Information report for AT3G20650
Gene Details
|
|
Functional Descriptions
- PO:0000084 — plant sperm cell — célula espermática o esperma (Spanish, exact), male gamete (exact), microgamete (exact), 植物精子細胞 (Japanese, exact), sperm nucleus (related), sperm cell (broad)
- PO:0025281 — pollen — polen (Spanish, exact), pollen grain (exact), 花粉 (Japanese, exact)
Functional Keywords
Literature and News
- Inactivation of the chloroplast ATP synthase gamma subunit results in high non-photochemical fluorescence quenching and altered nuclear gene expression in Arabidopsis thaliana. DOI: 10.1074/jbc.M308435200 ; PMID: 14576160
- Arabidopsis DCP2, DCP1, and VARICOSE form a decapping complex required for postembryonic development. DOI: 10.1105/tpc.106.047605 ; PMID: 17158604
Gene Resources
- UniProt: A0A1I9LQA7
- EMBL: CP002686
- AlphaFoldDB: A0A1I9LQA7
- EnsemblPlants: AT3G20650.3
- Gramene: AT3G20650.3
- Orthologous matrix: HYCFESM
- ExpressionAtlas: AT3G20650
- InterPro: IPR004971, IPR016899, IPR029063
- PANTHER: PTHR12189, PTHR12189:SF2
- SUPFAM: SSF53335
- PROSITE: PS51562
- Gene3D: 3.40.50.150
- OrthoDB: A0A1I9LQA7
- SWISS-MODEL: A0A1I9LQA7
- Conserved Domain Database: cd02440
Sequences
cDNA Sequence
- >AT3G20650.3
ATGAAACGAGGATTCTCCGATTCTCCTTCAAGCTCTGCTCCTCCTCCTTCTTCCAGATTCAAATCTAATCCCGAAGGTGATTCTCAGTTTCTGGAAGATGAGACTACAAAGAATTTTGCCCGGAAAGTTGCTGATCATTACAGTAGGAGAACAAACCAAACATTGGAAGAGCGAGAAGCTAGTCCCATCATTCATTTGAAGAAACTTAACAATTGGATTAAAAGTGTTTTGATCCAGCTTTATGCTCGTCCTGACGATGCTGTTCTCGACCTTGCCTGTGGGAAGGGTGGTGATTTGATCAAGTGGGATAAGGCGAGAATCGGGTACTATGTTGGAATTGATATTGCTGAAGGGTCGATTGAAGATTGTCGCACGCGTTATAACGGTGATGCAGACCATCATCAACGGCGTAAAAAGTTCAGTTTTCCGTCTCGATTATTATGTGGGGATTGTTTTGAGGTAGAGCTAGACAAGATTCTTGAAGAGGATGCCCCTTTTGATATCTGCAGTTGCCAGTTTGCTATGCATTACTCATGGACTACTGAGGCACGTGCACGACGAGCTTTGGCAAATGTTTCAGCTTTACTTCGTCCAGGAGGTGTCTTTATCGGAACAATGCCAGATGCCAATGTTATTATAAAAAAACTCAGAGAAGCTGAAGGTTTGGAGATTGGTAATAGTGTTTACTGGATTCGTTTTGGTGAAGAGTATTCCCAAAAGAAGTTCAAATCTAGCAGCCCATTTGGTATCGAATACGTGTTTCATCTCGAGGATGCTGTTGATTGTCCTGAATGGATTGTGCCCTTTAACGTCTTCAAGTCTTTAGCGGAGGAGTATGATTTAGAGTTGGTATTTGTGAAGAACTCCCACGAGTTTGTCCATGAGTATATGAAAAAGCCAGAGTTTGTCGAACTCATGAGAAGGCTTGGTGCTTTGGGTGATGGTAGCAATGATCAGAGCACATTATCAGCTGATGAATGGGAAGCTGCATATTTATACCTCTCTTTTGTCTTGAGAAAGGTTTGTCTCCTTTTTATCATCTTTCAATCTTCACCTTTCCTGCTTCGTCGGTAATGTCTATTTAACGGGTGGATTTTATAGAGGGGAGAATCAGATGGAGCTCGAAGGAGCGGGCGGAGGAAGAATGGGAAAATGAACTTGTCGAAAGATGATGTTTTGTATATCGATAGCTGAAGTGTCAAAGAGTGTTTCTTTTACTCTTAGAGTCTCTGTTTTTGGTCTCACTTCGTTGTCTTACGTTTTTGGCCATTTGAATTGAGAGATTGCATTACTTTAGAAAAATCTGATCCGTTCACAAGAAAGAAGATGAGAAGAAGCCAAATAATATTATAGTCGTTGAACACTTGTGTTTTCAAGTGTATAGGCTTTGATATACCATCAGGATGATGAACATGGTTACCATCATGATCATTATTCATGATTTGTATTGTGATGTATTCGTAGCGTACTTTGTTTAACAAGGTCCATGCCTTTTTATTTGTATTACTATCTTTTGGGATTAGGTCGAGTTTGAACTAGAGGAAATTGAGAAAAATTTCAAGC - >AT3G20650.2
ATGAAACGAGGATTCTCCGATTCTCCTTCAAGCTCTGCTCCTCCTCCTTCTTCCAGATTCAAATCTAATCCCGAAGGTGATTCTCAGTTTCTGGAAGATGAGACTACAAAGAATTTTGCCCGGAAAGTTGCTGATCATTACAGTAGGAGAACAAACCAAACATTGGAAGAGCGAGAAGCTAGTCCCATCATTCATTTGAAGAAACTTAACAATTGGATTAAAAGTGTTTTGATCCAGCTTTATGCTCGTCCTGACGATGCTGTTCTCGACCTTGCCTGTGGGAAGGGTGGTGATTTGATCAAGTGGGATAAGGCGAGAATCGGGTACTATGTTGGAATTGATATTGCTGAAGGGTCGATTGAAGATTGTCGCACGCGTTATAACGGTGATGCAGACCATCATCAACGGCGTAAAAAGTTCAGTTTTCCGTCTCGATTATTATGTGGGGATTGTTTTGAGGTAGAGCTAGACAAGATTCTTGAAGAGGATGCCCCTTTTGATATCTGCAGTTGCCAGTTTGCTATGCATTACTCATGGACTACTGAGGCACGTGCACGACGAGCTTTGGCAAATGTTTCAGCTTTACTTCGTCCAGGAGGTGTCTTTATCGGAACAATGCCAGATGCCAATGTTATTATAAAAAAACTCAGAGAAGCTGAAGGTTTGGAGATTGGTAATAGTGTTTACTGGATTCGTTTTGGTGAAGAGTATTCCCAAAAGAAGTTCAAATCTAGCAGCCCATTTGGTATCGAATACGTGTTTCATCTCGAGGATGCTGTTGATTGTCCTGAATGGATTGTGCCCTTTAACGTCTTCAAGTCTTTAGCGGAGGAGTATGATTTAGAGTTGGTATTTGTGAAGAACTCCCACGAGTTTGTCCATGAGTATATGAAAAAGCCAGAGTTTGTCGAACTCATGAGAAGGCTTGGTGCTTTGGGTGATGGTAGCAATGATCAGAGCACATTATCAGCTGATGAATGGGAAGCTGCATATTTATACCTCTCTTTTGTCTTGAGAAAGGTTTGTCTCCTTTTTATCATCTTTCAATCTTCACCTTTCCTGCTTCGTCGGTAATGTCTATTTAACGGGTGGATTTTATAGAGGGGAGAATCAGATGGAGCTCGAAGGAGCGGGCGGAGGAAGAATGGGAAAATGAACTTGTCGAAAGATGATGTTTTGTATATCGATAGCTGAAGTGTCAAAGAGTGTTTCTTTTACTCTTAGAGTCTCTGTTTTTGGTCTCACTTCGTTGTCTTACGTTTTTGGCCATTTGAATTGAGAGATTGCATTACTTTAGAAAAATCTGATCCGTTCACAAGAAAGAAGATGAGAAGAAGCCAAATAATATTATAGTCGTTGAACACTTGTGTTTTCAAGTGTATAGGCTTTGATATACCATCAGGATGATGAACATGGTTACCATCATGATCATTATTCATGATTTGTATTGTGATGTATTCGTAGCGTACTTTGTTTAACAAGGTCCATGCCTTTTTATTTGTATTACTATCTTTTGGGATTAGGTCGAGTTTGAACTAGAGGAAATTGAGAAAAATTTCAAGC - >AT3G20650.1
