Information report for AT5G16190
Gene Details
|
|
Functional Descriptions
- PO:0009005 — root — raíz (Spanish, exact), radices (exact, plural), radix (exact), 根 (Japanese, exact), aerial root (narrow), climbing root (narrow)
Functional Keywords
Literature and News
Gene Resources
- UniProt: A0A1P8BCC7
- EMBL: CP002688
- AlphaFoldDB: A0A1P8BCC7
- EnsemblPlants: AT5G16190.3
- Gramene: AT5G16190.3
- Orthologous matrix: RWTMSEI
- ExpressionAtlas: AT5G16190
- InterPro: IPR001173, IPR029044
- PANTHER: PTHR32044, PTHR32044:SF54
- SUPFAM: SSF53448
- Gene3D: 3.90.550.10
- SWISS-MODEL: A0A1P8BCC7
- Conserved Domain Database: cd06437
Sequences
cDNA Sequence
- >AT5G16190.3
GGTCCTTTTTTCTCATCTTGTTGTTCCCACTAGCTATGATCATGTTCTAGATCAGGTCCACAGATTTCCGGTAAAACGACGACGAATCAAAATAGAAACAAAAACTAAGACAAATTCCTTACTTAATTCAACAAAAAAAAAGAGAATCTCTGTAAAAGTCAGACACTTATAGACAGAACAAGAAAAACCCATTTCTAAAATCATCTCCTCTTCCTTCAAAAACTCTATCTCTCACTCCCACTTCTTGGTTCTAAGAAGAATAGTTAAATTTCTTTTGCGAAGAATAGTTCAGGATGCAGCTGCGACTTTCGAAAAGCTTGAAGCATATATAATGGTGTAAAGACTAAAGAGTAAAGATAATTAAGCATGAAGACGATGTGGTGGAGAGATATGAGAAGTCTACTTATAGTTCCAATGTTCAAGTGTTTGGTGGCTATATGTTTGGTCATCTCACTATTAGTTTTCGTAGAAAGTTTATATATGAACATTGTAGTAATCTACGTCAAGTTGTGTAAACGCAAACCCGAGAAGATTTACAAATGGGAGGCAATGCAAGAGGACTTGGAGCTCGGAAATCAAAACTTTCCCATGGTTCTTGTCCAAATCCCAATGTACAACGAACGAGAGGTGTTTAAGTTATCCATTGGTGCTGCTTGCAGACTCATATGGCCATTGGATCGACTAATCGTTCAAGTTTTAGATGATTCCACTGATCCCACCATCATGGAAATGGTAAGCACAGAGTGTGGAAAATGGGCAACCAAAGGCATAAACATAAAATGTGAGAGGAGAGACAATAGAAATGGCTATAAGGCTGGAGCTCTTAAACAAGGTATGAGGCATAGTTACGTCAAAACATGCACCTACATTGCAATCTTCGATGCTGATTTTCAGCCAGAGCCCGACTACCTCGAACGCACTGTCCCATTTCTTATCCACAATCCCGAACTCGCTCTTGTTCAAGCTCGATGGAAATTTGTGAACGCAAAGAAGTGCTTGATGACTAGGATGCAGGAGATGTCCCTCAATTACCATTTCACGGCAGAGCAAGAATCCGGATCCACTAGACATGCCTTCTTTGGCTTTAATGGGACTGCGGGTGTATGGAGACTGGCGGCGATGGAAGAAGCTGGTGGTTGGAAAGACCGGACCACCGTAGAGGACATGGACTTGGCCGTTCGTGTAGGTCTACACGGCTGGAAATTTGTCTTTGTCAACGATGTTTCGGTGAAAAGTGAGCTACCAAGCCAATTTAAGGCATTCAGATTCCAGCAACATCGATGGTCATGCGGTCCAGCTAATCTCTTCAGAAAAATGACTATGGAAATTATTCGCAATAAGAGAGTGACGATTTGGAAGAAATTGTATGTGATCTATAGTTTCTTTTTCGTAAGGAAGATCATAGTCCATTTCTTCACTTTCTTCTTCTATTGTTTCATTCTTCCTACGAGCGTATTCTTTCCCGAAGTCAACATTCCGACTTGGTCAACCGTTTATTTTCCTTTTATGATCACTCTATTCAATGCCATTGCCACACCAAGATCTTTCTACCTCGTGATTTTTTGGGTCTTATTCGAGAATGTAATGGCTATGCATCGGACCAAAGGCACTTTCATCGGTTTACTTGAAGGAGGGAGAGTTAACGAATGGGTCGTCACCGAGAAATTAGGTGATGCGCTTGAGACTAAGTTACTTCCCCAAGTAAGAAAACCTCGCAACGGGTTTCTCGAAAGGATAAACTCAAAAGAGATGATGGTGGGGATATACATATTGTGCTGTGCATCATATAACCTTGTCTTTGGGAAGACAGTGTTATATATCTATCTTTACATGCAGGCTCTTGCTTTTATTATTGCCGGAATTGGTTTTATAGGAACTTGATAAGTGTAATTAGTAATTTATATATCCGTTAGTATTCTCGTTCTTTTCTTTTTCATATTTCAGAATAAGTAGGTGAATTATTTTATTTAATACAATTCTTATTCATTAATATCTTTATTTTTTTGTACAGTGTTAATTAGTCCATATGTTTATATAGTGCGTGTAAGATTCTTGAGTACGCACATTGTAATTTGTTGTATGATCATTAGTTTCCTC - >AT5G16190.2
GGTCCTTTTTTCTCATCTTGTTGTTCCCACTAGCTATGATCATGTTCTAGATCAGGTCCACAGATTTCCGGTAAAACGACGACGAATCAAAATAGAAACAAAAACTAAGACAAATTCCTTACTTAATTCAACAAAAAAAAAGAGAATCTCTGTAAAAGTCAGACACTTATAGACAGAACAAGAAAAACCCATTTCTAAAATCATCTCCTCTTCCTTCAAAAACTCTATCTCTCACTCCCACTTCTTGGTTCTAAGAAGAATAGTTAAATTTCTTTTGCGAAGAATAGTTCAGGATGCAGCTGCGACTTTCGAAAAGCTTGAAGCATATATAATGGTGTAAAGACTAAAGAGTAAAGATAATTAAGCATGAAGACGATGTGGTGGAGAGATATGAGAAGTCTACTTATAGTTCCAATGTTCAAGTGTTTGGTGGCTATATGTTTGGTCATCTCACTATTAGTTTTCGTAGAAAGTTTATATATGAACATTGTAGTAATCTACGTCAAGTTGTGTAAACGCAAACCCGAGAAGATTTACAAATGGGAGGCAATGCAAGAGGACTTGGAGCTCGGAAATCAAAACTTTCCCATGGTTCTTGTCCAAATCCCAATGTACAACGAACGAGAGGTGTTTAAGTTATCCATTGGTGCTGCTTGCAGACTCATATGGCCATTGGATCGACTAATCGTTCAAGTTTTAGATGATTCCACTGATCCCACCATCATGGAAATGGTAAGCACAGAGTGTGGAAAATGGGCAACCAAAGGCATAAACATAAAATGTGAGAGGAGAGACAATAGAAATGGCTATAAGGCTGGAGCTCTTAAACAAGGTATGAGGCATAGTTACGTCAAAACATGCACCTACATTGCAATCTTCGATGCTGATTTTCAGCCAGAGCCCGACTACCTCGAACGCACTGTCCCATTTCTTATCCACAATCCCGAACTCGCTCTTGTTCAAGCTCGATGGAAATTTGTGAACGCAAAGAAGTGCTTGATGACTAGGATGCAGGAGATGTCCCTCAATTACCATTTCACGGCAGAGCAAGAATCCGGATCCACTAGACATGCCTTCTTTGGCTTTAATGGGACTGCGGGTGTATGGAGACTGGCGGCGATGGAAGAAGCTGGTGGTTGGAAAGACCGGACCACCGTAGAGGACATGGACTTGGCCGTTCGTGTAGGTCTACACGGCTGGAAATTTGTCTTTGTCAACGATGTTTCGGTGAAAAGTGAGCTACCAAGCCAATTTAAGGCATTCAGATTCCAGCAACATCGATGGTCATGCGGTCCAGCTAATCTCTTCAGAAAAATGACTATGGAAATTATTCGCAATAAGAGAGTGACGATTTGGAAGAAATTGTATGTGATCTATAGTTTCTTTTTCGTAAGGAAGATCATAGTCCATTTCTTCACTTTCTTCTTCTATTGTTTCATTCTTCCTACGAGCGTATTCTTTCCCGAAGTCAACATTCCGACTTGGTCAACCGTTTATTTTCCTTTTATGATCACTCTATTCAATGCCATTGCCACACCAAGATCTTTCTACCTCGTGATTTTTTGGGTCTTATTCGAGAATGTAATGGCTATGCATCGGACCAAAGGCACTTTCATCGGTTTACTTGAAGGAGGGAGAGTTAACGAATGGGTCGTCACCGAGAAATTAGGTGATGCGCTTGAGACTAAGTTACTTCCCCAAGTAAGAAAACCTCGCAACGGGTTTCTCGAAAGGATAAACTCAAAAGAGATGATGGTGGGGATATACATATTGTGCTGTGCATCATATAACCTTGTCTTTGGGAAGACAGTGTTATATATCTATCTTTACATGCAGGCTCTTGCTTTTATTATTGCCGGAATTGGTTTTATAGGAACTTGATAAGTGTAATTAGTAATTTATATATCCGTTAGTATTCTCGTTCTTTTCTTTTTCATATTTCAGAATAAGTAGGTGAATTATTTTATTTAATACAATTCTTATTCATTAATATCTTTATTTTTTTGTACAGTGTTAATTAGTCCATATGTTTATATAGTGCGTGTAAGATTCTTGAGTACGCACATTGTAATTTGTTGTATGATCATTAGTTTCCTC - >AT5G16190.1
