Information report for AT5G11380
Gene Details
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Functional Descriptions
- PO:0009005 — root — raíz (Spanish, exact), radices (exact, plural), radix (exact), 根 (Japanese, exact), aerial root (narrow), climbing root (narrow)
Functional Keywords
Literature and News
- Genome organization in Arabidopsis thaliana: a survey for genes involved in isoprenoid and chlorophyll metabolism. DOI: 10.1023/a:1023005504702 ; PMID: 12777052
- Transcriptome analyses show changes in gene expression to accompany pollen germination and tube growth in Arabidopsis. DOI: 10.1104/pp.108.126375 ; PMID: 18775970
Gene Resources
- UniProt: A0A1R7T385
- EMBL: CP002688
- AlphaFoldDB: A0A1R7T385
- EnsemblPlants: AT5G11380.3
- Gramene: AT5G11380.3
- ExpressionAtlas: AT5G11380
- InterPro: IPR005475, IPR005477, IPR029061
- PANTHER: PTHR43322, PTHR43322:SF3
- SUPFAM: SSF52518
- Gene3D: 3.40.50.970
- SWISS-MODEL: A0A1R7T385
- Conserved Domain Database: cd02007, cd07033
Sequences
cDNA Sequence
- >AT5G11380.3
TCTCTCTTTACCAATTGCTCTGGATTCTCTCTCGCTAAAGCTTCTCCATTCTCCACATGTCAACATTTTGGGCGTTTTTCGCGGCATTTGTTTCGAATTTCTTGTAATTTTTTCATTTCTTCTTCAGAATTATATCATCTTCCTCGTCCGTTGTAATTGATTTTCGAGGCTTTTTTTCTCTTAATGGGTTCGGCTTCGATTGGTTACCAATTCGGAATATCAGCTCGATTTTACGGCAATTTTAATCTGAGCTCAGATATTACTGTCTCCTCGCTTCCATGTAAACTTGATGTTTCCATAAAAAGCCTATTCTCAGCTCCAAGCTCCACTCACAAGGAATATTCAAATCGAGCTCGGGTATGTTCTTTGCCAAACACTGATGGATACTGCGATGAGAAATTTGAGACGCCAATACTAGACAGCATTGAAACTCCATTGCAGTTGAAGAATTTGAGTGTTAAGGAGTTGAAGTTATTAGCTGATGAAATCCGTACGGAGCTTCATTCTGTATTATGGAAGAAGACCCAAAAGTCTATGAATCCTAGCTTTGCTGCAATAGAGCTTACCCTTGCTCTGCATTATGTTTTTCGTGCCCCGGTTGACAATATATTGTGGGATGCTGTGGAACAAACATATGCACATAAGGTCTTGACACGACGTTGGTCTGCAATACCATCGAGACAAAACAGTGGTATTTCTGGGGTCACTTCTCGTTTGGAGAGTGAATATGATTCCTTTGGAACCGGGCATGGCTGCAACAGTATTTCTGCTGGGCTCGGATTAGCGGTTGCTCGAGATATGAAAGGAAAGAGGGACCGGGTTGTTGCTGTGATCGACAATGTGACAATAACTGCTGGTCAAGCATATGAGGCAATGAGCAATGCTGGTTACTTGGATTCTAATATGATTGTTATACTGAATGATAGCCGTCACTCTTTACATCCAAATATGGAGGAGGGATCCAAGGCATCCATCAGCGCACTTTCTAGCATCATGAGCAAAATCCAATCTAGCAAAGTTTTCCGGAAATTTAGAGAATTAGCCAAAGCTATGACGAAAAGAATTGGAAAGGGAATGTATGAATGGGCAGCCAAAGTCGATGAGTATGCTCGCGGTATGGTTGGACCAACAGGATCAACTCTCTTTGAAGAACTTGGTTTGTACTACATTGGTCCTGTTGATGGACACAACATTGAAGATCTAGTTTGTGTTCTCCGAGAAGTATCTTCTCTAGATTCAATGGGTCCTGTGTTGGTCCACGTGATCACAGAGGGAAACCGAGATGCAGAAACCGTAAAGAACATCATGGTCAAAGACAGACGCACTTACAGTGATTGCTTTGTTGAGGCTTTGGTGATGGAGGCAGAAAAGGATAGAGATATTGTTGTAGTTCATGCAGGAATGGAGATGGATCCGTCACTTCTTACATTTCAGGAGAGATTTCCAGACAGATTTTTCAATGTCGGAATGGCTGAACAGCATGCTGTCACATTCTCTGCTGGTCTTTCTTCTGGAGGTCTCAAGCCATTTTGTATTATTCCCTCTGCTTTTTTACAAAGAGCTTATGACCAGGTGGTCCATGATGTAGATCGGCAGAGAAAGGCGGTGCGATTTGTTATTACAAGCGCAGGGCTTGTTGGATCCGATGGTCCAGTGCAGTGTGGAGCTTTTGACATAGCTTTCATGTCATCCTTACCAAACATGATAGCCATGGCTCCAGCCGATGAGGATGAGCTTGTAAATATGGTTGCAACTGCTGCTTATGTCACTGACCGCCCAGTATGTTTCCGGTTCCCTAGAGGCTCCATCGTCAACATGAATTATCTTGTCCCCACTGGATTACCAATTGAAGTAAGTTCCAATCTAATCTTCAAATCTTTTGGTTGCAAAAACAGACCGTGGTGACACAAGAACTGCTTTATCATATTAGAGTAGATCGGAAGAGGAAGAGTTCTCGTAGAAGGTCAAGATGTGGCTTTACTTGGTTATGGAGCGATGGTTCAGAATTGTCTTCATGCTCACTCGCTTCTCTCGAAACTCGGTTTGAACGTGACTGTAGCTGATGCAAGATTTTGCAAACCCCTAGACATCAAGCTTGTGCGTGATCTTTGTCAGAACCACAAATTCCTTATCACTGTCGAAGAAGGCTGTGTTGGAGGGTTTGGTTCTCATGTGGCGCAGTTCATAGCCCTCGATGGCCAGCTCGATGGGAATATCAAGTGGAGACCCATTGTGTTACCGGATGGCTACATAGAAGAAGCATCGCCTAGGGAGCAGCTTGCTCTTGCAGGGCTAACTGGACATCACATAGCAGCAACCGCTTTGAGTCTTTTGGGCCGAACTCGTGAAGCATTGCTTCTCATGAGCTAGCTTAACCTTCTCATATGGGATTTACCTTCACAAGAGACTTAAAGAGGAGTTTCTTAAACAGAATTTGTAGATAATACATTCTGAATTCAAGAGCCCATTTGATATCCTGATTTTGGAATAGCAATCTGCTATGTATTGTAAATGTAGAGTTGAGAATTGACTAAAATAAATTCAATTACTTTTTAGGCGGTATCTCAGTTTTCATATTCTCAGTTAGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTT - >AT5G11380.1
TCTCTCTTTACCAATTGCTCTGGATTCTCTCTCGCTAAAGCTTCTCCATTCTCCACATGTCAACATTTTGGGCGTTTTTCGCGGCATTTGTTTCGAATTTCTTGTAATTTTTTCATTTCTTCTTCAGAATTATATCATCTTCCTCGTCCGTTGTAATTGATTTTCGAGGCTTTTTTTCTCTTAATGGGTTCGGCTTCGATTGGTTACCAATTCGGAATATCAGCTCGATTTTACGGCAATTTTAATCTGAGCTCAGATATTACTGTCTCCTCGCTTCCATGTAAACTTGATGTTTCCATAAAAAGCCTATTCTCAGCTCCAAGCTCCACTCACAAGGAATATTCAAATCGAGCTCGGGTATGTTCTTTGCCAAACACTGATGGATACTGCGATGAGAAATTTGAGACGCCAATACTAGACAGCATTGAAACTCCATTGCAGTTGAAGAATTTGAGTGTTAAGGAGTTGAAGTTATTAGCTGATGAAATCCGTACGGAGCTTCATTCTGTATTATGGAAGAAGACCCAAAAGTCTATGAATCCTAGCTTTGCTGCAATAGAGCTTACCCTTGCTCTGCATTATGTTTTTCGTGCCCCGGTTGACAATATATTGTGGGATGCTGTGGAACAAACATATGCACATAAGGTCTTGACACGACGTTGGTCTGCAATACCATCGAGACAAAACAGTGGTATTTCTGGGGTCACTTCTCGTTTGGAGAGTGAATATGATTCCTTTGGAACCGGGCATGGCTGCAACAGTATTTCTGCTGGGCTCGGATTAGCGGTTGCTCGAGATATGAAAGGAAAGAGGGACCGGGTTGTTGCTGTGATCGACAATGTGACAATAACTGCTGGTCAAGCATATGAGGCAATGAGCAATGCTGGTTACTTGGATTCTAATATGATTGTTATACTGAATGATAGCCGTCACTCTTTACATCCAAATATGGAGGAGGGATCCAAGGCATCCATCAGCGCACTTTCTAGCATCATGAGCAAAATCCAATCTAGCAAAGTTTTCCGGAAATTTAGAGAATTAGCCAAAGCTATGACGAAAAGAATTGGAAAGGGAATGTATGAATGGGCAGCCAAAGTCGATGAGTATGCTCGCGGTATGGTTGGACCAACAGGATCAACTCTCTTTGAAGAACTTGGTTTGTACTACATTGGTCCTGTTGATGGACACAACATTGAAGATCTAGTTTGTGTTCTCCGAGAAGTATCTTCTCTAGATTCAATGGGTCCTGTGTTGGTCCACGTGATCACAGAGGGAAACCGAGATGCAGAAACCGTAAAGAACATCATGGTCAAAGACAGACGCACTTACAGTGATTGCTTTGTTGAGGCTTTGGTGATGGAGGCAGAAAAGGATAGAGATATTGTTGTAGTTCATGCAGGAATGGAGATGGATCCGTCACTTCTTACATTTCAGGAGAGATTTCCAGACAGATTTTTCAATGTCGGAATGGCTGAACAGCATGCTGTCACATTCTCTGCTGGTCTTTCTTCTGGAGGTCTCAAGCCATTTTGTATTATTCCCTCTGCTTTTTTACAAAGAGCTTATGACCAGGTGGTCCATGATGTAGATCGGCAGAGAAAGGCGGTGCGATTTGTTATTACAAGCGCAGGGCTTGTTGGATCCGATGGTCCAGTGCAGTGTGGAGCTTTTGACATAGCTTTCATGTCATCCTTACCAAACATGATAGCCATGGCTCCAGCCGATGAGGATGAGCTTGTAAATATGGTTGCAACTGCTGCTTATGTCACTGACCGCCCAGTATGTTTCCGGTTCCCTAGAGGCTCCATCGTCAACATGAATTATCTTGTCCCCACTGGATTACCAATTGAAGTAAGTTCCAATCTAATCTTCAAATCTTTTGGTTGCAAAAACAGACCGTGGTGACACAAGAACTGCTTTATCATATTAGAGTAGATCGGAAGAGGAAGAGTTCTCGTAGAAGGTCAAGATGTGGCTTTACTTGGTTATGGAGCGATGGTTCAGAATTGTCTTCATGCTCACTCGCTTCTCTCGAAACTCGGTTTGAACGTGACTGTAGCTGATGCAAGATTTTGCAAACCCCTAGACATCAAGCTTGTGCGTGATCTTTGTCAGAACCACAAATTCCTTATCACTGTCGAAGAAGGCTGTGTTGGAGGGTTTGGTTCTCATGTGGCGCAGTTCATAGCCCTCGATGGCCAGCTCGATGGGAATATCAAGTGGAGACCCATTGTGTTACCGGATGGCTACATAGAAGAAGCATCGCCTAGGGAGCAGCTTGCTCTTGCAGGGCTAACTGGACATCACATAGCAGCAACCGCTTTGAGTCTTTTGGGCCGAACTCGTGAAGCATTGCTTCTCATGAGCTAGCTTAACCTTCTCATATGGGATTTACCTTCACAAGAGACTTAAAGAGGAGTTTCTTAAACAGAATTTGTAGATAATACATTCTGAATTCAAGAGCCCATTTGATATCCTGATTTTGGAATAGCAATCTGCTATGTATTGTAAATGTAGAGTTGAGAATTGACTAAAATAAATTCAATTACTTTTTAGGCGGTATCTCAGTTTTCATATTCTCAGTTAGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTT - >AT5G11380.4
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CDS Sequence
Protein Sequence