ATGAAACGAGGATTCTCCGATTCTCCTTCAAGCTCTGCTCCTCCTCCTTCTTCCAGATTCAAATCTAATCCCGAAGGTGATTCTCAGTTTCTGGAAGATGAGACTACAAAGAATTTTGCCCGGAAAGTTGCTGATCATTACAGTAGGAGAACAAACCAAACATTGGAAGAGCGAGAAGCTAGTCCCATCATTCATTTGAAGAAACTTAACAATTGGATTAAAAGTGTTTTGATCCAGCTTTATGCTCGTCCTGACGATGCTGTTCTCGACCTTGCCTGTGGGAAGGGTGGTGATTTGATCAAGTGGGATAAGGCGAGAATCGGGTACTATGTTGGAATTGATATTGCTGAAGGGTCGATTGAAGATTGTCGCACGCGTTATAACGGTGATGCAGACCATCATCAACGGCGTAAAAAGTTCAGTTTTCCGTCTCGATTATTATGTGGGGATTGTTTTGAGGTAGAGCTAGACAAGATTCTTGAAGAGGATGCCCCTTTTGATATCTGCAGTTGCCAGTTTGCTATGCATTACTCATGGACTACTGAGGCACGTGCACGACGAGCTTTGGCAAATGTTTCAGCTTTACTTCGTCCAGGAGGTGTCTTTATCGGAACAATGCCAGATGCCAATGTTATTATAAAAAAACTCAGAGAAGCTGAAGGTTTGGAGATTGGTAATAGTGTTTACTGGATTCGTTTTGGTGAAGAGTATTCCCAAAAGAAGTTCAAATCTAGCAGCCCATTTGGTATCGAATACGTGTTTCATCTCGAGGATGCTGTTGATTGTCCTGAATGGATTGTGCCCTTTAACGTCTTCAAGTCTTTAGCGGAGGAGTATGATTTAGAGTTGGTATTTGTGAAGAACTCCCACGAGTTTGTCCATGAGTATATGAAAAAGCCAGAGTTTGTCGAACTCATGAGAAGGCTTGGTGCTTTGGGTGATGGTAGCAATGATCAGAGCACATTATCAGCTGATGAATGGGAAGCTGCATATTTATACCTCTCTTTTGTCTTGAGAAAGGTTTGTCTCCTTTTTATCATCTTTCAATCTTCACCTTTCCTGCTTCGTCGGTAATGTCTATTTAACGGGTGGATTTTATAGAGGGGAGAATCAGATGGAGCTCGAAGGAGCGGGCGGAGGAAGAATGGGAAAATGAACTTGTCGAAAGATGATGTTTTGTATATCGATAGCTGAAGTGTCAAAGAGTGTTTCTTTTACTCTTAGAGTCTCTGTTTTTGGTCTCACTTCGTTGTCTTACGTTTTTGGCCATTTGAATTGAGAGATTGCATTACTTTAGAAAAATCTGATCCGTTCACAAGAAAGAAGATGAGAAGAAGCCAAATAATATTATAGTCGTTGAACACTTGTGTTTTCAAGTGTATAGGCTTTGATATACCATCAGGATGATGAACATGGTTACCATCATGATCATTATTCATGATTTGTATTGTGATGTATTCGTAGCGTACTTTGTTTAACAAGGTCCATGCCTTTTTATTTGTATTACTATCTTTTGGGATTAGGTCGAGTTTGAACTAGAGGAAATTGAGAAAAATTTCAAGC
CDS Sequence
- >AT3G20650.3