GGTCCTTTTTTCTCATCTTGTTGTTCCCACTAGCTATGATCATGTTCTAGATCAGGTCCACAGATTTCCGGTAAAACGACGACGAATCAAAATAGAAACAAAAACTAAGACAAATTCCTTACTTAATTCAACAAAAAAAAAGAGAATCTCTGTAAAAGTCAGACACTTATAGACAGAACAAGAAAAACCCATTTCTAAAATCATCTCCTCTTCCTTCAAAAACTCTATCTCTCACTCCCACTTCTTGGTTCTAAGAAGAATAGTTAAATTTCTTTTGCGAAGAATAGTTCAGGATGCAGCTGCGACTTTCGAAAAGCTTGAAGCATATATAATGGTGTAAAGACTAAAGAGTAAAGATAATTAAGCATGAAGACGATGTGGTGGAGAGATATGAGAAGTCTACTTATAGTTCCAATGTTCAAGTGTTTGGTGGCTATATGTTTGGTCATCTCACTATTAGTTTTCGTAGAAAGTTTATATATGAACATTGTAGTAATCTACGTCAAGTTGTGTAAACGCAAACCCGAGAAGATTTACAAATGGGAGGCAATGCAAGAGGACTTGGAGCTCGGAAATCAAAACTTTCCCATGGTTCTTGTCCAAATCCCAATGTACAACGAACGAGAGGTGTTTAAGTTATCCATTGGTGCTGCTTGCAGACTCATATGGCCATTGGATCGACTAATCGTTCAAGTTTTAGATGATTCCACTGATCCCACCATCATGGAAATGGTAAGCACAGAGTGTGGAAAATGGGCAACCAAAGGCATAAACATAAAATGTGAGAGGAGAGACAATAGAAATGGCTATAAGGCTGGAGCTCTTAAACAAGGTATGAGGCATAGTTACGTCAAAACATGCACCTACATTGCAATCTTCGATGCTGATTTTCAGCCAGAGCCCGACTACCTCGAACGCACTGTCCCATTTCTTATCCACAATCCCGAACTCGCTCTTGTTCAAGCTCGATGGAAATTTGTGAACGCAAAGAAGTGCTTGATGACTAGGATGCAGGAGATGTCCCTCAATTACCATTTCACGGCAGAGCAAGAATCCGGATCCACTAGACATGCCTTCTTTGGCTTTAATGGGACTGCGGGTGTATGGAGACTGGCGGCGATGGAAGAAGCTGGTGGTTGGAAAGACCGGACCACCGTAGAGGACATGGACTTGGCCGTTCGTGTAGGTCTACACGGCTGGAAATTTGTCTTTGTCAACGATGTTTCGGTGAAAAGTGAGCTACCAAGCCAATTTAAGGCATTCAGATTCCAGCAACATCGATGGTCATGCGGTCCAGCTAATCTCTTCAGAAAAATGACTATGGAAATTATTCGCAATAAGAGAGTGACGATTTGGAAGAAATTGTATGTGATCTATAGTTTCTTTTTCGTAAGGAAGATCATAGTCCATTTCTTCACTTTCTTCTTCTATTGTTTCATTCTTCCTACGAGCGTATTCTTTCCCGAAGTCAACATTCCGACTTGGTCAACCGTTTATTTTCCTTTTATGATCACTCTATTCAATGCCATTGCCACACCAAGATCTTTCTACCTCGTGATTTTTTGGGTCTTATTCGAGAATGTAATGGCTATGCATCGGACCAAAGGCACTTTCATCGGTTTACTTGAAGGAGGGAGAGTTAACGAATGGGTCGTCACCGAGAAATTAGGTGATGCGCTTGAGACTAAGTTACTTCCCCAAGTAAGAAAACCTCGCAACGGGTTTCTCGAAAGGATAAACTCAAAAGAGATGATGGTGGGGATATACATATTGTGCTGTGCATCATATAACCTTGTCTTTGGGAAGACAGTGTTATATATCTATCTTTACATGCAGGCTCTTGCTTTTATTATTGCCGGAATTGGTTTTATAGGAACTTGATAAGTGTAATTAGTAATTTATATATCCGTTAGTATTCTCGTTCTTTTCTTTTTCATATTTCAGAATAAGTAGGTGAATTATTTTATTTAATACAATTCTTATTCATTAATATCTTTATTTTTTTGTACAGTGTTAATTAGTCCATATGTTTATATAGTGCGTGTAAGATTCTTGAGTACGCACATTGTAATTTGTTGTATGATCATTAGTTTCCTC - >AT5G16190.4
