Information report for AT4G16990
Gene Details
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Functional Descriptions
- GO:0003729 — enables — mRNA binding
- GO:0005634 — located in — nucleus
- GO:0009507 — located in — chloroplast
- GO:0061809 — enables — NAD+ nucleotidase, cyclic ADP-ribose generating
- GO:0050135 — enables — NAD(P)+ nucleosidase activity
- GO:0005737 — located in — cytoplasm
- GO:0006952 — involved in — defense response
- GO:2000071 — acts upstream of or within — regulation of defense response by callose deposition
- GO:0043531 — enables — ADP binding
- GO:0005829 — located in — cytosol
- GO:0007165 — involved in — signal transduction
Functional Keywords
Literature and News
- TIR-X and TIR-NBS proteins: two new families related to disease resistance TIR-NBS-LRR proteins encoded in Arabidopsis and other plant genomes. DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01404.x ; PMID: 12366802
- The zinc finger protein Zat12 is required for cytosolic ascorbate peroxidase 1 expression during oxidative stress in Arabidopsis. DOI: 10.1074/jbc.M313350200 ; PMID: 14722088
- Changes in gene expression in response to altered SHL transcript levels. DOI: 10.1023/B:PLAN.0000023661.65248.4b ; PMID: 15082927
- Gibberellin mobilizes distinct DELLA-dependent transcriptomes to regulate seed germination and floral development in Arabidopsis. DOI: 10.1104/pp.106.082289 ; PMID: 16920880
- Global expression analysis of nucleotide binding site-leucine rich repeat-encoding and related genes in Arabidopsis. DOI: 10.1186/1471-2229-7-56 ; PMID: 17956627
- RLM3, a TIR domain encoding gene involved in broad-range immunity of Arabidopsis to necrotrophic fungal pathogens. DOI: 10.1111/j.1365-313X.2008.03503.x ; PMID: 18397376
- Heterosis manifestation during early Arabidopsis seedling development is characterized by intermediate gene expression and enhanced metabolic activity in the hybrids. DOI: 10.1111/j.1365-313X.2012.05021.x ; PMID: 22487254
- Loss and retention of resistance genes in five species of the Brassicaceae family. DOI: 10.1186/s12870-014-0298-z ; PMID: 25365911
- Discovering the RNA-Binding Proteome of Plant Leaves with an Improved RNA Interactome Capture Method. DOI: 10.3390/biom10040661 ; PMID: 32344669
- The TIR-NBS protein TN13 associates with the CC-NBS-LRR resistance protein RPS5 and contributes to RPS5-triggered immunity in Arabidopsis. DOI: 10.1111/tpj.15345 ; PMID: 33982335
Gene Resources
- UniProt: B3H733
- EMBL: CP002687
- AlphaFoldDB: B3H733
- EnsemblPlants: AT4G16990.5
- Gramene: AT4G16990.5
- ExpressionAtlas: AT4G16990
- InterPro: IPR002182, IPR013591, IPR027417
- PANTHER: PTHR11017, PTHR11017:SF274
- SUPFAM: SSF52540
- PROSITE: PS51514
- Gene3D: 1.10.8.430, 3.40.50.300
- SWISS-MODEL: B3H733
Sequences
cDNA Sequence
- >AT4G16990.5
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CDS Sequence
Protein Sequence