Gene Details:
- Gene ID: AT2G25660
- Gene Symbol: EMB2410, TIC236
- Gene Name: EMBRYO DEFECTIVE 2410, translocon at the inner-envelope membranes of chloroplasts236
- Description: embryo defective 2410;(source:Araport11)
- TAIR Accession: locus:2050327
- Genome: Araport11_genome_release
- Species: Arabidopsis thaliana
Transcripts:
Plant Ontology Annotations:
- PO:0009006 — shoot system — sistema de epiblasto (epiblastema) (Spanish, exact), シュート系、苗条系 (Japanese, exact), Poaceae crown (related), shoot (related), thalli (related), thallus (related), tree crown (narrow)
- PO:0009009 — plant embryo — embrión (Spanish, exact), 植物胚 (Japanese, exact), germ (related), embryo (broad)
- PO:0009029 — stamen — estambre (Spanish, exact), 雄蕊 (Japanese, exact), Poaceae stamen (narrow), Zea stamen (narrow)
- PO:0009052 — inflorescence flower pedicel — 小花柄 (Japanese, related), pedicelo (Spanish, broad)
- PO:0020030 — cotyledon — cotiledón (Spanish, exact), seed leaf (exact), 子葉 (Japanese, exact)
- PO:0020038 — petiole — pecíolo (Spanish, exact), 葉柄 (Japanese, exact)
- PO:0020100 — hypocotyl — hipocótile (Spanish, exact), 胚軸 (Japanese, exact)
- PO:0020137 — leaf apex — ápice de la hoja (Spanish, exact), 葉先 (Japanese, exact), leaf lamina apex (narrow), phyllid apex (narrow)
- PO:0025022 — collective leaf structure — estructura colectiva de hoja (Spanish, exact), leaf series (exact), 葉が集まった構造 (Japanese, exact), leaf whorl (narrow), rosette (narrow), cycle (broad), verticil (broad)
- PO:0025281 — pollen — polen (Spanish, exact), pollen grain (exact), 花粉 (Japanese, exact)
Gene Ontology:
- GO:0009507 — located in — chloroplast
- GO:0009793 — acts upstream of or within — embryo development ending in seed dormancy
- GO:0009706 — located in — chloroplast inner membrane
Function-related keywords:
- shoot system , plant embryo , stamen , inflorescence flower pedicel , cotyledon , petiole , hypocotyl , leaf apex , collective leaf structure , pollen
Literature:
- Inactivation of the chloroplast ATP synthase gamma subunit results in high non-photochemical fluorescence quenching and altered nuclear gene expression in Arabidopsis thaliana. DOI: 10.1074/jbc.M308435200 ; PMID: 14576160
- Identification of genes required for embryo development in Arabidopsis. DOI: 10.1104/pp.104.045179 ; PMID: 15266054
- Identification of nuclear genes encoding chloroplast-localized proteins required for embryo development in Arabidopsis. DOI: 10.1104/pp.110.168120 ; PMID: 21139083
- Proteomic analyses of apoplastic proteins from germinating Arabidopsis thaliana pollen. DOI: 10.1016/j.bbapap.2011.07.013 ; PMID: 21798377
- TIC236 links the outer and inner membrane translocons of the chloroplast. DOI: 10.1038/s41586-018-0713-y ; PMID: 30464337
