Gene Details:

  • Gene ID: AT4G27490
  • Gene Symbol: RRP41L
  • Gene Name: RRP41 like
  • Description: 3-5-exoribonuclease family protein;(source:Araport11)
  • TAIR Accession: locus:2124024
  • Genome: Araport11_genome_release
  • Species: Arabidopsis thaliana

Transcripts:

Plant Ontology Annotations:

  • PO:0000003  — whole plant — planta entera (Spanish, exact), 植物体全体 (Japanese, exact), clonal colony (related), colony (related), bush (narrow), frutex (narrow), frutices (narrow), gametophyte (narrow), herb (narrow), liana (narrow), prothalli (narrow), prothallium (narrow), prothallus (narrow), seedling (narrow), shrub (narrow), sporophyte (narrow), suffrutex (narrow), suffrutices (narrow), tree (narrow), vine (narrow), woody clump (narrow), genet (broad), ramet (broad)
  • PO:0000014  — rosette leaf — hoja en roseta (Spanish, exact), ロゼット葉 (Japanese, exact)
  • PO:0009001  — fruit — frucht (exact, German), fruto (exact, Spanish), 果実 (exact, Japanese), coenocarp (narrow), syncarp (narrow), aggregate fruit (broad), compound fruit (broad), dehiscent fruit (broad), diaspore (broad), indehiscent fruit (broad), multiple fruit (broad), propagule (broad)
  • PO:0009010  — seed — semilla (Spanish, exact), 種子 (Japanese, exact), pyrene (narrow), diaspore (broad)
  • PO:0009046  — flower — flor (Spanish, exact), 花 (Japanese, exact), floret (related), Asteraceae floret (narrow), basal flower (narrow), double flower (narrow), hermaphrodite flower (narrow), monoclinous flower (narrow), perfect flower (narrow)

Gene Ontology:

  • GO:0000176  — part of — nuclear exosome (RNase complex)
  • GO:0005634  — located in — nucleus
  • GO:0071028  — involved in — nuclear mRNA surveillance
  • GO:0005730  — is active in — nucleolus
  • GO:0009507  — located in — chloroplast
  • GO:0034427  — involved in — nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic, 3-5
  • GO:0016075  — involved in — rRNA catabolic process
  • GO:0009845  — acts upstream of or within — seed germination
  • GO:0005737  — located in — cytoplasm
  • GO:0034475  — involved in — polyadenylation-dependent snoRNA 3-end processing
  • GO:0008408  — enables — 3-5 exonuclease activity
  • GO:0000177  — part of — cytoplasmic exosome (RNase complex)

Literature:

Sequences:

cDNA Sequence
  • >AT4G27490.7
    TATGACTCCAGTTATTTGTGAGACTAAACTAGATTTGAATTTTGTTTCTTTTGTGAAAAATGCTTCTTTCAGTACTTCAAACTGGTGCTGTGAGTTCTGCTTCTGGTTCTGCTTATGCTGAGTTTGGGAACACTAAAGTTATTGTTTCAGTATTTGGGCCAAGGGAGAGTAAGAAAGCAATGGTTTATAGTGATGTAGGTAGATTGAATTGTAATGTTAGCTATACAAATTTTGCTTCCCCTACTCTTGGCCAGGGAACTGATCACAAAGAATATTCATCAATGCTTCACAAAGCATTGGAAGGTGTAATAATGATGGAGACGTTTCCAAAAACAACCGTTGATGTTTTTGCATTGGTTCTTGAATCTGGAGGAAGTGACCTCTCTGTTTTGATATCATGTGCTAGTCTTGCTTTAGCTGATGCCGGAATTATGATGTATGACCTTATCACAGCTGTTTCAGTGTCTTGCATAGGCAAAAGCCTTATGATAGACCCGGTTACAGAGGAGGAAGGATGTGAAGATGGCAGCTTTATGATGACGTGCATGCCATCTCGTTATGAAATCACTCAGCTAACCATCACTGGTGAATGGACAACACCTAATATCAACGAGGCAATGCAGCTTTGCTTGGATGCTAGTTCAAAACTTGGAGAGATCATGCGTGATTGTCTGAAACAGTCTGCCTCAGCTTCCGATGAATGAGCATAAATAACTATGATTTTGGATTGTAGCTCAGACTTGGTATGAAACCGGTTTTAGCTGTTATAGGTAAACGGATTTAGTCTAAACCTGTGTGTAGTTTAAACCGATGTATGTTTTCACATAAGATTTGATGGAACTAGATCTTTAGCTATGAAATGGATCCCAATTGCGAGTGGTATCAAAGACATACAGAATTTAAAGTAGGGAA
  • >AT4G27490.6
    TATGACTCCAGTTATTTGTGAGACTAAACTAGATTTGAATTTTGTTTCTTTTGTGAAAAATGCTTCTTTCAGTACTTCAAACTGGTGCTGTGAGTTCTGCTTCTGGTTCTGCTTATGCTGAGTTTGGGAACACTAAAGTTATTGTTTCAGTATTTGGGCCAAGGGAGAGTAAGAAAGCAATGGTTTATAGTGATGTAGGTAGATTGAATTGTAATGTTAGCTATACAAATTTTGCTTCCCCTACTCTTGGCCAGGGAACTGATCACAAAGAATATTCATCAATGCTTCACAAAGCATTGGAAGGTGTAATAATGATGGAGACGTTTCCAAAAACAACCGTTGATGTTTTTGCATTGGTTCTTGAATCTGGAGGAAGTGACCTCTCTGTTTTGATATCATGTGCTAGTCTTGCTTTAGCTGATGCCGGAATTATGATGTATGACCTTATCACAGCTGTTTCAGTGTCTTGCATAGGCAAAAGCCTTATGATAGACCCGGTTACAGAGGAGGAAGGATGTGAAGATGGCAGCTTTATGATGACGTGCATGCCATCTCGTTATGAAATCACTCAGCTAACCATCACTGGTGAATGGACAACACCTAATATCAACGAGGCAATGCAGCTTTGCTTGGATGCTAGTTCAAAACTTGGAGAGATCATGCGTGATTGTCTGAAACAGTCTGCCTCAGCTTCCGATGAATGAGCATAAATAACTATGATTTTGGATTGTAGCTCAGACTTGGTATGAAACCGGTTTTAGCTGTTATAGGTAAACGGATTTAGTCTAAACCTGTGTGTAGTTTAAACCGATGTATGTTTTCACATAAGATTTGATGGAACTAGATCTTTAGCTATGAAATGGATCCCAATTGCGAGTGGTATCAAAGACATACAGAATTTAAAGTAGGGAA
  • >AT4G27490.1
