Gene Details:

  • Gene ID: AT1G03060
  • Gene Symbol: BCHA1, SPI
  • Gene Name: Beach-Domain Homolog A1, SPIRRIG
  • Description: BEACH-DOMAIN HOMOLOG A1;(source:Araport11)
  • TAIR Accession:
  • Genome: Araport11_genome_release
  • Species: Arabidopsis thaliana

Transcripts:

Plant Ontology Annotations:

  • PO:0000013  — cauline leaf — hoja caulinar (Spanish, exact), 茎生葉、茎葉 (Japanese, exact)
  • PO:0000230  — inflorescence meristem — meristema de la inflorescencia (Spanish, exact), 花序分裂組織 (Japanese, exact)
  • PO:0009010  — seed — semilla (Spanish, exact), 種子 (Japanese, exact), pyrene (narrow), diaspore (broad)
  • PO:0009030  — carpel — carpelo (Spanish, exact), 心皮 (Japanese, exact), Poaceae carpel (narrow), Zea carpel (narrow), pistil (broad)
  • PO:0009032  — petal — pétalo (Spanish, exact), 花弁 (Japanese, exact)
  • PO:0009047  — stem — caña (Spanish, exact), culm (exact), eje primario (Spanish, exact), primary axis (exact), primary stem (exact), tallo (Spanish, exact), tronco (Spanish, exact), 茎 (Japanese, exact), bole (narrow), cane (narrow), caudex (narrow), caudices (narrow), core (narrow), primocane (narrow), scape (narrow), stalk (narrow), trunk (narrow)
  • PO:0025281  — pollen — polen (Spanish, exact), pollen grain (exact), 花粉 (Japanese, exact)
  • PO:0025195  — pollen tube cell — célula del tubo polínico (Spanish, exact), 花粉管細胞 (Japanese, exact)
  • PO:0000293  — guard cell — célula guardiana (Spanish, exact), occlusive cell (exact), 孔辺細胞 (Japanese, exact)

Germplasm Phenotype:

  • CS340424  — Reduced seed coat mucilage.
  • spi-11  — Trichome cells have shorter branches, reduced stalk length and width. Epidermal pavement cells are less complex, with less lobing. Root hairs are shorter and root hair vacuoles are fragmented.
  • spi-12  — Trichome cells have shorter branches, reduced stalk length and width. Epidermal pavement cells are less complex, with less lobing. Root hairs are shorter and root hair vacuoles are fragmented.
  • spi-139  — Trichome cells have shorter branches, reduced stalk length and width. Epidermal pavement cells are less complex, with less lobing. Root hairs are shorter and root hair vacuoles are fragmented.
  • spi-4.2  — Trichome cells have shorter branches, reduced stalk length and width. Epidermal pavement cells are less complex, with less lobing. Root hairs are shorter and root hair vacuoles are fragmented.
  • spi-4/lip5-1  — Significant reduction in seed coat mucilage. On a subcellular level there are defects in vacuolar trafficking.

Literature:

Sequences:

