repertoire of plant RING E3 ubiquitin ligases revisited: New groups counting gene families and single genes. DOI: 10.1371/journal.pone.0203442 ; PMID: 30169501
Sequences:
cDNA Sequence
- >AT5G25560.2
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CDS Sequence
Protein Sequence