Gene Details:
- Gene ID: AT2G25850
- Gene Symbol: PAPS2
- Gene Name: poly(A) polymerase 2
- Description: poly(A) polymerase 2;(source:Araport11)
- TAIR Accession: locus:2043560
- Genome: Araport11_genome_release
- Species: Arabidopsis thaliana
Transcripts:
- AT2G25850.1 AT2G25850.2 AT2G25850.3 AT2G25850.4 AT2G25850.9 AT2G25850.8 AT2G25850.5 AT2G25850.7 AT2G25850.6
Plant Ontology Annotations:
- PO:0009006 — shoot system — sistema de epiblasto (epiblastema) (Spanish, exact), シュート系、苗条系 (Japanese, exact), Poaceae crown (related), shoot (related), thalli (related), thallus (related), tree crown (narrow)
- PO:0009009 — plant embryo — embrión (Spanish, exact), 植物胚 (Japanese, exact), germ (related), embryo (broad)
- PO:0009029 — stamen — estambre (Spanish, exact), 雄蕊 (Japanese, exact), Poaceae stamen (narrow), Zea stamen (narrow)
- PO:0009052 — inflorescence flower pedicel — 小花柄 (Japanese, related), pedicelo (Spanish, broad)
- PO:0020030 — cotyledon — cotiledón (Spanish, exact), seed leaf (exact), 子葉 (Japanese, exact)
- PO:0020038 — petiole — pecíolo (Spanish, exact), 葉柄 (Japanese, exact)
- PO:0020100 — hypocotyl — hipocótile (Spanish, exact), 胚軸 (Japanese, exact)
- PO:0020137 — leaf apex — ápice de la hoja (Spanish, exact), 葉先 (Japanese, exact), leaf lamina apex (narrow), phyllid apex (narrow)
- PO:0025022 — collective leaf structure — estructura colectiva de hoja (Spanish, exact), leaf series (exact), 葉が集まった構造 (Japanese, exact), leaf whorl (narrow), rosette (narrow), cycle (broad), verticil (broad)
- PO:0025281 — pollen — polen (Spanish, exact), pollen grain (exact), 花粉 (Japanese, exact)
- PO:0025195 — pollen tube cell — célula del tubo polínico (Spanish, exact), 花粉管細胞 (Japanese, exact)
Gene Ontology:
- GO:0005634 — located in — nucleus
Function-related keywords:
- shoot system , plant embryo , stamen , inflorescence flower pedicel , cotyledon , petiole , hypocotyl , leaf apex , collective leaf structure , pollen , pollen tube cell , pollen
Literature:
- Novel alternative splicing of mRNAs encoding poly(A) polymerases in Arabidopsis. DOI: 10.1016/j.bbaexp.2004.06.001 ; PMID: 15297145
- Arabidopsis mRNA polyadenylation machinery: comprehensive analysis of protein-protein interactions and gene expression profiling. DOI: 10.1186/1471-2164-9-220 ; PMID: 18479511
- Global analysis of Arabidopsis gene expression uncovers a complex array of changes impacting pathogen response and cell cycle during geminivirus infection. DOI: 10.1104/pp.108.121038 ; PMID: 18650403
- Transcriptome analyses show changes in gene expression to accompany pollen germination and tube growth in Arabidopsis. DOI: 10.1104/pp.108.126375 ; PMID: 18775970
- Characterization of genes encoding poly(A) polymerases in plants: evidence for duplication and functional specialization. DOI: 10.1371/journal.pone.0008082 ; PMID: 19956626
- Target specificity among canonical nuclear poly(A) polymerases in plants modulates organ growth and pathogen response. DOI: 10.1073/pnas.1303967110 ; PMID: 23918356
- Genome-Wide Analysis of PAPS1-Dependent Polyadenylation Identifies Novel Roles for Functionally Specialized Poly(A) Polymerases in Arabidopsis thaliana. DOI: 10.1371/journal.pgen.1005474 ; PMID: 26305463
- Antagonistic control of flowering time by functionally specialized poly(A) polymerases in Arabidopsis thaliana. DOI: 10.1111/tpj.13280 ; PMID: 27447095
- The poly(A) polymerase PAPS1 interacts with the RNA-directed DNA-methylation pathway in sporophyte and pollen development. DOI: 10.1111/tpj.14348 ; PMID: 31009115
Sequences:
cDNA Sequence
- >AT2G25850.1
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