Gene Details:
- Gene ID: AT5G24740
- Gene Symbol: SHBY
- Gene Name: SHRUBBY
- Description: vacuolar protein sorting-associated protein, putative (DUF1162);(source:Araport11)
- TAIR Accession: locus:2184565
- Genome: Araport11_genome_release
- Species: Arabidopsis thaliana
Transcripts:
Plant Ontology Annotations:
- PO:0000282 — trichome — tricoma (Spanish, exact), 毛茸、糸状体、毛 (Japanese, exact), seta (related), setae (related), capilli (narrow), capillus (narrow), cilia (narrow), cilium (narrow), glochid (narrow), glochidia (narrow), glochidium (narrow), hair (narrow), lepides (narrow), lepis (narrow), non-secretory trichome (narrow), scale (narrow), squama (narrow), squamae (narrow), squamella (narrow), squamellae (narrow), squamule (narrow), barb trichome (broad), bristle (broad)
- PO:0009005 — root — raíz (Spanish, exact), radices (exact, plural), radix (exact), 根 (Japanese, exact), aerial root (narrow), climbing root (narrow)
Gene Ontology:
- GO:0010015 — acts upstream of or within — root morphogenesis
- GO:0010082 — acts upstream of or within — regulation of root meristem growth
- GO:0019898 — is active in — extrinsic component of membrane
- GO:0045053 — involved in — protein retention in Golgi apparatus
- GO:0003674 — enables — molecular_function
- GO:0006623 — involved in — protein targeting to vacuole
- GO:1990064 — acts upstream of or within — ground tissue pattern formation
- GO:0005794 — located in — Golgi apparatus
Germplasm Phenotype:
- SALK_138092 — no visible developmental phenotypes were observed in homozygous plants
Function-related keywords:
Literature:
- Cell-specific protein profiling in Arabidopsis thaliana trichomes: identification of trichome-located proteins involved in sulfur metabolism and detoxification. DOI: 10.1016/j.phytochem.2004.03.026 ; PMID: 15276459
- Systematic identification of functional plant modules through the integration of complementary data sources. DOI: 10.1104/pp.112.196725 ; PMID: 22589469
- Identification of SHRUBBY, a SHORT-ROOT and SCARECROW interacting protein that controls root growth and radial patterning. DOI: 10.1242/dev.090761 ; PMID: 23444357
- Cell-specific protein profiling in Arabidopsis thaliana trichomes: identification of trichome-located proteins involved in sulfur metabolism and detoxification. DOI: 10.1016/j.phytochem.2004.03.026 ; PMID: 15276459
Sequences:
cDNA Sequence
- >AT5G24740.1