- Genome-wide identification of EMBRYO-DEFECTIVE (EMB) genes required for growth and development in Arabidopsis. DOI: 10.1111/nph.16071 ; PMID: 31334862
Sequences:
cDNA Sequence
- >AT2G25660.1
ATGAGTTTGAGATTGCAAAACCCTTTCCTTTCTACTCCTCTGCTTCATGGTTCTTTCAATCGCAGAGAGAAGAGAATCAATGTAGCTAGAAGGGCGTTTCGTAGCAAGCGTATATATTCGGAGAAGAAACAGAATGATTGGTTAGCTAAAGTTGCCAAATTTTCTCAATTTTGTGGGAAAAATGTGCAATTGCTTAGGAAGTCTCTTGATTCTAGAAGTAGAATGGAAGTTAAATGTTTGAAAGAGCCTTTCGTACGAAGCAAGGATTTGGTTAGGTCTTTGGCTCCTGTTTGGGAAGAGGGTTTGTTTTTCTTGAGGTGTTCTGTGTTCTTTGCTGTTATCTCTGGGGTTTGTTTATTGGTGTGGTATGGACAGAACAAGGCTCGTGTTTTTGTTGAGACTAAGCTTTTGCCATCTGTTTGCTCTGTGCTTAGTGAGACTATTCAGCGTGAGGTTGATTTTGGAAAGGTTAGAAGAGTTTCACCATTGTGCATTACACTTGAAGCAAGCTCCATTGGTCCTCATGGTGAAGAGTTTTCCTGTGGTGAGGTTCCGACTATGAAAGTTTGTGTCCGTCCTTTTGCTAGTCTTAGGAGGGGAAAGATTGTGGTTGATGCGATTCTAAGTAATCCAACAGTTTTGGTTGCACAAAAGAAAGATTTTACATGGTTAGGGATACCTCTATCTGACACTACTTTGCCAAGCCATTTGTCATCTGAAGAAGGGATTGATTTTCGCACCAAAACTAGGAGAGTTTCAAGGGAGGAAGCAGGGATCCGTTGGGATGAAGAAAGGGATAATGATGCAAGAAAAGCTGCAGAGATAGGCTATATCGTTCCTTGTAAGAATTACTCTCAAGCTAAAGATAATGCGGTGAAGCACGACAGGCGTTTTACGGAAATTGCAAATCCCAACTCCTTTATTTGCATGGATGAAAAGATGCATTCAGCTGAGCAACATTGCATGGACCCAGGTGTTGAGTATGATGTGAAGCATGCTGAATTGGAGAAATCATTTGGCATAAAAATTCCTGGTTCAGGGCTCAAGTTCTTGTCCAAAATGTTAAAAGTCCCGAGGAAGTACAAATTCAAATGGAATTCAAAATCACATAAGAATTCAATGTCTAATATTAGTGCAAAGAAGAGAATTCTTGAGCGCAGTGCTTCAGCAGCTCTATCTTATTTCCACAGTCTATCACAACAAAAGCTTGACGAGCCTTCAGTGTTATCAACAAATTATGATGGGTTGAGTTTGGATATGCTATTAGTTAAAGGTGATAGAGAAATCAGTAATCAATATGATCGACATGTGCCGTATGGTGAGCAATCATTAGCTAATGATTTGGACGGGAAAGGTTATCGAGTGAGGGGTAAAAGGCTCCTTGGTGTAAAAAAGGCTTCCACGTTAGACAAGTTCACAGTATCATGTGATCCATTCCTTATGACTGTTGATAGACTCTGTGCACTCTTACAAACTAAACGAAGCCCATCTGTTGAAGATATTGTGAATTCTTCTGAATCTGAGACTTTAAGCAGTCAGAGAGGGGATATATCTATGAATGTTGTTAATCAGAATACTGACGATGTTCCACATGGTAATCGAAGTGGAAATCAGCCTCGTGACTTTACGTTCAAAAAGCATGAGCATCAACCTGTAGCAAACCATTGGCGTCCCAGCTGGCCACGGAACAAAAAATTAAAAGAAGCAGTGTTTAATATTTTAACTGGTTCCTCTAAGAAGTTAACAGGAAGGGCAGATCCGAATGCTCCTCACTTGAGCGATGAACTGGAGAAGCTGCCTGCTGTTTATGTTGAGAAGACACTACCAGTTATGCTTGACTCTGTGCAGTTTAAAGGTGGGACACTTCTTCTATTAGCTTATGGCGATACAGAGCCCAGAGAAATGAGGAACGTCCATGGACATGTTAAGTTTCAGAATCATTATGGTCGTGTGTACGTGCAACTTGGTGGAAACTGTAATATGTGGAGATCAGATGTAACATCTGAAGATGGTGGGCTTTTGTCTGTTGATGTTTTTGTTGATACCGTCGAGCAGAACTGGCATGCAAATTTAAATGTTGCCAACTTCTTTGTCCCGATTTTTGAAAGAATTCTAGAGATTCCAATCGAGTGGTCTAAGGGAAGAGCTACTGGTGAGGTTCATCTATGTATGTCTAGAGGAGAAAGTTTTCCAAACCTACATGGCCAACTTGACGTAACAGGACTAGGCTTCCATATAAATGATGCACCTTCTTCGTTTTCTGATGTCTCAGCCAGCCTTTCTTTCCGCGGCCAGCGCATTTTCCTGCATAACGCTAATGGTTGGTTTGGAAAGGTTCCTTTGGAGGCTTCTGGAGATTTCGGTATACATCCAGATGAGGGGGAGTTTCATCTGATGTGTCAGGTTCCCTATGTGGAAATTAATGCTTTGATGAAAACTTTCAAGATGAAGCCCTTGTTTTTCCCGCTAGCTGGTTCTGTCACAGCTGTATTCAACTGTCAAGGCCCGCTTGATGCTCCCGTTTTTGTGGGAAGTTGCATGGTCTCTAGGAAGATAGCTTATCTGTCTCCAGATCTCCCTACATCTTTGGCATATGAGGCAATGCTGAAAAACAAGGAAGCTGGTGCAGTTGCAGCATTTGACCGTGTTCCATTTTCTTATCTTTCTGCTAATTTCACATTTAACACTGACAACTGTGTTGCTGATTTATATGGTATTAGAGCTACCCTTGTTGATGGTGGGGAGATTCGAGGAGCAGGGAATGCTTGGATCTGTCCAGAGGGGGAGGTGGATGATACCGCACTGGATGTGAACTTTTCAGGAAATATATCTTTTGATAAGGTTTTGCATCGTTATATGCCTGAATATTTTAACATCGGGATGCTGAAGTTGGGTGATTTAACTGGGGAAACAAAACTTTCTGGGGCCCTCTTGAAACCGAGGTTTGACATAAAATGGGCAGCCCCTAAAGCTGATGGCTCCTTGACTGATGCTCGGGGAGATATTGTGATATCACATGATAATATCATTGTTAATTCATCCTCTGTTGCTTTTGATCTATTCACAAAATTAGATACCTCATACCATGACCCTTGTTTGTCGCACCAAGACTTCACTCAAGGGGAGGCCATGCCATTTGTTGTTGAGGGGCTTGATTTGGATTTACGTATGCGTGGTTTTGAGTTTTTCAGCTTGGTCTCTTCCTATCCATTTGATTCACCACGACCTACACATTTAAAAGCAACAGGAAGGATCAAATTTCTGGGGAAGATAAAACGACACAGCACTACAAAAGATGGAGATGTTGGGTCAGACAAATGTGAAGATGCAGCTGCAATTTCTAGCCTCGATGGTGATATTTCCATTTCAAGTCTCAAGCTTAATCAGTTGATTTTGGCCCCTCAACTGTCTGGACGTTTGAGCGTTTCACGTGATCATGTTAAGCTTGATGCCGCGGGCCGACCAGATGAAAGTCTTACACTAGACTTTATAGGTCCACTACAGCCTAATTCTGACGAAAATGTACAAAGTGGAAAGTTGCTCTCCTTTTCTCTTCAAAAGGGACAACTAAGAGCTAACGCTTGTTTTCAGCCACAACAGTCCGCTACTTTGGAGATACGCAATTTTCCACTTGATGAGTTGGAGTTGGCCTCACTGAGAGGGTTGATTCAAAAGGCAGAGATTCAACTAAATCTTCAGAAGCGAAGAGGGCATGGCCTGTTGTCTGTAATTCGGCCAAAGTTTAGTGGAGTTCTAGGTGAAGCTTTAGATGTTGCAGTAAGATGGAGCGGTGACGTGTGTTTCATGTTGTCCGGAAGACTAGAGGTTATGATCACTGTTGAGAAAACTATTCTGGAACAAAGCAATAGCCGGTATGAGCTTCAAGGTGAATATGTATTGCCGGGTTCCCGTGACCGAGACCTTGGTCAGAAGGAAGCTGGCAGTTTTTTAATGAGAGCCATGACTGGTCATCTAGGAAGTGTTATATCCTCCATGGGAAGATGGAGAATGAGACTTGAAGTGCCTAAGGCAGAGGTTGCTGAGATGCTTCCTCTTGCAAGGCTTCTTTCAAGAAGTACAGATCCAGCTGTTCACTCAAGATCAAAGGATCTTTTCATCCAAAGCGTTCAAAATCTCTGTCTACAAGCTGAAAATCTTCGAGACTTGCTTGAGGAGATACGTGGGTATTATACTCCACCAAGTGAAGTCGTTCTTGAAGATCTAAGTCTTCCAGGTTTAGCTGAGCTCAAGGGTCATTGGCATGGTTCGCTTGATGCTAGTGGTGGAGGCAATGGAGACACTTTGGCCGAATTTGACTTCCATGGAGATGATTGGGAGTGGGGGACTTACAAAACACAGCGTGTTCTGGCTACTGGTTCGTATAACAATGATGATGGTTTACGTCTTAAGGAGATGCTCATTCAAAAAGGAAACGCTACACTGCACGCAGATGGGACCTTATTGGGGCCAAAAACAAATCTTCATTTTGCTGTTCTGAATTTCCCTGTTAGTTTGATACCTACCTTGGTTGAGGTTGTTGAATCATCAGCTACTGATATTGTTCACTCTTTGAGGAAACTCTTGTCACCAATCAAAGGCATTTTGCACATGGAAGGGGATCTTAGAGGGAGTCTTGAAAAACCAGAATGTGATGTACAAGTTAGGTTATTGGATGGTGCTGTTGGTGGTATAGACCTTGGACGAGCTGAAGTTTTTGCTTCTCTTACATCTAACAGTCGTTTTCTTTTCAACTCCAACTTTGAACCATTTGTCCAAAATGGTCATGTCCATATACAAGGAAGTGTTCCTGTTAGCTTTTCGCAGAAAAATATGTCTGAAGGAGAAGTCAGCGAAACAGATAGAGGTGGTGCAGTGAAAATCCCGAGTTGGGCAAAAGAGAAGGAAGATGATGAGAAGAGAACCTCAAGGGATAGGAGCGAAGAGAGATGGGACAGCCAACTAGCTGAGAGTCTCAAGGGTTTATACTGGAATATTTTAGA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- >AT2G25660.2
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CDS Sequence
- >AT2G25660.1
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- >AT2G25660.2
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