Gene Details:

  • Gene ID: AT5G24740
  • Gene Symbol: SHBY
  • Gene Name: SHRUBBY
  • Description: vacuolar protein sorting-associated protein, putative (DUF1162);(source:Araport11)
  • TAIR Accession: locus:2184565
  • Genome: Araport11_genome_release
  • Species: Arabidopsis thaliana

Transcripts:

Plant Ontology Annotations:

  • PO:0000282  — trichome — tricoma (Spanish, exact), 毛茸、糸状体、毛 (Japanese, exact), seta (related), setae (related), capilli (narrow), capillus (narrow), cilia (narrow), cilium (narrow), glochid (narrow), glochidia (narrow), glochidium (narrow), hair (narrow), lepides (narrow), lepis (narrow), non-secretory trichome (narrow), scale (narrow), squama (narrow), squamae (narrow), squamella (narrow), squamellae (narrow), squamule (narrow), barb trichome (broad), bristle (broad)
  • PO:0009005  — root — raíz (Spanish, exact), radices (exact, plural), radix (exact), 根 (Japanese, exact), aerial root (narrow), climbing root (narrow)

Gene Ontology:

  • GO:0010015  — acts upstream of or within — root morphogenesis
  • GO:0010082  — acts upstream of or within — regulation of root meristem growth
  • GO:0019898  — is active in — extrinsic component of membrane
  • GO:0045053  — involved in — protein retention in Golgi apparatus
  • GO:0003674  — enables — molecular_function
  • GO:0006623  — involved in — protein targeting to vacuole
  • GO:1990064  — acts upstream of or within — ground tissue pattern formation
  • GO:0005794  — located in — Golgi apparatus

Germplasm Phenotype:

  • SALK_138092  — no visible developmental phenotypes were observed in homozygous plants

Literature:

Sequences:

cDNA Sequence
  • >AT5G24740.1
    ATGCTTGAAGGATATGTGCAAGGATTTGTGAACCTGTTGTTAGGGTACTTAGGTCGTTACATTAAAGACATCCAGAAAGACCAGCTCAAGATCTCACTCTGGAATGGAGAAGTCTTATTGGAGAACGTGGAATTGAATCCTGAGGCGTTTGAGTATTTGCAGCTTCCAATTGCTCTCAAGCAAGGCCGTGTTGGGAAATTGAGCATTAAAATTCCATGGAAGAAACTTCATAGGGATCCTGTAACCATTATGATTGAAGATGTCTTTATATGTGCATCGCAACGCAATGATCAAGAGTGGAGTTCAGATGTCGTTGAGAAAAGAGAGTTTGCTGGTAAGAAAGCTAAACTTGCTTCTGCAGAACTGGCAAAATTGTCCAGGCGTGTCTTCGACAATCCAGGCGGAAATTCTTATATGTCATATATTACTGCCAAGATTCTTGATAGCGTTCAAGTGTCCATCAAAAATTTTCACATCTTATACTCAGATGCACAACCTGAATCGGGGCAAGTTGTATTAGGATTGCGGTTTTCAAGCTTGACAGTTACTAAACAAAACTCAGTTGGGCCATCAGTTGGTAGGGTGAGAGGGGGGCAAGTGAATATACTTGTGGAGGTTGAAGGTTTGGAAATATATTGTGACATGTATGAGGGAAACATGGACTTTCCAAGTGTTAATGAAAAAATAGGTTTTGACAATTGGTGCCAGTCAAGATTGCAAAGCAATAGATTTGGTTATTTACTGAAGCCAGTCCATGTTTCTGTAACGCTATTGGTCAATCGATCTGGAGAGCTTTATGACGATCTTCCTCAGTATTCTATCAGCGCTGAGTTGACTGATGTGGTGGTGACTCTGAATGAATTTCAATTGCAGCAGATTCTTATTCTGTTAGATTATTTGCAAACCAGCCAGTTGCGTGAGAGGTATGGGCGGTATCGTCCCTGCTCCACTTCTTTATCGAGGAAACCACCTGGATGGCAGAAACTTTGGTGGCACTATGCCCAAAATTCAGTTTTATCTGATTCAATCGATAAGTCCATCCGTTTGGGTTTGGAAGAATTGGAGAAGAAGTCTGATATTGATGATATCTTAAGTTATAGGTCTGCAGCGGAAGGTGAGATGCAGGAAGCTTGCTCAGAATTGACAGTAAACATGGGAGCGACTGGTGCCACTAGATCCGAAAAGGAACAGAGTGCCCCTGAAAAGGAACCGAGTGACGATCCTACATTAAATAAGTCGCGTGGGTGGTTGAACTGGTTGTCACGGGGAATGCTTGGTGCCGGAGGCACAGAGGATTCAAGTCAGTTTTCTGGTGTTGTTTCTGATGAAGTTGTCAAGGATATACACAAGGCAACAAAGTTTTACCCTCTTTCTTCATCTCCTAGAAATACAAGTGCAACTGGTAAGATCTGTACGTGCTCCATTCGACTCAACGTACGCAAATTTTCTGCTACTTTGCAACATATAAGTGGAAGTTCTTCTCAAGTTATTACAGAGTTGGACATTTTGGGGGTGATTGTTGAATGCAAGTCTTGGAAAGATTCTACAGCCATGATTTTATCTGTTATTTCTGGAAGGCTGGTCTATCCTCACAATGGGAAAGAAATTTTAACCATGAAAAGGGTCTGTTCTCAGAGTGATACACTAGAAACGAAACCCTCATATGGAGCGCGGTTGGAGTTGTCTAAAGATCATGATGTTGCATTGTCATTAAAGGCCACCCTTCAACCACTTGAAGCCGCTTATGATGGAGGCTTCATTCTAGCTGTCAGTAATTTTTTCTCGGGTTCAAGATACTTCAAACTCCAACATGAAAGGATTTTATCATCACTCAATGGCCTTGAAAGTGAAACGCGATTGGCAGCGAAAGCTGAATACCTCTTATCAAGCCGAAATAAAGTTAAGTGGGATCTGGACATAAAAGATCTTACCTTAAGTTTCCCTGGACGATTGGTTGAATCAGAAAGCTATAATCTGGTTCTGGTATTGGAATCTCTTTCTATCACATCTAGTAGCACAGATGCTCTTAGCCAAATTCCAAGATTGCAGTCTGATGTGGACCATGTGGTCAATAGCTTACAAAGTTCCGTTGAAGCTTTGGATGCTTTTCAAGTCAAAGATCTCTACGACCATTTTGATATCAAAATCTGTAACCTTGAGATGAAGCTCATGAAGATTCATCCTTTCCAAGAACTTCCCCTTGTGGAGAAATCATCTTTACTTATCAAGTTTGCGTCTTGTATAATTCCGGAGGAGTCGATTTTGAAGCAGTTGGAGGTTGAAGCTACTCTGCCTATGTTCAATGTCCATTTCTCTCCGTCAATATTTAAAGGAGTCATGTCTGTGATTGAATATCTTGATATTCAGGATCATGGAACTCGAAATCCTCCACCTTCCCCTGCTCCCATCTTTCACTTCACCATCAAAACCGACTTGGCATTTTTAAGGTTGCACGTCAATCTCGAAAATAAAGGAGAAAATAGCACAGTGCTTGTTCTTTCTATACAGCAGCTTGATCTCTGGTATTCACGTGCTATATTTGAAGAGTGGTCAGTCCGTGCGAAAACATTGGAAATAACAGCTTGCTCCTCTAAAGATGCAGCTGACAGTCATATTTTATGTTCATCTGGAAATCTACTCAAATCGTCTTCCCATGGACATGGGATGGATGCTCATACTAGCGATGAAACCAACATTATTGACTACAGAACAACTCCTGAAGCTGCTATCAGCTTAAATTGCAAGGTTTCTCAAAGTAAAAGTTTTATTTTTCACAAGTATACAGTCTATTGGAGGAGCGCCGAGCTCCATTGCTACCCATACATATTTGGTTTGCTGACAAATTTTTTGGATAAGATAGCTTCCTATAAGATCTCGTCTAGCTATACAAATCCATCTAGCCTTGCTACAGATACCATTGCTCCAACAGAAATACCTCAGTTTGATTTTGAAAGGTTTGGATTCTCAAACTTCACTGAAAGTAGATCTTGTGGCTGCATTCCTCTTGACAAATTTCCATTTGTAACCATTAACAATTCGGGTTCTCTTCATAGCCTAGAAAGTTCTCTGTGTTATTCGACTTCTGACTGGAGGAAGTTATTTATATTAAAGAATAGAAAGGATGGGGCACAAATAGGTTTGAACTGCGAATGTAACAGCTGTACTTTTCAACTTAAACGTGATTGCCCTCTGAATGGGCTTGCGTCCTCCAGGGATCTTGGTCAGACCAATCACTTTACAGTTGATATGCATGTCTTCAACACCAATGTACATTTTCATGATTCTTCAAGTGTTTTTGGAACTATTATACTGCCAGTATCCAGATACTTTCTTAACATTTCAGATGATCTTCTCGATTTGGTTGCCTCTGCTGAAGACTTGATGCTGGTGTCATCTTTGTTCACCAACTATTCTGGCGGGTTTCTTTGGAAACAATCATCAACAGATGTCTCACAGGTCTTGAACCTACGTGTAAGGAAGAGGGGTTTGGAGCCTTCTGGTTCTCAACTTGAAGTGAGCATAGGTATTCAACACACATACTGCATTTTACCGCCGGAATATCTAGCCATTATAATTGGCTATTTCTCTCTTTCTGACTGGACTTCAAAGTCTGGCCTGCAGTCATTGCCACAAGCTACTGAGTTGACCAAGGCTCATTCTGAGTTTGCCATTAGTTATAAAATTGAGATACTGGACTCCTCTATTGTTCTTCCTGTGGAAGGTGATGACCGCCGGCAACTGAAAGTTGACATTCAGCAGTTATATATTAGCTTTATTCCAGAGTGTGCGTTGAGCAATGTGGTGCAGCACATACCACAGGAATGTGTTATTCCACTTAATCAAGTACTAGGGCGAGCCGACTGTTTAAACATATTTGGGCGGGACTTATCAGTATCATTGCTGCTTTCTGAGAGTGACATATCAACATTCAAGAAGAACGCCGTGTGCAGAAGTATCACTCTGGCTGCTAGCATTATTGCTGATACTTGGATTAGATTCCCTTGTGATCACAATCCGTTAACGGAATTGGCATGTGTTATGTCAAGGGTTGACGTTTGTGAAATTGTTGTCGATGATTCAGATGCCTTGGATGGGTTTAAGGCATTTCTTGATGTGGTTGATCAGCTTTCTTTAGTCGATGAGGAATCAAAACTTTTCGTGTCTGATGTTCCTCAGTTTCTTCATACGAAGATGCGCCTAAAGCAAGAGTTGTCAGTTGCACCCCTGGAACCTTCCACAAGCTTTATAAAATTCAGAATTTTTGTCAATCTTTTGACGTCAAAACTGCATCGGTTAAGGAAAGCTCCTGGAACACTGCTATCCGAACCAGTGCTCCAAGCTGATATGAAATTTGTTTGCTCTGGAGAACTTAAAAATAATTTCCCTATGAGCTTGGATGTTCAGTTTTTCAAAATCGGGCTTTATTCATTACTGAGCTCAGTCATGTTAGCTAGATGCATCAATGCAGATGGGGATCCTTCTGCACTGAGAGTCAGATTTACGGAGCAGGCTGAAAATGAATACGATCTCTGTTTTTCTCTTCCATCCCTAGACATCTGGTTACACTTTTTTGATTGGATTGAAGTTATTGAACTTCTGAAATCTTATTCCCAGAAACTGGAAGACAGTAGTGAAGACCGTTTTTTCTCAAAAGGTTCAAAATTGGATATGGATGAATCTATTGGAGTGGTAAGGACTATTTGTGACAATACTGATCGGGTTTTGAATGTTCTGCAAACTGAGGTATCAGAGAACTCTAGTGAGGTAATGTCATTTGCCGCAAGATCAGAGAATATTGGTGTCAAAATCCATATTCCTCTTTGCACAAGCCATACAGAATTTCCAGGGTTCATGGCAACTGATGTTCATGAGATATCTGAGGAAGAGCACACAAATTGTTTTAAAGGGAATTACTGTAAATATGTTTCTGTTACAGCGTGTAGTAGAAGTGGCGAACTCTCTATTCTTGGGAGAGATGTCAAACTGAGCTATAAGATTGA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  • >AT5G24740.2
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CDS Sequence
Protein Sequence