ATGAAACGAGGATTCTCCGATTCTCCTTCAAGCTCTGCTCCTCCTCCTTCTTCCAGATTCAAATCTAATCCCGAAGGTGATTCTCAGTTTCTGGAAGATGAGACTACAAAGAATTTTGCCCGGAAAGTTGCTGATCATTACAGTAGGAGAACAAACCAAACATTGGAAGAGCGAGAAGCTAGTCCCATCATTCATTTGAAGAAACTTAACAATTGGATTAAAAGTGTTTTGATCCAGCTTTATGCTCGTCCTGACGATGCTGTTCTCGACCTTGCCTGTGGGAAGGGTGGTGATTTGATCAAGTGGGATAAGGCGAGAATCGGGTACTATGTTGGAATTGATATTGCTGAAGGGTCGATTGAAGATTGTCGCACGCGTTATAACGGTGATGCAGACCATCATCAACGGCGTAAAAAGTTCAGTTTTCCGTCTCGATTATTATGTGGGGATTGTTTTGAGGTAGAGCTAGACAAGATTCTTGAAGAGGATGCCCCTTTTGATATCTGCAGTTGCCAGTTTGCTATGCATTACTCATGGACTACTGAGGCACGTGCACGACGAGCTTTGGCAAATGTTTCAGCTTTACTTCGTCCAGGAGGTGTCTTTATCGGAACAATGCCAGATGCCAATGTTATTATAAAAAAACTCAGAGAAGCTGAAGGTTTGGAGATTGGTAATAGTGTTTACTGGATTCGTTTTGGTGAAGAGTATTCCCAAAAGAAGTTCAAATCTAGCAGCCCATTTGGTATCGAATACGTGTTTCATCTCGAGGATGCTGTTGATTGTCCTGAATGGATTGTGCCCTTTAACGTCTTCAAGTCTTTAGCGGAGGAGTATGATTTAGAGTTGGTATTTGTGAAGAACTCCCACGAGTTTGTCCATGAGTATATGAAAAAGCCAGAGTTTGTCGAACTCATGAGAAGGCTTGGTGCTTTGGGTGATGGTAGCAATGATCAGAGCACATTATCAGCTGATGAATGGGAAGCTGCATATTTATACCTCTCTTTTGTCTTGAGAAAGGTTTGTCTCCTTTTTATCATCTTTCAATCTTCACCTTTCCTGCTTCGTCGGTAA - >AT3G20650.2
ATGAAACGAGGATTCTCCGATTCTCCTTCAAGCTCTGCTCCTCCTCCTTCTTCCAGATTCAAATCTAATCCCGAAGGTGATTCTCAGTTTCTGGAAGATGAGACTACAAAGAATTTTGCCCGGAAAGTTGCTGATCATTACAGTAGGAGAACAAACCAAACATTGGAAGAGCGAGAAGCTAGTCCCATCATTCATTTGAAGAAACTTAACAATTGGATTAAAAGTGTTTTGATCCAGCTTTATGCTCGTCCTGACGATGCTGTTCTCGACCTTGCCTGTGGGAAGGGTGGTGATTTGATCAAGTGGGATAAGGCGAGAATCGGGTACTATGTTGGAATTGATATTGCTGAAGGGTCGATTGAAGATTGTCGCACGCGTTATAACGGTGATGCAGACCATCATCAACGGCGTAAAAAGTTCAGTTTTCCGTCTCGATTATTATGTGGGGATTGTTTTGAGGTAGAGCTAGACAAGATTCTTGAAGAGGATGCCCCTTTTGATATCTGCAGTTGCCAGTTTGCTATGCATTACTCATGGACTACTGAGGCACGTGCACGACGAGCTTTGGCAAATGTTTCAGCTTTACTTCGTCCAGGAGGTGTCTTTATCGGAACAATGCCAGATGCCAATGTTATTATAAAAAAACTCAGAGAAGCTGAAGGTTTGGAGATTGGTAATAGTGTTTACTGGATTCGTTTTGGTGAAGAGTATTCCCAAAAGAAGTTCAAATCTAGCAGCCCATTTGGTATCGAATACGTGTTTCATCTCGAGGATGCTGTTGATTGTCCTGAATGGATTGTGCCCTTTAACGTCTTCAAGTCTTTAGCGGAGGAGTATGATTTAGAGTTGGTATTTGTGAAGAACTCCCACGAGTTTGTCCATGAGTATATGAAAAAGCCAGAGTTTGTCGAACTCATGAGAAGGCTTGGTGCTTTGGGTGATGGTAGCAATGATCAGAGCACATTATCAGCTGATGAATGGGAAGCTGCATATTTATACCTCTCTTTTGTCTTGAGAAAGGTTTGTCTCCTTTTTATCATCTTTCAATCTTCACCTTTCCTGCTTCGTCGGTAA - >AT3G20650.1
