Gene Details:
- Gene ID: AT3G05680
- Gene Symbol: EMB2016, VIR
- Gene Name: embryo defective 2016, VIRILIZER
- Description: embryo defective 2016;(source:Araport11)
- TAIR Accession: locus:2078082
- Genome: Araport11_genome_release
- Species: Arabidopsis thaliana
Transcripts:
Gene Ontology:
- GO:0080009 — involved in — mRNA methylation
- GO:0009793 — acts upstream of or within — embryo development ending in seed dormancy
- GO:0080009 — acts upstream of or within — mRNA methylation
- GO:0009793 — involved in — embryo development ending in seed dormancy
- GO:0010117 — involved in — photoprotection
- GO:0009651 — acts upstream of or within — response to salt stress
- GO:0005654 — located in — nucleoplasm
Germplasm Phenotype:
- vir-1 — Aberrant root cap formation, gravity response and lateral root development, as well as defective cotyledonal development.
Literature:
- Identification of genes required for embryo development in Arabidopsis. DOI: 10.1104/pp.104.045179 ; PMID: 15266054
- Identification of factors required for m(6) A mRNA methylation in Arabidopsis reveals a role for the conserved E3 ubiquitin ligase HAKAI. DOI: 10.1111/nph.14586 ; PMID: 28503769
- Genome-wide identification of EMBRYO-DEFECTIVE (EMB) genes required for growth and development in Arabidopsis. DOI: 10.1111/nph.16071 ; PMID: 31334862
- N(6) -Methyladenosine mRNA methylation is important for salt stress tolerance in Arabidopsis. DOI: 10.1111/tpj.15270 ; PMID: 33843075
- N(6)-methyladenosine RNA modification regulates photosynthesis during photodamage in plants. DOI: 10.1038/s41467-022-35146-z ; PMID: 36460653
Sequences:
cDNA Sequence
- >AT3G05680.1
GTTTAAATCGATAAGAACCGTTTTTGTTAATCAAAACCGGGCCAACCCTAAAAAGCTAAACGCCGGTTAGACTAAAAGAGCCAACCGCCGGATAAACCAAAAAAACAACGGCGTTTGTTTTTTCTTCTCCTTCTTCTTCACCCTGCGTCGTGCTCTCTCGAATTCCCAGATTTTAGCAACCAGTCTGAATCAATTTTATGAAGACCTAAGAGACCTAGCAATTCAAGAAGACCACCAATCAATCCTGGAGGCATGGTACGATCTGAGCCTTGTGTTCTGTTCGCTCAGACCTTTGTTCATCCTCAATTGGACGAATATGTTGACGAGGTGATATTTGCTGAGCCAGTAATCATCACAGCTTGCGAATTTTTGGAGCAGAATGCTTCCTCATCTTCTCAAGCTGTTTCTCTTGTCGGGGCAACTTCACCTCCTTCATTTGCGTTGGAAGTGTTCGTTCGATGTGAAGGAGAATCAAAGTTTAAGCGACTTTGTAATCCTTTTCTTTACACTCCTTCAGCGCCCTACCCTTTGGAAGTGGAGGCTGTTGTAACAAACCATCTGGTGGTCAGAGGTAGCTATCGAAGTTTGAGCTTGATCGTCTATGGGAACATCGTCAAAGATTTGGGGCAGTACAATATCATTCTTGAAGGTCGTTCTGTAACTGATATTGTGAGTTCCACTGAGGGTAATCTTGAGGACTTGCCATTGGTATTGCACTCAGTTAACAGAACAATAGAGGAATGTCTATCCTCTCTAGACATAGTATCTCTCCCCCTGGCTGCTGTAGATTTGCCGGTGGAAGTAAAGCGATTGTTGCAGCTGCTGCTAAAAATCTTTGATAAGCTAGCTACTAATGATGTAGTAAATAAATTTGTGGATACGGTAGTGTCTGGGGTCTCCTCGTATGTCACAGACAATGTAGATTTCTTTTTAAAGAATAAGAATTGTTCGGCTGTGACCAGTTCCCTAGATTCTGGGTTATTCCATGATATAGTTGACAGGGTTAAGGAAGATATTCTTGATCTCAATGAAATTCAAGAATCAGATGTGGCACTTGGATTGTTCAGCTTTCTTGAATCAGAGACTTATTTGGCTACTTCCCAACAATTGGTTGTTATGTTGAGCCCATATATTCAGTTTGAAAGAGATTCCTTATGTACTGTCCTTCCAAAACTTTCAAAGGGGAAAGCCACTCTTTTAGGTTTAAGTTTGGCCTTCTTATTATGCTCTGGCCGAGAAGGCTGCCTCCAATTTGTCAATTCGGGTGGGATGGATCAACTTGTATATTTGTTTGGTCATGATGGTCAGAATTCTACCACCATTACTTTGCTGTTGCTTGGAGTTGTTGAGCAGGCTACACGCCATTCAGTTGGGTGTGAAGGATTTTTAGGTTGGTGGCCTCGTGAGGATGGAAGTATCCCATCTGGTAAGAGTGAGGGCTACTGTCTTCTGTTGAAATTACTTATGCAGAAACCATGCCATGAGATTGCCTCTCTTGCAATTTATATTCTTCGTCGTTTGAGAATTTACGAGGTTATATCAAGATATGAGTTTGCAGTGTTGTCAGCACTGGAAGGTCTCTCTAATTCTCATGGGGCTGCAACTCATAATCTGAATATGCTATCTGATGCTAAGTCACAACTTCAAAAGCTCCAGAACCTGATGAAGTCACTTGGATCAGTTGAAGATCCCTCACCATCAGCCTACGCAGAAAGAAGTTTGGTTTCTGATCATTCTGAAGGGTGGTTGTCATACAAAGCCACAAGTAAACTAACTTCTTCATGGACATGTCCCTTTTATAGCTCTGGAATTGATTCGCACATATTGGCACTTCTGAAGGAGCGGGGTTTTCTTCCTTTGTCAGCAGCGCTTCTCTCAATGCCTGAATTGCATTCTAAAGTTGGAGATATTATGGATGTCTTTACTGATATCGCAATGTTTATTGGGAACATAATTCTTTCATTTATGTTTTCACGCACAGGATTGAGCTTTTTGCTACATCATCCTGAACTGACTGCTACAATAATACAATCTCTGAAGGGATCCGTCGATCTGAACAAGGAGGAGTGTGTCCCCCTCCACTATGCTTCAATTTTAATATCCAAGGGTTTTACTTGCAGCTTACTGGAAATTGGAATAAATCTTGAGATGCATTTGAGGGTGGTGAGTGCAGTAGATCGTTTGCTCAAGTCGATACAGCAAACAGAAGAATTTCTATGGATTTTATGGGAGTTGCGTGATGTTTCTAGGTCTGATTGTGGGCGTGAAGCTTTATTGACGTTAGGTGTTTTTCCAGAGGCTTTAGCAGTCTTGATTGAAGCTTTGCATTCAGCTAAGGATATGGAGCCGGCAGTTGAAAATAGTGGAATTTCACCGCTTAATCTAGCAATATGTCACTCAGCTGCTGAGATTTTTGAGGTCATAGTCTCTGACTCAACTGCATCATGCTTGCATGCTTGGATTGAACATGCCCCAGTCCTTCATAAGGCCTTGCATACTTTGTCACCGGGTGGTTCTAATCGAAAAGATGCTCCTTCACGATTACTTAAATGGATTGATGCGGGTGTGGTTTATCACAAACATGGCGTAGGTGGCCTTTTACGTTATGCTGCTGTCTTGGCTTCTGGAGGGGACGCCCAATTATCATCATCAAGCATCCTTGCACTCGATTTAACACCGGCTGAGAATGGTGCTGGAGAATCAACAAATGTCTCTGAGATGAACGTCCTAGATAATCTTGGAAAAGTTATCTTTGAGAAATCTTTTGAAGGTGTTAACCTTTCTGATTCATCAATTTCACAGTTGACAACAGCACTTCGAATTTTAGCGCTGATTTCAGATAATTCAACTGTTGCTGCTGCTTTATATGACGAGGGTGCGGTTACAGTTGTGTATGCTATCTTGGTCAACTGCAGCTTTATGTTTGAGAGGTCGTCAAATATTTATGATTATCTGGTGGATGACGATCATGGATGCAGTTCTATTTCTGACTTTTTGTCTGAACGTAATCGTGAGCAAAGCTTGGTGGACCTGTTAATTCCTTCCCTTGTCCTCTTGATATCAGTCCTACAAAGACTACAGGGAACTAAGGAGCAGTACAGAAACACCAAATTGATGAAGGCACTCCTAAGGCTACATCGGGAAGTCAGCCCGAAGCTAGCTGCTTGTGCAGCTGACTTGTCCTCCCATTATCCAGACTCTGCTCTTGGCTTTGGAGCAGTGTGCCACCTCATTGTGTCCGCCCTTGTCTGCTGGCCAGTTTATGGATGGATTCCTGGGCTATTCCACACTCTTCTTTCGGGTGTCCAGACGTCCTCTGTTCCTGCCTTGGGTCCAAAGGAGACCTGTAGCTTCCTCTGCATTCTAAGCGATATTCTCCCCGAAGAAGGAGTCTGGTTTTGGAAGAGTGGCATGCCCTTATTAAGTGGTCTAAGAAAGTTGGCGGTTGGGACATTGATGGGTCCACAGAAGGAGAAACAGATCAACTGGTATCTGGAGCCTGGTCCACTTGAAAAGCTGATAAACCATTTGACACCTAATCTTGACAAGATTGCAAAGATTATCCAACATCATGCAGTATCTGCATTGGTGGTCATTCAGGATATGCTTCGGGTTTTCATTGTTCGTATTGCATGTCAAAGGGTTGAACATGCTTCTATCCTTCTGAGGCCCATATTTTCATCTATCAGAGATGGAATTTTGGATCAGTCATCAACAAGAGACACTGAAGCTTATATGGTCTACCGATATCTTAATTTTCTGGCTAGTTTATTAGAGCATCCGCATGCTAAGGGATTACTGTTAGAGGAGGGTATTGTTCAACTGCTTGTGGAAGTTCTGGAAAGATGTTATGATGCCACTTATCCAAGTGAAAACAGGGTTCTAGAGTATGGAATTGTGTCCGCGTCTAGTGTGATTCAGTGGTGTATTCCAGCTTTCAGATCGATCTCACTGCTATGCGATTCACAAGTGCCTCTCTTGTGCTTTCAGAAAAAAGAGCTATTGGCCAGTCTGAGTGCAAAAGATTGTGCATTGATATTTCCCTTTGTGCTGAAGTTCTGCCAGGTGTTGCCTGTTGGCAATGAGCTATTATCTTGTCTTGGCGCTTTCAAAGACCTGAGCTCATGTGGTGAAGGTCAAGATGGTCTGGTTTCACTTTTGTTTCATCTGTTTTCTGGTACCGAAGAATCTGTATCTGAAAGGTGGTGTGACACTAATAGTCTCAGTCTCGATCAACTAGATATGAAGAAAAATCCCCCTTTTCTGTCTTGCTGGATCAAGTTATTGAACTCAATTAATTCAAAAGATGGTTTGTCTAGTCTTGCAATGAAGGCAGTAAACGTTCTGAGCGTGGGCTCCATCAGATTATGCCTTGATGGTAAAAGTTTGGACTCGAAGAAGGTTGCAGCACTAAAATCTCTTTTTGGCCTTCCAAGTGAGTTTAGTGGTACAGACACTTTTAGAGAGGAAAACATTGGTTTGATTGAACAGATGGTGACACTGTTGAGTTCAATGACTTCGGGGTCTGATAGTTCCGCAACAGCTGAGATGAAACCCTATTTGCATGAGGCATCTCAGTCGTTGCTGTCGTTGCTAAAAGACGGGAATATTGATGATATTATCTCCTGCAAAGGTGTTTTTGTTTCTCCTGGGAATCTTGATATGGATGATTTGGTTTCTAGAAACATTGAAGATGATCTCTATCAAAGAGGACTTGAAGACAAGTTCTGGTGGGAATGTCCAGAAACATTACCTGAGCGTCTGCCCCAGTCATCTCTCCCTGCGAAAAGGAAACTACCAACTTTGGAGAGCTCTAGCAGGCGTGCTAAAGGCGAAAACTCTTCTGTTGACATACCTACCCAAAATTCAATTCAACGGGGAATGGGTTCTGTATCCCTTCCTCCTGCTCCTACACGTAGAGATGCCTTTAGGCAGCGCAAGCCGAATACCAGCAGGCCTCCCTCTATGCATGTAGATGATTATGTTGCTAGGGAAAGAAG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- >AT3G05680.2
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