Information report for AT3G20010
Gene Details
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Functional Descriptions
- PO:0000084 — plant sperm cell — célula espermática o esperma (Spanish, exact), male gamete (exact), microgamete (exact), 植物精子細胞 (Japanese, exact), sperm nucleus (related), sperm cell (broad)
Functional Keywords
Literature and News
- Evaluation and classification of RING-finger domains encoded by the Arabidopsis genome. DOI: 10.1186/gb-2002-3-4-research0016 ; PMID: 11983057
- Isolation, sequence analysis, and expression studies of florally expressed cDNAs in Arabidopsis. DOI: 10.1023/B:PLAN.0000019063.18097.62 ; PMID: 15010618
- A transcriptome-based characterization of habituation in plant tissue culture. DOI: 10.1104/pp.105.076059 ; PMID: 16489130
- SNF2 chromatin remodeler-family proteins FRG1 and -2 are required for RNA-directed DNA methylation. DOI: 10.1073/pnas.1420515111 ; PMID: 25425661
- SUVR2 is involved in transcriptional gene silencing by associating with SNF2-related chromatin-remodeling proteins in Arabidopsis. DOI: 10.1038/cr.2014.156 ; PMID: 25420628
- Repertoire of plant RING E3 ubiquitin ligases revisited: New groups counting gene families and single genes. DOI: 10.1371/journal.pone.0203442 ; PMID: 30169501
Gene Resources
- UniProt: A0A1I9LTA5
- EMBL: CP002686
- AlphaFoldDB: A0A1I9LTA5
- EnsemblPlants: AT3G20010.4, AT3G20010.6, AT3G20010.8
- Gramene: AT3G20010.4, AT3G20010.6, AT3G20010.8
- ExpressionAtlas: AT3G20010
- InterPro: IPR000330, IPR001841, IPR013083
- PANTHER: PTHR45626, PTHR45626:SF34
- SUPFAM: SSF52540, SSF57850
- PROSITE: PS00518, PS50089, PS51192
- Gene3D: 3.30.40.10, 3.40.50.10810, 3.40.50.300
- Conserved Domain Database: cd18008, cd18793, cd23142
Homologs
- Brachypodium distachyon BRADI_1g57635v3
- Glycine max Glyma.02G174100
- Oryza sativa BRHIS1, ALT1
- Rosa chinensis RchiOBHm_Chr5g0025621
Sequences
cDNA Sequence
- >AT3G20010.8
ATGGATTCTGCTATTGAAATTAGTTCAGGTAGTGATAGTGATGACGAAGTACCACCGCAGCCTGTTTGGCCACAAACTCGAACCAGGATGGATCCCACATGGCTAAGCAGGAGACCTTTGCCTACAGTGGATAGCCATGCTAGAGCTGAACATACAAATCAGGCTCCTCCCAATGGTGCCTCGAGTGATACTTCTCGGCCTGGAGTCTCTAAGCCTTTCACAGGGAATGGGAACACTGTAAACTCGAGAATTTCCAGTGGATCTGGTGCTGATTATGTGAGACTGTCTTCTGAGCAAGCTCTGAAAAGAACTCTTCCACCCTCTTTTAATTCCCCTCCCCTTCCTGCCAGAAGTGGCACTAACAATATAAGTAATGCTAGTGGAAGTCGTGTTGGTGTGGATTATGAGAGACCATTGTCTCAGCAAGCTCTGAAAAGAACTCTTCCACCCTCTTTTAATCCCCCTCCCCTTCCTTCCAGAAGTGGCACAAACAATATACGTAATGCTGGTGGGAGTCGCTTTGGTGCCGATTATAGTCATCCAGCTGTGTCAGCTGTAGGCAACAAGAGTACCTTTGGTGATCATTATAGTGGAGCCCATGCTGAGATAGGAATTCAACGTGGCGTGAATGGGGTTAGGATCCTGCCTCCATCTCTGACGCATGGAACATCTGCTTCTGTTTTGCATCATGCTGGTTCGAGTGATCCAATGCACAGGTTTGGTGGTGGTGAAGATAGGAATCCTGATAACGATGAAAGGCTGGTTTATCAGGCTGCACTACAGGTTTTGAATCAACCCATGACTGAAAGTGATCTACCTCCTGGTACTCTTTCAGTTCCTCTTATGAGGCATCAGAAAATTGCGTTGGCATGGATGTTTCAGAAGGAAACAAGTAGTTTCAACTGTCCAGGAGGGATACTAGCAGATGATCAGGGACTTGGTAAGACGGTCTCGACGATTGCTCTTATCCTAAAGCAAAAGATTGTGTCACAACTGAAGTCCGAAAGTTCATGCAAGCAAGAAACTGAGGCATTAGTCCTGGATGCTGATGATGAGTCAGACAATGCAAAGCATGAAAGTGGTAGTCATGTAAAACCAGAGCTCAAGGTTTCAAGCAACAGTGAGACCTCGGTTCTGAGTGCATGTGGTAATGATGAGAATGACAGTTCAGATATGGAGAAAGCCGAAGATGAAGAAGCTAATTCTTCAACACGAGCATTTCAGTGGAAGAGACCAGCTGCTGGTACATTAATTGTTTGCCCAGCGAGTGTTGTAAGGCAGTGGGCAAGAGAGCTTGATGAGAAGGTTTCTGAAGAATCCAAACTTTCTGTGTTAGTCTACCATGGTAGTAATAGGACCAAAGATCCTAATGAATTAGCAGAATACGATGTGGTTGTGACAACGTACGCTATTGTTACTAATGAAGCTCCCAACAAATTCTTGGTGGATGAGGATGAGAACGATGAAAAAAATACTGACAGATATGGTCTTGCCTCTGGCTTCTCCAACAATAAGAAACGGAAAGTCGTGGTGGGTGCTAGTAAGAAGAGTAAAAGAAGAGGTAGAAAAAGCACTAACGATACTTCTTCTGAGCCTGATTGTGGTCCTCTAGGAAAGGTTGGGTGGTTCAGAATAGTACTAGATGAAGCTCAGACAATTAAGAACTATAGAACACAAATGGCAAGATCATGTTGCACTCTTCGAGCCAAAAGGAGGTGGTGCTTGTCTGGAACACCAATACAAAATACGATTGATGATTTATATAGCTATTTCAGGTTTCTTAGATATGATCCATATGCGGTGTACAAGTCATTTTACAGTACAATCAAGGTTCCAATTTCCAGAAATTCTTGTCAAGGTTACAAGAAGCTTCAAGCTGTTCTAAGGGCTATAATGCTGCGCCGCACCAAAGGAACATTGCTTGATGGGAAACCCATAATTAATCTACCTCCAAAGGTAGTAAATTTGAGCCAGGTAGACTTTTCAGTGGCTGAGCGCTCTTTCTACAAGAAGCTTGAAGCTGATTCACGTTCACAGTTCAAGGCCTATGCTGATGCGGGAACTTTGAGTCAAAACTACGCAAATATTCTTCTGTTGCTTTTGCGACTACGCCAAGCTTGTGACCACCCACAACTTGTTAAAAGATATAACTCAGATCCTGTTGGAAAAGTATCAGAAGCAGCAGTTAGAAGACTCCCTAGGGAGGCTCGAAGCAGACTGATCAATCGCTTAGAGTCATCATCTGCCATCTGCTATGAGTGCAATGAGCCACCAGAAAAACCTGTTGTTACGTTGTGTGGCCATATATTTTGCTATGAATGTGTTTTAGAATACATAACTGGGGATGAGAACACGTGCCCTGTACCGAGATGCAAACAACAGCTTGCGCGTGATGTTGTTTTCTCTGAATCTTCTCTTAGAAATTGCACTTCTGATGATTCGGGCTGTAGTTCCTCTCATGATAATGGTCTTGATAGATCGGTATTTCAAAAAAGAGACTTTTGTTCATCAAAAATTAAAGCTGTCCTCGATATCCTGCAGTCGCTTTCCCAACCAGACAGTCCAAACTCAGCTCAGCATGGTCAAATGCCATCTTCCTCACGGCCATATGATGACGATGATGTTACCATTGTAGAGCCAATGCGTCTTCACTCATCTTCACCTAGCCAGGGGGCAGTAAAGACGATAATATTTTCTCAGTGGACTGGTATGCTTGACTTGGTTGAGCTGCGTATTCTTGAAAGTGGTATTGAATTCAGAAGATTAGATGGCACAATGAGTCTAGCAGCAAGAGACAGGGCGGTTAAAGAATTCAGTAAAAAACCAGATGTAAGTGATGTAAATATCTTAGATATGTTTTCTAAAACAATATACTAATCGTTTCTCTGAAATATGGAATGTTCATGGAGTATTGATCCTGAAGCTCTCTAAAAGCGCAAAAAAAATTTTATTAGGTAAAGGTGATGCTGATGTCGCTAAAAGCTGGAAACCTTGGGCTGAATATGGTAGCTGCATGTCATGTTATTCTCTTGGATCTTTGGTGGAATCCAACTACCGAAGATCAGGCGATTGATCGTGCACATCGTATTGGACAAACTCGGCCAGTTACTGTAACTCGCATAACTATAAAAGACACCGTTGAGGATAGAATTTTGAAGCTTCAGGTATTCTCTAAACTCTATCTGCTCATTGTCGCTGGGTTTTGG - >AT3G20010.7
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