    TATGACTCCAGTTATTTGTGAGACTAAACTAGATTTGAATTTTGTTTCTTTTGTGAAAAATGCTTCTTTCAGTACTTCAAACTGGTGCTGTGAGTTCTGCTTCTGGTTCTGCTTATGCTGAGTTTGGGAACACTAAAGTTATTGTTTCAGTATTTGGGCCAAGGGAGAGTAAGAAAGCAATGGTTTATAGTGATGTAGGTAGATTGAATTGTAATGTTAGCTATACAAATTTTGCTTCCCCTACTCTTGGCCAGGGAACTGATCACAAAGAATATTCATCAATGCTTCACAAAGCATTGGAAGGTGTAATAATGATGGAGACGTTTCCAAAAACAACCGTTGATGTTTTTGCATTGGTTCTTGAATCTGGAGGAAGTGACCTCTCTGTTTTGATATCATGTGCTAGTCTTGCTTTAGCTGATGCCGGAATTATGATGTATGACCTTATCACAGCTGTTTCAGTGTCTTGCATAGGCAAAAGCCTTATGATAGACCCGGTTACAGAGGAGGAAGGATGTGAAGATGGCAGCTTTATGATGACGTGCATGCCATCTCGTTATGAAATCACTCAGCTAACCATCACTGGTGAATGGACAACACCTAATATCAACGAGGCAATGCAGCTTTGCTTGGATGCTAGTTCAAAACTTGGAGAGATCATGCGTGATTGTCTGAAACAGTCTGCCTCAGCTTCCGATGAATGAGCATAAATAACTATGATTTTGGATTGTAGCTCAGACTTGGTATGAAACCGGTTTTAGCTGTTATAGGTAAACGGATTTAGTCTAAACCTGTGTGTAGTTTAAACCGATGTATGTTTTCACATAAGATTTGATGGAACTAGATCTTTAGCTATGAAATGGATCCCAATTGCGAGTGGTATCAAAGACATACAGAATTTAAAGTAGGGAA
  • >AT4G27490.5
    TATGACTCCAGTTATTTGTGAGACTAAACTAGATTTGAATTTTGTTTCTTTTGTGAAAAATGCTTCTTTCAGTACTTCAAACTGGTGCTGTGAGTTCTGCTTCTGGTTCTGCTTATGCTGAGTTTGGGAACACTAAAGTTATTGTTTCAGTATTTGGGCCAAGGGAGAGTAAGAAAGCAATGGTTTATAGTGATGTAGGTAGATTGAATTGTAATGTTAGCTATACAAATTTTGCTTCCCCTACTCTTGGCCAGGGAACTGATCACAAAGAATATTCATCAATGCTTCACAAAGCATTGGAAGGTGTAATAATGATGGAGACGTTTCCAAAAACAACCGTTGATGTTTTTGCATTGGTTCTTGAATCTGGAGGAAGTGACCTCTCTGTTTTGATATCATGTGCTAGTCTTGCTTTAGCTGATGCCGGAATTATGATGTATGACCTTATCACAGCTGTTTCAGTGTCTTGCATAGGCAAAAGCCTTATGATAGACCCGGTTACAGAGGAGGAAGGATGTGAAGATGGCAGCTTTATGATGACGTGCATGCCATCTCGTTATGAAATCACTCAGCTAACCATCACTGGTGAATGGACAACACCTAATATCAACGAGGCAATGCAGCTTTGCTTGGATGCTAGTTCAAAACTTGGAGAGATCATGCGTGATTGTCTGAAACAGTCTGCCTCAGCTTCCGATGAATGAGCATAAATAACTATGATTTTGGATTGTAGCTCAGACTTGGTATGAAACCGGTTTTAGCTGTTATAGGTAAACGGATTTAGTCTAAACCTGTGTGTAGTTTAAACCGATGTATGTTTTCACATAAGATTTGATGGAACTAGATCTTTAGCTATGAAATGGATCCCAATTGCGAGTGGTATCAAAGACATACAGAATTTAAAGTAGGGAA
  • >AT4G27490.2
    TATGACTCCAGTTATTTGTGAGACTAAACTAGATTTGAATTTTGTTTCTTTTGTGAAAAATGCTTCTTTCAGTACTTCAAACTGGTGCTGTGAGTTCTGCTTCTGGTTCTGCTTATGCTGAGTTTGGGAACACTAAAGTTATTGTTTCAGTATTTGGGCCAAGGGAGAGTAAGAAAGCAATGGTTTATAGTGATGTAGGTAGATTGAATTGTAATGTTAGCTATACAAATTTTGCTTCCCCTACTCTTGGCCAGGGAACTGATCACAAAGAATATTCATCAATGCTTCACAAAGCATTGGAAGGTGTAATAATGATGGAGACGTTTCCAAAAACAACCGTTGATGTTTTTGCATTGGTTCTTGAATCTGGAGGAAGTGACCTCTCTGTTTTGATATCATGTGCTAGTCTTGCTTTAGCTGATGCCGGAATTATGATGTATGACCTTATCACAGCTGTTTCAGTGTCTTGCATAGGCAAAAGCCTTATGATAGACCCGGTTACAGAGGAGGAAGGATGTGAAGATGGCAGCTTTATGATGACGTGCATGCCATCTCGTTATGAAATCACTCAGCTAACCATCACTGGTGAATGGACAACACCTAATATCAACGAGGCAATGCAGCTTTGCTTGGATGCTAGTTCAAAACTTGGAGAGATCATGCGTGATTGTCTGAAACAGTCTGCCTCAGCTTCCGATGAATGAGCATAAATAACTATGATTTTGGATTGTAGCTCAGACTTGGTATGAAACCGGTTTTAGCTGTTATAGGTAAACGGATTTAGTCTAAACCTGTGTGTAGTTTAAACCGATGTATGTTTTCACATAAGATTTGATGGAACTAGATCTTTAGCTATGAAATGGATCCCAATTGCGAGTGGTATCAAAGACATACAGAATTTAAAGTAGGGAA