ATGAAACGAGGATTCTCCGATTCTCCTTCAAGCTCTGCTCCTCCTCCTTCTTCCAGATTCAAATCTAATCCCGAAGGTGATTCTCAGTTTCTGGAAGATGAGACTACAAAGAATTTTGCCCGGAAAGTTGCTGATCATTACAGTAGGAGAACAAACCAAACATTGGAAGAGCGAGAAGCTAGTCCCATCATTCATTTGAAGAAACTTAACAATTGGATTAAAAGTGTTTTGATCCAGCTTTATGCTCGTCCTGACGATGCTGTTCTCGACCTTGCCTGTGGGAAGGGTGGTGATTTGATCAAGTGGGATAAGGCGAGAATCGGGTACTATGTTGGAATTGATATTGCTGAAGGGTCGATTGAAGATTGTCGCACGCGTTATAACGGTGATGCAGACCATCATCAACGGCGTAAAAAGTTCAGTTTTCCGTCTCGATTATTATGTGGGGATTGTTTTGAGGTAGAGCTAGACAAGATTCTTGAAGAGGATGCCCCTTTTGATATCTGCAGTTGCCAGTTTGCTATGCATTACTCATGGACTACTGAGGCACGTGCACGACGAGCTTTGGCAAATGTTTCAGCTTTACTTCGTCCAGGAGGTGTCTTTATCGGAACAATGCCAGATGCCAATGTTATTATAAAAAAACTCAGAGAAGCTGAAGGTTTGGAGATTGGTAATAGTGTTTACTGGATTCGTTTTGGTGAAGAGTATTCCCAAAAGAAGTTCAAATCTAGCAGCCCATTTGGTATCGAATACGTGTTTCATCTCGAGGATGCTGTTGATTGTCCTGAATGGATTGTGCCCTTTAACGTCTTCAAGTCTTTAGCGGAGGAGTATGATTTAGAGTTGGTATTTGTGAAGAACTCCCACGAGTTTGTCCATGAGTATATGAAAAAGCCAGAGTTTGTCGAACTCATGAGAAGGCTTGGTGCTTTGGGTGATGGTAGCAATGATCAGAGCACATTATCAGCTGATGAATGGGAAGCTGCATATTTATACCTCTCTTTTGTCTTGAGAAAGGTTTGTCTCCTTTTTATCATCTTTCAATCTTCACCTTTCCTGCTTCGTCGGTAA
Protein Sequence
- >AT3G20650.3
MKRGFSDSPSSSAPPPSSRFKSNPEGDSQFLEDETTKNFARKVADHYSRRTNQTLEEREASPIIHLKKLNNWIKSVLIQLYARPDDAVLDLACGKGGDLIKWDKARIGYYVGIDIAEGSIEDCRTRYNGDADHHQRRKKFSFPSRLLCGDCFEVELDKILEEDAPFDICSCQFAMHYSWTTEARARRALANVSALLRPGGVFIGTMPDANVIIKKLREAEGLEIGNSVYWIRFGEEYSQKKFKSSSPFGIEYVFHLEDAVDCPEWIVPFNVFKSLAEEYDLELVFVKNSHEFVHEYMKKPEFVELMRRLGALGDGSNDQSTLSADEWEAAYLYLSFVLRKVCLLFIIFQSSPFLLRR - >AT3G20650.2
MKRGFSDSPSSSAPPPSSRFKSNPEGDSQFLEDETTKNFARKVADHYSRRTNQTLEEREASPIIHLKKLNNWIKSVLIQLYARPDDAVLDLACGKGGDLIKWDKARIGYYVGIDIAEGSIEDCRTRYNGDADHHQRRKKFSFPSRLLCGDCFEVELDKILEEDAPFDICSCQFAMHYSWTTEARARRALANVSALLRPGGVFIGTMPDANVIIKKLREAEGLEIGNSVYWIRFGEEYSQKKFKSSSPFGIEYVFHLEDAVDCPEWIVPFNVFKSLAEEYDLELVFVKNSHEFVHEYMKKPEFVELMRRLGALGDGSNDQSTLSADEWEAAYLYLSFVLRKVCLLFIIFQSSPFLLRR - >AT3G20650.1
MKRGFSDSPSSSAPPPSSRFKSNPEGDSQFLEDETTKNFARKVADHYSRRTNQTLEEREASPIIHLKKLNNWIKSVLIQLYARPDDAVLDLACGKGGDLIKWDKARIGYYVGIDIAEGSIEDCRTRYNGDADHHQRRKKFSFPSRLLCGDCFEVELDKILEEDAPFDICSCQFAMHYSWTTEARARRALANVSALLRPGGVFIGTMPDANVIIKKLREAEGLEIGNSVYWIRFGEEYSQKKFKSSSPFGIEYVFHLEDAVDCPEWIVPFNVFKSLAEEYDLELVFVKNSHEFVHEYMKKPEFVELMRRLGALGDGSNDQSTLSADEWEAAYLYLSFVLRKVCLLFIIFQSSPFLLRR