Information report for AT5G06120
Gene Details
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Functional Descriptions
- PO:0009005 — root — raíz (Spanish, exact), radices (exact, plural), radix (exact), 根 (Japanese, exact), aerial root (narrow), climbing root (narrow)
- GO:0005737 — is active in — cytoplasm
- GO:0005739 — located in — mitochondrion
- GO:0005049 — enables — nuclear export signal receptor activity
- GO:0006611 — involved in — protein export from nucleus
- GO:0015031 — acts upstream of or within — protein transport
- GO:0005643 — part of — nuclear pore
- GO:0031267 — enables — small GTPase binding
Functional Keywords
Literature and News
- HASTY, the Arabidopsis ortholog of exportin 5/MSN5, regulates phase change and morphogenesis. DOI: 10.1242/dev.00362 ; PMID: 12620976
- Nucleo-cytoplasmic partitioning of proteins in plants: implications for the regulation of environmental and developmental signalling. DOI: 10.1007/s00294-003-0444-x ; PMID: 14523572
- Global analysis of Arabidopsis gene expression uncovers a complex array of changes impacting pathogen response and cell cycle during geminivirus infection. DOI: 10.1104/pp.108.121038 ; PMID: 18650403
- Screening Arabidopsis mutants in genes useful for phytoremediation. DOI: 10.1016/j.jhazmat.2017.04.021 ; PMID: 28441590
- Experimental Verification and Evolutionary Origin of 5'-UTR Polyadenylation Sites in Arabidopsis thaliana. DOI: 10.3389/fpls.2018.00969 ; PMID: 30026753
- The Small GTPase Superfamily in Plants: A Conserved Regulatory Module with Novel Functions. DOI: 10.1146/annurev-arplant-112619-025827 ; PMID: 32442390
Gene Resources
- UniProt: F4K2C3
- EMBL: CP002688
- AlphaFoldDB: F4K2C3
- EnsemblPlants: AT5G06120.2, AT5G06120.3, AT5G06120.6
- Gramene: AT5G06120.2, AT5G06120.3, AT5G06120.6
- ExpressionAtlas: AT5G06120
- InterPro: IPR001494, IPR011989, IPR016024
- PANTHER: PTHR12596, PTHR12596:SF2
- SUPFAM: SSF48371
- Gene3D: 1.25.10.10
- OrthoDB: F4K2C3
- SWISS-MODEL: F4K2C3
Sequences
cDNA Sequence
- >AT5G06120.2
