Information report for AT5G11790
Gene Details
|
|
Functional Descriptions
- PO:0009005 — root — raíz (Spanish, exact), radices (exact, plural), radix (exact), 根 (Japanese, exact), aerial root (narrow), climbing root (narrow)
Functional Keywords
Literature and News
- Conservation and divergence of microRNAs in Populus. DOI: 10.1186/1471-2164-8-481 ; PMID: 18166134
- Global analysis of Arabidopsis gene expression uncovers a complex array of changes impacting pathogen response and cell cycle during geminivirus infection. DOI: 10.1104/pp.108.121038 ; PMID: 18650403
- Transcriptional profiling of mature Arabidopsis trichomes reveals that NOECK encodes the MIXTA-like transcriptional regulator MYB106. DOI: 10.1104/pp.108.126979 ; PMID: 18805951
- Transcriptome analyses show changes in gene expression to accompany pollen germination and tube growth in Arabidopsis. DOI: 10.1104/pp.108.126375 ; PMID: 18775970
- Arabidopsis N-MYC DOWNREGULATED-LIKE1, a positive regulator of auxin transport in a G protein-mediated pathway. DOI: 10.1105/tpc.109.065557 ; PMID: 19948787
- Endogenous Arabidopsis messenger RNAs transported to distant tissues. DOI: 10.1038/nplants.2015.25 ; PMID: 27247031
- Arabidopsis NDL-AGB1 modules Play Role in Abiotic Stress and Hormonal Responses Along with Their Specific Functions. DOI: 10.3390/ijms20194736 ; PMID: 31554237
Gene Resources
- UniProt: A0A1P8BGH7
- EMBL: CP002688
- AlphaFoldDB: A0A1P8BGH7
- EnsemblPlants: AT5G11790.2
- Gramene: AT5G11790.2
- ExpressionAtlas: AT5G11790
- InterPro: IPR004142, IPR029058
- PANTHER: PTHR11034
- SUPFAM: SSF53474
- Gene3D: 3.40.50.1820
- OrthoDB: A0A1P8BGH7
- SWISS-MODEL: A0A1P8BGH7
Sequences
cDNA Sequence
- >AT5G11790.2
GATTTTATTTTTATGCAAGGTCCTACATTAAACCGAGTCGACCGTCGGTGACTCAGTTACGAGTCTCGCGTTAACGAGTTCTTCTCTCCCTGGTTTTTTGTTTTTATATTTTATTTTAGTCTCACAAGTCTTCTCTATTTATAAACACAAAAAAACGAAGATAGCCATCGTTTTGGTGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAAGAAGGCCATGGAAAGATAATACTCTGCTTTTTTTTTAGAAATATACAGAGGAAATAAAGAGAGAGAGAAGGAGATGGCGGATTCAAGCGATTCTGTCTCCATTGATATGGAGGCATTGTCTCTTGGAGGACAGGTATGTTTTTTTCTGGTCTTTTATAGTGAGTTTAAGGAGATTCTGTTTTGGTTTACTAAGAAATTACGGGAAGAAGAAGAAGATAGGATAAATTGTATTTGTTGATTTTTGTTTTTGGTTACTGCATTCTTCGAGCTGCTTTGTTCCTGTTAATCATTGTTTTGATTACGAGAAGTAGTTTTTAGGAATCGTTTGTTACTAAAACAATGCTGGGAAATGTTCATGTTGCTAGAGCTGACATTAGAATATCATGTTTTGGTGTCGGTTATATATATCCAAAATTACGACTTGTGTTGTCGATAACCCAATTCGTTTTGTTTTTTTTGGGATTTTGTATGTTCTGAGTTTTTTCTGTTGGGTTCTAATGTCTTCCCTCAATTCATGGTTTAGTTGACACCTTAATTTGGAACATGTGTATTTGATCCAATTCTTGTTCTATTGGATCACAACTCACAAGTGAATATATAACTCTTGGATTTTCCAAATTCGTTTTTGCATTGTTCTAAGGTTCTCAAGAGTTTTTTTTCTTCTTTCTATAATGAGGTTTTGGGTTCCACTGTTAATGGTTAAATTCCCTTTTTGTTTGACCATGACTTATTTGCTGGTTAATGCGTATATGATTTTATGGCAAAGTTTGGTACTTTTTAAGTTGCTCACTAATCAATTTATTTTTCTCATATTGGAATTAATGTTTCTAGGAACACCTTGTGGAGACTACTTATGGCCCGGTTTGTGTTGCCGTTTGTGGAGATCCAGATAAACCAGCTCTTATCACTTATCCTGATATAGCTCTTAATTATATGTTCTGTTTTCAAGGATTATTGTTTTGTCCAGAAGCTAGTTCTTTGTTACTCCACAACTTTTGCATATATCACATCAGTCCTCTTGGCCATGAGTTGGGAGCTCCAATGATCAGTGTTGATGCTCCTTTGCTCTCAGCTGATGACTTAGCAGACCAGATAGTCGAGGTTCTTAATTATTTCGGACTTGGTGCAGTAATGTGTATGGGTGTCACAGCAGGAGCATACATTCTGACCTTATTTGCTATGAAGTACAGGCAGAGAGTTCTGGGCTTAATTCTCGTCTCTCCACTGTGCCAAGCGCCTTCTTGGTCAGAATGGTTGTGCAATAAGGTCATGTCTAATTTGCTTTACTATTATGGTACATGTGGAGTTGTTAAGGAAATGTTACTAAAACGGTACTTCAGCAAGGAAGTTCGTGGTAATGGTCATGTTCCAGAATCAGATATTGTTCAAGAATGCAGAAGATTACTTAGTGAGCGGCAGAGTACAAATGTATGGAGATTCCTTGAGGCAATCAACGGGAGAGTGGATCTTAGTGAAGGGTTAAGGAAATTGCAATGCAGAACGTTAATATTCATTGGTGAAAATTCTGCCTACCACTCCGAGGCTGTTCACATGACCACCAAACTAGACAGACGATACGGTGCATTAGTCGAGGTGCAGGGAAGCGGGTCGTTGGTGAGCGAAGAACAGCCACAGGCGATGATAATACCAATGGAATACTTTTTGATGGGATATGGCCTGTATCGTCCTACACAGAGCGTAAGTCCAAGAAGTCCTTTGAGCCCAACCCGAATCTCTCCGGAGCTTCTCTCCCCTGAAAACATGGGGTTGAAACTCAAGCCGATAAAGACACGACTCGCTCTATAGCCCTGCCTCCTCTGCTACACACATTTACATATACGACATGTGTCACCACATCAAAATCACCATTGTTGGATTGGAGCTGTTCCTCTGTTATGATTTGAGCTGTAGATATAGACAGAGATATATTGATCATCTATATATAGAAAGAGAGGGAGATGAAGAAGAGTAAAAAAAGGGGATGGGGAAGGGATTGATATATGGTAGAGTGAAAAACCGCCATTTATTTTTAATTTGGACGTTTAATACCTCTAGTATTTAATTTGGAAGAAAAATACCTTAATTAATTTTGGTTACCTATCAAAAAGTTGGTATAATCGTACCTCCGAGTTAACTTCCGTCAACTACCCTAACGGAAACATATTCGTATAATCAAGAAAAGCGATTGTACTTATTTACATAATTAACATGAGTTAAGTTTTAACCACAGTTAACAATTCCGTTAGGGTAGTTAACGGAAGTTAACTCGAAGGTAAGATTATACCAACTTTTTAAAAAACGAAAGTTTTAATAAGTAACCAAAATTAACTAAGGTGTTTTTCTTCCAAATTAAATAGTAGAGGTATTAAACGGGAAAATTAAAAGTAAATGATGGTTTTTTAGGTTTTCTCCCTTTACAGATATATTATATTTTGATTCATTAAACTTGTCTTAAAGGTTTATTTTGTGGTAGCTCTTCTTGTTCTGTACATTCAGTTGAATAAAAATCATCCCCTTACTATTTTA - >AT5G11790.1
GATTTTATTTTTATGCAAGGTCCTACATTAAACCGAGTCGACCGTCGGTGACTCAGTTACGAGTCTCGCGTTAACGAGTTCTTCTCTCCCTGGTTTTTTGTTTTTATATTTTATTTTAGTCTCACAAGTCTTCTCTATTTATAAACACAAAAAAACGAAGATAGCCATCGTTTTGGTGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAAGAAGGCCATGGAAAGATAATACTCTGCTTTTTTTTTAGAAATATACAGAGGAAATAAAGAGAGAGAGAAGGAGATGGCGGATTCAAGCGATTCTGTCTCCATTGATATGGAGGCATTGTCTCTTGGAGGACAGGTATGTTTTTTTCTGGTCTTTTATAGTGAGTTTAAGGAGATTCTGTTTTGGTTTACTAAGAAATTACGGGAAGAAGAAGAAGATAGGATAAATTGTATTTGTTGATTTTTGTTTTTGGTTACTGCATTCTTCGAGCTGCTTTGTTCCTGTTAATCATTGTTTTGATTACGAGAAGTAGTTTTTAGGAATCGTTTGTTACTAAAACAATGCTGGGAAATGTTCATGTTGCTAGAGCTGACATTAGAATATCATGTTTTGGTGTCGGTTATATATATCCAAAATTACGACTTGTGTTGTCGATAACCCAATTCGTTTTGTTTTTTTTGGGATTTTGTATGTTCTGAGTTTTTTCTGTTGGGTTCTAATGTCTTCCCTCAATTCATGGTTTAGTTGACACCTTAATTTGGAACATGTGTATTTGATCCAATTCTTGTTCTATTGGATCACAACTCACAAGTGAATATATAACTCTTGGATTTTCCAAATTCGTTTTTGCATTGTTCTAAGGTTCTCAAGAGTTTTTTTTCTTCTTTCTATAATGAGGTTTTGGGTTCCACTGTTAATGGTTAAATTCCCTTTTTGTTTGACCATGACTTATTTGCTGGTTAATGCGTATATGATTTTATGGCAAAGTTTGGTACTTTTTAAGTTGCTCACTAATCAATTTATTTTTCTCATATTGGAATTAATGTTTCTAGGAACACCTTGTGGAGACTACTTATGGCCCGGTTTGTGTTGCCGTTTGTGGAGATCCAGATAAACCAGCTCTTATCACTTATCCTGATATAGCTCTTAATTATATGTTCTGTTTTCAAGGATTATTGTTTTGTCCAGAAGCTAGTTCTTTGTTACTCCACAACTTTTGCATATATCACATCAGTCCTCTTGGCCATGAGTTGGGAGCTCCAATGATCAGTGTTGATGCTCCTTTGCTCTCAGCTGATGACTTAGCAGACCAGATAGTCGAGGTTCTTAATTATTTCGGACTTGGTGCAGTAATGTGTATGGGTGTCACAGCAGGAGCATACATTCTGACCTTATTTGCTATGAAGTACAGGCAGAGAGTTCTGGGCTTAATTCTCGTCTCTCCACTGTGCCAAGCGCCTTCTTGGTCAGAATGGTTGTGCAATAAGGTCATGTCTAATTTGCTTTACTATTATGGTACATGTGGAGTTGTTAAGGAAATGTTACTAAAACGGTACTTCAGCAAGGAAGTTCGTGGTAATGGTCATGTTCCAGAATCAGATATTGTTCAAGAATGCAGAAGATTACTTAGTGAGCGGCAGAGTACAAATGTATGGAGATTCCTTGAGGCAATCAACGGGAGAGTGGATCTTAGTGAAGGGTTAAGGAAATTGCAATGCAGAACGTTAATATTCATTGGTGAAAATTCTGCCTACCACTCCGAGGCTGTTCACATGACCACCAAACTAGACAGACGATACGGTGCATTAGTCGAGGTGCAGGGAAGCGGGTCGTTGGTGAGCGAAGAACAGCCACAGGCGATGATAATACCAATGGAATACTTTTTGATGGGATATGGCCTGTATCGTCCTACACAGAGCGTAAGTCCAAGAAGTCCTTTGAGCCCAACCCGAATCTCTCCGGAGCTTCTCTCCCCTGAAAACATGGGGTTGAAACTCAAGCCGATAAAGACACGACTCGCTCTATAGCCCTGCCTCCTCTGCTACACACATTTACATATACGACATGTGTCACCACATCAAAATCACCATTGTTGGATTGGAGCTGTTCCTCTGTTATGATTTGAGCTGTAGATATAGACAGAGATATATTGATCATCTATATATAGAAAGAGAGGGAGATGAAGAAGAGTAAAAAAAGGGGATGGGGAAGGGATTGATATATGGTAGAGTGAAAAACCGCCATTTATTTTTAATTTGGACGTTTAATACCTCTAGTATTTAATTTGGAAGAAAAATACCTTAATTAATTTTGGTTACCTATCAAAAAGTTGGTATAATCGTACCTCCGAGTTAACTTCCGTCAACTACCCTAACGGAAACATATTCGTATAATCAAGAAAAGCGATTGTACTTATTTACATAATTAACATGAGTTAAGTTTTAACCACAGTTAACAATTCCGTTAGGGTAGTTAACGGAAGTTAACTCGAAGGTAAGATTATACCAACTTTTTAAAAAACGAAAGTTTTAATAAGTAACCAAAATTAACTAAGGTGTTTTTCTTCCAAATTAAATAGTAGAGGTATTAAACGGGAAAATTAAAAGTAAATGATGGTTTTTTAGGTTTTCTCCCTTTACAGATATATTATATTTTGATTCATTAAACTTGTCTTAAAGGTTTATTTTGTGGTAGCTCTTCTTGTTCTGTACATTCAGTTGAATAAAAATCATCCCCTTACTATTTTA
CDS Sequence
Protein Sequence