GGTCCTTTTTTCTCATCTTGTTGTTCCCACTAGCTATGATCATGTTCTAGATCAGGTCCACAGATTTCCGGTAAAACGACGACGAATCAAAATAGAAACAAAAACTAAGACAAATTCCTTACTTAATTCAACAAAAAAAAAGAGAATCTCTGTAAAAGTCAGACACTTATAGACAGAACAAGAAAAACCCATTTCTAAAATCATCTCCTCTTCCTTCAAAAACTCTATCTCTCACTCCCACTTCTTGGTTCTAAGAAGAATAGTTAAATTTCTTTTGCGAAGAATAGTTCAGGATGCAGCTGCGACTTTCGAAAAGCTTGAAGCATATATAATGGTGTAAAGACTAAAGAGTAAAGATAATTAAGCATGAAGACGATGTGGTGGAGAGATATGAGAAGTCTACTTATAGTTCCAATGTTCAAGTGTTTGGTGGCTATATGTTTGGTCATCTCACTATTAGTTTTCGTAGAAAGTTTATATATGAACATTGTAGTAATCTACGTCAAGTTGTGTAAACGCAAACCCGAGAAGATTTACAAATGGGAGGCAATGCAAGAGGACTTGGAGCTCGGAAATCAAAACTTTCCCATGGTTCTTGTCCAAATCCCAATGTACAACGAACGAGAGGTGTTTAAGTTATCCATTGGTGCTGCTTGCAGACTCATATGGCCATTGGATCGACTAATCGTTCAAGTTTTAGATGATTCCACTGATCCCACCATCATGGAAATGGTAAGCACAGAGTGTGGAAAATGGGCAACCAAAGGCATAAACATAAAATGTGAGAGGAGAGACAATAGAAATGGCTATAAGGCTGGAGCTCTTAAACAAGGTATGAGGCATAGTTACGTCAAAACATGCACCTACATTGCAATCTTCGATGCTGATTTTCAGCCAGAGCCCGACTACCTCGAACGCACTGTCCCATTTCTTATCCACAATCCCGAACTCGCTCTTGTTCAAGCTCGATGGAAATTTGTGAACGCAAAGAAGTGCTTGATGACTAGGATGCAGGAGATGTCCCTCAATTACCATTTCACGGCAGAGCAAGAATCCGGATCCACTAGACATGCCTTCTTTGGCTTTAATGGGACTGCGGGTGTATGGAGACTGGCGGCGATGGAAGAAGCTGGTGGTTGGAAAGACCGGACCACCGTAGAGGACATGGACTTGGCCGTTCGTGTAGGTCTACACGGCTGGAAATTTGTCTTTGTCAACGATGTTTCGGTGAAAAGTGAGCTACCAAGCCAATTTAAGGCATTCAGATTCCAGCAACATCGATGGTCATGCGGTCCAGCTAATCTCTTCAGAAAAATGACTATGGAAATTATTCGCAATAAGAGAGTGACGATTTGGAAGAAATTGTATGTGATCTATAGTTTCTTTTTCGTAAGGAAGATCATAGTCCATTTCTTCACTTTCTTCTTCTATTGTTTCATTCTTCCTACGAGCGTATTCTTTCCCGAAGTCAACATTCCGACTTGGTCAACCGTTTATTTTCCTTTTATGATCACTCTATTCAATGCCATTGCCACACCAAGATCTTTCTACCTCGTGATTTTTTGGGTCTTATTCGAGAATGTAATGGCTATGCATCGGACCAAAGGCACTTTCATCGGTTTACTTGAAGGAGGGAGAGTTAACGAATGGGTCGTCACCGAGAAATTAGGTGATGCGCTTGAGACTAAGTTACTTCCCCAAGTAAGAAAACCTCGCAACGGGTTTCTCGAAAGGATAAACTCAAAAGAGATGATGGTGGGGATATACATATTGTGCTGTGCATCATATAACCTTGTCTTTGGGAAGACAGTGTTATATATCTATCTTTACATGCAGGCTCTTGCTTTTATTATTGCCGGAATTGGTTTTATAGGAACTTGATAAGTGTAATTAGTAATTTATATATCCGTTAGTATTCTCGTTCTTTTCTTTTTCATATTTCAGAATAAGTAGGTGAATTATTTTATTTAATACAATTCTTATTCATTAATATCTTTATTTTTTTGTACAGTGTTAATTAGTCCATATGTTTATATAGTGCGTGTAAGATTCTTGAGTACGCACATTGTAATTTGTTGTATGATCATTAGTTTCCTC
CDS Sequence
Protein Sequence