CTGAACCAAAAAAAGAAGTTAATATAATCGGTGAATTCTCTTCTTCGGCGTTATAAACGCTGTCATCGCCTGATCAGACTGCACGTCTCTTAATCTTCTTCTTCTGCTTCGTTGTAACCATCGACGCTTCGCTTGATCGAGATTTAGTTCGCCGGAAAACTTCACCGAACAACAAATCTGATTAACTACCAGCTCAATCTCTGAAATCAACCCGAGTACTGAGCTGGAGTAAGGTGATAGACAGCTTGAATACATTTTCCATCATGCAGAGTTAGGAACTTATCTCTGCCAGTAGGCTTTTACATATTTTTCTAATACTATTTGTGTACCTTCTCTCTCTTGCGCTTCTTTGTAGTATGAGATCTACATGATATTTACCGCTAGCTCACTTGTGTTGTCTGTGTTAACTCATACTGCACTTTTGTCATTGTTAATGTTGTTCCATCTCTGTTTGGATCTTGGTGTTTCAGTTTTCTTAAGAATGGTTGGTTGCGTTTACTGTGGAAATGTATCATTTGTTTTTTTTCTCCTGCAACCTGTTTGCCTTATTGTGATATTAAATTTCCAATCCAATTCTAGATATTTTGATTGAAACAGTGAAGGCTCTCTGGAAAATATTATTGTAATGATTCATTCATGTCTTTTGTTGCCACTTAACAGTTCTTAAATCAGAATACTTTGTAATATAATTGTAATCTTGTCAAAATATTCTTGTTAAAACGGTAGTGGTATCTATGGTTTTCTACCTTTTTGGTCAGATTCTGCTTTGTTACCAATGGAGAGCTTGGCGCAACTTGAGGCAATGTGCGAGAGATTATACAACTCACAGGATTCAGCTGAGAGGGCTCATGCTGAAAATAGTCTGAGATGCTTTTCTGTGAATACGGATTATATATCACAATGTCAATACATTCTCGACAATTCATCAAAACCTTATTCCTTAATGCTCGCTAGCTCGAGTTTGTTAAAGCAAGTAACTGATCATACTCTTCCGCTGAATCTTCGCCTTGACATCAGGGCTTATATTGTGAACTATCTGGCTACAAGAGGACCGAAGATGCAATCATTTGTTATCGCTTCTCTCATTCAACTGCTTTGCCGGCTCACAAAGTTTGGATGGTTAGATGATGATAGATTCAGGGATGTGGTTAAGGAATCTACAAACTTCTTGGAACAGGGTTCCTCGGATCACTATGCTATTGGTTTAAGAATTTTGGATCAACTTGTGCAGGAGATGAATCAGCCTAATCCAGGACTGCCATCTACACATCATCGGCGGGTTGCATGCAACTTTAGGGATCAATCCTTATTTCAAGTTTTCAGAATAGCTTTGACGTCATTAAGCTATCTGAAAAATGATGCCGCTGGTCGTTTACAAGAATTGGCGCTTTCTCTTGCACTGAGGTGTGTATCATTTGACTTTGTCGGAACTTCAATTGATGAAAGCACAGAGGAGTTTGGTACAGTTCAGATTCCAACTTCCTGGAGGTCAGTATTGGAGGATTCTTCCACGCTGCAGATATTTTTCGATTATTATGGTAGTACAGAGTCCCCTCTTTCGAAAGAGGCACTTGAGTGCTTGGTGCGATTGGCTTCTGTAAGGCGCTCTCTGTTCACAAATGATGCTACACGCTCTAATTTTCTAGCTCATTTGATGACGGGAACCAAAGAAATTCTTCAAACTGGAAAAGGTCTTGCTGATCATGATAATTACCACGTGTTCTGCCGTCTACTTGGGCGTTTTAGGCTGAATTATCAGCTTTCAGAGCTTGTGAAGATGGAAGGTTATGGTGAGTGGATACAGTTGGTGGCAGAGTTCACACTTAAATCTCTCCAGTCATGGCAGTGGGCCAGCAGCAGCGTGTATTACCTTCTTGGGATGTGGTCCAGATTAGTAGCATCTGTCCCATACTTGAAGGGTGATTCACCAAGTCTACTTGATGAATTTGTACCTAAAATTACAGAGGGTTTTATCATCTCCAGATTCAATTCTGTGCAGGCTAGCGTCCCAGATGATCCGACTGATCATCCTTTGGATAAAGTTGAAGTCCTGCAGGATGAGCTGGATTGCTTTCCTTACCTATGCAGATTTCAGTATGAAAGAACTGGTATGTATATAATAAACACAATGGAGCCTCTTCTGCAATCATATACGGAAAGAGGGCAACTACAGTTTGCTGATAATTCTGAACTAGCACTCATTGAAGCAAAATTGTCATGGATTGTTCACATTGTTGCCGCTATTGTTAAAATAAAGCAGTGCAGTGGTTGTAGTGTGGAGACGCAAGAGGTGCTTGATGCTGAACTCTCCGCTCGTGTTTTGCGGCTAGTAAATGTTATGGACAGTGGACTGCATAGACAGAGATATGGTGAAATAAGTAAACAAAGGCTTGATCGTGCCATTCTTACCTTCTTCCAAAATTTCCGGAAGTCTTACGTTGGTGATCAGGCCATGCATTCATCAAAACAGTTGTATGCCAGATTGAAAGAACTCCTTGGACTGCATGATCATCTTGTTCTGTTGAACGTTATTGTTGGCAAGATTGCTACAAACTTAAAATGTTATACAGAGAGTGAAGAAGTCATTAATCACACGCTAAGTTTGTTTCTGGAGTTGGCATCTGGATACATGACCGGGAAGCTGCTTTTGAAGTTGGACACGGTGACCTTTATTATATCTAATCACACTAGGGAGCAATTTCCATTCTTAGAAGAGTATAGATGCTCTCGCAGCAGAACAACGTTTTACTACACTATTGGCTGGTTGATTTTCATGGAGGATAGCTTAATAAAGTTCAAGACTTCTATGGAACCCCTTCTGCAGGTTTTCCGCACCCTGGAATCAACACCAGATTCGATGTTTCGCACTGATGCTGTGAAGTTTGCTCTGATCGGATTGATGAGGGATTTAAGAGGAATTGCAATGGCTACTAGCAGCCGGAGAAGCTATGGTTTTCTATTTGACTGGCTCTATCCTGCACACATGCCACTCCTTTTGAGAGGGGTCTCACATTGGTTCGACACACCAGAGGTTACGACCCCGTTGTTGAAGTTCATGGCTGAGTTTGTGCATAACAAAACGCAGCGCCTTACTTTTGATTCTTCTTCTCCAAATGGCATCCTGCTTTTCCGGGAAGTCAGTAAATTGATTGTGGCTTATGGTTCAAGGATTTTAGCCCTGCCAAATGTTGCGGATATATATGCCTTCAAATACAAGGGGATCTGGGTTTCACTCACAATACTGTCAAGAGCGCTCTCGGGAAATTATTGCAACTTCGGTGTCTTTGAACTTTATGGTGACCGGGCTCTTGCGGATGCACTTGATATTGCGTTGAAGATGACCCTTGCAATACCCTTGGCAGATATATTAGCATATCGCAAGCTTACAAAGGCATACTTTGGGTTCGTCGAGGTTTTGTGTGCCAGTCATATTACCTTCATATTGAAACTGGACACTGCAACCTTTATGCATCTCGTAGGTTCCCTTGAATCTGGACTCAAGGGGTTGGACACAAGTATTTCATCACAGTGTGCAATAGCTGTCGACAATCTTGCTTCATATTATTTCAATAACATCACAATGGGTGAGGCACCTACTACTCCAGCTGCTATTCGTTTTGCACAGCACATTGCAGACTGTCCGAGTTTGTTCCCCGAGATATTGAAGACACTGTTTGAAATAGTTTTATTCGAGGATTGTGGCAATCAGTGGAGTCTCAGCAGACCAATGTTAAGCTTGATTCTTATAAGTGAGCAGATTTTCTCTGATCTGAAAGCTAAGATCCTCTCATCACAGCCTGCGGATCAACACCAGCGACTCTCTGCCTGCTTTGACAGTCTTATGACAGACATATCGCGGGGATTAGATTCAAAGAACAGAGACAAGTTCACTCAGAACTTGACCCTTTTCAGACACGAGTTCCGCGTTAAATAAAATCGGCCAAACACAGTCCCTGAGCCACAGTCTACTACATTAGGGGTCTCATCAAAAAGACCCACATGACACAGTGAACCAGAAATCTTCAGAAGTTAAAAAATGGAAAAACAAAAAAGTAGTCTCGAGATTGTGGTACTGTACAGTTTCTTTATTCTCTCAGAAGAAAGGGTAATATGAAGAAAGATTTACGTTTTGGTGGTTTCCTCGCAATTGTGGCTTAATTCATCATTGGGATTTATTTTGTCTCTTGTCAGCCCCATAACAAGGTTGATGTAAAACATTGAAATCTAGGGTTTACTTTTGCAAATGTTGGGAGCAGTTAGGTCACATATTCTTTGTAATGGTAAACAAATCTGAAAGAAAATGCAGTATTTGTTTTGTTTATTGTCTGG - >AT5G06120.8