ATGCTTGAAGGATATGTGCAAGGATTTGTGAACCTGTTGTTAGGGTACTTAGGTCGTTACATTAAAGACATCCAGAAAGACCAGCTCAAGATCTCACTCTGGAATGGAGAAGTCTTATTGGAGAACGTGGAATTGAATCCTGAGGCGTTTGAGTATTTGCAGCTTCCAATTGCTCTCAAGCAAGGCCGTGTTGGGAAATTGAGCATTAAAATTCCATGGAAGAAACTTCATAGGGATCCTGTAACCATTATGATTGAAGATGTCTTTATATGTGCATCGCAACGCAATGATCAAGAGTGGAGTTCAGATGTCGTTGAGAAAAGAGAGTTTGCTGGTAAGAAAGCTAAACTTGCTTCTGCAGAACTGGCAAAATTGTCCAGGCGTGTCTTCGACAATCCAGGCGGAAATTCTTATATGTCATATATTACTGCCAAGATTCTTGATAGCGTTCAAGTGTCCATCAAAAATTTTCACATCTTATACTCAGATGCACAACCTGAATCGGGGCAAGTTGTATTAGGATTGCGGTTTTCAAGCTTGACAGTTACTAAACAAAACTCAGTTGGGCCATCAGTTGGTAGGGTGAGAGGGGGGCAAGTGAATATACTTGTGGAGGTTGAAGGTTTGGAAATATATTGTGACATGTATGAGGGAAACATGGACTTTCCAAGTGTTAATGAAAAAATAGGTTTTGACAATTGGTGCCAGTCAAGATTGCAAAGCAATAGATTTGGTTATTTACTGAAGCCAGTCCATGTTTCTGTAACGCTATTGGTCAATCGATCTGGAGAGCTTTATGACGATCTTCCTCAGTATTCTATCAGCGCTGAGTTGACTGATGTGGTGGTGACTCTGAATGAATTTCAATTGCAGCAGATTCTTATTCTGTTAGATTATTTGCAAACCAGCCAGTTGCGTGAGAGGTATGGGCGGTATCGTCCCTGCTCCACTTCTTTATCGAGGAAACCACCTGGATGGCAGAAACTTTGGTGGCACTATGCCCAAAATTCAGTTTTATCTGATTCAATCGATAAGTCCATCCGTTTGGGTTTGGAAGAATTGGAGAAGAAGTCTGATATTGATGATATCTTAAGTTATAGGTCTGCAGCGGAAGGTGAGATGCAGGAAGCTTGCTCAGAATTGACAGTAAACATGGGAGCGACTGGTGCCACTAGATCCGAAAAGGAACAGAGTGCCCCTGAAAAGGAACCGAGTGACGATCCTACATTAAATAAGTCGCGTGGGTGGTTGAACTGGTTGTCACGGGGAATGCTTGGTGCCGGAGGCACAGAGGATTCAAGTCAGTTTTCTGGTGTTGTTTCTGATGAAGTTGTCAAGGATATACACAAGGCAACAAAGTTTTACCCTCTTTCTTCATCTCCTAGAAATACAAGTGCAACTGGTAAGATCTGTACGTGCTCCATTCGACTCAACGTACGCAAATTTTCTGCTACTTTGCAACATATAAGTGGAAGTTCTTCTCAAGTTATTACAGAGTTGGACATTTTGGGGGTGATTGTTGAATGCAAGTCTTGGAAAGATTCTACAGCCATGATTTTATCTGTTATTTCTGGAAGGCTGGTCTATCCTCACAATGGGAAAGAAATTTTAACCATGAAAAGGGTCTGTTCTCAGAGTGATACACTAGAAACGAAACCCTCATATGGAGCGCGGTTGGAGTTGTCTAAAGATCATGATGTTGCATTGTCATTAAAGGCCACCCTTCAACCACTTGAAGCCGCTTATGATGGAGGCTTCATTCTAGCTGTCAGTAATTTTTTCTCGGGTTCAAGATACTTCAAACTCCAACATGAAAGGATTTTATCATCACTCAATGGCCTTGAAAGTGAAACGCGATTGGCAGCGAAAGCTGAATACCTCTTATCAAGCCGAAATAAAGTTAAGTGGGATCTGGACATAAAAGATCTTACCTTAAGTTTCCCTGGACGATTGGTTGAATCAGAAAGCTATAATCTGGTTCTGGTATTGGAATCTCTTTCTATCACATCTAGTAGCACAGATGCTCTTAGCCAAATTCCAAGATTGCAGTCTGATGTGGACCATGTGGTCAATAGCTTACAAAGTTCCGTTGAAGCTTTGGATGCTTTTCAAGTCAAAGATCTCTACGACCATTTTGATATCAAAATCTGTAACCTTGAGATGAAGCTCATGAAGATTCATCCTTTCCAAGAACTTCCCCTTGTGGAGAAATCATCTTTACTTATCAAGTTTGCGTCTTGTATAATTCCGGAGGAGTCGATTTTGAAGCAGTTGGAGGTTGAAGCTACTCTGCCTATGTTCAATGTCCATTTCTCTCCGTCAATATTTAAAGGAGTCATGTCTGTGATTGAATATCTTGATATTCAGGATCATGGAACTCGAAATCCTCCACCTTCCCCTGCTCCCATCTTTCACTTCACCATCAAAACCGACTTGGCATTTTTAAGGTTGCACGTCAATCTCGAAAATAAAGGAGAAAATAGCACAGTGCTTGTTCTTTCTATACAGCAGCTTGATCTCTGGTATTCACGTGCTATATTTGAAGAGTGGTCAGTCCGTGCGAAAACATTGGAAATAACAGCTTGCTCCTCTAAAGATGCAGCTGACAGTCATATTTTATGTTCATCTGGAAATCTACTCAAATCGTCTTCCCATGGACATGGGATGGATGCTCATACTAGCGATGAAACCAACATTATTGACTACAGAACAACTCCTGAAGCTGCTATCAGCTTAAATTGCAAGGTTTCTCAAAGTAAAAGTTTTATTTTTCACAAGTATACAGTCTATTGGAGGAGCGCCGAGCTCCATTGCTACCCATACATATTTGGTTTGCTGACAAATTTTTTGGATAAGATAGCTTCCTATAAGATCTCGTCTAGCTATACAAATCCATCTAGCCTTGCTACAGATACCATTGCTCCAACAGAAATACCTCAGTTTGATTTTGAAAGGTTTGGATTCTCAAACTTCACTGAAAGTAGATCTTGTGGCTGCATTCCTCTTGACAAATTTCCATTTGTAACCATTAACAATTCGGGTTCTCTTCATAGCCTAGAAAGTTCTCTGTGTTATTCGACTTCTGACTGGAGGAAGTTATTTATATTAAAGAATAGAAAGGATGGGGCACAAATAGGTTTGAACTGCGAATGTAACAGCTGTACTTTTCAACTTAAACGTGATTGCCCTCTGAATGGGCTTGCGTCCTCCAGGGATCTTGGTCAGACCAATCACTTTACAGTTGATATGCATGTCTTCAACACCAATGTACATTTTCATGATTCTTCAAGTGTTTTTGGAACTATTATACTGCCAGTATCCAGATACTTTCTTAACATTTCAGATGATCTTCTCGATTTGGTTGCCTCTGCTGAAGACTTGATGCTGGTGTCATCTTTGTTCACCAACTATTCTGGCGGGTTTCTTTGGAAACAATCATCAACAGATGTCTCACAGGTCTTGAACCTACGTGTAAGGAAGAGGGGTTTGGAGCCTTCTGGTTCTCAACTTGAAGTGAGCATAGGTATTCAACACACATACTGCATTTTACCGCCGGAATATCTAGCCATTATAATTGGCTATTTCTCTCTTTCTGACTGGACTTCAAAGTCTGGCCTGCAGTCATTGCCACAAGCTACTGAGTTGACCAAGGCTCATTCTGAGTTTGCCATTAGTTATAAAATTGAGATACTGGACTCCTCTATTGTTCTTCCTGTGGAAGGTGATGACCGCCGGCAACTGAAAGTTGACATTCAGCAGTTATATATTAGCTTTATTCCAGAGTGTGCGTTGAGCAATGTGGTGCAGCACATACCACAGGAATGTGTTATTCCACTTAATCAAGTACTAGGGCGAGCCGACTGTTTAAACATATTTGGGCGGGACTTATCAGTATCATTGCTGCTTTCTGAGAGTGACATATCAACATTCAAGAAGAACGCCGTGTGCAGAAGTATCACTCTGGCTGCTAGCATTATTGCTGATACTTGGATTAGATTCCCTTGTGATCACAATCCGTTAACGGAATTGGCATGTGTTATGTCAAGGGTTGACGTTTGTGAAATTGTTGTCGATGATTCAGATGCCTTGGATGGGTTTAAGGCATTTCTTGATGTGGTTGATCAGCTTTCTTTAGTCGATGAGGAATCAAAACTTTTCGTGTCTGATGTTCCTCAGTTTCTTCATACGAAGATGCGCCTAAAGCAAGAGTTGTCAGTTGCACCCCTGGAACCTTCCACAAGCTTTATAAAATTCAGAATTTTTGTCAATCTTTTGACGTCAAAACTGCATCGGTTAAGGAAAGCTCCTGGAACACTGCTATCCGAACCAGTGCTCCAAGCTGATATGAAATTTGTTTGCTCTGGAGAACTTAAAAATAATTTCCCTATGAGCTTGGATGTTCAGTTTTTCAAAATCGGGCTTTATTCATTACTGAGCTCAGTCATGTTAGCTAGATGCATCAATGCAGATGGGGATCCTTCTGCACTGAGAGTCAGATTTACGGAGCAGGCTGAAAATGAATACGATCTCTGTTTTTCTCTTCCATCCCTAGACATCTGGTTACACTTTTTTGATTGGATTGAAGTTATTGAACTTCTGAAATCTTATTCCCAGAAACTGGAAGACAGTAGTGAAGACCGTTTTTTCTCAAAAGGTTCAAAATTGGATATGGATGAATCTATTGGAGTGGTAAGGACTATTTGTGACAATACTGATCGGGTTTTGAATGTTCTGCAAACTGAGGTATCAGAGAACTCTAGTGAGGTAATGTCATTTGCCGCAAGATCAGAGAATATTGGTGTCAAAATCCATATTCCTCTTTGCACAAGCCATACAGAATTTCCAGGGTTCATGGCAACTGATGTTCATGAGATATCTGAGGAAGAGCACACAAATTGTTTTAAAGGGAATTACTGTAAATATGTTTCTGTTACAGCGTGTAGTAGAAGTGGCGAACTCTCTATTCTTGGGAGAGATGTCAAACTGAGCTATAAGATTGA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CDS Sequence
Protein Sequence