Information report for AT5G05560
Gene Details
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Functional Descriptions
- PO:0009005 — root — raíz (Spanish, exact), radices (exact, plural), radix (exact), 根 (Japanese, exact), aerial root (narrow), climbing root (narrow)
Functional Keywords
Literature and News
- Protein degradation in signaling. DOI: 10.1016/s1369-5266(00)00100-x ; PMID: 11019805
- First glance at the plant APC/C, a highly conserved ubiquitin-protein ligase. DOI: 10.1016/S1360-1385(02)00028-6 ; PMID: 12597875
- Identifying essential genes in Arabidopsis thaliana. DOI: 10.1016/j.tplants.2008.06.003 ; PMID: 18684657
- Concerted expression of a cell cycle regulator and a metabolic enzyme from a bicistronic transcript in plants. DOI: 10.1038/s41477-019-0358-3 ; PMID: 30737513
- Genome-wide identification of EMBRYO-DEFECTIVE (EMB) genes required for growth and development in Arabidopsis. DOI: 10.1111/nph.16071 ; PMID: 31334862
- Protein degradation in signaling. DOI: 10.1016/s1369-5266(00)00100-x ; PMID: 11019805
- The Arabidopsis anaphase-promoting complex or cyclosome: molecular and genetic characterization of the APC2 subunit. DOI: 10.1105/tpc.013847 ; PMID: 14508008
Gene Resources
- UniProt: A0A1P8BDT7
- EMBL: CP002688
- EnsemblPlants: AT5G05560.3
- Gramene: AT5G05560.3
- Orthologous matrix: KWPDAQK
- ExpressionAtlas: AT5G05560
- InterPro: IPR011989, IPR024990, IPR041221
- PANTHER: PTHR12827, PTHR12827:SF3
- Gene3D: 1.25.10.10
- OrthoDB: A0A1P8BDT7
- SWISS-MODEL: A0A1P8BDT7
Sequences
cDNA Sequence
- >AT5G05560.3
CTTGTCTTCTGCCGTCATTAAGGCATGCTGGAGCAACCTTGGTCGAGGGACAGAAGCTTTTCTTTGTGTATTACAAATTGCTTGCTTAACAATCTACAACACATCAGGCGAAGTTGTATCTGTTCCACTAATGCGTACTGTCAAATCAATATGGCCTCTACCATGTGGTCTACTTCTTGAGCAAGCTGGTGAAGTGAATCCACCCTCACATGTTCCATTTTCTCCTGTTAGCCCCATCCTTGGTTCTCGTGAGATGCTGCGCCAAAGAAAAGAAGTTGGGAATAGTTCACCACAAAACTTCCATTCCCCAGTCGCGCATGACCTTATTAGCAAAAGAGATATGCCATGCATGTCTTCCCATCTGATTCTAAGAGATCCACTAGAGGAACCTGGGCCAACCTACGTTGAAGAGAGGGGGAAGTTGACCATAATGAAGGACTACGATGAGAGGACAATTTGGACAAGTGACCGTCTACCTCTTATGACGTCGTATAACAAAGGCAAGATGCAACATTCTGTGTGGGCGGCCGAATTTATAGAGTCAAACCTTGAAGCTTCTGCGTCATGTTCAAGCGGCATTGTTCCTGATGCTGTTCTCTCGAAGCGGGTTTCTTTTCGTAGAATATGGCAAGCGAAAGGTGCTAAGAAAGCTGCATCTAAGGTCTTTTTGGCAACTGATAATTCAGTCCCAGTAATTTGCTTTCTGATTCTAGAACAAAAGAAGCTGTTATCGGTGGGACTTCAAACTGTTGAAATCAATAACGAAATTCTGTTCGATGTTAAGCCTGATATAAGCTGGAGTGTGTCTGCGATTGCTGCTGCACCTGTTGTTGTGACACGTTCTCAAGTGAAAATAGGACTGCTTCCACATTTGGATATCATTGTTTTATCTCCAGAAAATGACCTCTTTCTCTATTCAGGAAAACAATGTCTCTGTAGATATGTATTACCTTCTTGGTTGGGAGAAAGTATTGGTTCCGGGGATGGAGAGTCTGCAAAAACAGATTCAGGTTTCAGGAACCTGAAGATCACAGGATTGTCTGATGCTGTTTTAGGATCTATCAATCTCTCAGTTAACCATTCACAGATCTTTCGGTGTGCCTTAACTGGTAAACCTTCATCGTCACTTGCAAATGATTGCATAGCAGCCATAGCTGAGGGACTACGATCCGATCTGTACAGTTTGTTTCTCTCTCTTCTTTGGGGAGATGGTCATTCTGACCTGCAAGGTTCCAGTATTCATTTTGAATGGGAAGCATTATGCAACATTTTTCTGGAGATCTGTCAAAAGCCTACTGTTGTGCATCGAAAGCAACCCAAAACAGCATCAGAGTCCTCCTGGGAGTTTCTTCTCATCAGCAAATTTCATAAGACCTACTCTAGGTTTCACAATGGTATTACTTCAATAAATCGTTTAGATCTGGAAGGCATTGTCCCATTTGATTCCAAGATTTGTAGTGAAGAAACACTGGGCAGCTCATGTGAACTAATGGTCCAGAGTTTAGATTGTCTCCATGCAGTTTATGAGAGCTTGAAGATGGATAATCTACGGAAACAGGATTTGCATCACTTGGCTGTTTTGTTGTGCAATATTGCCAAGTTTCTGGATGAGAAGTGTTACTTAGATTACTACATACGTGATTTTCCTCGTCTGTCAACAACTATTGGGGCGTGCACAACCCTTTCTTCTAGCAGAAAACCTCCAAATTTATTTAGATGGCTTGAGAATTGTTTAAGACGTGGATGTTTATCAACAAACTTTGATGACCTCCCAGATTTGATCCGTAGAGATGGGTGCTCCATAGTAAGCTGGGCAAGGAAAGTTGTTTCCTTCTACAGTGTGTTATTTGGTGATAAGCCAGAAGGACGGACACTTTCATCAGGTGTCCCCTGTAATATCGCGCCAGGATCATACTCCTGTAACGAGGAACTCACTATCTTAGCTATGGCAGGAGAGAGATTTGGGCTTCACCAACTGGATTTGCTACCTTCTGGTGTTTCTCTCCCGCTAAGACATGCACTGGATAGCTGTCGGGAATCTCCTCCAGCTGACTGGCCAGCAATTGCTTATGTGCTTCTTGGTCGAGAAGATATGGCCCTATCCGTCTTCAGAAATTTTAGTTCATCTAAGGAATTTGAGATGCAGTCAAATACGAGTTTGATATCGATGTCCATACCTTACATGCTACATTTGCATCCAGTAATTGTTCCATCCTCTGAGTCGATTGGCTTAGAAAACACTAAGATTGAGGATACAAATTCTGTGGATGGTTCTGTGATAGATGGAATGGAGCATATCTTCAACTCCTACACACAGCTACGGTATGGCCGGGATCTAAGATTGAATGAGGTTAGACGTCTTTTGTGCTCTGCAAGACCTGTGGTAGTTCAAACGGCTGCTAACCCTACTATATCAGATCAGGAGCAGCAACAGGACCATCTTTGGCGCATAGCACAGAGGACTGCTGTTCTACCCCTCGGGCGTGGAGCATTCACATTATCAACGATACATACTCTTTTAACTGAGGCGTTTACTGTACCAAAGCTTGTTTTAGCTGGTCGACTGCCTTCTCAACAAAATGCCATTGTTAATCTAGATCCAAACATAAGGAATATCCAAGAATTAAAGACCTGGCCAGAGTTTCATAACGCTGTTGCTGCTGGGTTACGACTGGCTCCGCTTCAGGGAAAGGTCTCCAGAACGTGGATTAGATACAATAAACCTGGAGAGCCAAATGCTGTTCATGCTGGACTTCTGTTTGGCCTGGGATTACAGGGATATTTGCATGTGTTAAACCTTAGTGACATATACCAATATTTCACTCAGGACCATGAGAGCACTACGGTAGGTTTGATGCTTGGTCTGGCCGCTTCATACAGGGGAACAATGCAACCTGATATTGCAAAGGCTCTCTTTTTCCATGTTCCTGCTCGATACCAAGCTTCATATACTGAGTTTGAGATACCAACACTTCTACAGTCTGCAGCTTTAGTCTCCGTTGGCATGCTATTTGAAGGATCAGCACACCAGCAGACAATGCAATTACTTTTGGGTGAAATTGGCCGTAGAAGTGCAGGGGACAATGTCCTTGAAAGGGAGGGTTATGCTGTATCTGCAGGATTCTCACTTGGTCTTGTAGCTTTGGGCCGTGGAGGTGATGCGCTCGGTTCCATGGACTCCTTGGTCAATCGCTTACTCCTGTATTTAGGAGCAAAAGAGGAAAGATCTATCCTTGTACCATCCCTTGAAGATCACCGAAGTGCTGCACAGATAACAGACGGAAGCACTTCTAATGTTGATATAACTGCACCTGGAGCGATAATAGCTCTCACATTAATGTATCTTAAGACAGAATCAGAGGTCATCTTCTCAAAGCTCTCTATTCCTCAAACACATTACGATTTGGAGTGCGTTAGGCCTGATTTCATTATGCTCCGTGTCATTGCTCGGAACTTGATAATGTGGAGCAGGATCTGTCCTACTTGTGATTGGATTCAGTCTCAAGTTCCTGAAGTAGTCAAAAATGGTATCAGCCAACTCCGAGATGACATGGATAATATGTATGAGGTGGATGTTGAAGCCCTTGTTCAGGCATACGTCAATATAGTGGCCGGGGCCTGCATTTCACTTGGGCTGAGATTTGCTGGTACGAGGGATGGAAATGCTCGTGACTTACTTAACTCCTACGCTCTCTATCTTTTGAATGAGATCAAGCCTCTTTCTGCCACACCTGGAAATGCATTTCCCAGGGGAATATCAAAATTTGTTGATCGGGGAACACTTGAAATGTGTCTTTATCTTATCATTATTTCTCTGTCAGTGGTCATGGCGGGATCTGGAGACTTGCAAGTTTTTCGGTTGTTGAGATTTCTCCGCAGCCGAAACTCTGCCGATGGACATGCTAACTATGGCACACAAATGGCAGTGAGCTTAGCCACAGGATTCTTGTTTCTTGGAGGCGGTATGCGAACATTTTCAACGAATAATGGCTCACTGGCAATGTTGCTCATTACTCTCTATCCACGGTTGCCTTCTGGACCAAATGACAACCGTTGTCACCTCCAGGCATTCAGGCATTTATATGTCCTTGCAACAGAGGCTCGCTGGCTGCAGACCATTGATGTTGATTCTGGTCTGCCTGTCTATGCCCCTCTAGAAGTCACAGTAAAAGAGACAAAACTTTATTCAGAAACAAAATTTTGCGAGATAACACCGTGCATTCTGCCAGAGCGTGCTATTCTAAAGAGAATTTGTGTATGTGGTCCCCGATACTGGCCCCAACAAATTGAGCTAGTCCCCGAAGAGAAAAATTGGTGGAGCTTTGGGGACAAGAGTGATCCCTTCAGTTCTGGTGTTATATATGTCAAAAGGAAAGTAGGAGCTTGTTCGTATGTTGATGATCCAGTTGGGTGTCAGTCACTGCTTTCGCGAGCAATGCATAAGGTTTTTGGTTTAAGGACTCTGGGAGAATCTAATTTGATTGCTAATAGTCATAGAGAACTGGATTCTGATAGTGTTGATCACTTGGTCAGCACTTTCTCATCAGATCCAAGCCTAATAGCGTTTGCACAGTTGTGCTGTGACAAATCTTGGAATAACAGATCTGATTCTGAATTCAAGGAGTTCTGTCTGCAAGTGTTGTTTGACTGTATAAGCAAGGATAGACCAGCTCTTTTGCAGGTTTATTTATCTTTGTACACAACCATTGGTTCGATGGCTGATCTGCTTGTCAAAAGCGATAGTAACATGTGTGATTCACTTTCCATCTCAAGCCTCAAGGTTGCTCTTGCCTACAATGAGGCAGTATCAACTGGAAGATTGGCCTCCTCAGGTGGCTTTGTACAGTCAATCTTCTTAGCATCGCTGAGAAAGCGATGTGAAGAGGTTTTGAATTGCTCAACGGAGCTGAAGATTAATTTGAGGAATTATTTGACCTCAGAAGCATGGCCTTATGATAAGAACTCAAAGTTGCAGAAAGATATAATTATTCTCTCATGGT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- >AT5G05560.1
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- >AT5G05560.2
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CDS Sequence
Protein Sequence