Gene Details:

  • Gene ID: AT3G05680
  • Gene Symbol: EMB2016, VIR
  • Gene Name: embryo defective 2016, VIRILIZER
  • Description: embryo defective 2016;(source:Araport11)
  • TAIR Accession: locus:2078082
  • Genome: Araport11_genome_release
  • Species: Arabidopsis thaliana

Transcripts:

Gene Ontology:

  • GO:0080009  — involved in — mRNA methylation
  • GO:0009793  — acts upstream of or within — embryo development ending in seed dormancy
  • GO:0080009  — acts upstream of or within — mRNA methylation
  • GO:0009793  — involved in — embryo development ending in seed dormancy
  • GO:0010117  — involved in — photoprotection
  • GO:0009651  — acts upstream of or within — response to salt stress
  • GO:0005654  — located in — nucleoplasm

Germplasm Phenotype:

  • vir-1  — Aberrant root cap formation, gravity response and lateral root development, as well as defective cotyledonal development.

Literature:

Sequences:

cDNA Sequence
  • >AT3G05680.1
    GTTTAAATCGATAAGAACCGTTTTTGTTAATCAAAACCGGGCCAACCCTAAAAAGCTAAACGCCGGTTAGACTAAAAGAGCCAACCGCCGGATAAACCAAAAAAACAACGGCGTTTGTTTTTTCTTCTCCTTCTTCTTCACCCTGCGTCGTGCTCTCTCGAATTCCCAGATTTTAGCAACCAGTCTGAATCAATTTTATGAAGACCTAAGAGACCTAGCAATTCAAGAAGACCACCAATCAATCCTGGAGGCATGGTACGATCTGAGCCTTGTGTTCTGTTCGCTCAGACCTTTGTTCATCCTCAATTGGACGAATATGTTGACGAGGTGATATTTGCTGAGCCAGTAATCATCACAGCTTGCGAATTTTTGGAGCAGAATGCTTCCTCATCTTCTCAAGCTGTTTCTCTTGTCGGGGCAACTTCACCTCCTTCATTTGCGTTGGAAGTGTTCGTTCGATGTGAAGGAGAATCAAAGTTTAAGCGACTTTGTAATCCTTTTCTTTACACTCCTTCAGCGCCCTACCCTTTGGAAGTGGAGGCTGTTGTAACAAACCATCTGGTGGTCAGAGGTAGCTATCGAAGTTTGAGCTTGATCGTCTATGGGAACATCGTCAAAGATTTGGGGCAGTACAATATCATTCTTGAAGGTCGTTCTGTAACTGATATTGTGAGTTCCACTGAGGGTAATCTTGAGGACTTGCCATTGGTATTGCACTCAGTTAACAGAACAATAGAGGAATGTCTATCCTCTCTAGACATAGTATCTCTCCCCCTGGCTGCTGTAGATTTGCCGGTGGAAGTAAAGCGATTGTTGCAGCTGCTGCTAAAAATCTTTGATAAGCTAGCTACTAATGATGTAGTAAATAAATTTGTGGATACGGTAGTGTCTGGGGTCTCCTCGTATGTCACAGACAATGTAGATTTCTTTTTAAAGAATAAGAATTGTTCGGCTGTGACCAGTTCCCTAGATTCTGGGTTATTCCATGATATAGTTGACAGGGTTAAGGAAGATATTCTTGATCTCAATGAAATTCAAGAATCAGATGTGGCACTTGGATTGTTCAGCTTTCTTGAATCAGAGACTTATTTGGCTACTTCCCAACAATTGGTTGTTATGTTGAGCCCATATATTCAGTTTGAAAGAGATTCCTTATGTACTGTCCTTCCAAAACTTTCAAAGGGGAAAGCCACTCTTTTAGGTTTAAGTTTGGCCTTCTTATTATGCTCTGGCCGAGAAGGCTGCCTCCAATTTGTCAATTCGGGTGGGATGGATCAACTTGTATATTTGTTTGGTCATGATGGTCAGAATTCTACCACCATTACTTTGCTGTTGCTTGGAGTTGTTGAGCAGGCTACACGCCATTCAGTTGGGTGTGAAGGATTTTTAGGTTGGTGGCCTCGTGAGGATGGAAGTATCCCATCTGGTAAGAGTGAGGGCTACTGTCTTCTGTTGAAATTACTTATGCAGAAACCATGCCATGAGATTGCCTCTCTTGCAATTTATATTCTTCGTCGTTTGAGAATTTACGAGGTTATATCAAGATATGAGTTTGCAGTGTTGTCAGCACTGGAAGGTCTCTCTAATTCTCATGGGGCTGCAACTCATAATCTGAATATGCTATCTGATGCTAAGTCACAACTTCAAAAGCTCCAGAACCTGATGAAGTCACTTGGATCAGTTGAAGATCCCTCACCATCAGCCTACGCAGAAAGAAGTTTGGTTTCTGATCATTCTGAAGGGTGGTTGTCATACAAAGCCACAAGTAAACTAACTTCTTCATGGACATGTCCCTTTTATAGCTCTGGAATTGATTCGCACATATTGGCACTTCTGAAGGAGCGGGGTTTTCTTCCTTTGTCAGCAGCGCTTCTCTCAATGCCTGAATTGCATTCTAAAGTTGGAGATATTATGGATGTCTTTACTGATATCGCAATGTTTATTGGGAACATAATTCTTTCATTTATGTTTTCACGCACAGGATTGAGCTTTTTGCTACATCATCCTGAACTGACTGCTACAATAATACAATCTCTGAAGGGATCCGTCGATCTGAACAAGGAGGAGTGTGTCCCCCTCCACTATGCTTCAATTTTAATATCCAAGGGTTTTACTTGCAGCTTACTGGAAATTGGAATAAATCTTGAGATGCATTTGAGGGTGGTGAGTGCAGTAGATCGTTTGCTCAAGTCGATACAGCAAACAGAAGAATTTCTATGGATTTTATGGGAGTTGCGTGATGTTTCTAGGTCTGATTGTGGGCGTGAAGCTTTATTGACGTTAGGTGTTTTTCCAGAGGCTTTAGCAGTCTTGATTGAAGCTTTGCATTCAGCTAAGGATATGGAGCCGGCAGTTGAAAATAGTGGAATTTCACCGCTTAATCTAGCAATATGTCACTCAGCTGCTGAGATTTTTGAGGTCATAGTCTCTGACTCAACTGCATCATGCTTGCATGCTTGGATTGAACATGCCCCAGTCCTTCATAAGGCCTTGCATACTTTGTCACCGGGTGGTTCTAATCGAAAAGATGCTCCTTCACGATTACTTAAATGGATTGATGCGGGTGTGGTTTATCACAAACATGGCGTAGGTGGCCTTTTACGTTATGCTGCTGTCTTGGCTTCTGGAGGGGACGCCCAATTATCATCATCAAGCATCCTTGCACTCGATTTAACACCGGCTGAGAATGGTGCTGGAGAATCAACAAATGTCTCTGAGATGAACGTCCTAGATAATCTTGGAAAAGTTATCTTTGAGAAATCTTTTGAAGGTGTTAACCTTTCTGATTCATCAATTTCACAGTTGACAACAGCACTTCGAATTTTAGCGCTGATTTCAGATAATTCAACTGTTGCTGCTGCTTTATATGACGAGGGTGCGGTTACAGTTGTGTATGCTATCTTGGTCAACTGCAGCTTTATGTTTGAGAGGTCGTCAAATATTTATGATTATCTGGTGGATGACGATCATGGATGCAGTTCTATTTCTGACTTTTTGTCTGAACGTAATCGTGAGCAAAGCTTGGTGGACCTGTTAATTCCTTCCCTTGTCCTCTTGATATCAGTCCTACAAAGACTACAGGGAACTAAGGAGCAGTACAGAAACACCAAATTGATGAAGGCACTCCTAAGGCTACATCGGGAAGTCAGCCCGAAGCTAGCTGCTTGTGCAGCTGACTTGTCCTCCCATTATCCAGACTCTGCTCTTGGCTTTGGAGCAGTGTGCCACCTCATTGTGTCCGCCCTTGTCTGCTGGCCAGTTTATGGATGGATTCCTGGGCTATTCCACACTCTTCTTTCGGGTGTCCAGACGTCCTCTGTTCCTGCCTTGGGTCCAAAGGAGACCTGTAGCTTCCTCTGCATTCTAAGCGATATTCTCCCCGAAGAAGGAGTCTGGTTTTGGAAGAGTGGCATGCCCTTATTAAGTGGTCTAAGAAAGTTGGCGGTTGGGACATTGATGGGTCCACAGAAGGAGAAACAGATCAACTGGTATCTGGAGCCTGGTCCACTTGAAAAGCTGATAAACCATTTGACACCTAATCTTGACAAGATTGCAAAGATTATCCAACATCATGCAGTATCTGCATTGGTGGTCATTCAGGATATGCTTCGGGTTTTCATTGTTCGTATTGCATGTCAAAGGGTTGAACATGCTTCTATCCTTCTGAGGCCCATATTTTCATCTATCAGAGATGGAATTTTGGATCAGTCATCAACAAGAGACACTGAAGCTTATATGGTCTACCGATATCTTAATTTTCTGGCTAGTTTATTAGAGCATCCGCATGCTAAGGGATTACTGTTAGAGGAGGGTATTGTTCAACTGCTTGTGGAAGTTCTGGAAAGATGTTATGATGCCACTTATCCAAGTGAAAACAGGGTTCTAGAGTATGGAATTGTGTCCGCGTCTAGTGTGATTCAGTGGTGTATTCCAGCTTTCAGATCGATCTCACTGCTATGCGATTCACAAGTGCCTCTCTTGTGCTTTCAGAAAAAAGAGCTATTGGCCAGTCTGAGTGCAAAAGATTGTGCATTGATATTTCCCTTTGTGCTGAAGTTCTGCCAGGTGTTGCCTGTTGGCAATGAGCTATTATCTTGTCTTGGCGCTTTCAAAGACCTGAGCTCATGTGGTGAAGGTCAAGATGGTCTGGTTTCACTTTTGTTTCATCTGTTTTCTGGTACCGAAGAATCTGTATCTGAAAGGTGGTGTGACACTAATAGTCTCAGTCTCGATCAACTAGATATGAAGAAAAATCCCCCTTTTCTGTCTTGCTGGATCAAGTTATTGAACTCAATTAATTCAAAAGATGGTTTGTCTAGTCTTGCAATGAAGGCAGTAAACGTTCTGAGCGTGGGCTCCATCAGATTATGCCTTGATGGTAAAAGTTTGGACTCGAAGAAGGTTGCAGCACTAAAATCTCTTTTTGGCCTTCCAAGTGAGTTTAGTGGTACAGACACTTTTAGAGAGGAAAACATTGGTTTGATTGAACAGATGGTGACACTGTTGAGTTCAATGACTTCGGGGTCTGATAGTTCCGCAACAGCTGAGATGAAACCCTATTTGCATGAGGCATCTCAGTCGTTGCTGTCGTTGCTAAAAGACGGGAATATTGATGATATTATCTCCTGCAAAGGTGTTTTTGTTTCTCCTGGGAATCTTGATATGGATGATTTGGTTTCTAGAAACATTGAAGATGATCTCTATCAAAGAGGACTTGAAGACAAGTTCTGGTGGGAATGTCCAGAAACATTACCTGAGCGTCTGCCCCAGTCATCTCTCCCTGCGAAAAGGAAACTACCAACTTTGGAGAGCTCTAGCAGGCGTGCTAAAGGCGAAAACTCTTCTGTTGACATACCTACCCAAAATTCAATTCAACGGGGAATGGGTTCTGTATCCCTTCCTCCTGCTCCTACACGTAGAGATGCCTTTAGGCAGCGCAAGCCGAATACCAGCAGGCCTCCCTCTATGCATGTAGATGATTATGTTGCTAGGGAAAGAAG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  • >AT3G05680.2
    GTTTAAATCGATAAGAACCGTTTTTGTTAATCAAAACCGGGCCAACCCTAAAAAGCTAAACGCCGGTTAGACTAAAAGAGCCAACCGCCGGATAAACCAAAAAAACAACGGCGTTTGTTTTTTCTTCTCCTTCTTCTTCACCCTGCGTCGTGCTCTCTCGAATTCCCAGATTTTAGCAACCAGTCTGAATCAATTTTATGAAGACCTAAGAGACCTAGCAATTCAAGAAGACCACCAATCAATCCTGGAGGCATGGTACGATCTGAGCCTTGTGTTCTGTTCGCTCAGACCTTTGTTCATCCTCAATTGGACGAATATGTTGACGAGGTGATATTTGCTGAGCCAGTAATCATCACAGCTTGCGAATTTTTGGAGCAGAATGCTTCCTCATCTTCTCAAGCTGTTTCTCTTGTCGGGGCAACTTCACCTCCTTCATTTGCGTTGGAAGTGTTCGTTCGATGTGAAGGAGAATCAAAGTTTAAGCGACTTTGTAATCCTTTTCTTTACACTCCTTCAGCGCCCTACCCTTTGGAAGTGGAGGCTGTTGTAACAAACCATCTGGTGGTCAGAGGTAGCTATCGAAGTTTGAGCTTGATCGTCTATGGGAACATCGTCAAAGATTTGGGGCAGTACAATATCATTCTTGAAGGTCGTTCTGTAACTGATATTGTGAGTTCCACTGAGGGTAATCTTGAGGACTTGCCATTGGTATTGCACTCAGTTAACAGAACAATAGAGGAATGTCTATCCTCTCTAGACATAGTATCTCTCCCCCTGGCTGCTGTAGATTTGCCGGTGGAAGTAAAGCGATTGTTGCAGCTGCTGCTAAAAATCTTTGATAAGCTAGCTACTAATGATGTAGTAAATAAATTTGTGGATACGGTAGTGTCTGGGGTCTCCTCGTATGTCACAGACAATGTAGATTTCTTTTTAAAGAATAAGAATTGTTCGGCTGTGACCAGTTCCCTAGATTCTGGGTTATTCCATGATATAGTTGACAGGGTTAAGGAAGATATTCTTGATCTCAATGAAATTCAAGAATCAGATGTGGCACTTGGATTGTTCAGCTTTCTTGAATCAGAGACTTATTTGGCTACTTCCCAACAATTGGTTGTTATGTTGAGCCCATATATTCAGTTTGAAAGAGATTCCTTATGTACTGTCCTTCCAAAACTTTCAAAGGGGAAAGCCACTCTTTTAGGTTTAAGTTTGGCCTTCTTATTATGCTCTGGCCGAGAAGGCTGCCTCCAATTTGTCAATTCGGGTGGGATGGATCAACTTGTATATTTGTTTGGTCATGATGGTCAGAATTCTACCACCATTACTTTGCTGTTGCTTGGAGTTGTTGAGCAGGCTACACGCCATTCAGTTGGGTGTGAAGGATTTTTAGGTTGGTGGCCTCGTGAGGATGGAAGTATCCCATCTGGTAAGAGTGAGGGCTACTGTCTTCTGTTGAAATTACTTATGCAGAAACCATGCCATGAGATTGCCTCTCTTGCAATTTATATTCTTCGTCGTTTGAGAATTTACGAGGTTATATCAAGATATGAGTTTGCAGTGTTGTCAGCACTGGAAGGTCTCTCTAATTCTCATGGGGCTGCAACTCATAATCTGAATATGCTATCTGATGCTAAGTCACAACTTCAAAAGCTCCAGAACCTGATGAAGTCACTTGGATCAGTTGAAGATCCCTCACCATCAGCCTACGCAGAAAGAAGTTTGGTTTCTGATCATTCTGAAGGGTGGTTGTCATACAAAGCCACAAGTAAACTAACTTCTTCATGGACATGTCCCTTTTATAGCTCTGGAATTGATTCGCACATATTGGCACTTCTGAAGGAGCGGGGTTTTCTTCCTTTGTCAGCAGCGCTTCTCTCAATGCCTGAATTGCATTCTAAAGTTGGAGATATTATGGATGTCTTTACTGATATCGCAATGTTTATTGGGAACATAATTCTTTCATTTATGTTTTCACGCACAGGATTGAGCTTTTTGCTACATCATCCTGAACTGACTGCTACAATAATACAATCTCTGAAGGGATCCGTCGATCTGAACAAGGAGGAGTGTGTCCCCCTCCACTATGCTTCAATTTTAATATCCAAGGGTTTTACTTGCAGCTTACTGGAAATTGGAATAAATCTTGAGATGCATTTGAGGGTGGTGAGTGCAGTAGATCGTTTGCTCAAGTCGATACAGCAAACAGAAGAATTTCTATGGATTTTATGGGAGTTGCGTGATGTTTCTAGGTCTGATTGTGGGCGTGAAGCTTTATTGACGTTAGGTGTTTTTCCAGAGGCTTTAGCAGTCTTGATTGAAGCTTTGCATTCAGCTAAGGATATGGAGCCGGCAGTTGAAAATAGTGGAATTTCACCGCTTAATCTAGCAATATGTCACTCAGCTGCTGAGATTTTTGAGGTCATAGTCTCTGACTCAACTGCATCATGCTTGCATGCTTGGATTGAACATGCCCCAGTCCTTCATAAGGCCTTGCATACTTTGTCACCGGGTGGTTCTAATCGAAAAGATGCTCCTTCACGATTACTTAAATGGATTGATGCGGGTGTGGTTTATCACAAACATGGCGTAGGTGGCCTTTTACGTTATGCTGCTGTCTTGGCTTCTGGAGGGGACGCCCAATTATCATCATCAAGCATCCTTGCACTCGATTTAACACCGGCTGAGAATGGTGCTGGAGAATCAACAAATGTCTCTGAGATGAACGTCCTAGATAATCTTGGAAAAGTTATCTTTGAGAAATCTTTTGAAGGTGTTAACCTTTCTGATTCATCAATTTCACAGTTGACAACAGCACTTCGAATTTTAGCGCTGATTTCAGATAATTCAACTGTTGCTGCTGCTTTATATGACGAGGGTGCGGTTACAGTTGTGTATGCTATCTTGGTCAACTGCAGCTTTATGTTTGAGAGGTCGTCAAATATTTATGATTATCTGGTGGATGACGATCATGGATGCAGTTCTATTTCTGACTTTTTGTCTGAACGTAATCGTGAGCAAAGCTTGGTGGACCTGTTAATTCCTTCCCTTGTCCTCTTGATATCAGTCCTACAAAGACTACAGGGAACTAAGGAGCAGTACAGAAACACCAAATTGATGAAGGCACTCCTAAGGCTACATCGGGAAGTCAGCCCGAAGCTAGCTGCTTGTGCAGCTGACTTGTCCTCCCATTATCCAGACTCTGCTCTTGGCTTTGGAGCAGTGTGCCACCTCATTGTGTCCGCCCTTGTCTGCTGGCCAGTTTATGGATGGATTCCTGGGCTATTCCACACTCTTCTTTCGGGTGTCCAGACGTCCTCTGTTCCTGCCTTGGGTCCAAAGGAGACCTGTAGCTTCCTCTGCATTCTAAGCGATATTCTCCCCGAAGAAGGAGTCTGGTTTTGGAAGAGTGGCATGCCCTTATTAAGTGGTCTAAGAAAGTTGGCGGTTGGGACATTGATGGGTCCACAGAAGGAGAAACAGATCAACTGGTATCTGGAGCCTGGTCCACTTGAAAAGCTGATAAACCATTTGACACCTAATCTTGACAAGATTGCAAAGATTATCCAACATCATGCAGTATCTGCATTGGTGGTCATTCAGGATATGCTTCGGGTTTTCATTGTTCGTATTGCATGTCAAAGGGTTGAACATGCTTCTATCCTTCTGAGGCCCATATTTTCATCTATCAGAGATGGAATTTTGGATCAGTCATCAACAAGAGACACTGAAGCTTATATGGTCTACCGATATCTTAATTTTCTGGCTAGTTTATTAGAGCATCCGCATGCTAAGGGATTACTGTTAGAGGAGGGTATTGTTCAACTGCTTGTGGAAGTTCTGGAAAGATGTTATGATGCCACTTATCCAAGTGAAAACAGGGTTCTAGAGTATGGAATTGTGTCCGCGTCTAGTGTGATTCAGTGGTGTATTCCAGCTTTCAGATCGATCTCACTGCTATGCGATTCACAAGTGCCTCTCTTGTGCTTTCAGAAAAAAGAGCTATTGGCCAGTCTGAGTGCAAAAGATTGTGCATTGATATTTCCCTTTGTGCTGAAGTTCTGCCAGGTGTTGCCTGTTGGCAATGAGCTATTATCTTGTCTTGGCGCTTTCAAAGACCTGAGCTCATGTGGTGAAGGTCAAGATGGTCTGGTTTCACTTTTGTTTCATCTGTTTTCTGGTACCGAAGAATCTGTATCTGAAAGGTGGTGTGACACTAATAGTCTCAGTCTCGATCAACTAGATATGAAGAAAAATCCCCCTTTTCTGTCTTGCTGGATCAAGTTATTGAACTCAATTAATTCAAAAGATGGTTTGTCTAGTCTTGCAATGAAGGCAGTAAACGTTCTGAGCGTGGGCTCCATCAGATTATGCCTTGATGGTAAAAGTTTGGACTCGAAGAAGGTTGCAGCACTAAAATCTCTTTTTGGCCTTCCAAGTGAGTTTAGTGGTACAGACACTTTTAGAGAGGAAAACATTGGTTTGATTGAACAGATGGTGACACTGTTGAGTTCAATGACTTCGGGGTCTGATAGTTCCGCAACAGCTGAGATGAAACCCTATTTGCATGAGGCATCTCAGTCGTTGCTGTCGTTGCTAAAAGACGGGAATATTGATGATATTATCTCCTGCAAAGGTGTTTTTGTTTCTCCTGGGAATCTTGATATGGATGATTTGGTTTCTAGAAACATTGAAGATGATCTCTATCAAAGAGGACTTGAAGACAAGTTCTGGTGGGAATGTCCAGAAACATTACCTGAGCGTCTGCCCCAGTCATCTCTCCCTGCGAAAAGGAAACTACCAACTTTGGAGAGCTCTAGCAGGCGTGCTAAAGGCGAAAACTCTTCTGTTGACATACCTACCCAAAATTCAATTCAACGGGGAATGGGTTCTGTATCCCTTCCTCCTGCTCCTACACGTAGAGATGCCTTTAGGCAGCGCAAGCCGAATACCAGCAGGCCTCCCTCTATGCATGTAGATGATTATGTTGCTAGGGAAAGAAG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CDS Sequence
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