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CTGAACCAAAAAAAGAAGTTAATATAATCGGTGAATTCTCTTCTTCGGCGTTATAAACGCTGTCATCGCCTGATCAGACTGCACGTCTCTTAATCTTCTTCTTCTGCTTCGTTGTAACCATCGACGCTTCGCTTGATCGAGATTTAGTTCGCCGGAAAACTTCACCGAACAACAAATCTGATTAACTACCAGCTCAATCTCTGAAATCAACCCGAGTACTGAGCTGGAGTAAGGTGATAGACAGCTTGAATACATTTTCCATCATGCAGAGTTAGGAACTTATCTCTGCCAGTAGGCTTTTACATATTTTTCTAATACTATTTGTGTACCTTCTCTCTCTTGCGCTTCTTTGTAGTATGAGATCTACATGATATTTACCGCTAGCTCACTTGTGTTGTCTGTGTTAACTCATACTGCACTTTTGTCATTGTTAATGTTGTTCCATCTCTGTTTGGATCTTGGTGTTTCAGTTTTCTTAAGAATGGTTGGTTGCGTTTACTGTGGAAATGTATCATTTGTTTTTTTTCTCCTGCAACCTGTTTGCCTTATTGTGATATTAAATTTCCAATCCAATTCTAGATATTTTGATTGAAACAGTGAAGGCTCTCTGGAAAATATTATTGTAATGATTCATTCATGTCTTTTGTTGCCACTTAACAGTTCTTAAATCAGAATACTTTGTAATATAATTGTAATCTTGTCAAAATATTCTTGTTAAAACGGTAGTGGTATCTATGGTTTTCTACCTTTTTGGTCAGATTCTGCTTTGTTACCAATGGAGAGCTTGGCGCAACTTGAGGCAATGTGCGAGAGATTATACAACTCACAGGATTCAGCTGAGAGGGCTCATGCTGAAAATAGTCTGAGATGCTTTTCTGTGAATACGGATTATATATCACAATGTCAATACATTCTCGACAATTCATCAAAACCTTATTCCTTAATGCTCGCTAGCTCGAGTTTGTTAAAGCAAGTAACTGATCATACTCTTCCGCTGAATCTTCGCCTTGACATCAGGGCTTATATTGTGAACTATCTGGCTACAAGAGGACCGAAGATGCAATCATTTGTTATCGCTTCTCTCATTCAACTGCTTTGCCGGCTCACAAAGTTTGGATGGTTAGATGATGATAGATTCAGGGATGTGGTTAAGGAATCTACAAACTTCTTGGAACAGGGTTCCTCGGATCACTATGCTATTGGTTTAAGAATTTTGGATCAACTTGTGCAGGAGATGAATCAGCCTAATCCAGGACTGCCATCTACACATCATCGGCGGGTTGCATGCAACTTTAGGGATCAATCCTTATTTCAAGTTTTCAGAATAGCTTTGACGTCATTAAGCTATCTGAAAAATGATGCCGCTGGTCGTTTACAAGAATTGGCGCTTTCTCTTGCACTGAGGTGTGTATCATTTGACTTTGTCGGAACTTCAATTGATGAAAGCACAGAGGAGTTTGGTACAGTTCAGATTCCAACTTCCTGGAGGTCAGTATTGGAGGATTCTTCCACGCTGCAGATATTTTTCGATTATTATGGTAGTACAGAGTCCCCTCTTTCGAAAGAGGCACTTGAGTGCTTGGTGCGATTGGCTTCTGTAAGGCGCTCTCTGTTCACAAATGATGCTACACGCTCTAATTTTCTAGCTCATTTGATGACGGGAACCAAAGAAATTCTTCAAACTGGAAAAGGTCTTGCTGATCATGATAATTACCACGTGTTCTGCCGTCTACTTGGGCGTTTTAGGCTGAATTATCAGCTTTCAGAGCTTGTGAAGATGGAAGGTTATGGTGAGTGGATACAGTTGGTGGCAGAGTTCACACTTAAATCTCTCCAGTCATGGCAGTGGGCCAGCAGCAGCGTGTATTACCTTCTTGGGATGTGGTCCAGATTAGTAGCATCTGTCCCATACTTGAAGGGTGATTCACCAAGTCTACTTGATGAATTTGTACCTAAAATTACAGAGGGTTTTATCATCTCCAGATTCAATTCTGTGCAGGCTAGCGTCCCAGATGATCCGACTGATCATCCTTTGGATAAAGTTGAAGTCCTGCAGGATGAGCTGGATTGCTTTCCTTACCTATGCAGATTTCAGTATGAAAGAACTGGTATGTATATAATAAACACAATGGAGCCTCTTCTGCAATCATATACGGAAAGAGGGCAACTACAGTTTGCTGATAATTCTGAACTAGCACTCATTGAAGCAAAATTGTCATGGATTGTTCACATTGTTGCCGCTATTGTTAAAATAAAGCAGTGCAGTGGTTGTAGTGTGGAGACGCAAGAGGTGCTTGATGCTGAACTCTCCGCTCGTGTTTTGCGGCTAGTAAATGTTATGGACAGTGGACTGCATAGACAGAGATATGGTGAAATAAGTAAACAAAGGCTTGATCGTGCCATTCTTACCTTCTTCCAAAATTTCCGGAAGTCTTACGTTGGTGATCAGGCCATGCATTCATCAAAACAGTTGTATGCCAGATTGAAAGAACTCCTTGGACTGCATGATCATCTTGTTCTGTTGAACGTTATTGTTGGCAAGATTGCTACAAACTTAAAATGTTATACAGAGAGTGAAGAAGTCATTAATCACACGCTAAGTTTGTTTCTGGAGTTGGCATCTGGATACATGACCGGGAAGCTGCTTTTGAAGTTGGACACGGTGACCTTTATTATATCTAATCACACTAGGGAGCAATTTCCATTCTTAGAAGAGTATAGATGCTCTCGCAGCAGAACAACGTTTTACTACACTATTGGCTGGTTGATTTTCATGGAGGATAGCTTAATAAAGTTCAAGACTTCTATGGAACCCCTTCTGCAGGTTTTCCGCACCCTGGAATCAACACCAGATTCGATGTTTCGCACTGATGCTGTGAAGTTTGCTCTGATCGGATTGATGAGGGATTTAAGAGGAATTGCAATGGCTACTAGCAGCCGGAGAAGCTATGGTTTTCTATTTGACTGGCTCTATCCTGCACACATGCCACTCCTTTTGAGAGGGGTCTCACATTGGTTCGACACACCAGAGGTTACGACCCCGTTGTTGAAGTTCATGGCTGAGTTTGTGCATAACAAAACGCAGCGCCTTACTTTTGATTCTTCTTCTCCAAATGGCATCCTGCTTTTCCGGGAAGTCAGTAAATTGATTGTGGCTTATGGTTCAAGGATTTTAGCCCTGCCAAATGTTGCGGATATATATGCCTTCAAATACAAGGGGATCTGGGTTTCACTCACAATACTGTCAAGAGCGCTCTCGGGAAATTATTGCAACTTCGGTGTCTTTGAACTTTATGGTGACCGGGCTCTTGCGGATGCACTTGATATTGCGTTGAAGATGACCCTTGCAATACCCTTGGCAGATATATTAGCATATCGCAAGCTTACAAAGGCATACTTTGGGTTCGTCGAGGTTTTGTGTGCCAGTCATATTACCTTCATATTGAAACTGGACACTGCAACCTTTATGCATCTCGTAGGTTCCCTTGAATCTGGACTCAAGGGGTTGGACACAAGTATTTCATCACAGTGTGCAATAGCTGTCGACAATCTTGCTTCATATTATTTCAATAACATCACAATGGGTGAGGCACCTACTACTCCAGCTGCTATTCGTTTTGCACAGCACATTGCAGACTGTCCGAGTTTGTTCCCCGAGATATTGAAGACACTGTTTGAAATAGTTTTATTCGAGGATTGTGGCAATCAGTGGAGTCTCAGCAGACCAATGTTAAGCTTGATTCTTATAAGTGAGCAGATTTTCTCTGATCTGAAAGCTAAGATCCTCTCATCACAGCCTGCGGATCAACACCAGCGACTCTCTGCCTGCTTTGACAGTCTTATGACAGACATATCGCGGGGATTAGATTCAAAGAACAGAGACAAGTTCACTCAGAACTTGACCCTTTTCAGACACGAGTTCCGCGTTAAATAAAATCGGCCAAACACAGTCCCTGAGCCACAGTCTACTACATTAGGGGTCTCATCAAAAAGACCCACATGACACAGTGAACCAGAAATCTTCAGAAGTTAAAAAATGGAAAAACAAAAAAGTAGTCTCGAGATTGTGGTACTGTACAGTTTCTTTATTCTCTCAGAAGAAAGGGTAATATGAAGAAAGATTTACGTTTTGGTGGTTTCCTCGCAATTGTGGCTTAATTCATCATTGGGATTTATTTTGTCTCTTGTCAGCCCCATAACAAGGTTGATGTAAAACATTGAAATCTAGGGTTTACTTTTGCAAATGTTGGGAGCAGTTAGGTCACATATTCTTTGTAATGGTAAACAAATCTGAAAGAAAATGCAGTATTTGTTTTGTTTATTGTCTGG - >AT5G06120.3
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CDS Sequence
Protein Sequence