Information report for AT5G25560
Gene Details
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Functional Descriptions
- PO:0009005 — root — raíz (Spanish, exact), radices (exact, plural), radix (exact), 根 (Japanese, exact), aerial root (narrow), climbing root (narrow)
- PO:0000084 — plant sperm cell — célula espermática o esperma (Spanish, exact), male gamete (exact), microgamete (exact), 植物精子細胞 (Japanese, exact), sperm nucleus (related), sperm cell (broad)
- GO:0008270 — enables — zinc ion binding
- GO:0006511 — involved in — ubiquitin-dependent protein catabolic process
- GO:0010255 — involved in — glucose mediated signaling pathway
- GO:0005634 — located in — nucleus
- GO:0061630 — enables — ubiquitin protein ligase activity
- GO:0005737 — located in — cytoplasm
- GO:0005634 — is active in — nucleus
Functional Keywords
Literature and News
- Evaluation and classification of RING-finger domains encoded by the Arabidopsis genome. DOI: 10.1186/gb-2002-3-4-research0016 ; PMID: 11983057
- Transcriptome analyses show changes in gene expression to accompany pollen germination and tube growth in Arabidopsis. DOI: 10.1104/pp.108.126375 ; PMID: 18775970
- Endogenous Arabidopsis messenger RNAs transported to distant tissues. DOI: 10.1038/nplants.2015.25 ; PMID: 27247031
- Repertoire of plant RING E3 ubiquitin ligases revisited: New groups counting gene families and single genes. DOI: 10.1371/journal.pone.0203442 ; PMID: 30169501
Gene Resources
- UniProt: F4JY60
- EMBL: CP002688
- AlphaFoldDB: F4JY60
- EnsemblPlants: AT5G25560.1, AT5G25560.2, AT5G25560.5
- Gramene: AT5G25560.1, AT5G25560.2, AT5G25560.5
- ExpressionAtlas: AT5G25560
- InterPro: IPR001841, IPR008913, IPR013083
- PANTHER: PTHR21319, PTHR21319:SF53
- SUPFAM: SSF161219, SSF161245, SSF57850
- PROSITE: PS50089, PS51266, PS51270
- Gene3D: 2.20.28.10, 3.30.40.10
- SWISS-MODEL: F4JY60
- Conserved Domain Database: cd16464
Sequences
cDNA Sequence
- >AT5G25560.2
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CDS Sequence
Protein Sequence