cDNA Sequence
  • >AT1G03060.3
    AAGGAGAAACAAACAGTATCGTGTTTTAGAGAGAGAAAGTGAGACGACTTGAGCGAGAAACAAGGCGCGGAGAGAGACGACGCCGTCAACAACACCAGAACAGAAAAAAAAAACAAAGAAAGAAGGAAGAAAAAAGAGAGAGAAGGAGATTTGATTTAATTTAAATTTTCTTTAAGGAAAAAAAAAACAAAAACAAAATCGCGTTTTTCCGCTAAGCTCTTTTTCTTCCCTTTTTGTCAAAATTTGGGTTTTTGCTCATTCTCGTGGAAGGAAAAAAGGGGATTTTTTCAAGTGTTTAGGGGTTCACAAATTGAAAATTTTGGATCTTAGATCTTTCTTCTTGCTACGAAACCCTAATTCGTCACATTGTATCAGCTCAATTTGATCTTAAAAAAAAAAGACTATTTTTTTCCTTTTTGGGTCTCCTTCTTCTTTCTTTCTTTAATTTGAATTCCTCAATTTAAGGATTGTGTGTTTTGTTTCCTTCTTGTGAACGAATGAGAGTTTTGGGTTGATCGCATTTTTAGGGTTGATTTTATTTATCTGATCGACGACTCGGATCTGAGGTGGGTCGTGTTTGGAGACCGAGTCAGGGTCTGGTCTGGTCTGGTGAGGTCGTCGTCTTCATCGGATGAAAGTTTCTGGGATCGAAAAGCACAACGATGAAATGGGCAACATTGCTTAAGGACATCAAGGAGAAGGTTGGATTAGCTCAATCCTCTGACTCCGACCCCTTTCCCGTTGACCTAACTGCTCCGCCCTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCTCCTTCTTTTACTTACCCCTCCTCTTCTTCTCTTCATCACTTCAACTTCTCTCCTTCAAGAGATAACCATGAGTTGGAGCTGGACTTCAAGAGATTATGGGAAGAGTTTCGTTCATCTAGTTCTGAAAAGGAGAAGGAGGCCGCCTTGAATTTGACCGTCGATATATTTTGTAGATTAGTGAAGCGGCACGCTAATGTAGATCAGTTAGTTACTATGTTAGTAGAAACACATATATTCTCCTTTGTCATTGGGAGAGCATTTGTGACAGATATTGAAAAGTTGAAGATCGGCAGCAAGACAAGGTCACTGAATGTAGAGAAAGTATTAAGGTTCTTTTCAGATGTCACCAAGGAGGGATTTAGTCCTGGTGCAAACCTCTTAACTGCTGTTGAAGTACTTGTATCTGGGCCTATCGACAAACAATCACTACTGGATTCTGGGATATTCTGTTGTCTAATACACGTTCTCATTGCACTTCTAGCATATGATGAACTAAGCAAAAGTAAAATAACTGGTGACTTAGAAGTTGTATCAGCGGAAAAAGATGCTGGATACATAGTTCTCCAGACTAGACGACTTGAGGTGGAGGGTAGTGTTGTTCATATCATGAAAGCATTAGCAAGCAATCCTTCTGCTGCTCAGAGTTTGATTGAAGATGACTCTCTTGAGTCGCTTTTCAATATGGTTGCCAATGGCTCCATTACAGTTTTTTCTCAGTATAAAGAAGGTCTAGTTCCCCTCCATAACATACAACTTCACAGACATGCAATGCAGATCCTTGGACTTCTACTAGTCAATGACAATGGGAGCACAGCAAGATACATACGCAAGCACCATCTGATAAAGGTGCTCTTGATGGCTGTCAAAGAATTTGATCCAAGTTGTGGTGACTCAGCCTACACTATGGGCATTGTGGACTTGTTACTTGAATGTGTAGAACTATCGTACAGACCTGAGGCTGGTGGTGTTAGGCTCCGGGAGGACATACGTAATGCACACGGTTACCACTTTCTTGTTCAGTTTGCCCTGGTTCTATCTTCCTTGCCAAAAAATCCGATTTTTGTGTCCAGTAATCATGATAGTGGTTCCGATGACCCTGAAGTGTTTCATGATGGAGAAAATACAAACAGTACGGAAAATGCTGATTTTTCATCACAAAACTTTGCTCCATCGTTGTCAAGATTGCTTGATGTCCTCGTCACCCTGGCTCAGACTGGTCCAGCTGAGCCATCTGTAGGGAGGGCCTCACGGTCATCCCAAACGAAGCCAACTGGGCATAGCAGAAGTCGAACTTCATCTGTTGACAGTATATACGATGAGACATGGGAACAGGGAAGTGGTAAAGTTAAAGACCTGGAAGCTGTTCAAATGCTGCAAGATATCTTCCTGAAGGCAGAGAATAAGGATCTTCAGGCAGAAGTATTAAATAGAATGTTCAAGATATTCTCGAGCCACGTGGAAAACTATAGATTATGTCAGGAATTAAGAACCGTTCCATTGCTTGTCCTCAATATGGCTGGTTTTCCTTCCTCGCTGCAAGATATAATTCTCAAAATTCTTGAATATGCTGTCACAGTTGTGAATTGTGTTCCAGAGCAAGAATTGTTGTCACTTTGTTGCTTATTGCAACAGCCAATTACATCTCAGTTGAAGCACACCATACTTTCTTTCTTTGTGAAGCTCATATCTTTTGATCAACAATATAAGAAAGTCCTACGTGAAGTTGGTGTTTTGGAAGTCTTACAGGATGATTTGAAGCAGCACAAGCTTCTTATTGGTCCAGATCAGTATAGTGGAGTCTCTAGTCATTCAGATCGGAAGCCTAGCTCAGGTAGCTTCAGAAAGAACTTAGATACTAAAGATGCCATCATCTCATCACCAAAGTTGATGGAATCTGGGTCAGGAAAGTTACCTGTTTTTGAAGTTGACAACACTATTACTGTTGGTTGGGATTGTTTGATCTCTTTGTTAAAGAAAGCTGAGGCTAATCAGTCATCTTTTCGTGCGGCCAATGGGGTGGCGATTATTCTTCCTTTCTTGATATCTGATGCCCATCGAAGTGGCGTTTTGAGGATCTTATCATGTCTAATCACAGAAGACACTAAACAGGTCCATCATGACGAATTAGGAGCTGTTGTCGATTTGTTAAAGAGTGGAATGGTCACTGGTATTTCTGGCCATCAATACAAGCTTCATGATGATGCGAAATGTGATACAATGGGTGCTCTATGGCGTATTGTTGGTGTTAATGGCTCTGCCCAAAGAGTCTTTGGCGAAGCCACTGGTTTCTCTCTTTTATTGACGACCCTTCATACTTTTCAAGGGAAAAGAGAGCACATGGATGAGTCTGACTTGACGGTTTACATCAAATTGTTTAAATATCTGTTTCGCCTTATGACAGCTGCAGTCTGTGAGAATGCTGTTAATAGGATGAAACTCCACGCTGTTATAACGTCTCAGACATTTTTTGAGCTTTTGGCGGAGTCTGGATTGCTGTGTGTTGAGTTGGAAAGGCAGGTTATACAGCTGTTGTTAGAACTTGCACTTGAAGTGGTGGTTCCCCCGTTTTTAACATCAGAGTCAACGGCCCTTGCTACTATACCAGAAAATGAAAACACAACTTTTGTTGTAACAACCCCATCGGGCCAGTTCAATCCTGACAAGGAGAGAATTTACAATGCAGGTGCGGTCAGAGTTCTGATCCGTTCTTTGTTGCTTTTTAGTCCAAAAATGCAGCTAGAATTTTTGAGACTTCTGGAAAGTCTTGCACGTGCCAGTCCATTCAATCAGGAAAACCTCACATCGATTGGTTGCGTGGAACTCTTGTTGGAGATCATTTACCCCTTTCTTGCGGGTTCATCTCCATTTCTTTCTTATGCTTTGAAGATTGTGGAAATTCTTGGAGCGTACAGATTGTCCCCATCTGAGCTCCGAATGCTGTTTAGATATGTTTTGCAAATGAGGATTATGAATTCAGGTCATGCAATAGTTGGCATGATGGAAAAACTAATTCTCATGGAAGACACAGCCTTGGAACATCTATCTCTGGCTCCTTTTGTAGAATTGGATATGAGCAAAACTGGGCATGCTTCTGTTCAGGTGTCCCTGGGAGAAAGATCTTGGCCGCCTGCGGCTGGTTATTCATTTGTTTGTTGGTTCCAGTTTCGTAATTTTTTGACAACCCAAGGAAAAGAATCAGAAGCCTCTAAAGCTGGCGGTTCATCAAAGACGCGCATGACAAGTGCCCAACAACACGAGCAGAACATTTTCCGGATGTTTTCTGTTGGTGCTGTAAGCAATGAAAGTCCATTCTATGCAGAACTTTACTTTCAGGAGGATGGTATTCTGACCCTTGCCACTAGCAATTCACATTCTTTGTCGTTTTCTGGATTGGAGATTGAGGAGGGCAGGTGGCATCACCTTGCTGTTGTTCATAGTAAACCGAATGCTCTTGCTGGACTCTTCCAAGCTAGTGTTGCATATGTCTATCTTGATGGAAAACTAAGGCACACGGGTAAATTGGGGTACTCTCCTTCGCCTGTTGGAAAATCTTTGCAGGTAACAGTTGGAACTCCGGCTACTTGTGCCAGAGTTAGTGATCTGACATGGAAAACACGCTCATGTTATCTTTTTGAGGAGGTGCTCACATCAGGTTGCATTGGTTTCATGTACATTCTTGGTAGGGGGTACAAAGGTCTTTTCCAGGATGCAGACCTCTTACGCTTTGTGCCTAATCAGGCTTGTGGTGGGGGCAGCATGGCTATCCTGGACTCATTAGACACTGACATGACTTCATCGTCGAATGGACAAAAGTTTGATGGAAGCAATAGACAAGGTGACTCCAAGGCAGATGGCAGTGGAATTGTCTGGGATCTTGAGAGGTTGGGAAATCTTGCCTTTCAGTTACCTGGCAAGAAACTGATATTTGCATTTGATGGAACATGCTCGGAGTTCATCCGTGCGTCTGGAAATTTTTCACTCCTCAATCTGGTTGACCCATTGTCTGCTGCTGCTTCTCCAATTGGAGGAATACCACGTTTTGGGCGTCTGGTAGGAAATGTATCTATCTGCAGACAAAGTGTGATTGGTGATACTATCCGACCTGTGGGAGGAATGACTGTTGTACTTGCGCTTGTTGAGGCTGCCGAATCTAGAAATATGCTACATATGGCTCTTTCATTGCTTGCATGTGCGCTTCATCAAAACCCTCAAAAT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