  • >AT4G27490.3
    TATGACTCCAGTTATTTGTGAGACTAAACTAGATTTGAATTTTGTTTCTTTTGTGAAAAATGCTTCTTTCAGTACTTCAAACTGGTGCTGTGAGTTCTGCTTCTGGTTCTGCTTATGCTGAGTTTGGGAACACTAAAGTTATTGTTTCAGTATTTGGGCCAAGGGAGAGTAAGAAAGCAATGGTTTATAGTGATGTAGGTAGATTGAATTGTAATGTTAGCTATACAAATTTTGCTTCCCCTACTCTTGGCCAGGGAACTGATCACAAAGAATATTCATCAATGCTTCACAAAGCATTGGAAGGTGTAATAATGATGGAGACGTTTCCAAAAACAACCGTTGATGTTTTTGCATTGGTTCTTGAATCTGGAGGAAGTGACCTCTCTGTTTTGATATCATGTGCTAGTCTTGCTTTAGCTGATGCCGGAATTATGATGTATGACCTTATCACAGCTGTTTCAGTGTCTTGCATAGGCAAAAGCCTTATGATAGACCCGGTTACAGAGGAGGAAGGATGTGAAGATGGCAGCTTTATGATGACGTGCATGCCATCTCGTTATGAAATCACTCAGCTAACCATCACTGGTGAATGGACAACACCTAATATCAACGAGGCAATGCAGCTTTGCTTGGATGCTAGTTCAAAACTTGGAGAGATCATGCGTGATTGTCTGAAACAGTCTGCCTCAGCTTCCGATGAATGAGCATAAATAACTATGATTTTGGATTGTAGCTCAGACTTGGTATGAAACCGGTTTTAGCTGTTATAGGTAAACGGATTTAGTCTAAACCTGTGTGTAGTTTAAACCGATGTATGTTTTCACATAAGATTTGATGGAACTAGATCTTTAGCTATGAAATGGATCCCAATTGCGAGTGGTATCAAAGACATACAGAATTTAAAGTAGGGAA
  • >AT4G27490.4
    TATGACTCCAGTTATTTGTGAGACTAAACTAGATTTGAATTTTGTTTCTTTTGTGAAAAATGCTTCTTTCAGTACTTCAAACTGGTGCTGTGAGTTCTGCTTCTGGTTCTGCTTATGCTGAGTTTGGGAACACTAAAGTTATTGTTTCAGTATTTGGGCCAAGGGAGAGTAAGAAAGCAATGGTTTATAGTGATGTAGGTAGATTGAATTGTAATGTTAGCTATACAAATTTTGCTTCCCCTACTCTTGGCCAGGGAACTGATCACAAAGAATATTCATCAATGCTTCACAAAGCATTGGAAGGTGTAATAATGATGGAGACGTTTCCAAAAACAACCGTTGATGTTTTTGCATTGGTTCTTGAATCTGGAGGAAGTGACCTCTCTGTTTTGATATCATGTGCTAGTCTTGCTTTAGCTGATGCCGGAATTATGATGTATGACCTTATCACAGCTGTTTCAGTGTCTTGCATAGGCAAAAGCCTTATGATAGACCCGGTTACAGAGGAGGAAGGATGTGAAGATGGCAGCTTTATGATGACGTGCATGCCATCTCGTTATGAAATCACTCAGCTAACCATCACTGGTGAATGGACAACACCTAATATCAACGAGGCAATGCAGCTTTGCTTGGATGCTAGTTCAAAACTTGGAGAGATCATGCGTGATTGTCTGAAACAGTCTGCCTCAGCTTCCGATGAATGAGCATAAATAACTATGATTTTGGATTGTAGCTCAGACTTGGTATGAAACCGGTTTTAGCTGTTATAGGTAAACGGATTTAGTCTAAACCTGTGTGTAGTTTAAACCGATGTATGTTTTCACATAAGATTTGATGGAACTAGATCTTTAGCTATGAAATGGATCCCAATTGCGAGTGGTATCAAAGACATACAGAATTTAAAGTAGGGAA
CDS Sequence
Protein Sequence